FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0387, 603 aa
1>>>pF1KE0387 603 - 603 aa - 603 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0730+/-0.000797; mu= 20.8201+/- 0.048
mean_var=71.8900+/-14.214, 0's: 0 Z-trim(108.3): 29 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.151266
statistics sampled from 10115 (10142) to 10115 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5 ( 603) 4226 931.6 0
CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4 ( 601) 3146 695.9 3.8e-200
CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 ( 578) 1367 307.7 2.7e-83
CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12 ( 575) 1361 306.4 6.8e-83
CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18 ( 559) 1323 298.0 2.1e-80
CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 556) 1311 295.4 1.3e-79
CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 561) 1311 295.4 1.3e-79
CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9 ( 581) 1288 290.4 4.3e-78
CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14 ( 558) 1278 288.2 1.9e-77
CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 532) 1257 283.6 4.3e-76
CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 552) 1257 283.6 4.5e-76
CCDS2203.1 GALNT5 gene_id:11227|Hs108|chr2 ( 940) 1253 282.9 1.2e-75
CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7 ( 608) 1236 279.1 1.2e-74
CCDS33711.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 639) 1220 275.6 1.3e-73
CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12 ( 622) 1188 268.6 1.7e-71
CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1 ( 571) 1179 266.6 6.1e-71
CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 557) 1172 265.1 1.7e-70
CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2 ( 633) 1171 264.9 2.2e-70
CCDS82742.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 617) 1142 258.6 1.7e-68
CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7 ( 598) 1092 247.7 3.3e-65
CCDS3815.1 GALNT7 gene_id:51809|Hs108|chr4 ( 657) 1052 239.0 1.5e-62
CCDS5929.1 GALNTL5 gene_id:168391|Hs108|chr7 ( 443) 990 225.3 1.3e-58
CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 603) 971 221.3 2.9e-57
CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11 ( 607) 971 221.3 3e-57
CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12 ( 637) 900 205.8 1.4e-52
>>CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5 (603 aa)
initn: 4226 init1: 4226 opt: 4226 Z-score: 4980.4 bits: 931.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4226; 100.0% identity (100.0% similar) in 603 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRRKEKRLLQAVALVLAALVLLPNVGLWALYRERQPDGTPGGSGAAVAPAAGQGSHSRQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MRRKEKRLLQAVALVLAALVLLPNVGLWALYRERQPDGTPGGSGAAVAPAAGQGSHSRQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRENGFNIYVSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRENGFNIYVSDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSHC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 EANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYKRIPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYKRIPIP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVWMCGGRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVWMCGGRM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVSLARNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEYRHLSAGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVSLARNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEYRHLSAGDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAWGEIRNVGTGLCADTKHGALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAWGEIRNVGTGLCADTKHGALG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 SPLRLEGCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTSPVTLYDCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPLRLEGCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTSPVTLYDCHS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 MKGNQLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDCSESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKGNQLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDCSESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLEKF
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 NRN
:::
CCDS43 NRN
>>CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4 (601 aa)
initn: 3190 init1: 3033 opt: 3146 Z-score: 3706.7 bits: 695.9 E(32554): 3.8e-200
Smith-Waterman score: 3146; 71.4% identity (89.4% similar) in 605 aa overlap (1-603:1-598)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRRKEKRLLQAVALVLAALVLLPNVGLWALYRERQ--PDGTPGGSGAAVAPAAGQGSHSR
:.::.::.:: . : .::..:::::::.::.... .. :: . . : : :. .
