Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0036
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0036, 715 aa
1>>>pF1KE0036 715 - 715 aa - 715 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4996+/-0.000923; mu= 18.8307+/- 0.056
mean_var=71.0587+/-13.999, 0's: 0 Z-trim(105.2): 27 B-trim: 79 in 1/53
Lambda= 0.152148
statistics sampled from 8294 (8311) to 8294 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11602.1 EPX gene_id:8288|Hs108|chr17 ( 715) 4868 1078.2 0
CCDS11604.1 MPO gene_id:4353|Hs108|chr17 ( 745) 3480 773.6 0
CCDS32689.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17 ( 712) 2499 558.2 1.5e-158
CCDS54149.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17 ( 629) 2387 533.6 3.4e-151
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2 (1479) 1739 391.6 4.5e-108
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8 (1463) 1572 354.9 4.9e-97
CCDS1643.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2 ( 933) 1388 314.4 4.8e-85
CCDS1646.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2 ( 760) 988 226.6 1.1e-58
CCDS1644.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2 ( 876) 533 126.7 1.4e-28
CCDS32221.1 DUOX1 gene_id:53905|Hs108|chr15 (1551) 479 115.0 8.6e-25
CCDS10117.1 DUOX2 gene_id:50506|Hs108|chr15 (1548) 474 113.9 1.8e-24
>>CCDS11602.1 EPX gene_id:8288|Hs108|chr17 (715 aa)
initn: 4868 init1: 4868 opt: 4868 Z-score: 5770.3 bits: 1078.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4868; 100.0% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (1-715:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHLLPALAGVLATLVLAQPCEGTDPASPGAVETSVLRDCIAEAKLLVDAAYNWTQKSIKQ
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CCDS11 MHLLPALAGVLATLVLAQPCEGTDPASPGAVETSVLRDCIAEAKLLVDAAYNWTQKSIKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RLRSGSASPMDLLSYFKQPVAATRTVVRAADYMHVALGLLEEKLQPQRSGPFNVTDVLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLRSGSASPMDLLSYFKQPVAATRTVVRAADYMHVALGLLEEKLQPQRSGPFNVTDVLTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PQLRLLSQASGCALRDQAERCSDKYRTITGRCNNKRRPLLGASNQALARWLPAEYEDGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQLRLLSQASGCALRDQAERCSDKYRTITGRCNNKRRPLLGASNQALARWLPAEYEDGLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQIVRFPNERLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLDFSPE
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CCDS11 LPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQIVRFPNERLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLDFSPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFPIKIPPNDPRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQNKNRVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFPIKIPPNDPRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQNKNRVRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QINALTSFVDASMVYGSEVSLSLRLRNRTNYLGLLAINQRFQDNGRALLPFDNLHDDPCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QINALTSFVDASMVYGSEVSLSLRLRNRTNYLGLLAINQRFQDNGRALLPFDNLHDDPCL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LTNRSARIPCFLAGDTRSTETPKLAAMHTLFMREHNRLATELRRLNPRWNGDKLYNEARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTNRSARIPCFLAGDTRSTETPKLAAMHTLFMREHNRLATELRRLNPRWNGDKLYNEARK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 IMGAMVQIITYRDFLPLVLGKARARRTLGHYRGYCSNVDPRVANVFTLAFRFGHTMLQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IMGAMVQIITYRDFLPLVLGKARARRTLGHYRGYCSNVDPRVANVFTLAFRFGHTMLQPF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 MFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAFFASWRIVYEGGIDPILRGLMATPAKLNRQDAMLVDEL
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CCDS11 MFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAFFASWRIVYEGGIDPILRGLMATPAKLNRQDAMLVDEL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 RDRLFRQVRRIGLDLAALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLSQPRNLAQLSRVLKNQDLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDRLFRQVRRIGLDLAALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLSQPRNLAQLSRVLKNQDLAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEPLLPGARVGPLLACLFENQFRRARDGDRFWWQKRGVFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEPLLPGARVGPLLACLFENQFRRARDGDRFWWQKRGVFTK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE0 RQRKALSRISLSRIICDNTGITTVSRDIFRANIYPRGFVNCSRIPRLNLSAWRGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQRKALSRISLSRIICDNTGITTVSRDIFRANIYPRGFVNCSRIPRLNLSAWRGT
