Result of FASTA (omim) for
pF1KE0347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0347, 853 aa
1>>>pF1KE0347 853 - 853 aa - 853 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9517+/-0.000382; mu= 13.7099+/- 0.024
mean_var=142.9310+/-28.642, 0's: 0 Z-trim(116.1): 38 B-trim: 205 in 1/57
Lambda= 0.107278
statistics sampled from 26956 (26992) to 26956 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 13.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008823 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-m ( 853) 5871 921.2 0
NP_787044 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-m ( 833) 3339 529.3 2.7e-149
NP_787046 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-m ( 845) 3339 529.4 2.7e-149
XP_011530965 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 857) 2712 432.3 4.5e-120
XP_011530964 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 863) 2711 432.2 5e-120
XP_005264232 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 912) 2711 432.2 5.3e-120
NP_072046 (OMIM: 602769,615879) DNA (cytosine-5)-m ( 912) 2711 432.2 5.3e-120
XP_016859015 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 912) 2711 432.2 5.3e-120
NP_783328 (OMIM: 602769,615879) DNA (cytosine-5)-m ( 912) 2711 432.2 5.3e-120
XP_011530969 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 689) 2709 431.8 5.3e-120
XP_005264234 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 689) 2709 431.8 5.3e-120
XP_016859016 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 689) 2709 431.8 5.3e-120
NP_715640 (OMIM: 602769,615879) DNA (cytosine-5)-m ( 723) 2709 431.8 5.5e-120
XP_011530968 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 736) 2709 431.8 5.5e-120
NP_001307822 (OMIM: 602769,615879) DNA (cytosine-5 ( 760) 2709 431.8 5.7e-120
NP_001193985 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5 ( 694) 2603 415.4 4.6e-115
NP_001193984 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5 ( 728) 2603 415.4 4.8e-115
XP_011526956 (OMIM: 242860,602900) PREDICTED: DNA ( 740) 2603 415.4 4.8e-115
NP_787045 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-m ( 770) 2603 415.4 5e-115
XP_011526955 (OMIM: 242860,602900) PREDICTED: DNA ( 782) 2603 415.4 5e-115
XP_011530966 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA ( 781) 1925 310.5 2e-83
NP_787063 (OMIM: 606588) DNA (cytosine-5)-methyltr ( 386) 623 108.7 5.3e-23
NP_037501 (OMIM: 606588) DNA (cytosine-5)-methyltr ( 387) 623 108.7 5.3e-23
>>NP_008823 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-methy (853 aa)
initn: 5871 init1: 5871 opt: 5871 Z-score: 4919.0 bits: 921.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5871; 100.0% identity (100.0% similar) in 853 aa overlap (1-853:1-853)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRRSSSRLSKREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRRSSSRLSKREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSESPAVRTRNNNSVSSRERHRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSESPAVRTRNNNSVSSRERHRPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRATASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRATASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQPVVNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQPVVNKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDEDQSREQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDEDQSREQM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 ASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 CCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 CCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 DWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 YVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 RKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 IDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 IDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 IKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 IKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIR
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE0 HLFAPLKDYFACE
:::::::::::::
NP_008 HLFAPLKDYFACE
850
>>NP_787044 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-methy (833 aa)
initn: 5736 init1: 3338 opt: 3339 Z-score: 2801.3 bits: 529.3 E(85289): 2.7e-149
Smith-Waterman score: 5700; 97.7% identity (97.7% similar) in 853 aa overlap (1-853:1-833)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRRSSSRLSKREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRRSSSRLSKREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSESPAVRTRNNNSVSSRERHRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 SSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSESPAVRTRNNNSVSSRERHRPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRATASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 PRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRATASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 PQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 AMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQPVVNKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 AMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQP-----
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDEDQSREQM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 ---------------ENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDEDQSREQM
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 ASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTV
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 CCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 CCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRK
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 DWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 DWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGK
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 YVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 YVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPA
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 RKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 RKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVM
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 IDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 IDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNS
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 IKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 IKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIR
770 780 790 800 810 820
850
pF1KE0 HLFAPLKDYFACE
:::::::::::::
NP_787 HLFAPLKDYFACE
