Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0386, 694 aa
1>>>pF1KE0386 694 - 694 aa - 694 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9788+/-0.00104; mu= 15.9880+/- 0.063
mean_var=73.1223+/-14.363, 0's: 0 Z-trim(104.1): 20 B-trim: 16 in 1/49
Lambda= 0.149986
statistics sampled from 7723 (7728) to 7723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72715.1 PADI6 gene_id:353238|Hs108|chr1 ( 694) 4691 1024.9 0
CCDS180.1 PADI4 gene_id:23569|Hs108|chr1 ( 663) 1507 335.9 1.1e-91
CCDS179.1 PADI3 gene_id:51702|Hs108|chr1 ( 664) 1420 317.1 5.2e-86
CCDS177.1 PADI2 gene_id:11240|Hs108|chr1 ( 665) 1347 301.3 2.9e-81
CCDS178.1 PADI1 gene_id:29943|Hs108|chr1 ( 663) 397 95.8 2.2e-19
>>CCDS72715.1 PADI6 gene_id:353238|Hs108|chr1 (694 aa)
initn: 4691 init1: 4691 opt: 4691 Z-score: 5482.6 bits: 1024.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4691; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ANTVISEKEDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ANTVISEKEDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNSSTFELVLGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNSSTFELVLGPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 REAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 REAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTF
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE0 INDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 INDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
670 680 690
>>CCDS180.1 PADI4 gene_id:23569|Hs108|chr1 (663 aa)
initn: 1729 init1: 952 opt: 1507 Z-score: 1759.4 bits: 335.9 E(32554): 1.1e-91
Smith-Waterman score: 2048; 44.8% identity (73.4% similar) in 688 aa overlap (9-694:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
:. ..:... ..:.:::::::: ::. . ::. : :.:..: :..:.
CCDS18 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
:. ..:... . :::. . .:. : : :. .::...:::: . :: :.:::
CCDS18 AHGPPAKKKSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGP-KTPPV-KALLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
::.:.:: .:: :.:.:. . . .. : ::: : ::::::::. .. .. : . .
CCDS18 TGVEISLCADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVLG
:. ::.. ..: :::... :. .. .. ::::... : :.::. . . :: .:::
CCDS18 VLDSEDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTV
: .. : . :.. . :::::.:::...: :::. ..::.. : . .::.:...:.:
CCDS18 PKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTS-NLELPEAVVFQDSV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQ
:::::: .. : :: : ::: : .. . :. .:: :. :.. ... :. : .:.:
CCDS18 VFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGN
::: . : :::::: ...:.:. : :::.: ..: .::. . . ....::.::
CCDS18 DEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMT
: ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.::: ::::::::.:::::: .
CCDS18 LEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLS
::::::. :.:. :. ::: :::::: .:::::.:.:.::.:.::::. ..
CCDS18 GHVDEFLSFVPAPDR----KGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKK-----
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 NGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTN
.. . : ..:....:...: .::.:: ::..:: ::::.:.:::.::::: :.....
CCDS18 --KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSK
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 IPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKC
:. .::... :.:.::.::::::::: :.: ::::::.: ::::::..:
CCDS18 -----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQC
580 590 600 610 620
660 670 680 690
pF1KE0 TFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
:::::: : . :.. .:.:: ::.::::.:::
CCDS18 TFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
630 640 650 660
>>CCDS179.1 PADI3 gene_id:51702|Hs108|chr1 (664 aa)
initn: 1600 init1: 667 opt: 1420 Z-score: 1657.7 bits: 317.1 E(32554): 5.2e-86
Smith-Waterman score: 1924; 43.3% identity (73.4% similar) in 689 aa overlap (9-694:1-664)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
::.: :...::. :. :::: :.: .:. : .:. . : ..:. : : .
CCDS17 MSLQRIVRVSLEHPTSAVCVAGVETLVDIYGSVPEGTEMFEVYGTPGVDIYI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
. .. .: : : : .. : :.::: ... ..:...:.. .: :.. :::::
CCDS17 SPNMERGRERADTRRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
: ...::. :. .:. .. . :..:.:::::.:.::::::. : . ...:. ..
CCDS17 TCVDISLDCDLNCEGR--QDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYW--PQKDNSSTFELVL
: ... ..: :.: .:::. .. ..::::::. ..:.:.:. .: ... ::
CCDS17 VHCLQDLEDMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDT
: :. .: . : . .: :.::...::.: :.::::. :.:...:.. .. . .. ::
CCDS17 GQDKVSYEVPRLHGD-EERFFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNE-DFSASPIFTDT
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWL
::::::: .. : : :::::.:: . :::.:..:..:.. ... . :: ::.
CCDS17 VVFRVAPWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIG
:::: . :.:::::: ...:.:. ..:..::.: :.: .::. .. .:..:...::.:
CCDS17 QDEMELGYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLM
:: ::::: ..::::::::.:::... :.. :: .....::::.::.:: ::::. :::
CCDS17 NLEVSPPVVANGKEYPLGRILIGGNL-PGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 TGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLL
.::::::. :.:. : ::: .:::::.::.:::.:::: :.: ::::. . :. .
CCDS17 VGHVDEFLSFVPAPDG----KGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLT
.. .:.:.:....: . :..:..:: ::..:: ::::.: :::.::::: :
CCDS17 ----KTISINQVLSNKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKTE---
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 NIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFK
:. : .::::. :.:.::.::::::::: :.: ::::::. ::::::..
