FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0264, 415 aa
1>>>pF1KE0264 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6448+/-0.000821; mu= 14.8767+/- 0.049
mean_var=67.0688+/-13.478, 0's: 0 Z-trim(107.1): 89 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156608
statistics sampled from 9284 (9376) to 9284 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3127.1 PCOLCE2 gene_id:26577|Hs108|chr3 ( 415) 2848 652.4 2.2e-187
CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 ( 449) 1034 242.6 5.6e-64
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 514 125.2 1.7e-28
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 514 125.2 1.8e-28
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 514 125.2 2.4e-28
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 514 125.2 2.5e-28
CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 ( 449) 494 120.6 3e-27
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 411 101.9 1.6e-21
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 384 96.1 5.8e-19
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 318 80.9 4.3e-15
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 317 80.7 6.6e-15
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 311 79.4 1.7e-14
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 307 78.5 3.2e-14
CCDS2193.1 TNFAIP6 gene_id:7130|Hs108|chr2 ( 277) 293 75.1 9.2e-14
CCDS8421.1 MFRP gene_id:83552|Hs108|chr11 ( 579) 291 74.8 2.4e-13
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 283 73.3 4.1e-12
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 283 73.3 4.3e-12
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 270 70.0 6.2e-12
CCDS44491.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (1785) 276 71.6 6.9e-12
CCDS44492.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2403) 276 71.6 8.9e-12
CCDS44490.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2413) 276 71.6 8.9e-12
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 270 70.1 9.6e-12
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 270 70.1 9.6e-12
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 270 70.1 9.7e-12
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 270 70.1 9.8e-12
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 270 70.1 9.9e-12
>>CCDS3127.1 PCOLCE2 gene_id:26577|Hs108|chr3 (415 aa)
initn: 2848 init1: 2848 opt: 2848 Z-score: 3477.6 bits: 652.4 E(32554): 2.2e-187
Smith-Waterman score: 2848; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQRIGRFCGTFRPGALVSSGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQRIGRFCGTFRPGALVSSGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAGVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAGVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPPAPIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPPAPIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQQK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 CRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQAGKNMSARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQAGKNMSARL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE0 TVVCKQCPLLRRGLNYIIMGQVGEDGRGKIMPNSFIMMFKTKNQKLLDALKNKQC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVVCKQCPLLRRGLNYIIMGQVGEDGRGKIMPNSFIMMFKTKNQKLLDALKNKQC
370 380 390 400 410
>>CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 (449 aa)
initn: 1324 init1: 711 opt: 1034 Z-score: 1262.0 bits: 242.6 E(32554): 5.6e-64
Smith-Waterman score: 1328; 44.5% identity (71.6% similar) in 436 aa overlap (4-415:7-437)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPE--RPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPP
:. .:: : : ... :.:. :::: ::: . ::::...:::::..:::
CCDS57 MLPAATASLLGPL-LTACALLPFAQGQTPNYTRPVFLCGGDVKGESGYVASEGFPNLYPP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NSKCTWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHA-NGQRIGRFCGTFRPGA
:..: : ::::::..: :.:: .::: :::: ..:. : . .:::.:::::::::.
CCDS57 NKECIWTITVPEGQTVSLSFRVFDLELHPACRYDALEVFAGSGTSGQRLGRFCGTFRPAP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRD
::. ::.. ..: .: .:.: ::. .:. . :.::: :.. .:.. :::::. :
CCDS57 LVAPGNQVTLRMTTDEGTGGRGFLLWYSGRATSGTEHQFCGGRLEKAQGTLTTPNWPESD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDS
:: :..: :::.:: .:.: : :::::.: :.::::: :.::::. .:.::.::.:::.
CCDS57 YPPGISCSWHIIAPPDQVIALTFEKFDLEPDTYCRYDSVSVFNGAVSDDSRRLGKFCGDA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KE0 PPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPK-------------------KLPTT
:. : :: ::::.::.::::.::::: . : :. :::
CCDS57 VPGSISSEGNELLVQFVSDLSVTADGFSASYKTLPRGTAKEGQGPGPKRGTEPKVKLPPK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 TEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDG-SLHA
.. : : .. :: : ..:::::::..:.:.:..:...:: . . . : .: .
