FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0307, 684 aa 1>>>pF1KE0307 684 - 684 aa - 684 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3942+/-0.000477; mu= -22.4341+/- 0.030 mean_var=507.2054+/-106.696, 0's: 0 Z-trim(122.5): 48 B-trim: 500 in 1/53 Lambda= 0.056949 statistics sampled from 40673 (40732) to 40673 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16 Scan time: 14.280 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011533807 (OMIM: 611438) PREDICTED: beta-taxili ( 684) 4447 380.2 1.4e-104 XP_016865811 (OMIM: 611438) PREDICTED: beta-taxili ( 684) 4447 380.2 1.4e-104 XP_005266893 (OMIM: 611438) PREDICTED: beta-taxili ( 684) 4447 380.2 1.4e-104 NP_694967 (OMIM: 611438) beta-taxilin [Homo sapien ( 684) 4447 380.2 1.4e-104 XP_011533808 (OMIM: 611438) PREDICTED: beta-taxili ( 536) 3479 300.6 9.9e-81 NP_787048 (OMIM: 608676) alpha-taxilin [Homo sapie ( 546) 1506 138.5 6.3e-32 XP_016856051 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 546) 1506 138.5 6.3e-32 XP_016856052 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 579) 1445 133.5 2.1e-30 XP_016856050 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 579) 1445 133.5 2.1e-30 XP_016856053 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 371) 1398 129.6 2.2e-29 XP_016856054 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 371) 1398 129.6 2.2e-29 NP_060830 (OMIM: 300677) gamma-taxilin isoform 1 [ ( 528) 1372 127.5 1.3e-28 XP_011539233 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 386) 1302 121.7 5.3e-27 XP_011539234 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxil ( 386) 1302 121.7 5.3e-27 NP_001162154 (OMIM: 300677) gamma-taxilin isoform ( 396) 1204 113.6 1.4e-24 XP_016885120 (OMIM: 300677) PREDICTED: gamma-taxil ( 323) 933 91.3 6.1e-18 >>XP_011533807 (OMIM: 611438) PREDICTED: beta-taxilin is (684 aa) initn: 4447 init1: 4447 opt: 4447 Z-score: 1998.6 bits: 380.2 E(85289): 1.4e-104 Smith-Waterman score: 4447; 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100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (149-684:1-536) 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 PPTVKEPVSNKEQKLEKKILKGLGKEANLLMQNLNKLQTPEEKFDFLFKKYAELLDEHRT :::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MQNLNKLQTPEEKFDFLFKKYAELLDEHRT 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 EQKKLKLLQKKQVQIQKEKDQLQGEHSRAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEEALQRARE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EQKKLKLLQKKQVQIQKEKDQLQGEHSRAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEEALQRARE 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 EEEKRKEITSHFQSTLTDIQGQIEQQSERNMKLCQENTELAEKLKSIIDQYELREEHLDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EEEKRKEITSHFQSTLTDIQGQIEQQSERNMKLCQENTELAEKLKSIIDQYELREEHLDK 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 IFKHRELQQKLVDAKLEQAQEMMKEAEERHKREKEYLLNQAAEWKLQAKVLKEQETVLQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 IFKHRELQQKLVDAKLEQAQEMMKEAEERHKREKEYLLNQAAEWKLQAKVLKEQETVLQA 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 QLTLYSGRFEEFQSTLTKSNEVFATFKQEMDKTTKKMKKLEKDTATWKARFENCNKALLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QLTLYSGRFEEFQSTLTKSNEVFATFKQEMDKTTKKMKKLEKDTATWKARFENCNKALLD 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 MIEEKALRAKEYECFVMKIGRLENLCRALQEERNELHKKIRDAEISEKDDQSQHNSDEEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MIEEKALRAKEYECFVMKIGRLENLCRALQEERNELHKKIRDAEISEKDDQSQHNSDEEP 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 ESNVSVDQEIDAEEVNSVQTAVKNLATAFMIIHHPESTPHQSKETQPEIGSSQESADAAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ESNVSVDQEIDAEEVNSVQTAVKNLATAFMIIHHPESTPHQSKETQPEIGSSQESADAAL 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 KEPEQPPLIPSRDSESPLPPLTPQAEAEGGSDAEPPSKASNSPAGLGAETQCEGLPVGAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KEPEQPPLIPSRDSESPLPPLTPQAEAEGGSDAEPPSKASNSPAGLGAETQCEGLPVGAQ 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 pF1KE0 ADQASWKPEAEASGQAPQAPTEASLQKMEADVPAPACAAEEHVAAMVPACEPSRQPPRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ADQASWKPEAEASGQAPQAPTEASLQKMEADVPAPACAAEEHVAAMVPACEPSRQPPRAA 460 470 480 490 500 510 660 670 680 pF1KE0 AEELPVGASAGPQPRNVADTNLEGVD :::::::::::::::::::::::::: XP_011 AEELPVGASAGPQPRNVADTNLEGVD 520 530 >>NP_787048 (OMIM: 608676) alpha-taxilin [Homo sapiens] (546 aa) initn: 1568 init1: 1459 opt: 1506 Z-score: 694.1 bits: 138.5 E(85289): 6.3e-32 Smith-Waterman score: 1594; 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NP_787 MKNQDKKNGAAKQSNPKSSPGQPEAGPEGAQERPSQAAPAVEAEGPGSSQAPRKPEGAQ 