Result of FASTA (omim) for
pF1KE0386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0386, 694 aa
1>>>pF1KE0386 694 - 694 aa - 694 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7958+/-0.000432; mu= 17.1993+/- 0.027
mean_var=74.8818+/-14.836, 0's: 0 Z-trim(110.6): 28 B-trim: 43 in 1/49
Lambda= 0.148213
statistics sampled from 18992 (19013) to 18992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 9.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_997304 (OMIM: 610363) protein-arginine deiminas ( 694) 4691 1013.1 0
NP_036519 (OMIM: 180300,605347) protein-arginine d ( 663) 1507 332.3 3.6e-90
NP_057317 (OMIM: 606755) protein-arginine deiminas ( 664) 1420 313.7 1.4e-84
XP_016856592 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 594) 1418 313.3 1.8e-84
NP_031391 (OMIM: 607935) protein-arginine deiminas ( 665) 1347 298.1 7.2e-80
XP_011539873 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 626) 1309 290.0 1.9e-77
XP_011539452 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 601) 1083 241.6 6.5e-63
XP_011539454 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 484) 1078 240.5 1.1e-62
XP_011539609 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 471) 1059 236.5 1.8e-61
XP_016856952 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 485) 1049 234.3 8.3e-61
XP_011539455 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 397) 949 212.9 1.9e-54
XP_011539456 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 397) 949 212.9 1.9e-54
XP_011539458 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 386) 943 211.6 4.6e-54
XP_011539457 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 392) 943 211.6 4.6e-54
XP_011539453 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 563) 943 211.7 6.3e-54
XP_011539874 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 421) 890 200.3 1.3e-50
XP_011539459 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 366) 796 180.2 1.3e-44
XP_016856590 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 612) 397 95.0 9.4e-19
XP_016856591 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 612) 397 95.0 9.4e-19
NP_037490 (OMIM: 607934) protein-arginine deiminas ( 663) 397 95.0 1e-18
XP_016855637 (OMIM: 607935) PREDICTED: protein-arg ( 350) 372 89.5 2.4e-17
>>NP_997304 (OMIM: 610363) protein-arginine deiminase ty (694 aa)
initn: 4691 init1: 4691 opt: 4691 Z-score: 5419.0 bits: 1013.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4691; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ANTVISEKEDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 ANTVISEKEDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 GIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNSSTFELVLGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 IFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNSSTFELVLGPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 QHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 RVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 REAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 REAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 SDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTF
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE0 INDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 INDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
670 680 690
>>NP_036519 (OMIM: 180300,605347) protein-arginine deimi (663 aa)
initn: 1729 init1: 952 opt: 1507 Z-score: 1739.8 bits: 332.3 E(85289): 3.6e-90
Smith-Waterman score: 2048; 44.8% identity (73.4% similar) in 688 aa overlap (9-694:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
:. ..:... ..:.:::::::: ::. . ::. : :.:..: :..:.
NP_036 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
:. ..:... . :::. . .:. : : :. .::...:::: . :: :.:::
NP_036 AHGPPAKKKSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGP-KTPPV-KALLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
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NP_036 TGVEISLCADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVLG
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NP_036 VLDSEDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTV
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NP_036 PKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTS-NLELPEAVVFQDSV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQ
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NP_036 VFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGN
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NP_036 DEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMT
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NP_036 LEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLS
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NP_036 GHVDEFLSFVPAPDR----KGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKK-----
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 NGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTN
.. . : ..:....:...: .::.:: ::..:: ::::.:.:::.::::: :.....
NP_036 --KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSK
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 IPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKC
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NP_036 -----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQC
580 590 600 610 620
660 670 680 690
pF1KE0 TFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
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NP_036 TFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
630 640 650 660
>>NP_057317 (OMIM: 606755) protein-arginine deiminase ty (664 aa)
initn: 1600 init1: 667 opt: 1420 Z-score: 1639.3 bits: 313.7 E(85289): 1.4e-84
Smith-Waterman score: 1924; 43.3% identity (73.4% similar) in 689 aa overlap (9-694:1-664)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
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NP_057 MSLQRIVRVSLEHPTSAVCVAGVETLVDIYGSVPEGTEMFEVYGTPGVDIYI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
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NP_057 SPNMERGRERADTRRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
: ...::. :. .:. .. . :..:.:::::.:.::::::. : . ...:. ..