CCDS57 SQPPEKTEESPSAPDAPT---CPKQCRRTGTLQSNFCASSLVVTATVKSMVREPGEGLAV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 TVSIINIYKEGNLAIQQAGKNMSARLTVVCKQCPLLRRGLNYIIMGQVGEDGRGKIMP-N
:::.:. :: :.: . . . : .. : ::::: ...:..:..:::: :..:: ..: .
CCDS57 TVSLIGAYKTGGLDLPSPPTGASLKFYVPCKQCPPMKKGVSYLLMGQV-EENRGPVLPPE
360 370 380 390 400 410
400 410
pF1KE0 SFIMMFKTKNQKLLDALKNKQC
::... . .....: :....:
CCDS57 SFVVLHRPNQDQILTNLSKRKCPSQPVRAAASQD
420 430 440
>>CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (609 aa)
initn: 317 init1: 129 opt: 514 Z-score: 625.0 bits: 125.2 E(32554): 1.7e-28
Smith-Waterman score: 514; 35.4% identity (64.6% similar) in 243 aa overlap (33-265:27-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGES-GFIGSEGFPGVYPPNSKCTW
:: . :: :.. : :.: : :. :: :
CCDS31 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 KITVPEG-KVVVLNFR-FIDLESDNLCRYDFVDVYNG-HANGQRIGRFCGTFRPGALVSS
: .:. . ...:: .::: : :.::.:.:..: . ::. :.::: . : .:::
CCDS31 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLE-DRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
: ......:: .: : :: . : .:: . :. ::: .:.:..:.. :: .
CCDS31 GPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRY---EIFKRGPE-CSQNYTTPSGVIKSPGFPEK-YPNS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDN------YCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCG
. :.. . .:: . : :.::.::.: :. .:::: . ...: . . .::.:::
CCDS31 LECTYIVFVPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFP-DVGPHIGRYCG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKP
.. :. : : . : . : .: ... .:: ..:
CCDS31 QKTPGRIRSSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQA
CCDS31 QITASSQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKET
290 300 310 320 330 340
>>CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (644 aa)
initn: 317 init1: 129 opt: 514 Z-score: 624.6 bits: 125.2 E(32554): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 514; 35.4% identity (64.6% similar) in 243 aa overlap (33-265:27-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGES-GFIGSEGFPGVYPPNSKCTW
:: . :: :.. : :.: : :. :: :
CCDS31 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 KITVPEG-KVVVLNFR-FIDLESDNLCRYDFVDVYNG-HANGQRIGRFCGTFRPGALVSS
: .:. . ...:: .::: : :.::.:.:..: . ::. :.::: . : .:::
CCDS31 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLE-DRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
: ......:: .: : :: . : .:: . :. ::: .:.:..:.. :: .
CCDS31 GPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRY---EIFKRGPE-CSQNYTTPSGVIKSPGFPEK-YPNS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDN------YCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCG
. :.. . .:: . : :.::.::.: :. .:::: . ...: . . .::.:::
CCDS31 LECTYIVFVPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFP-DVGPHIGRYCG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKP
.. :. : : . : . : .: ... .:: ..:
CCDS31 QKTPGRIRSSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQA
CCDS31 QITASSQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKET
290 300 310 320 330 340
>>CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (906 aa)
initn: 317 init1: 129 opt: 514 Z-score: 622.2 bits: 125.2 E(32554): 2.4e-28
Smith-Waterman score: 514; 35.4% identity (64.6% similar) in 243 aa overlap (33-265:27-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGES-GFIGSEGFPGVYPPNSKCTW
:: . :: :.. : :.: : :. :: :
CCDS81 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 KITVPEG-KVVVLNFR-FIDLESDNLCRYDFVDVYNG-HANGQRIGRFCGTFRPGALVSS
: .:. . ...:: .::: : :.::.:.:..: . ::. :.::: . : .:::
CCDS81 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLE-DRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
: ......:: .: : :: . : .:: . :. ::: .:.:..:.. :: .