CCDS34 MKRKQKRFLQMTLLFTVALIFLPNVGLWSLYKDKHLVKSAEPGEQ--QTFPL-GLGDGQF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QKKTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRENGFNIYVS
. : :: . ::::: :.:...:.: :.::.:.:::.:. .. :.:::::::::.::
CCDS34 YSWT----DGLRRKDWHDYESIQKEAMRSGKGEHGKPYPLTEEDHDDSAYRENGFNIFVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVA
..:.:.:::::::: ::. : ::: :::::::::::::::.:::::.::..::.: :.:
CCDS34 NNIALERSLPDIRHANCKHKMYLERLPNTSIIIPFHNEGWTSLLRTIHSIINRTPGSLIA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDS
::.::::::.::::: ::.::: : .:::.::::::::::::.::::.: :.:.:::::
CCDS34 EIILVDDFSEREHLKDKLEEYMARFSKVRIVRTKKREGLIRTRLLGASMARGEVLTFLDS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYKRIP
:::.:::::::::..:: :.:::::::::::::. : ::.::::::::::::::::::::
CCDS34 HCEVNVNWLPPLLNQIALNHKTIVCPMIDVIDHNHFGYEAQAGDAMRGAFDWEMYYKRIP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IPPELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVWMCGG
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IPPELQRADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVWMCGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RMEDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVSLARNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEYRHLSAG
.: :.::::::::::::::::::.:.:::::::::::.::::.:::::::::::::::.:
CCDS34 EMFDVPCSRVGHIYRKYVPYKVPSGTSLARNLKRVAETWMDEFAEYIYQRRPEYRHLSTG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 DVAVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAWGEIRNVGTGLCADTKHGA
:...::.::..:.::.:::::. .:::.::.::::::: :::::::::...::.:.::::
CCDS34 DISAQKELRKQLKCKDFKWFMAAVAWDVPKYYPPVEPPPAAWGEIRNVAANLCVDSKHGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LGSPLRLEGCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTSPVTLYDC
:. :::. ::. .: .:.. :.::: ::::::::.: ::.:::::::::.::::::::
CCDS34 TGTELRLDICVKDGSERTWSHEQLFTFGWREDIRPGEPLHTRKFCFDAISHNSPVTLYDC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 HSMKGNQLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDCSESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLE
:.::::::: ::::.::.::::.:::::. ....::: :.: : ::::.::: : ::::
CCDS34 HGMKGNQLWGYRKDRTLFHPVSNSCMDCNPAEKKIFMARCDPLSETQQWIFEHINMTVLE
540 550 560 570 580 590
600
pF1KE0 KFNRN
:::..
CCDS34 KFNHHANS
600
>>CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 (578 aa)
initn: 1261 init1: 619 opt: 1367 Z-score: 1608.7 bits: 307.7 E(32554): 2.7e-83
Smith-Waterman score: 1393; 40.1% identity (68.1% similar) in 561 aa overlap (50-590:35-577)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 VLLPNVGLWALYRERQPDGTPGGSGAAVAPAAGQGSHSRQKKTFFLGDGQKLKDWHDKEA
.:: : ..:. . :.: :: . ..
CCDS53 WTWAGKSCLLLAFLTVAYIFVELLVSTFHASAGAG-RARELGSRRLSDLQKNTEDLSRPL
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 IRRD-AQRVGNGEQGRPYPMTDAE----RVDQAYRENGFNIYVSDKISLNRSLPDIRHPN
.. :. . :: :. . : . .. .. ..:::.::.:::.: . : : .
CCDS53 YKKPPADSRALGEWGKASKLQLNEDELKQQEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMYE
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 CNSKRY-LETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEIVLVDDFSDREHLK
:.:... .:::.::.:: :.::.::.::::.::::. :: :. ::.::::.::: .::
CCDS53 CKSQKFNYRTLPTTSVIIAFYNEAWSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLK
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 KPLEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSHCEANVNWLPPLLDR
:: :.. . ::..::.:::::.:.:..::. :::::.:::: ::: : .:: :::.:
CCDS53 TQLETYISNLDRVRLIRTNKREGLVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECNSGWLEPLLER
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 IARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYKRIPIPPELQKADPS--DP
:.:.. ..:::.::.:: . :.. : :. : :.:::.. .. .: . . : ::
CCDS53 IGRDETAVVCPVIDTIDWNTFEFYMQIGEPMIGGFDWRLTFQWHSVPKQERDRRISRIDP
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 FESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVWMCGGRMEDIPCSRVGHI
..::.::::::::..:.: :: :: :.:.::::. :.::.::.:::..: :::.:::.
CCDS53 IRSPTMAGGLFAVSKKYFQYLGTYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHV
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 YRKYVPYKVPAGVSLARNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEYRHLSAGDVAVQKKLRSSLN
. : .:: : .. .: :.:::::::: :..:.: : :. . ::.. .: :: :
CCDS53 FPKRAPYARP---NFLQNTARAAEVWMDEYKEHFYNRNPPARKEAYGDISERKLLRERLR
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480
pF1KE0 CKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAW-GEIRNVG-TGLCADTK---HGALGSPLRLE
:::: :.. .. .:... : . : .: : ::. : .. : : . .. :. : :
CCDS53 CKSFDWYLKNV---FPNLHVPEDRP--GWHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLF
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTSPVTLYDCHS----MK
:: .:.: . : : .: ..:: .. . ..: .. . . : . .: . .
