Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0294, 314 aa
1>>>pF1KE0294 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6579+/-0.00125; mu= 13.8590+/- 0.073
mean_var=158.8804+/-56.720, 0's: 0 Z-trim(100.8): 367 B-trim: 363 in 1/46
Lambda= 0.101751
statistics sampled from 5835 (6259) to 5835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 2020 309.5 2.1e-84
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1221 192.3 4.5e-49
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1094 173.6 1.8e-43
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1086 172.4 4e-43
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1082 171.8 6.1e-43
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1073 170.5 1.5e-42
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1055 167.9 9.4e-42
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 1012 161.6 7.5e-40
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1008 161.0 1.1e-39
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1008 161.0 1.1e-39
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 1001 159.9 2.3e-39
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 985 157.6 1.2e-38
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 972 155.7 4.5e-38
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 964 154.5 9.9e-38
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 964 154.5 1e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 961 154.1 1.4e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 955 153.2 2.5e-37
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 946 151.9 6.2e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 942 151.3 9.3e-37
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 941 151.1 1e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 941 151.2 1.1e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 939 150.9 1.3e-36
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 932 149.8 2.6e-36
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 932 149.8 2.6e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 930 149.5 3.1e-36
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 929 149.4 3.5e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 929 149.5 3.8e-36
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 922 148.3 7e-36
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 919 147.9 1e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 915 147.3 1.5e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 911 146.7 2.2e-35
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 911 146.7 2.2e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 907 146.1 3.2e-35
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 907 146.1 3.3e-35
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 906 146.0 3.6e-35
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 903 145.6 5e-35
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 899 145.0 7.5e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 895 144.5 1.2e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 894 144.2 1.2e-34
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 893 144.1 1.4e-34
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 891 143.8 1.7e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 891 143.8 1.7e-34
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 891 143.8 1.8e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 889 143.5 2e-34
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 888 143.3 2.3e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 887 143.2 2.5e-34
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 886 143.0 2.8e-34
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 886 143.1 2.8e-34
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 886 143.1 2.8e-34
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 886 143.1 2.9e-34
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 2020 init1: 2020 opt: 2020 Z-score: 1628.6 bits: 309.5 E(32554): 2.1e-84
Smith-Waterman score: 2020; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGKKAFVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGKKAFVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKTA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LKRVLGMPVATKMS
::::::::::::::
CCDS30 LKRVLGMPVATKMS
310
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 897 init1: 878 opt: 1221 Z-score: 994.4 bits: 192.3 E(32554): 4.5e-49
Smith-Waterman score: 1221; 59.9% identity (85.7% similar) in 307 aa overlap (8-313:27-333)
10 20 30 40
pF1KE0 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILV
:.::.:.:.:::::::.:: :::.::.:::.::
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ANVTIMAVIRFSWTLHTPMYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQ
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CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LFFFLGFACTNCLLIAVMGYDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVAT
.::::::: :::::..:::::::.::::::.: ... .. .: . . ::. .:...
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NLICDMRFCGPNRVNHYFCDMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGF
::. .. ::. :.:::::::.. :: ::::.: :.:...: ..::..::::.: .::
CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 IVNTILKIPSAEGK-KAFVTCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTV
:. ::::::::::. ::: ::::::.::.:::::::.::::: .. .:.::.::.::::.
CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 VTPLLNPLVYSLRNKEVKTALKRVLGMPVATKMS
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CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1109 init1: 755 opt: 1094 Z-score: 894.0 bits: 173.6 E(32554): 1.8e-43
Smith-Waterman score: 1094; 54.2% identity (81.0% similar) in 310 aa overlap (3-306:2-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
: ...: .:...:::: ::::::::..:: :::. :..:: :. .::.. :::::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPM
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
: :: .:::::.:::. :::..: : . ..::...::.:.:: ..:::::.:.:.::
CCDS30 YLFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMG
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pF1KE0 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
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CCDS30 FDRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFC
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190 200 210 220 230
pF1KE0 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEG-KKAFV
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CCDS30 DTPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
:::::::::..::::::..:::::.. . ..:::.:.:::::::::::.::::::. ..:
CCDS30 TCASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRNRAIQT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALK-----RVLGMPVATKMS
::. :.::
CCDS30 ALRNAFRGRLLGKG
300 310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1123 init1: 769 opt: 1086 Z-score: 887.6 bits: 172.4 E(32554): 4e-43
Smith-Waterman score: 1086; 53.1% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
:. ::: :: .:...:::::..:: ::::::::::: : .:. :...: .. .:::::
CCDS30 MEQVNKT-VVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
: :: ::: :: ::::::.:..:: :::. :::::..:: :.: :: :. .. .:.:.::
CCDS30 YFFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
::::.:::.::::...... . . :.. . : :: ..::.:.:. . : . :...:.::
CCDS30 YDRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGK-KAFV
:..::.::: . ..:..: :.......:.::::.:: :...::::::. :. :.:
CCDS30 DISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
:::::: :: :::.:::.::::::.. .:..: :..:.::..:::.::..::::::: :.
CCDS30 TCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKS
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALKRVLGMPVATKMS
::.:..:
CCDS30 ALRRTIGQTFYPLS
300 310
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1004 init1: 806 opt: 1082 Z-score: 884.4 bits: 171.8 E(32554): 6.1e-43
Smith-Waterman score: 1082; 53.7% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (8-306:18-316)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVI
:..:.:.. ::::. : :. :: .:: ::. :..:. :...:
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RFSWTLHTPMYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFAC
:.. :::::: :: .:: ::. ::.::.:..: :.. .. ::. .::::.:::. :.
CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TNCLLIAVMGYDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFC
:::.:...::::::::::.:::: .:.:::: ..:. . . :...:.. .. . . ::
CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GPNRVNHYFCDMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIP
. .: :.:::. ::.::.: :: :.:. . .:.::..::. :..::: .:..:::::
CCDS11 A-RKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 SAEG-KKAFVTCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLV
:.:: ::::.:::::::::.:::.:::: ::.:::... ..:::..:::::.::::::.:
CCDS11 SVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVV
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE0 YSLRNKEVKTALKRVLGMPVATKMS
:.::::::: :: :..:
CCDS11 YTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1099 init1: 766 opt: 1073 Z-score: 877.3 bits: 170.5 E(32554): 1.5e-42
Smith-Waterman score: 1073; 52.5% identity (82.3% similar) in 299 aa overlap (8-305:7-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
::: . :..:::::..:: ::::::::::: : .:. :...: .. .:: ::
CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPM
10 20 30 40 50
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CCDS30 ALCKIVRRTISLL
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CCDS30 YFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMG
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CCDS30 DIYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFA
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CCDS30 TCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKD
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CCDS30 ALCRVVGRNIS
300
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CCDS12 HVPPLLKLACGN-NVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKA
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CCDS12 FSTCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKEL
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CCDS12 KVAMKRTFLSTLYSSGT
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CCDS12 YLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
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