CCDS81 GPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRY---EIFKRGPE-CSQNYTTPSGVIKSPGFPEK-YPNS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDN------YCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCG
. :.. . .:: . : :.::.::.: :. .:::: . ...: . . .::.:::
CCDS81 LECTYIVFVPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFP-DVGPHIGRYCG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKP
.. :. : : . : . : .: ... .:: ..:
CCDS81 QKTPGRIRSSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQA
CCDS81 QITASSQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKET
290 300 310 320 330 340
>>CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (923 aa)
initn: 317 init1: 129 opt: 514 Z-score: 622.1 bits: 125.2 E(32554): 2.5e-28
Smith-Waterman score: 514; 35.4% identity (64.6% similar) in 243 aa overlap (33-265:27-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGES-GFIGSEGFPGVYPPNSKCTW
:: . :: :.. : :.: : :. :: :
CCDS71 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 KITVPEG-KVVVLNFR-FIDLESDNLCRYDFVDVYNG-HANGQRIGRFCGTFRPGALVSS
: .:. . ...:: .::: : :.::.:.:..: . ::. :.::: . : .:::
CCDS71 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLE-DRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
: ......:: .: : :: . : .:: . :. ::: .:.:..:.. :: .
CCDS71 GPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRY---EIFKRGPE-CSQNYTTPSGVIKSPGFPEK-YPNS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDN------YCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCG
. :.. . .:: . : :.::.::.: :. .:::: . ...: . . .::.:::
CCDS71 LECTYIVFVPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFP-DVGPHIGRYCG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKP
.. :. : : . : . : .: ... .:: ..:
CCDS71 QKTPGRIRSSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQA
CCDS71 QITASSQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKET
290 300 310 320 330 340
>>CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 (449 aa)
initn: 535 init1: 258 opt: 494 Z-score: 602.7 bits: 120.6 E(32554): 3e-27
Smith-Waterman score: 568; 37.2% identity (62.8% similar) in 261 aa overlap (7-265:5-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCT
:. :::::.: :. :::.:.. :: ..: .:: .:: :..:.
CCDS58 MLAEWGA-CLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 WKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHA--NGQRIGRFCGTFRPGALVSS
: :.: ::. :.:.:. .::: . : .::...::: . .:. .::::: : ..::
CCDS58 WLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
. : : . :: ..:..:: : .. . :::.: :: . .:..:. .:: .
CCDS58 WHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQK--------DVCGGVLTGLSGVLTSPEYPN-NYPNS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPPAP
. : : : : ..: : :.:: .. : ::::::..: : .:::.. :
CCDS58 MECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP---GPTRGHHYCGSTRPPT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQ
.:: .:: . : ::... . :: ..:
CCDS58 LVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHW
230 240 250 260 270 280
>>CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 (565 aa)
initn: 357 init1: 201 opt: 411 Z-score: 499.7 bits: 101.9 E(32554): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 414; 30.3% identity (64.1% similar) in 251 aa overlap (21-270:307-545)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFP
:: :. :.. :. :. : :..
CCDS73 DQGSPGIFTDISKVLPWIHEHIQTGNRRKSSRAWCSEQDVIVSGA--EGKLHF--PESLH
280 290 300 310 320 330
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GVYPPNSKCTWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQRIGRFCGTF
: ...:.: . ::: :.:.: .:.:: :.......:. . . ::.:::
CCDS73 LYYESKQRCVWTLLVPEEMHVLLSFSHLDVES---CHHSYLSMYS--LEDRPIGKFCGES
340 350 360 370 380
120 130 140 150 160
pF1KE0 RPGALVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGL-LDRPSGSFKTPN
:.... ..:.. ....:::. . :: ..: .:: :. :. : . : ... :
CCDS73 LPSSILIGSNSLRLKFVSDATDNAAGFNLTYKALKPNYIPDSGCSYLTVLFEEGLIQSLN
390 400 410 420 430 440
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 WPDRDYPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGK
.:. .: ..: : . : :..::.:.:.....:... : :::.: . .:. ..:..
