FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0289, 312 aa
1>>>pF1KE0289 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3013+/-0.00148; mu= 9.5654+/- 0.085
mean_var=121.8988+/-40.808, 0's: 0 Z-trim(99.4): 371 B-trim: 638 in 2/45
Lambda= 0.116165
statistics sampled from 5283 (5720) to 5283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.492), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1981 344.2 7.5e-95
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CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1078 192.9 2.7e-49
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1076 192.6 3.4e-49
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1072 191.9 5.4e-49
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1056 189.2 3.4e-48
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1053 188.8 5.2e-48
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CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1037 186.0 3.2e-47
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CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1035 185.7 4e-47
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1033 185.4 5e-47
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1020 183.2 2.3e-46
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1017 182.7 3.3e-46
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1012 181.8 5.7e-46
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1000 179.8 2.3e-45
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CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 997 179.4 3.6e-45
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CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 993 178.7 5.2e-45
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CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 991 178.3 6.8e-45
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CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 982 176.9 2.1e-44
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CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 980 176.5 2.4e-44
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 975 175.6 4.2e-44
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CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 969 174.6 8.5e-44
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 968 174.5 9.5e-44
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 968 174.5 9.5e-44
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 966 174.2 1.2e-43
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 965 174.0 1.3e-43
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 965 174.0 1.4e-43
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CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 963 173.6 1.7e-43
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 960 173.1 2.4e-43
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 958 172.8 3.1e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 953 172.0 5.4e-43
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 948 171.1 9.8e-43
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 948 171.1 9.8e-43
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 946 170.8 1.3e-42
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 944 170.4 1.5e-42
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 944 170.5 1.6e-42
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 941 170.0 2.3e-42
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 940 169.8 2.5e-42
>>CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1981 init1: 1981 opt: 1981 Z-score: 1816.4 bits: 344.2 E(32554): 7.5e-95
Smith-Waterman score: 1981; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 VKRAIEMKHFLC
::::::::::::
CCDS31 VKRAIEMKHFLC
310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1100 init1: 1067 opt: 1081 Z-score: 1001.1 bits: 193.4 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 1081; 55.4% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (5-311:11-316)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSK
: : ::::.::::.:. .:..:::..::.:: ... :::::.::.:
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LHTPMYFLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFL
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LSVMAYDRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAV
:..::::::.:: .:::: : .: : : :.. :...: :. ::: ::::: : .
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SHFFCDIPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGR
.::.:: : ::::::::: .: .....::. :... . :.:::. : .: :.. : ::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QQAFSTCASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRN
..:::::::.: :::::.::..: :..:.:.: .::.::::.:::. ::.:: ::.::.:
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 KDVKEAVKRAIEMKHFLC
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CCDS31 KDVKKALKK-ILWKHIL
310
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1077 init1: 1077 opt: 1078 Z-score: 998.6 bits: 192.9 E(32554): 2.7e-49
Smith-Waterman score: 1078; 54.7% identity (80.6% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMY
:: : : .:::::.::::: ::: :::.:: :: .:.. :::.::::. ..:.::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAY
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CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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pF1KE0 DRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCD
:::::: .:::: :.:. :..::. . ... .:.::: :::.:. : :.::.::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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pF1KE0 IPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFST
::.:.:::: ...: ... .:.. ....: :..::.:: : ::.::: :::.::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
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pF1KE0 CASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVKEA
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 VKRAIEMKHFLC
.:. : :.
CCDS41 LKKIIINKN
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1107 init1: 1053 opt: 1076 Z-score: 996.7 bits: 192.6 E(32554): 3.4e-49
Smith-Waterman score: 1076; 55.7% identity (80.7% similar) in 300 aa overlap (4-303:4-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMY
.: . .:.:.:::.:.. :.:..::.:::..: :.. :::::.::.. .::::::
CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAY
:.:: ::: : :::.: .:::::.::. . .: : .: .: : : .: .: .::::::.
CCDS31 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCD
::: ::..:::::: ::.: : :.:: .. ::...::: :: :: : ..:::::
CCDS31 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFST
:: :: :: :::..:::.:.: : : ..:. :.::: .: .. :.:::: :: .:.::
CCDS31 IPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVKEA
:.:::.::.:: :::.: :..:::.: ..:.:..:.:::: .:::: ::.::::::::::
CCDS31 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 VKRAIEMKHFLC
.:.
CCDS31 LKKLKNKILF
310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1049 init1: 1049 opt: 1072 Z-score: 993.0 bits: 191.9 E(32554): 5.4e-49
Smith-Waterman score: 1072; 53.3% identity (80.7% similar) in 306 aa overlap (3-308:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTP
: :.:.::::::::. . ::. :::..::..::: :. :.:..:::.: .:.::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYFLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVM
:::.:: ::::: :: : :.::::::.: . .::. .: .: : .: ::.:.:..:
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFF
:::::::: .::::::.:: :..:.. :..:: ...:.:: :..: :...:::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDIPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAF
::.: ::::::.::..:: :: :... . . :. .::::.:: .. :.:.: :::...:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVK
::::::::.:::. :::.: : .:: : . .:..:.:::. ::.:: ::.::::::::
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 EAVKRAIEMKHFLC
.:...... :
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1045 init1: 1022 opt: 1056 Z-score: 978.6 bits: 189.2 E(32554): 3.4e-48
Smith-Waterman score: 1056; 52.5% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMY
:. .:......:.: :::..:::. ::..:: ::..:.. :::::::: .. ::::::
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAY
..:: ::::: ::::.:.::::::.: : :: .: :::: . : ::...::.::..:::
CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCD
:::::: :::::.. ::. : :: .... :....: :: .. .::::. . ..:.:::
CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFST
. ::.::::.: .:::::. ..: ... :.: .:: :: .. :.:.:. ::..::.:
CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVKEA
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CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
250 260 270 280 290 300
310
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.....
CCDS31 LRKVLVGK
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10 20 30
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CCDS31 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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CCDS31 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
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CCDS31 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
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CCDS31 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
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CCDS31 LISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDIIV
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280 290 300 310
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CCDS31 SIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
310 320 330 340
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10 20 30 40 50
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..: : : : : :::..:. ::.. ::.:::.:: .:.: :.:.:..:.:. :::::
CCDS31 MLLTDRN-TSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
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CCDS31 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
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::::.::: .:::::: ::.. :: ::.::. :. .: : : .: : .:...:::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
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:.. :::.:::::: .:. ::. .. ..:.: :. :: ::. . :...:.:::..::
CCDS31 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
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CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE0 EAVKRAIEMKHFLC
..: . .. : :
CCDS31 DTVTEILDTKVFSY
300 310
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CCDS35 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
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CCDS35 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
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CCDS35 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
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310 320
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CCDS31 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
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CCDS31 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
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CCDS31 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
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CCDS31 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
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