CCDS53 GC-HGQG-----GNQFFEYTSNKEIRFNS---VTELCAEVPEQKNYVGMQNCPKDGFPVP
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE0 GNQLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDC---SESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLEK
.: .:....: :..:: :: :.. :. . : ::. . .: : ::
CCDS53 ANIIWHFKEDGTIFHPHSGLCLSAYRTPEGRPDVQMRTCDALDKNQIWSFEK
530 540 550 560 570
600
pF1KE0 FNRN
>>CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12 (575 aa)
initn: 1261 init1: 619 opt: 1361 Z-score: 1601.7 bits: 306.4 E(32554): 6.8e-83
Smith-Waterman score: 1387; 40.1% identity (68.0% similar) in 559 aa overlap (52-590:34-574)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 LPNVGLWALYRERQPDGTPGGSGAAVAPAAGQGSHSRQKKTFFLGDGQKLKDWHDKEAIR
: : ..:. . :.: :: . .. .
CCDS55 ATEDPVLERYFKGHKAAITSLDLSPNGKQLGAG-RARELGSRRLSDLQKNTEDLSRPLYK
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130
pF1KE0 RD-AQRVGNGEQGRPYPMTDAE----RVDQAYRENGFNIYVSDKISLNRSLPDIRHPNCN
. :. . :: :. . : . .. .. ..:::.::.:::.: . : : .:.
CCDS55 KPPADSRALGEWGKASKLQLNEDELKQQEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMYECK
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 SKRY-LETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEIVLVDDFSDREHLKKP
:... .:::.::.:: :.::.::.::::.::::. :: :. ::.::::.::: .::
CCDS55 SQKFNYRTLPTTSVIIAFYNEAWSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKTQ
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSHCEANVNWLPPLLDRIA
:: :.. . ::..::.:::::.:.:..::. :::::.:::: ::: : .:: :::.::.
CCDS55 LETYISNLDRVRLIRTNKREGLVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECNSGWLEPLLERIG
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 RNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYKRIPIPPELQKADPS--DPFE
:.. ..:::.::.:: . :.. : :. : :.:::.. .. .: . . : ::..
CCDS55 RDETAVVCPVIDTIDWNTFEFYMQIGEPMIGGFDWRLTFQWHSVPKQERDRRISRIDPIR
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 SPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVWMCGGRMEDIPCSRVGHIYR
::.::::::::..:.: :: :: :.:.::::. :.::.::.:::..: :::.:::..
CCDS55 SPTMAGGLFAVSKKYFQYLGTYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHVFP
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 KYVPYKVPAGVSLARNLKRVAEVWMDEYAEYIYQRRPEYRHLSAGDVAVQKKLRSSLNCK
: .:: : .. .: :.:::::::: :..:.: : :. . ::.. .: :: : ::
CCDS55 KRAPYARP---NFLQNTARAAEVWMDEYKEHFYNRNPPARKEAYGDISERKLLRERLRCK
370 380 390 400 410
440 450 460 470 480
pF1KE0 SFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAW-GEIRNVG-TGLCADTK---HGALGSPLRLEGC
:: :.. .. .:... : . :. : : ::. : .. : : . .. :. : : ::
CCDS55 SFDWYLKNV---FPNLHVPEDRPG--WHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLFGC
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHTSPVTLYDCHS----MKGN
.:.: . : : .: ..:: .. . ..: .. . . : . .: . . .:
CCDS55 -HGQG-----GNQFFEYTSNKEIRFNS---VTELCAEVPEQKNYVGMQNCPKDGFPVPAN
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 QLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDC---SESDHRIFMNTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLEKFN
.:....: :..:: :: :.. :. . : ::. . .: : ::
CCDS55 IIWHFKEDGTIFHPHSGLCLSAYRTPEGRPDVQMRTCDALDKNQIWSFEK
530 540 550 560 570
pF1KE0 RN
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60 70 80 90 100 110
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: ::.:.: : : :.. . .. : ::.
CCDS11 YFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNL
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YVSDKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPE
..:. :.:::::::.: .:..: : ..::.::..: ::::.::.::::::::.:::: .
CCDS11 MASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRH
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
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.. ::::::: :.:. ::.:::.:. : :...: ..: ::::.:. ::.:. :.:::
CCDS11 MIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVIT
150 160 170 180 190 200
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:::.::: .:.:: ::: :: ..:.:.:::.::::. : :.: .:: : :.:.:..
CCDS11 FLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEY--MAGSDMTYGGFNWKLN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
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.. :.: :. .:.: . : ..:.::::::..:: .: :.: :: :..:::::. :::
CCDS11 FRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEIS
270 280 290 300 310 320
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:..:.::: .: . ::.:::..:: .:: :.:.. . .: .:.:::::::. ...:
CCDS11 FRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYII
330 340 350 360 370 380
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: ... ::.. . :: .:.:: :.:.. .: : .:. : . ::::::
CCDS11 SPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFSL-------GEIRNV
390 400 410 420 430
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:. : :. . . . .: .: : . :::..: ..:: : .:.:.
