Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0091, 632 aa
1>>>pF1KE0091 632 - 632 aa - 632 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4187+/-0.000972; mu= 18.9214+/- 0.058
mean_var=72.5124+/-14.479, 0's: 0 Z-trim(105.4): 38 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.150615
statistics sampled from 8359 (8393) to 8359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 4383 962.1 0
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 2961 653.1 3.1e-187
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 2831 624.8 1e-178
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 2619 578.8 7.5e-165
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 2619 578.8 8.5e-165
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 2329 515.8 7.2e-146
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 2195 486.6 3.5e-137
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 2158 478.6 1e-134
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 2004 445.1 1.1e-124
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1772 394.7 2e-109
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 1765 393.2 5.5e-109
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 1765 393.2 5.5e-109
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 1733 386.3 6.9e-107
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 1686 376.0 8.1e-104
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 1467 328.2 7e-90
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 1388 311.2 2.1e-84
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1288 289.6 1.1e-77
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1263 284.1 3.8e-76
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1263 284.1 3.9e-76
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1263 284.2 4.2e-76
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 1122 253.5 6.5e-67
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 776 178.0 1.1e-44
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 688 159.2 1.4e-38
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 533 125.5 2.2e-28
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 527 124.2 5.3e-28
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 523 123.3 9.2e-28
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 480 114.0 7.1e-25
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 466 110.7 2.7e-24
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 466 111.0 5.8e-24
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 458 109.2 1.7e-23
CCDS58198.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 97) 294 73.1 2e-13
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 301 75.1 3.6e-13
>>CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 (632 aa)
initn: 4383 init1: 4383 opt: 4383 Z-score: 5144.4 bits: 962.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4383; 100.0% identity (100.0% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 CWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VEFQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 VEFQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 FCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 DAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 YEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 AVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 IFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 IFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 NNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 NNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 GVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 GVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
610 620 630
>>CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (602 aa)
initn: 2976 init1: 2148 opt: 2961 Z-score: 3474.8 bits: 653.1 E(32554): 3.1e-187
Smith-Waterman score: 2961; 70.8% identity (88.8% similar) in 579 aa overlap (27-603:7-583)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRV--KRDKAVHERGHWNNKVE
: .:.: . .: . :.. .. ::::::::.:
CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKME
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGG
::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.. ::::::.:::::::.::.::
CCDS85 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTE
.: :::.::.:::::::.:.: :::::::.::::.::: . :: .:::. : ::::::
CCDS85 VTAWRKICPIFEGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NCVEFQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTI
.:.:::: : .. . .: .::::::.::::.::: :::::.:.: :::::::::: ::.:
CCDS85 HCMEFQKTN-GSLNGTS-ENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVI
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQV
::::::::.:::::::: ::::::.::..:::::::::::..::.:::::.:.:: ::::
CCDS85 CYFCIWKGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGF
:.:::::::::.::::::::::::::.:.:::::::: :: :::::::::::::::.:::
CCDS85 WMDAGTQIFFSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 MAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESL
:. ::::::.:::::::::::::::.::.:.:.::::: ::.:...:::::::::::::
CCDS85 MSQEQGVPISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLF
:::.:::::.:::. :::.:::..::.:...::.::::::::.::::: ::::::::::
CCDS85 VTALVDMYPHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLF
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPL
::::: .:..::::..:::::::::::::: :::.::...::..:.. :.: :::: ::
CCDS85 VAIFESLCVAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPL
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 KYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRG
::. :::: :: ..:::.:::::.::: : . .: . :....: :. :: .:.