CCDS73 YPE-NYSDKANCDWIFQASKHHLIKLSFQSLEIEESGDCTSDYVTVHS--DVERKKEIAR
450 460 470 480 490 500
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 YCGDSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTG
:: . :.:..: . .::.: :: . : :: . : ::
CCDS73 LCGYDVPTPVLSPSSIMLISFQSDENGTCRGFQATVSFIPKAVYPDLNISISEDESMFLE
510 520 530 540 550 560
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LKPTVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAI
CCDS73 T
>>CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623 aa)
initn: 645 init1: 242 opt: 384 Z-score: 453.9 bits: 96.1 E(32554): 5.8e-19
Smith-Waterman score: 461; 32.1% identity (62.8% similar) in 234 aa overlap (30-262:1735-1957)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKC
: .::: . :...: :.: .:::: .:
CCDS71 ITSFSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVTASVSACGGTFYMAEGIFNSPGYPDIYPPNVEC
1710 1720 1730 1740 1750 1760
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQRIGRFCGTFRPGALVS-S
.:.:. :. . :.: ..::... : :::.. .:.:.:. .::.::. : :
CCDS71 VWNIVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCSRDFVEIREGNATGHLVGRYCGNSFPLNYSSIV
1770 1780 1790 1800 1810 1820
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
:. . :..:::.. .:.::.: : : :. : :. .: ::. .:: .
CCDS71 GHTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGN---DNIVG-----THGKVASPFWPE-NYPHN
1830 1840 1850 1860 1870
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPPAP
. : . . ..... .. ..:.:. . : :: . ...: .. :: :: ::: .
CCDS71 SNYQWTVNVNASHVVHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSIH-ARLIGAYCG-TQTES
1880 1890 1900 1910 1920 1930
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQ
. : : : ..: :: :... ::.
CCDS71 FSSTGNSLTFHFYSDSSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGDAPVFLFS
1940 1950 1960 1970 1980 1990
>--
initn: 363 init1: 172 opt: 455 Z-score: 540.6 bits: 112.1 E(32554): 8.6e-24
Smith-Waterman score: 455; 30.2% identity (64.0% similar) in 242 aa overlap (31-268:2686-2919)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFT-CGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKC
:: :::: :.:: : : ..:..: ..:
CCDS71 LPLVIPYSQVWIHFVTNERVEHIGFHAKYSFTDCGGIQIGDSGVITSPNYPNAYDSLTHC
2660 2670 2680 2690 2700 2710
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHA-NGQRIGRFCGTFRPGALVSS
. . .:.:....:.: .:.: . : .: : : :: . .. ::..::. : .. :.
CCDS71 SSLLEAPQGHTITLTFSDFDIEPHTTCAWDSVTVRNGGSPESPIIGQYCGNSNPRTIQSG
2720 2730 2740 2750 2760 2770
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG
.:...: . :: . :.::.: ... . : :::.. .:....:.:: ...: .
CCDS71 SNQLVVTFNSDHSLQGGGFYATWNT---QTLG---CGGIFHSDNGTIRSPHWP-QNFPEN
2780 2790 2800 2810 2820
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEK-FDVER-DNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPP
: : .. :.. .:..:.. : . :. :. ..: :. : : : .. ::. :
CCDS71 SRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKVWAGTEEVDKALLATGCGNVAP
2830 2840 2850 2860 2870 2880
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 APIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVAL
.:... : . : :. . :.:: . .. :
CCDS71 GPVITPSNTFTAVFQSQEA-PAQGFSASFVSRCGSNFTGPSGYIISPNYPKQYDNNMNCT
2890 2900 2910 2920 2930 2940
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 CQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQAGKNM
CCDS71 YVIEANPLSVVLLTFVSFHLEARSAVTGSCVNDGVHIIRGYSVMSTPFATVCGDEMPAPL
2950 2960 2970 2980 2990 3000
>--
initn: 480 init1: 155 opt: 446 Z-score: 529.6 bits: 110.1 E(32554): 3.5e-23
Smith-Waterman score: 450; 35.2% identity (62.7% similar) in 233 aa overlap (33-261:1510-1727)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCTWK
::::. . :: : : ..:. : :. :.:
CCDS71 TGNELAIRFKTDLSINGRGFNASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSPNYPSPYRSNTDCSWV
1480 1490 1500 1510 1520 1530
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQ-RIGRFCGTFR-PGALVSSGN
: : ... :.::: .::: .. : . .:.: .. . :..: :: . . .:::::
CCDS71 IRVDRNHRVLLNFTDFDLEPQDSC----IMAYDGLSSTMSRLARTCGREQLANPIVSSGN
1540 1550 1560 1570 1580 1590
130 140 150 160 170
pF1KE0 KMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGG-LLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAGV
...... : . . :: :.: : ::: .: . ..: .: .:: .