670 680 690 700 710
>>CCDS11604.1 MPO gene_id:4353|Hs108|chr17 (745 aa)
initn: 3419 init1: 2842 opt: 3480 Z-score: 4123.5 bits: 773.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3480; 70.0% identity (87.2% similar) in 716 aa overlap (1-713:27-742)
10 20 30
pF1KE0 MHLLPALAGVLATLVLAQPCEGTDPASPGAVETS
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CCDS11 MGVPFFSSLRCMVDLGPCWAGGLTAEMKLLLALAGLLAILATPQPSEGAAPAVLGEVDTS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VLRDCIAEAKLLVDAAYNWTQKSIKQRLRSGSASPMDLLSYFKQPVAATRTVVRAADYMH
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CCDS11 LVLSSMEEAKQLVDKAYKERRESIKQRLRSGSASPMELLSYFKQPVAATRTAVRAADYLH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 VALGLLEEKLQPQRSGPFNVTDVLTEPQLRLLSQASGCALRDQAERC--SDKYRTITGRC
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CCDS11 VALDLLERKLRSLWRRPFNVTDVLTPAQLNVLSKSSGCAYQDVGVTCPEQDKYRTITGMC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NNKRRPLLGASNQALARWLPAEYEDGLSLPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQIVRFPNE
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CCDS11 NNRRSPTLGASNRAFVRWLPAEYEDGFSLPYGWTPGVKRNGFPVALARAVSNEIVRFPTD
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 RLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLDFSPESPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFPIKIPPND
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CCDS11 QLTPDQERSLMFMQWGQLLDHDLDFTPEPAARASFVTGVNCETSCVQQPPCFPLKIPPND
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 PRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQNKNRVRNQINALTSFVDASMVYGSEVSLSLRLRNRTNYL
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CCDS11 PRIKNQADCIPFFRSCPACPGSNITIRNQINALTSFVDASMVYGSEEPLARNLRNMSNQL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 GLLAINQRFQDNGRALLPFDNLHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSTETPKLAAMHTLFM
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CCDS11 GLLAVNQRFQDNGRALLPFDNLHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSSEMPELTSMHTLLL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 REHNRLATELRRLNPRWNGDKLYNEARKIMGAMVQIITYRDFLPLVLGKARARRTLGHYR
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CCDS11 REHNRLATELKSLNPRWDGERLYQEARKIVGAMVQIITYRDYLPLVLGPTAMRKYLPTYR
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 GYCSNVDPRVANVFTLAFRFGHTMLQPFMFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAFFASWRIVYE
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CCDS11 SYNDSVDPRIANVFTNAFRYGHTLIQPFMFRLDNRYQPMEPNPRVPLSRVFFASWRVVLE
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 GGIDPILRGLMATPAKLNRQDAMLVDELRDRLFRQVRRIGLDLAALNMQRSRDHGLPGYN
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CCDS11 GGIDPILRGLMATPAKLNRQNQIAVDEIRERLFEQVMRIGLDLPALNMQRSRDHGLPGYN
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 AWRRFCGLSQPRNLAQLSRVLKNQDLARKFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEPLLPGARVGPL
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CCDS11 AWRRFCGLPQPETVGQLGTVLRNLKLARKLMEQYGTPNNIDIWMGGVSEPLKRKGRVGPL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 LACLFENQFRRARDGDRFWWQKRGVFTKRQRKALSRISLSRIICDNTGITTVSRD-IFRA
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CCDS11 LACIIGTQFRKLRDGDRFWWENEGVFSMQQRQALAQISLPRIICDNTGITTVSKNNIFMS
670 680 690 700 710 720
700 710
pF1KE0 NIYPRGFVNCSRIPRLNLSAWRGT
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CCDS11 NSYPRDFVNCSTLPALNLASWREAS
730 740
>>CCDS32689.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17 (712 aa)
initn: 2219 init1: 1205 opt: 2499 Z-score: 2960.0 bits: 558.2 E(32554): 1.5e-158
Smith-Waterman score: 2499; 52.0% identity (76.9% similar) in 719 aa overlap (1-712:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHLLPALAGVLATLVLAQPCEGTDPASPGAVETSVLRDCIAEAKLLVDAAYNWTQKSIKQ