CCDS11 ETNQCLDNMARKENEKVGIFNC-HGMG-----GNQVFSYTANKEIRTDD------LCLDV
440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 ISHTSPVTLYDCHSMKGNQLWKYRKDK-TLYHPVSGSCMD-CSESDHRI-FMNTCNPSSL
. ..:::. :: .::::::.: : :: : :..:.: .: : .. . :: .:
CCDS11 SKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCN-GSR
490 500 510 520 530 540
590 600
pF1KE0 TQQWLFEHTNSTVLEKFNRN
.::::.. : :. : :
CCDS11 SQQWLLR--NVTLPEIF
550
>>CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 (556 aa)
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50 60 70 80 90 100
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. .: :. . : ::.:. : : :..
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. .. : ::...:: :.:::::::.: .:..: : . :::::..: ::::.::.::::
CCDS21 KELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVIVFHNEAWSTLLRT
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CCDS21 VYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVKIIRMEERSGLIRARLR
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::... :.::::::.::: ...:: ::: :: ..:::.:::.::::. : :.: .:: :
CCDS21 GAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIIDVISDDTFEY--MAGSD
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290 300 310 320 330
pF1KE0 AMRGAFDWEMYYKRIPIPP-EL--QKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGL
:.:.:.. .. :.: :. .:.: . : ..:.::::::..::..: :.: :: :.
CCDS21 MTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRNYFEEIGTYDAGM
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 EIWGGEQYEISFKVWMCGGRMEDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVS--LARNLKRVAEVW
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CCDS21 DIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVINKNNRRLAEVW
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 MDEYAEYIYQRRPEYRHLSAGDVAVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPA
:::. ...: : ... :::.:.: :: .:.:: :.:.. .: :: . :
CCDS21 MDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENI-------YPDSQIPR
380 390 400 410 420
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pF1KE0 AAW--GEIRNVGTGLCADTKHGALGSPLRLEGCVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGD
. :::::: :. : :. . . . .: .: : . :::..: ..:: :
CCDS21 RYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNC-HGMG-----GNQVFSYTADKEIRTDD
430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 PQHTKKFCFDAISHTSPVTLYDCHSMKGNQLWKYRKDK-TLYHPVSGSCMDC-SESDHRI
.:.:. ..:: . :: :.:::::.: .. :: : :..:.: :: :. .
CCDS21 ------LCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEPSEEDKMV
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580 590 600
pF1KE0 -FMNTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLEKFNRN
:. :. : .::::...
CCDS21 PTMQDCSGSR-SQQWLLRNMTLGT
540 550
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pF1KE0 VAPAAGQGSHSRQKKTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPY--PMTDAERV
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CCDS77 WVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAVISRNQE--GPGEMGKAVLIPKDDQEKM
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110 120 130 140 150 160
pF1KE0 DQAYRENGFNIYVSDKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRT
. .. : ::...:: :.:::::::.: .:..: : . :::::..: ::::.::.::::
CCDS77 KELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVIVFHNEAWSTLLRT
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pF1KE0 VHSVLNRSPPELVAEIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMA-LFPSVRILRTKKREGLIRTRML
:.::.:::: :..:..:::: :.:. :: ::.:. : :.:.: ..: ::::.:.
CCDS77 VYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVKIIRMEERSGLIRARLR
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pF1KE0 GASVATGDVITFLDSHCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAG-D
::... :.::::::.::: ...:: ::: :: ..:::.:::.::::. : :.: .:: :
CCDS77 GAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIIDVISDDTFEY--MAGSD
200 210 220 230 240 250
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:.:.:.. .. :.: :. .:.: . : ..:.::::::..::..: :.: :: :.
CCDS77 MTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRNYFEEIGTYDAGM
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.:::::. :.::..:.::: .: . ::.:::..:: .:: :.:.. . .: .:.::::
CCDS77 DIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVINKNNRRLAEVW
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pF1KE0 MDEYAEYIYQRRPEYRHLSAGDVAVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPA
:::. ...: : ... :::.:.: :: .:.:: :.:.. .: :: . :
CCDS77 MDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENI-------YPDSQIPR
380 390 400 410 420
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. :::::: :. : :. . . . .: .: : . :::..: ..:: :
CCDS77 RYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNC-HGMG-----GNQVFSYTADKEIRTDD
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.:.:. ..:: . :: :.:::::.: .. : : ...... .