CCDS71 SLFLRFQSGPSRQNRGFRAQFR---------QACGGHILTSSFDTVSSPRFPA-NYPNNQ
1600 1610 1620 1630 1640
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TCVWHIVA-PKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPPAP
.: : : : : . : :.: .:..::.. : :.: ...::. .:: :.::: . : :
CCDS71 NCSWIIQAQPPLNHITLSFTHFELERSTTCARDFVEILDGGH-EDAPLRGRYCGTDMPHP
1650 1660 1670 1680 1690 1700
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQ
:.: . : ..:.:: :..: ::
CCDS71 ITSFSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVTASVSACGGTFYMAEGIFNSPGYPDIYPPNVEC
1710 1720 1730 1740 1750 1760
>--
initn: 405 init1: 169 opt: 435 Z-score: 516.2 bits: 107.6 E(32554): 2e-22
Smith-Waterman score: 435; 29.7% identity (60.2% similar) in 266 aa overlap (33-291:2336-2591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGV-YPPNSKCTW
::: . :.:: . : : : . : : : :
CCDS71 WSSGEVMYLRFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHPTLPYRDNLFCEW
2310 2320 2330 2340 2350 2360
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQRIGRFCGTFRPGALVSSGNK
.. :. ....:. ..:.... :. :::.....:..:. .::.::. : .. .:.:
CCDS71 HLQGLSGHYLTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHTSGNILGRYCGNTIPDSIDTSSNT
2370 2380 2390 2400 2410 2420
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAGVTC
.:....:......:: : : . . ::: :. :.: .::.:. . : : :
CCDS71 AVVRFVTDGSVTASGFRLRF------ESSMEECGGDLQGSIGTFTSPNYPNPN-PHGRIC
2430 2440 2450 2460 2470
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGD-SPPAPIV
:.:.::... : : :... . : ..: :::: . :. . . : :.. . :
CCDS71 EWRITAPEGRRITLMFNNLRLATHPSCNNEHVIVFNGIRSNSPQ-LEKLCSSVNVSNEIK
2480 2490 2500 2510 2520 2530
250 260 270 280 290
pF1KE0 SERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPK-----KLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVA
: : . . :..: : :: . : .::.: : :. : :..
CCDS71 SSGNTMKVIFFTDGSRPYGGFTASYTSSEDAVCGGSLPNTPEGNFTS--PGYDGVRNYSR
2540 2550 2560 2570 2580 2590
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQAGKN
CCDS71 NLNCEWTLSNPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGDADGPLMWRLCGPSKPT
2600 2610 2620 2630 2640 2650
>--
initn: 399 init1: 132 opt: 415 Z-score: 491.8 bits: 103.1 E(32554): 4.5e-21
Smith-Waterman score: 415; 32.3% identity (59.7% similar) in 248 aa overlap (32-265:2091-2331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 RGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCTW
.::: : .. :.: : .: .:: : .:.:
CCDS71 PIRSTGEYMFIRFTSDSSVTRAGFNASFHKSCGGYLHADRGIITSPKYPETYPSNLNCSW
2070 2080 2090 2100 2110 2120
70 80 90 100
pF1KE0 KITVPEGKVVVLNFR--FIDLESDNLCRY-DFVDVYNGH---------ANGQRIGRFCGT
.. : : .....:. : ..:. : :.. . :: .:. :.:::.