CCDS17 ---------RKKATAFFPDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLH
580 590 600 610 620
660 670 680 690
pF1KE0 CTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
::::.:: : :.. .:. : ::.::::.:::
CCDS17 CTFIDDFTPYHMLHGEVHCGTNVCRKPFSFKWWNMVP
630 640 650 660
>>CCDS177.1 PADI2 gene_id:11240|Hs108|chr1 (665 aa)
initn: 1601 init1: 697 opt: 1347 Z-score: 1572.3 bits: 301.3 E(32554): 2.9e-81
Smith-Waterman score: 1851; 44.1% identity (68.8% similar) in 690 aa overlap (9-694:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
: . ..:. : :.:: :::: . :. . :: : :... : .: ..:
CCDS17 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEK--EDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLY
. .:. .. : :: : : :.. : ...:::.:.:: . . :. : :.
CCDS17 VRDGEAEEVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LTGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTK
::.::.::.:: :.: :: .. :.: .: ::: : ::::::::. :: . .
CCDS17 LTAIEISLDVDADRDGVVEKNNPKKA--SWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVL
:: .:.. ..::: : ..::. . :..::. : .: :. :.. .. .. . .:
CCDS17 KVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEE-SQDPSIPETVLYKD
: . ... :. . :.::.. ::. ::::.: :::.: .:: :: : .. :
CCDS17 GRRKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQD--IPLTPIFTD
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRW
::.::.:: .. : :. :..: . :. : .: ::.: .. .. :: ::
CCDS17 TVIFRIAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRW
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSI
.:::. : : .:::: ..::.:. ..: .::.: :.: .::. .. ..:.:.::.
CCDS17 IQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWL
::: ::::: :.:: :::::.:::::: : . :: :.:..:::: :::::::::::::::
CCDS17 GNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSF-PLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 MTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQL
.::::::: :.: : : ::::.:: ::::::::::::.:.:.:..: : .
CCDS17 TVGHVDEFMSFVPI----PGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGG---
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 LSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKL
.:. : ::...:..::: ..: : ..:. :::::: ::::.:::::..: :: ...
CCDS17 MSSKR--ITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDE-
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 TNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGF
:.. :: .::... :::. :.::::::::::.. :::: .. ::::::.
CCDS17 -----DHR-----ARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGL
580 590 600 610 620
660 670 680 690
pF1KE0 KCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
.::::.:.. : .:.. .:.:: ::.::::.:::
CCDS17 ECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
630 640 650 660
>>CCDS178.1 PADI1 gene_id:29943|Hs108|chr1 (663 aa)
initn: 1664 init1: 383 opt: 397 Z-score: 461.4 bits: 95.8 E(32554): 2.2e-19
Smith-Waterman score: 1935; 44.5% identity (70.5% similar) in 694 aa overlap (9-694:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
:. . ...::: :.:::::.:.: .:. . .:. . : . ::. : . .
CCDS17 MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ANTVISEKED-ATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
. . :: . :::. . .:.. . : . :: :.:.: .:: .: .::::
CCDS17 VYNRTRVKEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
::...::::: :.:.:. : . :: : ::: :.::::::::. : .. : :..
CCDS17 TGVDISLEVDTGRTGKVKRS--QGDKKTWRWGPEGYGAILLVNCD-RDNHRSAEPDLTHS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIFS-EEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNS-STFELVL
..: .. ..: : :. .::. .. ...:::.. .::..::. . :: : .. ::
CCDS17 WLMSLADLQDMSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDP-SIPETVLYKD
::. .: . .. . ::::...::.:.: ::.: ::::: :: ..::..:. :
CCDS17 GPQCLSYEVERQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLV----DPGTLPEVTLFTD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQG----FVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNR
:: ::.:: .. : :: : :.:.:: .. .: :.. .. :. :.: ... . ::
CCDS17 TVGFRMAPWIMTPNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVAS
::.:::: : : .::::. ...:.:. : .::.: :.: .::. .. .:
CCDS17 NDRWIQDEMEFGYIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 MDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELY
.::.::: ::::: : : ::::::.:::::: :.. :: :....:.:: :::::::::::
CCDS17 LDSFGNLDVSPPVTVGGTEYPLGRILIGSSF-PKSGGRQMARAVRNFLKAQQVQAPVELY
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 SDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELR
:::: .::::::. :.::.:. ::: ::::::::: :::.::..::::.: :: :.
CCDS17 SDWLSVGHVDEFLTFVPTSDQ----KGFRLLLASPSACLKLFQEKKEEGYGEAAQFDGLK
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 ADQLLSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFC
. ..:...:::. :...: ...::: ::..:: ::::.:.::..:::::
CCDS17 H-------QAKRSINEMLADRHLQRDNLHAQKCIDWNRNVLKRELGLAESDIVDIPQLFF
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LEKLTNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLE
:... .:. .:::.. :.:.:: ::::::.:: :.: ::::::. :::
CCDS17 LKNF------------YAEAFFPDMVNMVVLGKYLGIPKPYGPIINGRCCLEEKVQSLLE
580 590 600 610 620
660 670 680 690
pF1KE0 PLGFKCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
:::..: ::.:. : :.: .:.:: :: ::::.:::
CCDS17 PLGLHCIFIDDYLSYHELQGEIHCGTNVRRKPFPFKWWNMVP
630 640 650 660
694 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:57:19 2016 done: Thu Nov 3 12:57:20 2016
Total Scan time: 3.720 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]