CCDS85 TYNKKYTYPWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRN
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630
pF1KE0 KLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
: :
CCDS85 PAGPSAPATPRTSLLRLTELESHC
580 590 600
>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 (614 aa)
initn: 2843 init1: 2057 opt: 2831 Z-score: 3322.1 bits: 624.8 E(32554): 1e-178
Smith-Waterman score: 2831; 67.8% identity (87.7% similar) in 587 aa overlap (47-632:33-614)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 EARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFVLSVAGEIIGLGNVWRF
:..::.:.::.:::::::::::::::::::
CCDS85 GKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRF
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 PYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEGIGYAT
::::::::::::.::: .::. :::::::::.::::.::.:..: :::.::::.::: :.
CCDS85 PYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLAS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 QVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENCVEFQKLNVSNYSHVS-
:::..::::::::::::.::: . ::.::::.::.. ::::.:..: :: :. . :.
CCDS85 VVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDF--LNHSGAGTVTP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVY
..: :::::::::.:::.:..::. .:.:::::::::: ::.:::::::::.::::::::
CCDS85 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 VTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWVDAGTQIFFSYAICLG
::::::.::.:::::::::::: .:: .:: ::: ::.:::::.:::::::::.::: :
CCDS85 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 CLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMAYEQGVPIAEVAESGP
:::::::::.:.::::.::: :: :::.:::::::..::.::::. ::::::.:::::::
CCDS85 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 GLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVTAVVDMYPKVFRRGYR
::::::.:::::::::: ::. :::.::::::::::::::: :::: .::.:. .:.. :
CCDS85 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 RELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWVYGSNR
::::::...:. :..:: ..:::::::::::: ::.::.::::...:: .::.::::..:
CCDS85 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 FYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWGYGIGW
::::::::::::: :.: :...:::.: . :.: : :: ::::::.:.:: :::.:::
CCDS85 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 LMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKLGVSPRMVTVNDCDAK
..:::::.:.::.. ::. ::.: . ..:..: ::...: . . . : .
CCDS85 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
550 560 570 580 590 600
620 630
pF1KE0 LKSDGTIAAITEKETHF
. .: ::. :::::.
CCDS85 TR-EGLIAG--EKETHL
610
>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa)
initn: 2597 init1: 1914 opt: 2619 Z-score: 3073.0 bits: 578.8 E(32554): 7.5e-165
Smith-Waterman score: 2619; 64.1% identity (84.2% similar) in 562 aa overlap (30-590:21-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFV
: : .:. .:. . . .: .:..:..::
CCDS33 MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGIT
::::: ..:::::::::::::::::::::::: .:.. :.:::::: .::.:::::::
CCDS33 LSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGIT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENC
::.:.:::: :::::. :: . ::::::.::::: .:: . : ::::: :.: ::: .:
CCDS33 CWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 VE-FQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTIC
.: .. : : . .: : ::::.::::. ::..: ::.: :.:.:.:::::: .: .:
CCDS33 MEDTMRKNKSVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVW
.::::::..::::::: :::::. :::.::.::.:::::. :::::::::..:: :::::
CCDS33 FFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFM
.::::::::::::::: .:.:::::.:. : ::::..: :::::::::.::::::.::::
CCDS33 IDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 AYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLV
: :::: ::.:::::::::::::::::::::: .:. :::.::..:::::::: ::. .
CCDS33 AQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFV
:..::.::. .:.:::::..: . :::.:::.:.::::::.::::: :::::.:::.:
CCDS33 TSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 AIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLK
:.:::. :.:.::.. .::.::::::::: .:. : ..:: .:.: ::: :.:: ::
CCDS33 AFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 YNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGK
::. :.:: :. :.:: .:::::::.:: : : . .::: . ... : ::
CCDS33 YNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE0 LGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
CCDS33 REGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
600 610 620
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEF
: : .:. .:. . . .: .:..:..:
CCDS77 ALLRSSQTKEMATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDF
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGI
:::::: ..:::::::::::::::::::::::: .:.. :.:::::: .::.::::::
CCDS77 VLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGI
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTEN
:::.:.:::: :::::. :: . ::::::.::::: .:: . : ::::: :.: ::: .
