Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0229
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0229, 304 aa
1>>>pF1KE0229 304 - 304 aa - 304 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9620+/-0.000875; mu= 12.0342+/- 0.053
mean_var=69.1262+/-14.013, 0's: 0 Z-trim(106.3): 30 B-trim: 34 in 1/48
Lambda= 0.154260
statistics sampled from 8895 (8916) to 8895 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 ( 304) 2101 476.5 1.1e-134
CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 302) 1201 276.2 2.1e-74
CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 ( 296) 1164 268.0 6.3e-72
CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 296) 1157 266.4 1.8e-71
CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 ( 295) 1084 250.2 1.4e-66
CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 ( 295) 1084 250.2 1.4e-66
CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 295) 1065 245.9 2.7e-65
CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 ( 295) 1060 244.8 5.8e-65
CCDS3531.1 SULT1E1 gene_id:6783|Hs108|chr4 ( 294) 1043 241.0 8e-64
CCDS2076.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 307) 861 200.5 1.3e-51
CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 217) 749 175.6 3e-44
CCDS12724.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 350) 716 168.3 7.5e-42
CCDS12723.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 365) 716 168.3 7.8e-42
CCDS12707.1 SULT2A1 gene_id:6822|Hs108|chr19 ( 285) 698 164.3 1e-40
CCDS82492.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 227) 631 149.3 2.5e-36
CCDS14051.1 SULT4A1 gene_id:25830|Hs108|chr22 ( 284) 470 113.5 1.9e-25
CCDS33182.1 SULT6B1 gene_id:391365|Hs108|chr2 ( 265) 459 111.1 9.6e-25
>>CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 (304 aa)
initn: 2101 init1: 2101 opt: 2101 Z-score: 2531.6 bits: 476.5 E(32554): 1.1e-134
Smith-Waterman score: 2101; 100.0% identity (100.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
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CCDS33 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RTEI
::::
CCDS33 RTEI
>>CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 (302 aa)
initn: 1182 init1: 941 opt: 1201 Z-score: 1449.2 bits: 276.2 E(32554): 2.1e-74
Smith-Waterman score: 1201; 58.7% identity (82.7% similar) in 283 aa overlap (18-300:17-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
... : :. . . :.:. :::::::::...::::.:::
CCDS20 MALHDMEDFTFDGTKRLSVNYVKGILQPTDTCDIWDKIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
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CCDS20 WTQEIVELIQNEGDVEKSKRAPTHQRFPFLEMKIP-SLGSGLEQAHAMPSPRILKTHLPF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
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CCDS20 HLLPPSLLEKNCKIIYVARNPKDNMVSYYHFQRMNKALPAPGTWEEYFETFLAGKVCWGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
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CCDS20 WHEHVKGWWEAKDKHRILYLFYEDMKKNPKHEIQKLAEFIGKKLDDKVLDKIVHYTSFDV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
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CCDS20 MKQNPMANYSSIPAEIMDHSISPFMRKGAVGDWKKHFTVAQNERFDEDYKKKMTDTRLTF
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEI
CCDS20 HFQF
300
>>CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 (296 aa)
initn: 1158 init1: 1158 opt: 1164 Z-score: 1404.8 bits: 268.0 E(32554): 6.3e-72
Smith-Waterman score: 1164; 56.0% identity (80.9% similar) in 282 aa overlap (23-304:15-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
: : : :::. .:...:::...:::::::::
CCDS35 MLSPKDILRKDLKLVHGYPMTCAFASNWEKIEQFHSRPDDIVIATYPKSGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
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CCDS35 WVSEIIDMILNDGDIEKCKRGFITEKVPMLEMTLPGLRTSGIEQLEKNPSPRIVKTHLPT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
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CCDS35 DLLPKSFWENNCKMIYLARNAKDVSVSYYHFDLMNNLQPFPGTWEEYLEKFLTGKVAYGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
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CCDS35 WFTHVKNWWKKKEEHPILFLYYEDMKENPKEEIKKIIRFLEKNLNDEILDRIIHHTSFEV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
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CCDS35 MKDNPLVNYTHLPTTVMDHSKSPFMRKGTAGDWKNYFTVAQNEKFDAIYETEMSKTALQF
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEI
::::
CCDS35 RTEI
>>CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 (296 aa)
initn: 1180 init1: 898 opt: 1157 Z-score: 1396.4 bits: 266.4 E(32554): 1.8e-71
Smith-Waterman score: 1157; 55.5% identity (81.3% similar) in 283 aa overlap (22-304:15-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
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CCDS20 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
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CCDS20 WIQEIVDMIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPS-GVEKAKAMPSPRILKTHLST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
.:.:::.:..:::..::::: :::.::::::.:: ..::: . ::..: :..:::: ::
CCDS20 QLLPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
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CCDS20 WFDHVKGWWEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
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CCDS20 MKENPMTNRSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINF
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEI
:.