CCDS71 HVLVQSGLTIAVHFEQPFQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICSPPLGPPGGN--GHFCGS
2130 2140 2150 2160 2170
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FRPGALVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKT-P
..: .: :.:.::.::: .. :.:: . : :. : . : :... : :
CCDS71 HASSTLFTSDNQMFVQFISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVY---IHDADSAGYVTSP
2180 2190 2200 2210 2220 2230
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NWPDRDYPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFE-KFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRI
: : ..:: . :.: ..:: . :.:.:: .::.: : .:. . .: . .:: .
CCDS71 NHP-HNYPPHADCIWILAAPPETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVD-SDAPIL
2240 2250 2260 2270 2280 2290
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GKYCGDSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVT
.:.:: : :. : . . ..: :: : : :: ..:
CCDS71 SKFCGTSLPSSQWSSGEVMYLRFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHP
2300 2310 2320 2330 2340 2350
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TGLKPTVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNL
CCDS71 TLPYRDNLFCEWHLQGLSGHYLTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHTSGNILGRYCGN
2360 2370 2380 2390 2400 2410
>--
initn: 377 init1: 197 opt: 382 Z-score: 451.5 bits: 95.6 E(32554): 7.9e-19
Smith-Waterman score: 504; 33.3% identity (65.4% similar) in 243 aa overlap (30-265:3034-3271)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGV-YPPNSK
...:::... ::.: : .. . :: . .
CCDS71 PAPLTIAGPVLLNFYSNEQITDFGFKFSYRIISCGGVFNFSSGIITSPAYSYADYPNDMH
3010 3020 3030 3040 3050 3060
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CTWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNG-HANGQRIGRFCGTFRPGALVS
: . ::: . ::. :.: .:. .. : .:.. .:.: ... .:.:::. :: . :
CCDS71 CLYTITVSDDKVIELKFSDFDVVPSTSCSHDYLAIYDGANTSDPLLGKFCGSKRPPNVKS
3070 3080 3090 3100 3110 3120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRD--Y
:.:.:.. . .:. ...:. : . ..: ::: : ...: .:. : . :
CCDS71 SNNSMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQG---CGGYLTGSNNTFASPD-SDSNGMY
3130 3140 3150 3160 3170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDN---YCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCG
...::: :.:: :..:.: :. : .: . : :::: ...: . ..: : .::
CCDS71 DKNLNCVWIIIAPVNKVIHLTFNTFALEAASTRQRCLYDYVKLYDG-DSENANLAGTFCG
3180 3190 3200 3210 3220 3230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKP
.. :::..: : : .::.:::.: .:: . :
CCDS71 STVPAPFISSGNFLTVQFISDLTLEREGFNATYTIMDMPCGGTYNATWTPQNISSPNSSD
3240 3250 3260 3270 3280 3290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQA
CCDS71 PDVPFSICTWVIDSPPHQQVKITVWALQLTSQDCTQNYLQLQDSPQGHGNSRFQFCGRNA
3300 3310 3320 3330 3340 3350
>--
initn: 630 init1: 194 opt: 363 Z-score: 428.3 bits: 91.4 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 438; 34.3% identity (64.3% similar) in 213 aa overlap (21-230:803-1004)
10 20 30 40
pF1KE0 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVF--TCGGILTGESGFIGSEG
: ... : :. .:: :::: : : :
CCDS71 TLLGKVCGNGTISHIKSITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGE-GVIRSPF
780 790 800 810 820 830
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FPGVYPPNSKCTWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQ-RIGRFC
::.::: . : : : :...:..::: ... :. :. :.:.. .. :. . ..:
CCDS71 FPNVYPGERTCRWTIHQPQSQVILLNFTVFEIGSSAHCETDYVEIGSSSILGSPENKKYC
840 850 860 870 880 890
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GTFRPGALVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKT
:: :. ..: : ..: ......: ..:::: ::: : :: .: . .:....
CCDS71 GTDIPSFITSVYNFLYVTFVKSSSTENHGFMAKFSAE------DLACGEILTESTGTIQS
900 910 920 930 940
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 PNWPDRDYPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRI
:. :. :: :..:.:::.. :.::.: :: : .: : ::. :. .... .