CCDS77 TCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPH
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CVE-FQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTI
:.: .. : : . .: : ::::.::::. ::..: ::.: :.:.:.:::::: .: .
CCDS77 CMEDTMRKNKSVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLV
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQV
:.::::::..::::::: :::::. :::.::.::.:::::. :::::::::..:: ::::
CCDS77 CFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQV
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGF
:.::::::::::::::: .:.:::::.:. : ::::..: :::::::::.::::::.:::
CCDS77 WIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGF
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 MAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESL
:: :::: ::.:::::::::::::::::::::: .:. :::.::..:::::::: ::.
CCDS77 MAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQ
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLF
.:..::.::. .:.:::::..: . :::.:::.:.::::::.::::: :::::.:::.
CCDS77 ITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLW
520 530 540 550 560 570
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPL
::.:::. :.:.::.. .::.::::::::: .:. : ..:: .:.: ::: :.:: ::
CCDS77 VAFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPL
580 590 600 610 620 630
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 KYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRG
::. :.:: :. :.:: .:::::::.:: : : . .::: . ... : ::
CCDS77 TYNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAV
640 650 660 670 680 690
600 610 620 630
pF1KE0 KLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
CCDS77 EREGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
700 710 720
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Smith-Waterman score: 2329; 56.3% identity (79.3% similar) in 575 aa overlap (23-590:24-597)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPG-GGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVE
::: : . : .:. :: : :. ...
CCDS14 MAKKSAENGIYSVSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMD
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGG
:..: .: .::::::::::::::::::.::::::.. . :::.:::: .:::: . :.
CCDS14 FIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTE
:. : ..::::.:.:::..:: . :.:::..:::...:: . ::: :::::::: :::
CCDS14 INVW-NICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTP
130 140 150 160 170
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pF1KE0 NCVE-FQKLNVSNYSHVSLQ-----NATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCL
.::: :.. . .: : ..: . :::.::::..:: .: :.: : : ::..:::
CCDS14 DCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSR
:: :.. :::.:::.:::::.:: ::::::..:..::.::: :::: .:: .:: :: :.
CCDS14 LACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSK
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 LSDPQVWVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAI
:..::::.:::::::::::: :: :::::::: .:::::.: :.: .:::::: :::..
CCDS14 LGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVV
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pF1KE0 FSVLGFMAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQF
::.::::: :::: :..::::::::::::::.:::.::..::::.:::.::..:::::::
CCDS14 FSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQF
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 VCVESLVTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAAS
: ::...:...:. : . ..::. . .. . . : :.:.::::.::::: :.::
CCDS14 VGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSAS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GMCLLFVAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFL
: ::. :..::. ..::::..::.:.: :::::: .:::: ..:: .: ::::: .
CCDS14 GTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 IKYKPLKYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPST
. :.:: ::: :.:: :: ..:: .:::::::.:: . . ...::. :. :.:: :
CCDS14 VYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIW
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE0 DLKMRGKLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
CCDS14 GLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM
600 610 620 630
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initn: 2430 init1: 2148 opt: 2195 Z-score: 2576.4 bits: 486.6 E(32554): 3.5e-137
Smith-Waterman score: 2272; 59.6% identity (74.6% similar) in 579 aa overlap (27-603:7-491)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRV--KRDKAVHERGHWNNKVE
: .:.: . .: . :.. .. ::::::::.:
CCDS53 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKME
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGG
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGG---------------------------------
50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTE
:
CCDS53 -----------------------------------------------------------E
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NCVEFQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTI
.:.:::: : .. . .: .::::::.::::.::: :::::.:.: :::::::::: ::.:
CCDS53 HCMEFQKTN-GSLNGTS-ENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVI
70 80 90 100 110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQV
::::::::.:::::::: ::::::.::..:::::::::::..::.:::::.:.:: ::::
CCDS53 CYFCIWKGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQV
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGF
:.:::::::::.::::::::::::::.:.:::::::: :: :::::::::::::::.:::
CCDS53 WMDAGTQIFFSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGF
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 MAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESL
:. ::::::.:::::::::::::::.::.:.:.::::: ::.:...:::::::::::::
CCDS53 MSQEQGVPISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESL
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLF
:::.:::::.:::. :::.:::..::.:...::.::::::::.::::: ::::::::::
CCDS53 VTALVDMYPHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLF
310 320 330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPL
::::: .:..::::..:::::::::::::: :::.::...::..:.. :.: :::: ::
CCDS53 VAIFESLCVAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPL
370 380 390 400 410 420
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pF1KE0 KYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRG
::. :::: :: ..:::.:::::.::: : . .: . :....: :. :: .:.