830
>>NP_787046 (OMIM: 242860,602900) DNA (cytosine-5)-methy (845 aa)
initn: 5736 init1: 3338 opt: 3339 Z-score: 2801.2 bits: 529.4 E(85289): 2.7e-149
Smith-Waterman score: 5700; 97.7% identity (97.7% similar) in 853 aa overlap (1-853:13-845)
10 20 30 40
pF1KE0 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 MEPSPEPPSLESMKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSESPAVRTRNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 RRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSESPAVRTRNN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRATASAGTPWPSPPSSYLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 NSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRATASAGTPWPSPPSSYLTI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 DLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 VWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 LATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 KPNNTQPVVNKSKVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGK
::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 KPNNTQP--------------------ENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGK
370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 DRGDEDQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 DRGDEDQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYM
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 YDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 YDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 PQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 PQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGY
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 LVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 LVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGG
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 SPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 SPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKR
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 DISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 DISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKL
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 KKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 KKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQK
770 780 790 800 810 820
830 840 850
pF1KE0 LLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
:::::::::::::::::::::::::
NP_787 LLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
830 840
>>XP_011530965 (OMIM: 602769,615879) PREDICTED: DNA (cyt (857 aa)
initn: 2812 init1: 2281 opt: 2712 Z-score: 2276.7 bits: 432.3 E(85289): 4.5e-120
Smith-Waterman score: 2798; 52.4% identity (72.9% similar) in 828 aa overlap (49-852:51-856)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 DSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRRSSSRLSKR-EVSSLLS--YTQDLTGDGD
::. :.:: .... .. : : ..
XP_011 RRAGPQQRERVQLRPCLKPQEQWKMAAAPPRRAEEPLQKRADLGNRIQHPYFPDEETESR
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 GED--GDGSDTPVMPKLFRETRTRS---ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGR
:. . :: . : .:: .: :. : :.. . : :.:: :: :
XP_011 REEVASPGSCSSWPGKEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDP
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180
pF1KE0 NHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASAG---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSS
.... :. : : ...: . :: . . :. .. . . . : .
XP_011 YYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDP
150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
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..: .: . : .. . .: .. : ::.::. ::::.:::::..::::::. .:
XP_011 ASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIV
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYH
:: :.. .: : :::.:::::::: : ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:.
XP_011 SWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYE
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
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.:. : :::: :: :. .:. .: : :::.::: :::.:.: .::.: :
XP_011 VLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEP----PEE
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 NKSKVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDE---D
.:. . : : . ..:. : : : : . : . : .
XP_011 EKNPYK------------EVYTDMWVEPEAAA--YAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDE
380 390 400 410
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..::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.. ::: :.::::::
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420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 QSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHG
:::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : ..::.:::: . .:
XP_011 QSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYG
480 490 500 510 520 530
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pF1KE0 VLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKEL
.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.:::::::::::::: ::::.:
XP_011 LLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDL
540 550 560 570 580 590
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pF1KE0 GIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDL
::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.:::::::::::::::::
XP_011 GIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDL
600 610 620 630 640 650
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pF1KE0 SNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFL
: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::::: :.:::::::::
XP_011 SIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 ECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTI
: ::::::: .::::::::::::::::::::. .. :::::::.:::..::::..::.::
XP_011 ESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTI
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pF1KE0 TTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSW
::.::::::::.: ::: :: :::.:::::.::.:::::::::::::.: :::.::::::
XP_011 TTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSW
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840 850
pF1KE0 SVPVIRHLFAPLKDYFACE
:::::::::::::.::::
XP_011 SVPVIRHLFAPLKEYFACV
840 850
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Smith-Waterman score: 2802; 51.0% identity (71.9% similar) in 861 aa overlap (12-852:31-862)
10 20 30 40
pF1KE0 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
.:.:. : .: :: .: .: :.
