Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0196
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0196, 416 aa
1>>>pF1KE0196 416 - 416 aa - 416 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9454+/-0.00101; mu= 12.9796+/- 0.060
mean_var=61.9022+/-12.493, 0's: 0 Z-trim(103.2): 176 B-trim: 383 in 1/48
Lambda= 0.163013
statistics sampled from 7114 (7295) to 7114 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 2792 665.5 2.6e-191
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 1122 272.8 4.4e-73
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 1113 270.7 1.9e-72
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 1095 266.4 3.6e-71
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 1077 262.2 6.7e-70
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 898 220.1 3.3e-57
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 737 182.2 8.5e-46
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 727 179.9 4.3e-45
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 684 169.8 5.2e-42
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 684 169.8 5.6e-42
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 666 165.5 9.1e-41
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 660 164.1 2.2e-40
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 663 164.9 2.3e-40
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 660 164.1 2.4e-40
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 645 160.6 2e-39
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 641 159.6 3.5e-39
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 641 159.7 4.7e-39
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 641 159.7 5.1e-39
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 641 159.7 5.1e-39
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 641 159.7 5.1e-39
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 644 160.4 7.4e-39
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 642 159.9 7.9e-39
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 642 159.9 7.9e-39
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 641 159.7 1.2e-38
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 637 158.7 1.4e-38
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 619 154.5 3.9e-37
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 619 154.5 4.3e-37
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 595 148.9 1.3e-35
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 592 148.1 1.8e-35
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 592 148.1 1.9e-35
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 592 148.1 1.9e-35
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 589 147.4 3.4e-35
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 580 145.3 6.7e-35
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 559 140.4 6e-33
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 556 139.7 1e-32
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 536 134.9 8.5e-32
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1 ( 326) 534 134.5 1.5e-31
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 525 132.4 5.1e-31
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 525 132.4 5.2e-31
CCDS82945.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 576) 521 131.4 2.1e-30
CCDS34049.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 583) 521 131.4 2.1e-30
CCDS82946.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 591) 521 131.4 2.2e-30
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 513 129.5 3.7e-30
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 514 129.8 4.1e-30
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 ( 263) 508 128.4 8.2e-30
CCDS73390.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 344) 497 125.8 6.4e-29
CCDS73393.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 388) 497 125.8 7.2e-29
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 489 123.9 2.4e-28
CCDS83235.1 PRSS2 gene_id:5645|Hs108|chr7 ( 261) 486 123.2 2.9e-28
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 483 122.5 7.6e-28
>>CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 (416 aa)
initn: 2792 init1: 2792 opt: 2792 Z-score: 3548.2 bits: 665.5 E(32554): 2.6e-191
Smith-Waterman score: 2792; 99.3% identity (99.8% similar) in 416 aa overlap (1-416:1-416)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MYRHGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVEKTYYYQGDFHISGVTYND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MYRHGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVEKTYYYQGDFHISGVTYND
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQLKFKFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQLKFKFP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTNNCCGRQVANSII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTNNCCGRQVANSII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNNSKDWTVNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNNSKDWTVNF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GVVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKICLPEAKMKLSE
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GIVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKICLPEAKMKLSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 NDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDSMLCAGFMSGEAD
:::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS35 NDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEDFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDTMLCAGFMSGEAD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE0 ACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITSKTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITSKTGL
370 380 390 400 410
>>CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 (418 aa)
initn: 925 init1: 842 opt: 1122 Z-score: 1425.6 bits: 272.8 E(32554): 4.4e-73
Smith-Waterman score: 1122; 40.7% identity (73.3% similar) in 423 aa overlap (1-416:2-418)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MYR---HGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVE-KTYYYQGDFHISG
::: : :. : ...: :... ...::::::::::. . : ::.:.:.:
CCDS47 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLT-VVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILD
10 20 30 40 50
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pF1KE0 VTYNDNCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQL
:.: .. . .: . :. . . : .:. :.:.:..:..: :. .: .:.. .