NP_057 TCVDISLDCDLNCEGR--QDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYW--PQKDNSSTFELVL
: ... ..: :.: .:::. .. ..::::::. ..:.:.:. .: ... ::
NP_057 VHCLQDLEDMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDT
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NP_057 GQDKVSYEVPRLHGD-EERFFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNE-DFSASPIFTDT
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWL
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NP_057 VVFRVAPWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIG
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NP_057 QDEMELGYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLM
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NP_057 NLEVSPPVVANGKEYPLGRILIGGNL-PGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 TGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLL
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NP_057 VGHVDEFLSFVPAPDG----KGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLT
.. .:.:.:....: . :..:..:: ::..:: ::::.: :::.::::: :
NP_057 ----KTISINQVLSNKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKTE---
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 NIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFK
:. : .::::. :.:.::.::::::::: :.: ::::::. ::::::..
NP_057 ---------RKKATAFFPDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLH
580 590 600 610 620
660 670 680 690
pF1KE0 CTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
::::.:: : :.. .:. : ::.::::.:::
NP_057 CTFIDDFTPYHMLHGEVHCGTNVCRKPFSFKWWNMVP
630 640 650 660
>>XP_016856592 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arginin (594 aa)
initn: 1144 init1: 340 opt: 1418 Z-score: 1637.7 bits: 313.3 E(85289): 1.8e-84
Smith-Waterman score: 1418; 44.0% identity (70.3% similar) in 529 aa overlap (9-529:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
:. . ...::: :.:::::.:.: .:. . .:. . : . ::. : . .
XP_016 MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEKED-ATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
. . :: . :::. . .:.. . : . :: :.:.: .:: .: .::::
XP_016 VYNRTRVKEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
::...::::: :.:.:. :. :: : ::: :.::::::::. : .. : :..
XP_016 TGVDISLEVDTGRTGKVKRSQGD--KKTWRWGPEGYGAILLVNCD-RDNHRSAEPDLTHS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFS-EEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNS-STFELVL
..: .. ..: : :. .::. .. ...:::.. .::..::. . :: : .. ::
XP_016 WLMSLADLQDMSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDP-SIPETVLYKD
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XP_016 GPQCLSYEVERQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLV----DPGTLPEVTLFTD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQG----FVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNR
:: ::.:: .. : :: : :.:.:: .. .: :.. .. :. :.: ... . ::
XP_016 TVGFRMAPWIMTPNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVAS
::.:::: : : .::::. ...:.:. : .::.: :.: .::. .. .:
XP_016 NDRWIQDEMEFGYIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 MDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELY
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XP_016 LDSFGNLDVSPPVTVGGTEYPLGRILIGSSF-PKSGGRQMARAVRNFLKAQQVQAPVELY
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 SDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELR
:::: .::::::. :.::.: .::: ::::::::: :::.::..::::.: ::
XP_016 SDWLSVGHVDEFLTFVPTSD----QKGFRLLLASPSACLKLFQEKKEEGYGEAAQFDGPL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 ADQLLSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFC
XP_016 MGGGVPGPHPRRGKAQEVMSAPGAGQCQACSCSHSPLISLPSSLSLFTEVETEAQKGELA
530 540 550 560 570 580
>>NP_031391 (OMIM: 607935) protein-arginine deiminase ty (665 aa)
initn: 1601 init1: 697 opt: 1347 Z-score: 1554.9 bits: 298.1 E(85289): 7.2e-80
Smith-Waterman score: 1851; 44.1% identity (68.8% similar) in 690 aa overlap (9-694:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
: . ..:. : :.:: :::: . :. . :: : :... : .: ..:
NP_031 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEK--EDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLY
. .:. .. : :: : : :.. : ...:::.:.:: . . :. : :.
NP_031 VRDGEAEEVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLF
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pF1KE0 LTGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTK
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NP_031 LTAIEISLDVDADRDGVVEKNNPKKA--SWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVL
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NP_031 KVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEE-SQDPSIPETVLYKD
: . ... :. . :.::.. ::. ::::.: :::.: .:: :: : .. :
NP_031 GRRKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQD--IPLTPIFTD
240 250 260 270 280
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pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRW
::.::.:: .. : :. :..: . :. : .: ::.: .. .. :: ::
NP_031 TVIFRIAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRW
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pF1KE0 LQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSI
.:::. : : .:::: ..::.:. ..: .::.: :.: .::. .. ..:.:.::.