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CCDS32 MRVLLHLPALLASLILLQAAASTTRAQ--TTRTSAISDTVSQAKVQVNKAFLDSRTRLKT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RLRSGSASPMDLLSYFKQPVAATRTVVRAADYMHVALGLLEEKLQPQRSGPFNVTDVLTE
. : . . .: :.:. . :::..: .. . .: :. :... ::::
CCDS32 AMSSETPTSRQLSEYLKHAKGRTRTAIRNGQVWEESLKRLR-----QKASLTNVTD----
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 PQLRL--LSQASGCALRDQAERCS--DKYRTITGRCNNKRRPLLGASNQALARWLPAEYE
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CCDS32 PSLDLTSLSLEVGCGAPAPVVRCDPCSPYRTITGDCNNRRKPALGAANRALARWLPAEYE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DGLSLPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQIVRFPNERLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLD
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CCDS32 DGLSLPFGWTPGKTRNGFPLPLAREVSNKIVGYLNEEGVLDQNRSLLFMQWGQIVDHDLD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSPESPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFPIKIPPNDPRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQN--
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CCDS32 FAPDTELGSSEYSKAQCDEYCIQGDNCFPIMFPPNDPKAGTQGKCMPFFRAGFVCPTPPY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KNRVRNQINALTSFVDASMVYGSEVSLSLRLRNRTNYLGLLAINQRFQDNGRALLPFDNL
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CCDS32 KSLAREQINALTSFLDASFVYSSEPSLASRLRNLSSPLGLMAVNQEVSDHGLPYLPYDSK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSTETPKLAAMHTLFMREHNRLATELRRLNPRWNGDKL
. .:: . : .::.:::::::.:..: ::. ::::.::::::: ::.::::.:.:.::
CCDS32 KPSPCEFINTTARVPCFLAGDSRASEHILLATSHTLFLREHNRLARELKRLNPQWDGEKL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 YNEARKIMGAMVQIITYRDFLPLVLGKARARRTLGHYRGYCSNVDPRVANVFTLAFRFGH
:.:::::.::.:::::.::.::..:: . .. . :.:: .::::..::::.::::::
CCDS32 YQEARKILGAFVQIITFRDYLPILLGD-HMQKWIPPYQGYSESVDPRISNVFTFAFRFGH
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 TMLQPFMFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAFFASWRIVYEGGIDPILRGLMATPAKLNRQDA
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CCDS32 LEVPSSMFRLDENYQPWGPEPELPLHTLFFNTWRMVKDGGIDPLVRGLLAKKSKLMKQNK
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 MLVDELRDRLFRQVRRI-GLDLAALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLSQPRNLAQLSRVL
:.. :::..::. ..:: :.::::.: :: :::: ::::.:: :: ::::..: .:. ::
CCDS32 MMTGELRNKLFQPTHRIHGFDLAAINTQRCRDHGQPGYNSWRAFCDLSQPQTLEELNTVL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 KNQDLARKFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEPLLPGARVGPLLACLFENQFRRARDGDRFWWQ
:.. ::.:.:.:::::::::::::::::::. .:::::::::. .::.. ::::::::.
CCDS32 KSKMLAKKLLGLYGTPDNIDIWIGAIAEPLVERGRVGPLLACLLGKQFQQIRDGDRFWWE
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 KRGVFTKRQRKALSRISLSRIICDNTGITTVSRDIFRANIYPRGFVNCSRIPRLNLSAWR
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CCDS32 NPGVFTNEQKDSLQKMSFSRLVCDNTRITKVPRDPFWANSYPYDFVDCSAIDKLDLSPWA
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 GT
CCDS32 SVKN
710
>>CCDS54149.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17 (629 aa)
initn: 2219 init1: 1205 opt: 2387 Z-score: 2827.9 bits: 533.6 E(32554): 3.4e-151
Smith-Waterman score: 2387; 56.8% identity (80.3% similar) in 600 aa overlap (120-712:26-624)
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 ADYMHVALGLLEEKLQPQRSGPFNVTDVLTEPQLRL--LSQASGCALRDQAERCS--DKY
.:.: : :: ::. . ::. . :
CCDS54 MRVLLHLPALLASLILLQAAASTTRDPSLDLTSLSLEVGCGAPAPVVRCDPCSPY
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 RTITGRCNNKRRPLLGASNQALARWLPAEYEDGLSLPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQ
::::: :::.:.: :::.:.::::::::::::::::::::::.. :::: :::.: :::.
CCDS54 RTITGDCNNRRKPALGAANRALARWLPAEYEDGLSLPFGWTPGKTRNGFPLPLAREVSNK
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 IVRFPNERLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLDFSPESPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFP
:: . ::. . :..:.:.::::::..::::::.:.. . . ..:.. : : :::
CCDS54 IVGYLNEEGVLDQNRSLLFMQWGQIVDHDLDFAPDTELGSSEYSKAQCDEYCIQGDNCFP
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 IKIPPNDPRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQN--KNRVRNQINALTSFVDASMVYGSEVSLSL
: .:::::. .: :.::::.. :: :. .:.::::::::.:::.::.:: ::.