CCDS20 CMEL
>>CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1093 init1: 851 opt: 1084 Z-score: 1308.6 bits: 250.2 E(32554): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 1084; 55.3% identity (75.5% similar) in 282 aa overlap (23-304:15-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
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CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
:. .::::: . ::.:::.:: : :::.. : : :: . . :.:::.:::
CCDS32 WVSQILDMIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPG-EPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
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CCDS32 ALLPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
:..::. :: . : .:::::::.:..:::::.:::.:. ... :: .. .. ::::
CCDS32 WYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
::.::::::::.: .::::::::::::: ::::. :::::::.:: :: .:::: .:.:
CCDS32 MKKNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSF
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEI
:.:.
CCDS32 RSEL
>>CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1093 init1: 851 opt: 1084 Z-score: 1308.6 bits: 250.2 E(32554): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 1084; 55.3% identity (75.5% similar) in 282 aa overlap (23-304:15-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
: ::: . : . .:::.::::.. ::::::::
CCDS10 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
:. .::::: . ::.:::.:: : :::.. : : :: . . :.:::.:::
CCDS10 WVSQILDMIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPG-EPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
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CCDS10 ALLPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
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CCDS10 WYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
::.::::::::.: .::::::::::::: ::::. :::::::.:: :: .:::: .:.:
CCDS10 MKKNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSF
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEI
:.:.
CCDS10 RSEL
>>CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1063 init1: 804 opt: 1065 Z-score: 1285.8 bits: 245.9 E(32554): 2.7e-65
Smith-Waterman score: 1065; 54.3% identity (76.2% similar) in 282 aa overlap (23-304:15-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
: ::: . : . .:::.::::...::::::::
CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
:. .::::: . ::.:::.:: . : :::.: : . .: . . .:.:.:::::
CCDS32 WVSQILDMIYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKAPGIPS-GMETLKDTPAPRLLKTHLPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
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CCDS32 ALLPQTLLDQKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVHPEPGTWDSFLEKFMVGEVSYGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
:..::. :: . : .:::::::.:..:::::.:::.:. ... :: .. .. ::::
CCDS32 WYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDFVVQHTSFKE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
::.::::::::.: .::::::::::::: ::::. :::::::.:: :: .:::: .:.:
CCDS32 MKKNPMTNYTTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSF
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEI
:.:.
CCDS32 RSEL
>>CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1060 init1: 799 opt: 1060 Z-score: 1279.8 bits: 244.8 E(32554): 5.8e-65
Smith-Waterman score: 1060; 54.6% identity (76.2% similar) in 282 aa overlap (23-304:15-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
: ::: . : . .:::.::::...::::::::
CCDS10 MELIQDISRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
:. .::::: . ::.:::.:: . : :::.: : . .: . . .:.:.:::::
CCDS10 WVSQILDMIYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKVPGIPS-GMETLKNTPAPRLLKTHLPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
:.: .. .. :.:::::: :: ::::::..::. .: : . : : ::::.:.: ::
CCDS10 ALLPQTLLDQKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVYPHPGTWESFLEKFMAGEVSYGS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
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CCDS10 MKKNPMTNYTTVRREFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAKKMAGCSLSF
240 250 260 270 280 290
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:.:.
CCDS10 RSEL
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: .:.: :.:...:::.:. :: :: ::.:.: :.. :.: .. :: ::::.:.:
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:::. :::.:: :.:.:::::.:.: ..:. :...:::. :::....::.::::
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:::::
CCDS35 KFRTEI
290
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10 20 30 40 50 60
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:..::.::: ..::::::.:: :: :.: . :. . .. : . . : ... :
CCDS20 WIQEIVDMIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSETGFHHVAQAGLKLLSSSNPP
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. :.:::.:..:::..::::: :::.::::::.:: ..::: . ::..:
CCDS20 ASTSQSAKITDLLPPSFWENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFET
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300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]