Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0241
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0241, 427 aa
1>>>pF1KE0241 427 - 427 aa - 427 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6299+/-0.00101; mu= 15.4979+/- 0.061
mean_var=67.2611+/-13.692, 0's: 0 Z-trim(103.6): 32 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.156384
statistics sampled from 7443 (7468) to 7443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 2858 654.0 7.7e-188
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 2075 477.4 1.2e-134
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 2042 470.0 2e-132
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1610 372.5 4.5e-103
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 1388 322.4 5.5e-88
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 1293 301.0 1.5e-81
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 1283 298.7 6.6e-81
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 1277 297.4 1.8e-80
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 1266 294.9 1.2e-79
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 1140 266.4 3.4e-71
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 1108 259.2 5.4e-69
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 1108 259.2 5.8e-69
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1094 256.0 4.3e-68
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1094 256.1 4.5e-68
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 926 218.1 9.3e-57
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 925 217.9 1.3e-56
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 901 212.5 5.7e-55
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 882 208.2 1.2e-53
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 761 180.8 1.2e-45
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 680 162.6 5.5e-40
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 2858 init1: 2858 opt: 2858 Z-score: 3485.8 bits: 654.0 E(32554): 7.7e-188
Smith-Waterman score: 2858; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFIN
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CCDS11 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 EYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 MVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRP
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LRRESEI
:::::::
CCDS11 LRRESEI
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 2020 init1: 1533 opt: 2075 Z-score: 2531.0 bits: 477.4 E(32554): 1.2e-134
Smith-Waterman score: 2075; 71.0% identity (88.9% similar) in 431 aa overlap (5-427:6-433)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFI
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CCDS11 MTAASRANPYSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGK--VHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEG
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CCDS11 NMDEKSQRYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPA-EG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KA---CVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFII
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CCDS11 RGRTPCVMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRI
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CCDS11 GAIMAKMARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVV
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CCDS11 TEEGEYIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLC
:::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::. ::.:::.::::::::.:: :
CCDS11 ILEGMVEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 SARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTD--TPP---DIDLHNQ
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CCDS11 SAKDLVENKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQA
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 ASVPLEPRPLRRESEI
.. :: :: ::::::
CCDS11 GGGVLEQRPYRRESEI
420 430
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1983 init1: 1506 opt: 2042 Z-score: 2490.8 bits: 470.0 E(32554): 2e-132
Smith-Waterman score: 2042; 70.5% identity (88.1% similar) in 430 aa overlap (5-427:6-433)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFI
:.: ::::: ::::..:.::. :::::::: ::::..::.:::::.:.::. :
CCDS74 MTAASRANPYSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGK--VHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLD-ASKE
:. ::.::::::.::::::::::.::.:: :::. :::.:: .::.::. ::::. : .
CCDS74 NMDEKSQRYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEGH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GKA-CVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIG
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CCDS74 GRTPCVMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRIT
:.:::::.:::: .::.::::::.:.::::::::::::::::::.:::::::::.: :.:
CCDS74 AIMAKMARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVI
::::::::::::.::::.:.:::::::::::.::::: :::. .:.::... :::::::
CCDS74 EEGEYIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCS
::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::. ::.:::.::::::::.:: ::
CCDS74 LEGMVEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTD--TPP---DIDLHNQA
:.::.:.:..: .:::::::::.:. :..:.: .: .. : : .: :.: . .