CCDS53 TYNKKYTYPWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRN
430 440 450 460 470 480
600 610 620 630
pF1KE0 KLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
: :
CCDS53 PAGPSAPATPRTSLLRLTELESHC
490 500 510
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Smith-Waterman score: 2158; 54.6% identity (77.8% similar) in 553 aa overlap (42-594:36-577)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 GKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFVLSVAGEIIGLG
:. . .: :... .:..: .: ::::
CCDS26 SKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLG
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pF1KE0 NVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEG
::::::::: ::::::::::: . .: :.:.:.:: .:::.:: ::. : :. :.:.:
CCDS26 NVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLAPMFKG
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 IGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENCVEFQKLNVSNY
.: :. :. ::.:::.:..:::.:: : ::: ::: : . :::. : :::
CCDS26 VGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRC-------FSNY
130 140 150 160 170
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pF1KE0 SHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTG
: :. : :: :.::::. . ..::... :..:: ::. : :: . :::::::. ::
CCDS26 SMVNTTNMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 KVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWVDAGTQIFFSYA
:::: .::.:::::.::..::::::::.::: ::. :.. .::: .::.::.:::::::.
CCDS26 KVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYG
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 ICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMAYEQGVPIAEVA
. :: : ::::::...:: ::: :..::.:: ::. :::.:::..::::. ::.::
CCDS26 LGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 ESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVTAVVDMYPKVFR
:::::::.:::.:::..:.::::: ::: ::..::.:::: ::...::.:: ::...:
CCDS26 ASGPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLR
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 RGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWVY
::::.: :. .:::..:: .:.::.:.:.::: :.:::: :::...:::. :.: :
CCDS26 N--RRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFY
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 GSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWGY
: :::::::..:.: :: : :: ..:: : ::.::: ... :: ..: :..: ::
CCDS26 GVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTPLTMGN-YVFPKWGQ
480 490 500 510 520 530
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pF1KE0 GIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKLGVSPRMVTVND
:.:::::::::. :: .. .:.: ...: .. :: :.
CCDS26 GVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTS
540 550 560 570 580 590
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pF1KE0 CDAKLKSDGTIAAITEKETHF
CCDS26 KEAYI
>>CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 1988 init1: 1712 opt: 2004 Z-score: 2351.9 bits: 445.1 E(32554): 1.1e-124
Smith-Waterman score: 2004; 57.5% identity (81.2% similar) in 480 aa overlap (117-590:4-482)
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 AFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVY
:.:. : ..::::.:.:::..:: . :.:
CCDS48 MKAGSINVW-NICPLFKGLGYASMVIVFYCNTY
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 YIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENCVE-FQKLNVSNYSHVSLQ-----NAT
::..:::...:: . ::: :::::::: ::: .::: :.. . .: : ..: .
CCDS48 YIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRR
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVYVTATF
:::.::::..:: .: :.: : : ::..::::: :.. :::.:::.:::::.:: ::::
CCDS48 SPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATF
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWVDAGTQIFFSYAICLGCLTAL
::..:..::.::: :::: .:: .:: :: :.:..::::.:::::::::::: :: ::::
CCDS48 PYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTAL
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
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