NP_031 IQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSF
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pF1KE0 GNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWL
::: ::::: :.:: :::::.:::::: : . :: :.:..:::: :::::::::::::::
NP_031 GNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSF-PLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWL
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pF1KE0 MTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQL
.::::::: :.: : : ::::.:: ::::::::::::.:.:.:..: : .
NP_031 TVGHVDEFMSFVPI----PGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGG---
470 480 490 500 510 520
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pF1KE0 LSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKL
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NP_031 MSSKR--ITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDE-
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pF1KE0 TNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGF
:.. :: .::... :::. :.::::::::::.. :::: .. ::::::.
NP_031 -----DHR-----ARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGL
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pF1KE0 KCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
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NP_031 ECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
630 640 650 660
>>XP_011539873 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arginin (626 aa)
initn: 1480 init1: 667 opt: 1309 Z-score: 1511.4 bits: 290.0 E(85289): 1.9e-77
Smith-Waterman score: 1813; 43.5% identity (74.0% similar) in 650 aa overlap (48-694:2-626)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 SLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDVANTVISEKEDA-TIWWP
: ..:. : : .. .. .: : : :
XP_011 MFEVYGTPGVDIYISPNMERGRERADTRRWR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 LSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLTGIEVSLEVDIYRNGQV
.. : :.::: ... ..:...:.. .: :.. :::::: ...::. :. .:.
XP_011 FDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYLTCVDISLDCDLNCEGR-
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pF1KE0 EMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKVIFSEEITNLSQMTLNV
.. . :..:.:::::.:.::::::. : . ...:. ..: ... ..: :.: .
XP_011 -QDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQHVHCLQDLEDMSVMVLRT
100 110 120 130 140
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pF1KE0 QGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYW--PQKDNSSTFELVLGPDQHAYTLALLGNHLK
:::. .. ..::::::. ..:.:.:. .: ... ::: :. .: . : . .
XP_011 QGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYEVPRLHGD-E
150 160 170 180 190 200
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pF1KE0 ETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVFRVAPCVFIPCTQVP
: :.::...::.: :.::::. :.:...:.. .. . .. ::::::::: .. : : :
XP_011 ERFFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNE-DFSASPIFTDTVVFRVAPWIMTPSTLPP
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 LEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTS
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XP_011 LEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMELGYVQAPHKTLP
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pF1KE0 LILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPL
...:.:. ..:..::.: :.: .::. .. .:..:...::.::: ::::: ..::::::
XP_011 VVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVVANGKEYPL
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 GRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKN
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XP_011 GRILIGGNL-PGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSFVPAPD--
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pF1KE0 EGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNGREAKTIDQLLADES
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XP_011 -GK-GFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQV----KTISINQVLSNKD
450 460 470 480 490
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pF1KE0 LKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIPSDQQPKRSFARPYF
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XP_011 LINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKTER----------KKATA--FF
500 510 520 530 540
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pF1KE0 PDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTFINDFDCYLTEVGDI
:::. :.:.::.::::::::: :.: ::::::. ::::::..::::.:: : :..
XP_011 PDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLHCTFIDDFTPYHMLHGEV
550 560 570 580 590 600
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pF1KE0 CACANIRRVPFAFKWWKMVP
.:. : ::.::::.:::
XP_011 HCGTNVCRKPFSFKWWNMVP
610 620
>>XP_011539452 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: protein- (601 aa)
initn: 1793 init1: 741 opt: 1083 Z-score: 1250.5 bits: 241.6 E(85289): 6.5e-63
Smith-Waterman score: 1751; 41.4% identity (67.4% similar) in 688 aa overlap (9-694:1-601)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
:. ..:... ..:.:::::::: ::. . ::. : :.:..: :..:.