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE0 ASVHP-----DISEELNRQLEDIINTY--GSAASTAGKEGSARASEQPENAESPDN---E : . :.::::.::::::..:: . . :..:. .::.::. . . NP_787 ARTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNNQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRTYVAR 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 DGDCEETTEEAGREPVASGEPPTVK----EPVSNKEQK--LEKKILKGLGKEANLLMQNL .:. : : :.. ..:.: : . . :...... ::: :::::: .::::.: NP_787 NGEPEPTPVVNGEKEPSKGDPNTEEIRQSDEVGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 NKLQTPEEKFDFLFKKYAELLDEHRTEQKKLKLLQKKQVQIQKEKDQLQGEHSRAILARS : :.:::::. : :::::::.:::. ::..::::::: :. .:::.:.::::.:.:::: NP_787 NTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARS 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 KLESLCRELQRHNKTLKEEALQRAREEEEKRKEITSHFQSTLTDIQGQIEQQSERNMKLC :::::::::::::..::::..::::::::::::.::::: ::.::: :.::..::: :: NP_787 KLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 QENTELAEKLKSIIDQYELREEHLDKIFKHRELQQKLVDAKLEQAQEMMKEAEERHKREK ::: ::::.::..:.::::::::.::.:::..:::.::::::.:::::.:::::::.::: NP_787 QENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREK 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 EYLLNQAAEWKLQAKVLKEQETVLQAQLTLYSGRFEEFQSTLTKSNEVFATFKQEMDKTT ..::..:.: . . ...:.::: :. ::.::. .:::::.::.::.:::.::::::.: : NP_787 DFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFKQEMEKMT 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 KKMKKLEKDTATWKARFENCNKALLDMIEEKALRAKEYECFVMKIGRLENLCRALQEERN ::.:::::.:. ...:.:. :::::.: :::..: :: : . .:: :::.:::::: ::: NP_787 KKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERN 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 ELHKKIRDAEISEKDDQSQHNSDEEPESNVSVDQEIDAEEVNSVQTAVKNLATAFMIIHH .:.:...: . . . .. . ...:: NP_787 DLNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPSTEASGQTGPQ 480 490 500 510 520 530 >>XP_016856051 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxilin i (546 aa) initn: 1568 init1: 1459 opt: 1506 Z-score: 694.1 bits: 138.5 E(85289): 6.3e-32 Smith-Waterman score: 1594; 52.6% identity (78.2% similar) in 504 aa overlap (4-479:3-506) 10 20 30 40 pF1KE0 MEANHSEQLSAERQSTP---PGDSSSLP---------SHNGLEKEDGQDSPTPVQPPEKE :.... .: .::.: ::. . : . ..: : .: .: .: . XP_016 MKNQDKKNGAAKQSNPKSSPGQPEAGPEGAQERPSQAAPAVEAEGPGSSQAPRKPEGAQ 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE0 ASVHP-----DISEELNRQLEDIINTY--GSAASTAGKEGSARASEQPENAESPDN---E : . :.::::.::::::..:: . . :..:. .::.::. . . XP_016 ARTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNNQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRTYVAR 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 DGDCEETTEEAGREPVASGEPPTVK----EPVSNKEQK--LEKKILKGLGKEANLLMQNL .:. : : :.. ..:.: : . . :...... ::: :::::: .::::.: XP_016 NGEPEPTPVVNGEKEPSKGDPNTEEIRQSDEVGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 NKLQTPEEKFDFLFKKYAELLDEHRTEQKKLKLLQKKQVQIQKEKDQLQGEHSRAILARS : :.:::::. : :::::::.:::. ::..::::::: :. .:::.:.::::.:.:::: XP_016 NTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARS 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 KLESLCRELQRHNKTLKEEALQRAREEEEKRKEITSHFQSTLTDIQGQIEQQSERNMKLC :::::::::::::..::::..::::::::::::.::::: ::.::: :.::..::: :: XP_016 KLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 QENTELAEKLKSIIDQYELREEHLDKIFKHRELQQKLVDAKLEQAQEMMKEAEERHKREK ::: ::::.::..:.::::::::.::.:::..:::.::::::.:::::.:::::::.::: XP_016 QENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREK 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 EYLLNQAAEWKLQAKVLKEQETVLQAQLTLYSGRFEEFQSTLTKSNEVFATFKQEMDKTT ..::..:.: . . ...:.::: :. ::.::. .:::::.::.::.:::.::::::.: : XP_016 DFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFKQEMEKMT 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 KKMKKLEKDTATWKARFENCNKALLDMIEEKALRAKEYECFVMKIGRLENLCRALQEERN ::.:::::.:. ...:.:. :::::.: :::..: :: : . .:: :::.:::::: ::: XP_016 KKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERN 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 ELHKKIRDAEISEKDDQSQHNSDEEPESNVSVDQEIDAEEVNSVQTAVKNLATAFMIIHH .:.:...: . . . .. . ...:: XP_016 DLNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPSTEASGQTGPQ 480 490 500 510 520 530 >>XP_016856052 (OMIM: 608676) PREDICTED: alpha-taxilin i (579 aa) initn: 1536 init1: 1427 opt: 1445 Z-score: 666.7 bits: 133.5 E(85289): 2.1e-30 Smith-Waterman score: 1507; 51.2% identity (74.9% similar) in 506 aa overlap (25-479:34-539) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEANHSEQLSAERQSTPPGDSSSLPSHNG--LEKEDGQDSPTPVQPPEKEASVH ::. . .: : .: .: .: .: . 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