FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0277, 321 aa
1>>>pF1KE0277 321 - 321 aa - 321 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0399+/-0.000525; mu= 18.0087+/- 0.033
mean_var=129.9444+/-36.207, 0's: 0 Z-trim(107.9): 272 B-trim: 1018 in 1/49
Lambda= 0.112511
statistics sampled from 15558 (15954) to 15558 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 5.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 1009 176.0 8.9e-44
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 1005 175.4 1.4e-43
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 545 100.7 4.2e-21
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 540 99.9 7.3e-21
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 526 97.6 3.5e-20
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 526 97.6 3.5e-20
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 526 97.6 3.5e-20
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 525 97.5 3.9e-20
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 523 97.2 5e-20
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 522 97.0 5.5e-20
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 522 97.0 5.5e-20
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 518 96.3 8.6e-20
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 507 94.5 3e-19
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 503 93.9 4.7e-19
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 498 93.1 8.2e-19
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 496 92.7 1e-18
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 495 92.6 1.1e-18
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 485 91.0 3.5e-18
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 478 89.9 8e-18
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 476 89.5 9.8e-18
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 454 85.9 1.1e-16
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 453 85.8 1.3e-16
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 243 51.7 2.4e-06
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 201 44.9 0.00028
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 200 44.8 0.00033
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 200 44.8 0.00033
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 198 44.4 0.00039
XP_016864712 (OMIM: 600933) PREDICTED: proteinase- ( 383) 198 44.5 0.00042
NP_005233 (OMIM: 600933) proteinase-activated rece ( 397) 198 44.5 0.00043
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 198 44.6 0.00044
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 43.7 0.00077
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 43.7 0.00077
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 193 43.7 0.00077
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 43.7 0.00077
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 43.7 0.00077
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 191 43.3 0.00086
NP_003605 (OMIM: 603692) galanin receptor type 3 [ ( 368) 189 43.0 0.0011
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 186 42.5 0.0015
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 181 41.8 0.003
NP_036284 (OMIM: 605106) lysophosphatidic acid rec ( 353) 180 41.5 0.003
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 180 41.7 0.0035
NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 180 41.7 0.0035
NP_001307846 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholi ( 532) 178 41.5 0.0048
NP_036257 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine ( 532) 178 41.5 0.0048
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 168 38.9 0.0062
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 171 40.0 0.0076
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 171 40.0 0.0076
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 171 40.0 0.0076
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 171 40.1 0.0083
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 171 40.1 0.0083
>>NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [Homo (320 aa)
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10 20 30 40 50 60
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NP_110 ERSLHAPMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIE
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NP_110 STILLAMAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHS
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NP_110 SERAKAFGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPII
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310 320
pF1KE0 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
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NP_110 YGAKTKQIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
300 310 320
>>NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [Homo (318 aa)
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Smith-Waterman score: 1005; 45.5% identity (79.0% similar) in 310 aa overlap (7-316:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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NP_689 EHSLHEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGME
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pF1KE0 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
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NP_689 STVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRS
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NP_689 NILSHSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TR
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pF1KE0 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
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NP_689 EAQAKAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIV
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310 320
pF1KE0 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
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NP_689 YGVKTKEIRQRILRLFHVATHASEP
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 545; 32.3% identity (62.7% similar) in 300 aa overlap (19-316:10-306)
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NP_835 TNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPS
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pF1KE0 QEERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGK-HLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNP
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NP_835 AKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYI---SSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNP
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NP_835 IIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
290 300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 540; 31.4% identity (64.4% similar) in 303 aa overlap (16-316:7-304)
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pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISS
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pF1KE0 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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NP_002 DSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALD
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pF1KE0 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSR-IIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCH
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NP_002 SRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQIN-HTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIP
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NP_002 SVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYG---TLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNP
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NP_002 FIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRL
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pF1KE0 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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NP_036 DSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIE
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NP_036 FVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSG----FISSPVQTAITFQLP
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NP_036 MCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILK
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pF1KE0 VASQEERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSP--VAHVLIGNIYILFPP
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NP_036 IQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCY-GVAIFTYIQ---PHSSPSVLQEKLFSVFYAILTP
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NP_036 MLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 526; 30.9% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (19-316:10-305)
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pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRL
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pF1KE0 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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XP_011 DSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLT--IIGRSFFFITPPIICLKFFN--
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XP_011 FVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSG----FISSPVQTAITFQLP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YCHFHILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLA
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XP_011 MCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VASQEERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSP--VAHVLIGNIYILFPP
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XP_011 IQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCY-GVAIFTYIQ---PHSSPSVLQEKLFSVFYAILTP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 LMNPIIYSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
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XP_011 MLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 468 init1: 414 opt: 526 Z-score: 483.2 bits: 97.6 E(85289): 3.5e-20
Smith-Waterman score: 526; 30.9% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (19-316:10-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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XP_011 DSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLT--IIGRSFFFITPPIICLKFFN--
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XP_011 FVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSG----FISSPVQTAITFQLP
120 130 140 150 160
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pF1KE0 YCHFHILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLA
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XP_011 MCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VASQEERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSP--VAHVLIGNIYILFPP
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XP_011 IQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCY-GVAIFTYIQ---PHSSPSVLQEKLFSVFYAILTP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 LMNPIIYSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
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XP_011 MLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 511 init1: 417 opt: 525 Z-score: 482.4 bits: 97.5 E(85289): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 525; 31.8% identity (63.2% similar) in 296 aa overlap (19-308:12-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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NP_006 DPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIK-IGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCH
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NP_006 SFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAF-ILKYCD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FHILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFN-----SYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSV
....: :: ::.:.:.: .: .: . . .::. :.:..::..:: ::
NP_006 KNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICF-----IIIIISYFFILLSV
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pF1KE0 LAVASQEERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPP
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NP_006 LKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTL--LFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIP
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 LMNPIIYSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
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NP_006 VLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 514 init1: 456 opt: 523 Z-score: 480.5 bits: 97.2 E(85289): 5e-20
Smith-Waterman score: 523; 30.8% identity (63.2% similar) in 302 aa overlap (13-308:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSS----FLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLH
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
10 20 30 40 50
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pF1KE0 VIWTEPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGL
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XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 SFMESSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNS--RIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKF
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XP_011 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVAN--LNVLLHTLLMAP
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 FNYCHFHILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSV
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XP_011 LSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LAVASQEERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPP
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XP_011 LKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAV-YFNPLSSH-SAEKDTMATVLYTVVTP
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 LMNPIIYSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
..::.:::.... .
XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 514 init1: 456 opt: 522 Z-score: 479.8 bits: 97.0 E(85289): 5.5e-20
Smith-Waterman score: 522; 30.8% identity (63.4% similar) in 295 aa overlap (16-308:7-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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NP_036 DSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMD
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNS--RIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYC
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NP_036 NFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVAN--LNVLLHTLLMAPLSFC
120 130 140 150 160
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pF1KE0 HFHILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVA
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NP_036 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]