XP_011 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDI
10 20 30 40 50
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:. ..:... . :::. . .:. : : :. .::...:::: . :: :.:::
XP_011 AHGPPAKKKSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGP-KTPPV-KALLYL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
::.. :.:
XP_011 TGVD------------------------------------------------LQD-----
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVLG
.: :::... :. .. .. ::::... : :.::. . . :: .:::
XP_011 ---------MSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLG
120 130 140 150 160
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pF1KE0 PDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTV
: .. : . :.. . :::::.:::...: :::. ..::.. : . .::.:...:.:
XP_011 PKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTS-NLELPEAVVFQDSV
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pF1KE0 VFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQ
:::::: .. : :: : ::: : .. . :. .:: :. :.. ... :. : .:.:
XP_011 VFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQ
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 DEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGN
::: . : :::::: ...:.:. : :::.: ..: .::. . . ....::.::
XP_011 DEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGN
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 LMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMT
: ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.::: ::::::::.:::::: .
XP_011 LEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSV
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 GHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLS
::::::. :.:. :. ::: :::::: .:::::.:.:.::.:.::::. ..
XP_011 GHVDEFLSFVPAPDR----KGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKK-----
410 420 430 440 450
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pF1KE0 NGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTN
.. . : ..:....:...: .::.:: ::..:: ::::.:.:::.::::: :.....
XP_011 --KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSK
460 470 480 490 500 510
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pF1KE0 IPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKC
:. .::... :.:.::.::::::::: :.: ::::::.: ::::::..:
XP_011 -----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQC
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pF1KE0 TFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
:::::: : . :.. .:.:: ::.::::.:::
XP_011 TFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
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>>XP_011539454 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: protein- (484 aa)
initn: 1578 init1: 741 opt: 1078 Z-score: 1246.2 bits: 240.5 E(85289): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 1619; 47.1% identity (74.8% similar) in 507 aa overlap (189-694:1-484)
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LLVNCNPADVGQQLEDKKTKKVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESK
.: :::... :. .. .. ::::... :
XP_011 MSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMD
10 20 30
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pF1KE0 KARVYWPQKDN-SSTFELVLGPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSV
:.::. . . :: .:::: .. : . :.. . :::::.:::...: :::. ..
XP_011 KVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTI
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 SLVEESQDPSIPETVLYKDTVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSE
::.. : . .::.:...:.::::::: .. : :: : ::: : .. . :. .:: :.
XP_011 SLLDTS-NLELPEAVVFQDSVVFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAM
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:.. ... :. : .:.:::: . : :::::: ...:.:. : :::.: ..:
XP_011 KAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPD
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pF1KE0 IGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLR
.::. . . ....::.::: ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.
XP_011 FGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQ
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 DFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREK
::: ::::::::.:::::: .::::::. :.:. : .::: :::::: .:::::.:.
XP_011 DFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDEFLSFVPAPD----RKGFRLLLASPRSCYKLFQEQ
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 QKEGYGDALLFDELRADQLLSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTEL
:.::.:.::::. .. .. . : ..:....:...: .::.:: ::..:: ::
XP_011 QNEGHGEALLFEGIKK-------KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKREL
330 340 350 360 370
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pF1KE0 GLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQI
::.:.:::.::::: :..... :. .::... :.:.::.::::::::: :
XP_011 GLAESDIIDIPQLFKLKEFSK-----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVI
380 390 400 410 420
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pF1KE0 KGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
.: ::::::.: ::::::..::::::: : . :.. .:.:: ::.::::.:::
XP_011 NGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
430 440 450 460 470 480
>>XP_011539609 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arginin (471 aa)
initn: 1022 init1: 339 opt: 1059 Z-score: 1224.4 bits: 236.5 E(85289): 1.8e-61
Smith-Waterman score: 1059; 40.1% identity (67.7% similar) in 449 aa overlap (9-449:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
:. . ...::: :.:::::.:.: .:. . .:. . : . ::. : . .
XP_011 MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFM
10 20 30 40 50
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pF1KE0 ANTVISEKED-ATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
. . :: . :::. . .:.. . : . :: :.:.: .:: .: .::::
XP_011 VYNRTRVKEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
::...::::: :.:.:. : . :: : ::: :.::::::::. : .. : :..
XP_011 TGVDISLEVDTGRTGKVKRS--QGDKKTWRWGPEGYGAILLVNCD-RDNHRSAEPDLTHS
120 130 140 150 160
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pF1KE0 VIFS-EEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNS-STFELVL
..: .. ..: : :. .::. .. ...:::.. .::..::. . :: : .. ::
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