CCDS47 PQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KFKFPPAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVP---ASIKLMEISKAASEMLTNNCCG
:.:: .: ..: : :....:.... . :.: .:... .:....:. .. ::
CCDS47 VFQFPSTEQRAVREK---KIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RQVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNN
..:. . :.:..: . ..:::::::.:. . : :::.:::. ::..::::: : .:
CCDS47 KRVVPLNV--NRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SKDWTVNFGVVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKICLP
..:::.::. .: : : :.:. .:.::.: : . . :::.::.. .:.:.. ::.::::
CCDS47 PHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQICLP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 EAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDSMLCA
::. ... : .: .::.:.::..: :.:: .:::.. .:. .:.. . .:.::
CCDS47 EASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCA
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pF1KE0 GFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITS
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CCDS47 GYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIAS
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KTGL
:::.
CCDS47 KTGI
>>CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 (421 aa)
initn: 917 init1: 842 opt: 1113 Z-score: 1414.1 bits: 270.7 E(32554): 1.9e-72
Smith-Waterman score: 1113; 40.4% identity (73.0% similar) in 426 aa overlap (1-416:2-421)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MYR---HGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVE-KTYYYQGDFHISG
::: : :. : ...: :... ...::::::::::. . : ::.:.:.:
CCDS35 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLT-VVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILD
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pF1KE0 VTYNDNCENAASQASTNLSKDIE---TKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQ
:.: .. . .: . : ... . : .:. :.:.:..:..: :. .: .:.
CCDS35 PQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVSQVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVD
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pF1KE0 LQLKFKFPPAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVP---ASIKLMEISKAASEMLTNN
. . :.:: .: ..: : :....:.... . :.: .:... .:....:. ..
CCDS35 VIMVFQFPSTEQRAVREK---KIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQA
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pF1KE0 CCGRQVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAK
::..:. . :.:..: . ..:::::::.:. . : :::.:::. ::..::::: :
CCDS35 SCGKRVVPLNV--NRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KNNSKDWTVNFGVVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKI
.: ..:::.::. .: : : :.:. .:.::.: : . . :::.::.. .:.:.. ::.:
CCDS35 YKNPHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQI
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290 300 310 320 330 340
pF1KE0 CLPEAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDSM
:::::. ... : .: .::.:.::..: :.:: .:::.. .:. .:.. . .:
CCDS35 CLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGM
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350 360 370 380 390 400
pF1KE0 LCAGFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNW
.:::.: : :::..::::::. : .. :.:.:::::::.::.:.::::::.:: ::::
CCDS35 FCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNW
360 370 380 390 400 410
410
pF1KE0 ITSKTGL
:.::::.
CCDS35 IASKTGI
420
>>CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 1000 init1: 874 opt: 1095 Z-score: 1391.2 bits: 266.4 E(32554): 3.6e-71
Smith-Waterman score: 1095; 40.0% identity (67.8% similar) in 423 aa overlap (1-416:2-423)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MYRHGISSQRS---WPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAV--EKTYYYQGDFHIS
::: . :. : :. .... .:.: ::: ::.. .::: : . . ..
CCDS33 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GVTYNDNCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQ
. ::. :..:. .:. . ::: .: . .:.:::.:::. . .: ...
CCDS33 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LKFKFPPAEGVSMRTKI-KAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTNNCCGR
: .: .: :: . ::. :.. .. .. : :.:. .:.:. .. :.:::
CCDS33 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 QVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNNS
. .... . .::.: :: ::::::.:: : : :::.::.. ::.::::::. .:
CCDS33 RRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTYKNP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KDWTVNFGVVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHD-DIALVQLAEEVSFTEYIRKICLP
::..:::... : : .. :: ::.:. :. :: ::.:..:. : .:. ....:::
CCDS33 ARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPS-HDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVCLP
250 260 270 280 290
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pF1KE0 EAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDSMLCA
.:..... .: . :::.:.: .: :..: . .:: :: ::. .: ::::
CCDS33 DASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRMLCA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 GFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITS
: . :..::::.::::::. :.:.::.:.::::::: :.: ::::::::::. :.::::
CCDS33 GSLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITS
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KTGL
:::.