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.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
XP_011 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
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pF1KE0 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
XP_011 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
XP_011 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
XP_011 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE0 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
XP_011 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
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.: : :::.::: :::.:.: .::.: : .:. . : : .
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pF1KE0 DDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRK
..:. : : : : . : . : ...::... .: .. ..:: :.:::
XP_011 PEAAA--YAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSL
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pF1KE0 NPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCV
: . :::: ::.::.:.. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::
XP_011 NVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCV
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pF1KE0 ECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAP
::...::: :.: : ..::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. :
XP_011 ECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPP
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pF1KE0 KLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGN
:.:: .:: .:.:::::::::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.
XP_011 KVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGK
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pF1KE0 IKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNY
: ::.:::..:.:.:.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::.
XP_011 IMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHD
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pF1KE0 SRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPG
.::::::::::::.::::::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::
XP_011 ARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPG
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pF1KE0 MNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLW
::::. .. :::::::.:::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.::
XP_011 MNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILW
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pF1KE0 CTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
:::.::.:::::::::::::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
XP_011 CTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
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Smith-Waterman score: 2802; 51.0% identity (71.9% similar) in 861 aa overlap (12-852:80-911)
10 20 30 40
pF1KE0 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
.:.:. : .: :: .: .: :.
XP_005 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
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50 60 70 80 90
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.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
XP_005 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
110 120 130 140 150 160
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pF1KE0 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
XP_005 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
XP_005 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
XP_005 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
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280 290 300 310 320
pF1KE0 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
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330 340 350 360 370 380
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.: : :::.::: :::.:.: .::.: : .:. . : : .
XP_005 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEP----PEEEKNPYK------------EVYTDMWVE
400 410 420 430 440
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..:. : : : : . : . : ...::... .: .. ..:: :.:::
XP_005 PEAAA--YAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSL
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450 460 470 480 490 500
pF1KE0 NPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCV
: . :::: ::.::.:.. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::
XP_005 NVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCV
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510 520 530 540 550 560
pF1KE0 ECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAP
::...::: :.: : ..::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. :
XP_005 ECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPP
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570 580 590 600 610 620
pF1KE0 KLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGN
:.:: .:: .:.:::::::::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.
XP_005 KVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGK
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 IKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNY
: ::.:::..:.:.:.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::.
XP_005 IMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHD
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690 700 710 720 730 740
pF1KE0 SRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPG
.::::::::::::.::::::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::
XP_005 ARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPG
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KE0 MNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLW
::::. .. :::::::.:::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.::
XP_005 MNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILW
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850
pF1KE0 CTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
:::.::.:::::::::::::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
XP_005 CTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
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>>NP_072046 (OMIM: 602769,615879) DNA (cytosine-5)-methy (912 aa)
initn: 2812 init1: 2281 opt: 2711 Z-score: 2275.5 bits: 432.2 E(85289): 5.3e-120
Smith-Waterman score: 2802; 51.0% identity (71.9% similar) in 861 aa overlap (12-852:80-911)
10 20 30 40
pF1KE0 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
.:.:. : .: :: .: .: :.
NP_072 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90
pF1KE0 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMP-KLFRETRTRS--
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
NP_072 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
NP_072 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
NP_072 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
NP_072 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320
pF1KE0 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
NP_072 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQPVVNKSKVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTA
.: : :::.::: :::.:.: .::.: : .:. . : : .
NP_072 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEP----PEEEKNPYK------------EVYTDMWVE
400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 DDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRK
..:. : : : : . : . : ...::... .: .. ..:: :.:::
NP_072 PEAAA--YAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSL
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
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853 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 14:54:05 2016 done: Thu Nov 3 14:54:07 2016
Total Scan time: 13.310 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]