CCDS71 PGHPNV-YPHGINCTWHILVQPNHLIHLMFETFHLEFHYNCTNDYLEVY---DTDSETSL
950 960 970 980 990 1000
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GKYCGDSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVT
:.:
CCDS71 GRYCGKSIPPSLTSSGNSLMLVFVTDSDLAYEGFLINYEAISAATACLQDYTDDLGTFTS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>--
initn: 440 init1: 194 opt: 355 Z-score: 418.5 bits: 89.5 E(32554): 5.4e-17
Smith-Waterman score: 357; 30.9% identity (59.0% similar) in 188 aa overlap (86-272:527-706)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NSKCTWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQ-RIGRFCGTFRPGA
: ..:..::.: ... ..:::::. :
CCDS71 DVNCFWVIKTEMGKVLRITFTFFRLESMDNCPHEFLQVYDGDSSSAFQLGRFCGSSLPHE
500 510 520 530 540 550
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRD
:.:: : .. .. :. : :: . . . .:. :::.: : ::.:.:..: .
CCDS71 LLSSDNALYFHLYSEHLRNGRGFTVRWETQQPE------CGGILTGPYGSIKSPGYPG-N
560 570 580 590 600
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDS
:: : ::: .:. . :. . : ...:. . : ::. . .: .: .::.:
CCDS71 YPPGRDCVWIVVTSPDLLVTFTFGTLSLEHHDDCNKDYLEIRDGPLYQDPL-LGKFCTTF
610 620 630 640 650 660
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTV
:. . :.: :: ... .:: :. :. :
CCDS71 SVPPLQTTGPFARIHFHSDSQISDQGFHITYLTSPSDLRCGGNYTDPEGELFLPELSGPF
670 680 690 700 710 720
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQAGK
CCDS71 THTRQCVYMMKQPQGEQIQINFTHVELQCQSDSSQNYIEVRDGETLLGKVCGNGTISHIK
730 740 750 760 770 780
>>CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (730 aa)
initn: 538 init1: 222 opt: 318 Z-score: 384.4 bits: 80.9 E(32554): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 336; 34.8% identity (67.4% similar) in 135 aa overlap (141-273:578-710)
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RPGALVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNW
. : ..: . :::.: . .::. .:.:
CCDS34 VDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGW
550 560 570 580 590 600
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PDRDYPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKY
: ..:: . .:.:..::: . : :.:. :..: .. :.::.: : .: . :.. ::.
CCDS34 P-KEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEV-RSGLTADSKLHGKF
610 620 630 640 650 660
240 250 260 270 280
pF1KE0 CGDSPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIF--RPKKLPTTTEQPVTTTFPVTT
::. : :.:. :.. ..: :: ... :: .:.. :: :
CCDS34 CGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKR
670 680 690 700 710 720
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 GLKPTVALCQQKCRRTGTLEGNYCSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLA
CCDS34 NRTPQ
730
>--
initn: 533 init1: 182 opt: 283 Z-score: 341.7 bits: 73.0 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 397; 32.2% identity (58.8% similar) in 233 aa overlap (85-315:374-575)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PNSKCTWKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHANGQRI-GRFCGTFRPG
:: ::.:.: .: . :::::. :
CCDS34 AHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPE
350 360 370 380 390 400
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ALVSSGNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDR
.::. ... :.. :..: .:.::.:.. : ::: . . : ...::.::
CCDS34 PIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAI---------CGGDVKKDYGHIQSPNYPD-
410 420 430 440 450
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DYPAGVTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGD
:: . .:.:.: . .. . : :..:..:: . : :::. : .: . ... ::.:::
CCDS34 DYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDG-HSESSTLIGRYCGY
460 470 480 490 500 510
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SPPAPIVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPT
: : : ..: ..:.:: :.. :: .. :. : .:.
CCDS34 EKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNF-FKE----------------VDECSRPN
520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VALCQQKCRRTGTLEGNY-CSSDFVLAGTVITTITRDGSLHATVSIINIYKEGNLAIQQA
. :.:.: .:: :.: :: :
CCDS34 RGGCEQRC--LNTL-GSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYP
560 570 580 590 600 610
415 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:28:59 2016 done: Thu Nov 3 18:28:59 2016
Total Scan time: 2.450 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]