CCDS33 KTGI
420
>>CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 (418 aa)
initn: 1013 init1: 819 opt: 1077 Z-score: 1368.4 bits: 262.2 E(32554): 6.7e-70
Smith-Waterman score: 1077; 39.0% identity (74.0% similar) in 420 aa overlap (1-416:1-418)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MYRHG--ISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVE-KTYYYQGDFHISGVT
::: . :..: ... :: .. ..::.:::.:::.::: . :.:.:...:.. .:
CCDS35 MYRPARVTSTSRFLNPYVVCFIVVAGVVILAVTIALLVYFLAFDQKSYFYRSSFQLLNVE
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60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YNDNCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQLKF
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CCDS35 YNSQLNSPATQEYRTLSGRIESLITKTFKESNLRNQFIRAHVAKLRQDGSGVRADVVMKF
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KFP-PAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTNNCCGRQVA
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CCDS35 QFTRNNNGASMKSRIESVLRQML-NNSGNLEINPSTEITSLTDQAAANWLINEC-GAGPD
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pF1KE0 NSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNNSKDW
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CCDS35 LITLSEQRILGGTEAEEGSWPWQVSLRLNNAHHCGGSLINNMWILTAAHCFRSNSNPRDW
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 TVNFGVVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKICLPEAKM
.. :. .. : . .:.::..:.::.: ..:::::.: . :.::. :...::: : .
CCDS35 IATSGISTTFPKLRMRVRNILIHNNYKSATHENDIALVRLENSVTFTKDIHSVCLPAATQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 KLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDSMLCAGFMS
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CCDS35 NIPPGSTAYVTGWGAQEYAGHTVPELRQGQVRIISNDVCNAPHSYNGAILSGMLCAGVPQ
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pF1KE0 GEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITSKTGL
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CCDS35 GGVDACQGDSGGPLVQEDSRRLWFIVGIVSWGDQCGLPDKPGVYTRVTAYLDWIRQQTGI
360 370 380 390 400 410
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CCDS35 MMYAPVEFSEAEFSRAEYQRKQQFWDSVRLALFTLAIVAIIGIAIGIVTHFVVEDDKSFY
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50 60 70 80 90 100
pF1KE0 YQGDFHISGVTYNDNCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNA
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CCDS35 YLASFKVTNIKYKENYGIRSSREFIERSHQIERMMSRIFRHSSVGGRFIKSHVIKLSPDE
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CCDS35 QGVDILIVLIFRYPSTDSAEQIKKKIEKALYQSLKTKQLSLTINKPSFRLTPIDSKKMRN
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: :. :: ....: . . ..::.:. ...:: ::::::.: : : :::::::.
CCDS35 LLNSRCGIRMTSSNMPLPASSSTQRIVQGRETAMEGEWPWQASLQLIGSGHQCGASLISN
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pF1KE0 RWLLSAAHCFAKKNNSKDWTVNFGVVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLA
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CCDS35 TWLLTAAHCFWKNKDPTQWIATFGATITPPAVKRNVRKIILHENYHRETNENDIALVQLS
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CCDS35 TGVEFSNIVQRVCLPDSSIKLPPKTSVFVTGFGSIVDDGPIQNTLRQARVETISTDVCNR
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340 350 360 370 380 390
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CCDS35 KDVYDGLITPGMLCAGFMEGKIDACKGDSGGPLVY-DNHDIWYIVGIVSWGQSCALPKKP
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400 410
pF1KE0 GVYTRVTSYRNWITSKTGL
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CCDS35 GVYTRVTKYRDWIASKTGM
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: : ...:. : .. : .:... .. . .. .:..: .: .: . ..
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pF1KE0 IALVQLAEEVSFTEYIRKICLPEAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKII
:::..:: ..:.:.:. .:::... .. .. ..:::. .:. .:..: . .:
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CCDS58 SNKICNHRDVYGGIISPSMLCAGYLTGGVDSCQGDSGGPLVCQE-RRLWKLVGATSFGIG
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400 410
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CCDS58 CAEVNKPGVYTRVTSFLDWIHEQMERDLKT
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10 20 30 40
pF1KE0 MYRHGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAA-ILGVTIGLLVHFLAV
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CCDS13 FRSLFGLDDLKISPVAPDADAVAAQILSLLPLKFFPIIVIGIIALILALAIGLGIHFDCS
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pF1KE0 EKTYYYQGDFH-ISGVTYND---NCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKS
: : ...:. : .. : .:... .. . .. .:..: .: .: . ..
CCDS13 GK-YRCRSSFKCIELIARCDGVSDCKDGEDEYRC-VRVGGQNAVLQVFTAAS-WKTMCSD
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. :. ... . . . :.. ... . . ..: .. .. :. :.