CCDS74 AKDLVENKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAG
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 SVPLEPRPLRRESEI
. :: :: :: :::
CCDS74 GGVLEQRPYRRGSEI
420 430
>>CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 (436 aa)
initn: 1683 init1: 1610 opt: 1610 Z-score: 1964.0 bits: 372.5 E(32554): 4.5e-103
Smith-Waterman score: 1669; 64.9% identity (84.2% similar) in 368 aa overlap (44-402:49-416)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 SEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIF
:.:::::::::::.:.:.: .: :::.:.:
CCDS12 SRAGDEEEAGPGLCRNGWAPAPVQSPVGRRRGRFVKKDGHCNVRFVNLGGQGARYLSDLF
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 TTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGKACVSEVNSFTAAF
:::::.::::: ..: .:. :::.:: .::::: ::::: : : :.: :: :::
CCDS12 TTCVDVRWRWMCLLFSCSFLASWLLFGLAFWLIASLHGDLAAPPPPAPCFSHVASFLAAF
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNETL
::..::::.:::: : ::.::: :: ::.: :.::..:::..:::::::::::::::::
CCDS12 LFALETQTSIGYGVRSVTEECPAAVAAVVLQCIAGCVLDAFVVGAVMAKMAKPKKRNETL
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 VFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDINVG
:::.:::.:.:: .:::::::::::.:::::::::::::. :.: ::::::::. :..::
CCDS12 VFSENAVVALRDHRLCLMWRVGNLRRSHLVEAHVRAQLLQPRVTPEGEYIPLDHQDVDVG
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 FDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQCRS
::.: :::::::::::::::: ::::.:.. .. ::::.:::::::::::::::::::
CCDS12 FDGGTDRIFLVSPITIVHEIDSASPLYELGRAELARADFELVVILEGMVEATAMTTQCRS
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 SYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNA--
::: .:.:::::.:::::.. :.::: .::.:::::.::.:::..: :. :..
CCDS12 SYLPGELLWGHRFEPVLFQRGSQYEVDYRHFHRTYEVPGTPVCSAKELDERAEQASHSLK
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KE0 -------NSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRE
..::::::.::. .:.: .. . :.....:
CCDS12 SSFPGSLTAFCYENELALSCCQEEDEDDETEEGNGVETEDGAASPRVLTPTLALTLPP
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 SEI
>>CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 (445 aa)
initn: 1763 init1: 1283 opt: 1388 Z-score: 1693.1 bits: 322.4 E(32554): 5.5e-88
Smith-Waterman score: 1716; 60.9% identity (79.1% similar) in 440 aa overlap (32-427:7-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINV
::...: :.. :.:::::.:.::: : :.
CCDS13 MHGHSRNGQAHVPRRKR-RNRFVKKNGQCNVYFANL
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 GEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASK----
..:.:::.::::::::: :::.::.:: ::..:::::: .:: ::..::::.::
CCDS13 SNKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KE0 EG--------------KACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVF
: : :. .::.: .:::::.::::::::::::::.:::.::. ::
CCDS13 AGGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVV
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLV
::::::.::.:.::..:::::.:::: .::.:::.:::..::::::::::::::::::.:
CCDS13 QSIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIV
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLS
::::::::.: .:.::::.:::: :.:::.: :.::::::::: :::::::::::: ..
CCDS13 EAHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQRDLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 KQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSR
:..... :::::::::::::::::::: ::::::.:::::::.:::.:::: .:::::::
CCDS13 KEELESEDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHYKVDYSR
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE0 FHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNA-----NSFCYENEVALTSKEEDDSEN------
::::::: .:: ::::.: :.: . : ..::::::.:: :.::.. :.
CCDS13 FHKTYEVAGTPCCSARELQESKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAA
340 350 360 370 380 390
400 410 420
pF1KE0 ------GVPESTSTDTP--------PDIDLHN-QASVPLEPRPLRRESEI
:. ... .. .::. :::.::. :::: :
CCDS13 AVAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFGSHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
400 410 420 430 440
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 1290 init1: 980 opt: 1293 Z-score: 1577.7 bits: 301.0 E(32554): 1.5e-81
Smith-Waterman score: 1293; 56.5% identity (85.5% similar) in 324 aa overlap (44-365:50-371)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 SEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIF
:.:...:.:.:::. :: : :::.:.:
CCDS84 WDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQET-YRYLSDLF
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 TTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLD--ASKEGKACVSEVNSFTA
:: ::..::. :..: ......::::: ..:::: ..:::: ...: :: ....:..