CCDS77 ------LCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAESCL------SVNKVADGSQHPTV
480 490 500 510 520
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pF1KE0 NTCNPSSLTQQWLFEHTNSTVLEKFNRN
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CCDS77 ETCNDSTL-QKWLLR--NYTRMEIF-RNIFGNSTDYIL
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10 20 30 40 50
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CCDS67 MWGRTARRRCPRELRRGREALLVLLALLALAGLGSVLRAQR--GA--GAGAA-EPGPPRT
10 20 30 40 50
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. ... . . . ::.: . : ::. : ... : . .
CCDS67 PRPGRREPVMPRPPVPANALGARGEAVRLQLQ----GEELRLQ--------EESVRLHQI
60 70 80 90 100
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pF1KE0 NIYVSDKISLNRSLPDIRHPNCNSKRY-LETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRS
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CCDS67 NIYLSDRISLHRRLPERWNPLCKEKKYDYDNLPRTSVIIAFYNEAWSTLLRTVYSVLETS
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CCDS67 PDILLEEVILVDDYSDREHLKERLANELSGLPKVRLIRANKREGLVRARLLGASAARGDV
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CCDS67 LTFLDCHCECHEGWLEPLLQRIHEEESAVVCPVIDVIDWNTFEYLGNSGEPQIGGFDWRL
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CCDS67 VFTWHTVPERERIRMQSPVDVIRSPTMAGGLFAVSKKYFEYLGSYDTGMEVWGGENLEFS
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:..:.::: .: :::.:::.. : .::. . .:: .. :.:::::::. : :.: :
CCDS67 FRIWQCGGVLETHPCSHVGHVFPKQAPYS--RNKALANSV-RAAEVWMDEFKELYYHRNP
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. : :::. .:.::..:.::.::::. . :... : . :. .: ..: : :
CCDS67 RARLEPFGDVTERKQLRDKLQCKDFKWFLETV---YPELHVPEDRPGF-FGMLQNKGLTD
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: : .. .: . : : .: :. : : .: ...:: . : . :.
CCDS67 YCFDYNPPDENQIVGHQVILYLC-HGMGQN-----QFFEYTSQKEIRYN--THQPEGCIA
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. . . . .. :. . :: . ..: .:.: : .:.. .. :: . .. :.
CCDS67 VEAGMDTLIMHLCEETAPENQKFILQEDGSLFHEQSKKCVQAARKESSDSFVPLLRDCTN
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:. :.:.:.
CCDS67 SD-HQKWFFKERML
570 580
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10 20 30 40 50
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CCDS32 MRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLW--QDNRAHAASSGGRGAQ---RAGRRSEQLRE
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.:. .. : : . .: . .:... ::. :: :...:: :
CCDS32 DRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYL--SAKQLKAGED--PY------------RQHAFNQLES
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::.: .: . : :: .: : : :: ::.:: ::::. :.:::::.:::::.: .:.
CCDS32 DKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEARSTLLRTVKSVLNRTPANLIQ
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::.::::::. : :: . : .:.:. ::. .::::::.:. ::.::.. :.:::
CCDS32 EIILVDDFSS-----DP-EDCLLLTRIPKVKCLRNDRREGLIRSRVRGADVAAATVLTFL
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:::::.:..::::.:.:. ... .: :.::::. :.: : . ..: .::.::: ...:
CCDS32 DSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAYLAASAD-LRGGFDWSLHFKW
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pF1KE0 -RIPIPPELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVW
.::. .. ..::. :...::.:::.:..:..:: .:: :: ..:::::..:.::.::
CCDS32 EQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGKYDAQMDIWGGENFELSFRVW
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:::: .: .:::::::..:: ::. : : .:. :: ::.:::::::: .: :. ::
CCDS32 MCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKRTAEVWMDEYKQYYYEARPSA
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. :.::.. . :...:::::.:.. .. :.. ::. : : :.. :.. :
CCDS32 IGKAFGSVATRIEQRKKMNCKSFRWYLENV---YPELTVPVKE--ALPGIIKQ-GVN-CL
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... ... :. : : :: .: : . . .. . . . :. : :. : :
CCDS32 ESQGQNTAGDFLLGMGICRG---SAKNPQPAQAWLFSDHL----IQQQGK-CLAATSTLM
450 460 470 480 490
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CCDS32 SSPGSPVILQMCNPREGKQKWR-RKGSFIQHSVSGLCLETKPA--QLVTSKCQADAQAQQ
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: :. ::
CCDS32 WQLLPHT
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