CCDS13 DWKGHYANVACAQLGFPSYVSSDNLRVSSLEGQFREEFVSIDHLLPDDKVT--ALHHSVY
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CCDS13 VRE-GCASGHVVTLQCTACGHRRGYS----SRIVGGNMSLLSQWPWQASLQFQGYHLCGG
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:.:. :...:::: :.::.. :.: ...: .. :..:..: .:. : .:
CCDS13 SVITPLWIITAAHCVYDLYLPKSWTIQVGLVSLLDNPAPSHLVEKIVYHSKYKPKRLGND
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pF1KE0 IALVQLAEEVSFTEYIRKICLPEAKMKLSENDNVVVTGWG-TLYMNGSFPVILQEAFLKI
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CCDS13 IALMKLAGPLTFNEMIQPVCLPNSEENFPDGKVCWTSGWGATEDGAGDASPVLNHAAVPL
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pF1KE0 IDNKICNASYAYSGFVTDSMLCAGFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGD
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CCDS13 ISNKICNHRDVYGGIISPSMLCAGYLTGGVDSCQGDSGGPLVCQE-RRLWKLVGATSFGI
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pF1KE0 GCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITSKTGL
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CCDS13 GCAEVNKPGVYTRVTSFLDWIHEQMERDLKT
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pF1KE0 SNVQLQLKFKFPPAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTN
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CCDS33 YGRAACRDMGYKNNFYSSQGIVDDSGSTSFMKLNTSAGN-VDIYKKLYHSDACSSKAVVS
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pF1KE0 -NC--CGRQVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAH
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CCDS33 LRCIACGVNLNSS--RQSRIVGGESALPGAWPWQVSLHVQNVHVCGGSIITPEWIVTAAH
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pF1KE0 CFAKK-NNSKDWTVNFGVVVNKPYMTR----KVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEV
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CCDS33 CVEKPLNNPWHWTA-FAGILRQSFMFYGAGYQVEKVISHPNYDSKTKNNDIALMKLQKPL
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pF1KE0 SFTEYIRKICLPEAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYA
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CCDS33 TFNDLVKPVCLPNPGMMLQPEQLCWISGWGATEEKGKTSEVLNAAKVLLIETQRCNSRYV
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pF1KE0 YSGFVTDSMLCAGFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVY
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CCDS33 YDNLITPAMICAGFLQGNVDSCQGDSGGPLV-TSKNNIWWLIGDTSWGSGCAKAYRPGVY
420 430 440 450 460 470
410
pF1KE0 TRVTSYRNWITSKTGL
: . .::
CCDS33 GNVMVFTDWIYRQMRADG
480 490
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110 120 130 140 150 160
pF1KE0 SNVQLQLKFKFPPAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTN
.: : .. : : ::.. . .:. ...
CCDS54 YGRAACRDMGYKNNFYSSQGIVDDSGSTSFMKLNTSAGN-VDIYKKLYHSDACSSKAVVS
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 -NC--CGRQVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAH
: :: .. .: ..::.:.:.: ::::::.:.. .. : ::.:.:. .:...:::
CCDS54 LRCIACGVNLNSS--RQSRIVGGESALPGAWPWQVSLHVQNVHVCGGSIITPEWIVTAAH
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 CFAKK-NNSKDWTVNFGVVVNKPYMTR----KVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEV
: : :: ::. :. .. . .: .:...: : ::.: ..::::..: . .
CCDS54 CVEKPLNNPWHWTA-FAGILRQSFMFYGAGYQVEKVISHPNYDSKTKNNDIALMKLQKPL
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SFTEYIRKICLPEAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEAFLKIIDNKICNASYA
.:.. .. .:::. : :. .. ..:::. .:. .:. : . .:... ::. :.
CCDS54 TFNDLVKPVCLPNPGMMLQPEQLCWISGWGATEEKGKTSEVLNAAKVLLIETQRCNSRYV
400 410 420 430 440 450
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pF1KE0 YSGFVTDSMLCAGFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVY
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CCDS54 YDNLITPAMICAGFLQGNVDSCQGDSGGPLV-TSKNNIWWLIGDTSWGSGCAKAYRPGVY
460 470 480 490 500 510
410
pF1KE0 TRVTSYRNWITSKTGL
: . .::
CCDS54 GNVMVFTDWIYRQMRADG
520
416 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:38:50 2016 done: Thu Nov 3 21:38:50 2016
Total Scan time: 2.570 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]