CCDS84 TTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGFVS
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 AFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNE
::::::::.:::::::: .:..:: ...... :.:.: :..::..: ...:...:::: :
CCDS84 AFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAE
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 TLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDIN
::.::.::::.::: :::::.:::.::.::.::: .::.:.::: :.:::.:::.: :::
CCDS84 TLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDIN
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 VGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQC
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CCDS84 VGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQA
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 RSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNA
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CCDS84 RSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYET-NTPSCCAKELAEMKREGRLL
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KE0 NSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI
CCDS84 QYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
380 390 400 410
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANG-FGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFI
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CCDS11 MAQENAAFSPGQEE-PPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQG
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEG
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CCDS11 NVRET-YRYLTDLFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDT
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 K--ACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIG
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CCDS11 AWTPCVNNLNGFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVG
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRIT
...:...:.:: ::::: .::...:::.::::.:::.::.::.::: .::.:..:: :
CCDS11 CMFVKISQPNKRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQT
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVI
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CCDS11 LEGEFIPLHQTDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCS
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CCDS11 LEGMVEATGMTCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVP-TPSCS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLE
::.:::
CCDS11 ARELAEAAARLDAHLYWSIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
340 350 360 370 380 390
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
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Smith-Waterman score: 1277; 50.9% identity (81.7% similar) in 387 aa overlap (35-414:45-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 RTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEK
:. .:... . :.:.:::.:::. :: :
CCDS42 DSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQ-RYVRKDGKCNVHHGNVRET
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGK--AC
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CCDS42 -YRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPC
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAK
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CCDS42 VTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVK
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEY
...:::: :::::: .:::.:::::::::.:::.::.::.::: .::.:.::. :::::.
CCDS42 ISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEF
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMV
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CCDS42 IPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMV
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLA
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CCDS42 EATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET-STPSLSAKELA
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410
pF1KE0 E----KKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDI-DLHNQASVPLE
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CCDS42 ELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEE---EKNLEEQTERNG--DVANLENESKV
380 390 400 410 420
420
pF1KE0 PRPLRRESEI
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQ
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CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQ----GPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQ
10 20 30 40 50
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pF1KE0 FINVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASK
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CCDS22 HGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAH
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 EGK--ACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFI
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CCDS22 VGNYTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFL
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 IGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSR
:: .. ::..:::: :::.::..:::.:::::: ::.::::::.::.: :..: .:::::
CCDS22 IGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSR
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 ITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIV
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CCDS22 QTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIV
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 VILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPL
:::::.::.:.:: : :.:: .:.:::::. ::. :. ..:::::.:: :.:::. :
CCDS22 VILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPY
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 CSARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVP
CCDS22 SVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKL
360 370 380 390 400 410
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Smith-Waterman score: 1140; 50.6% identity (79.0% similar) in 338 aa overlap (34-368:23-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGE
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CCDS31 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAKPRYRARQR-RARFVSKKGNCNVAHKNIRE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGKA--
.: :.: :.::: ::..: :.:: ..:. :::.:. ..::::. :::: : .:: :
CCDS31 QG-RFLQDVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDL-APSEGTAEP
60 70 80 90 100
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pF1KE0 CVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMA
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CCDS31 CVTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFM
110 120 130 140 150 160
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pF1KE0 KMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGE
: :. ..: :::.::..::::.: :.::.: :::.:::: .. : .. :.... . :::
CCDS31 KTAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGE
170 180 190 200 210 220
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pF1KE0 YIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDN-ADFEIVVILEG
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CCDS31 VVPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEG
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 MVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARD
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CCDS31 VVETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVP-TPLCTARQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 LAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRP
: : . .:
CCDS31 LDEDHSLLEALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
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427 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 19:42:17 2016 done: Thu Nov 3 19:42:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]