CCDS54 IMFPPNDPKAGTQGKCMPFFRAGFVCPTPPYKSLAREQINALTSFLDASFVYSSEPSLAS
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 RLRNRTNYLGLLAINQRFQDNGRALLPFDNLHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSTETPK
:::: .. :::.:.::. .:.: ::.:. . .:: . : .::.:::::::.:..:
CCDS54 RLRNLSSPLGLMAVNQEVSDHGLPYLPYDSKKPSPCEFINTTARVPCFLAGDSRASEHIL
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 LAAMHTLFMREHNRLATELRRLNPRWNGDKLYNEARKIMGAMVQIITYRDFLPLVLGKAR
::. ::::.::::::: ::.::::.:.:.:::.:::::.::.:::::.::.::..:: .
CCDS54 LATSHTLFLREHNRLARELKRLNPQWDGEKLYQEARKILGAFVQIITFRDYLPILLGD-H
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 ARRTLGHYRGYCSNVDPRVANVFTLAFRFGHTMLQPFMFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAF
.. . :.:: .::::..::::.:::::: . ::::: .:. .:. ..:: . :
CCDS54 MQKWIPPYQGYSESVDPRISNVFTFAFRFGHLEVPSSMFRLDENYQPWGPEPELPLHTLF
360 370 380 390 400 410
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 FASWRIVYEGGIDPILRGLMATPAKLNRQDAMLVDELRDRLFRQVRRI-GLDLAALNMQR
: .::.: .:::::..:::.: .:: .:. :.. :::..::. ..:: :.::::.: ::
CCDS54 FNTWRMVKDGGIDPLVRGLLAKKSKLMKQNKMMTGELRNKLFQPTHRIHGFDLAAINTQR
420 430 440 450 460 470
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 SRDHGLPGYNAWRRFCGLSQPRNLAQLSRVLKNQDLARKFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEP
:::: ::::.:: :: ::::..: .:. :::.. ::.:.:.::::::::::::::::::
CCDS54 CRDHGQPGYNSWRAFCDLSQPQTLEELNTVLKSKMLAKKLLGLYGTPDNIDIWIGAIAEP
480 490 500 510 520 530
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 LLPGARVGPLLACLFENQFRRARDGDRFWWQKRGVFTKRQRKALSRISLSRIICDNTGIT
:. .:::::::::. .::.. ::::::::.. ::::..:. .:...:.::..:::: ::
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CCDS54 KVPRDPFWANSYPYDFVDCSAIDKLDLSPWASVKN
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CCDS46 DLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLS
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CCDS47 LTSVKNFEDLQNEIKDSEIRQKLRKLYGSPGDIDLWPALMVEDLIPGTRVGPTLMCLFVT
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CCDS47 QFQRLRDGDRFWYENPGVFTPAQLTQLKQASLSRVLCDNGDSIQQVQADVFVKAEYPQDY
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CCDS47 LNCSEIPKVDLRVWQDCCADCRSRGQFRAVTQESQKKRSAQYSYPVDKDMELSHLRSRQQ
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CCDS16 RLAAALKALNAHWSADAVYQEARKVVGALHQIITLRDYIPRILGPEAFQQYVGPYEGYDS
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CCDS16 TANPTVSNVFSTAAFRFGHATIHPLVRRLDASFQEHPDLPGLWLHQAFFSPWTLLRGGGL
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CCDS16 EFCGLPRLETPADLSTAIASRSVADKILDLYKHPDNIDVWLGGLAENFLPRARTGPLFAC
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CCDS16 LIGKQMKALRDGDWFWWENSHVFTDAQRRELEKHSLSRVICDNTGLTRVPMDAFQVGKFP
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CCDS16 EDFESCDSITGMNLEAWRETFPQDDKCGFPESVENGDFVHCEESGRRVLVYSCRHGYELQ
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CCDS16 RALAVLSVTLVMACTEAFFPFISRGKELLWGKPEESRVSSVLEESKRLVDTAMYATMQRN
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CCDS16 PVYEDGFSQPRGWNPGFLYNGFPLPPVREVTRHVIQVSNEVVTDDDRYSDLLMAWGQYID
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CCDS16 HDIAFTPQSTSKAAFGGGADCQMTCENQNPCFPI--------------------------
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CCDS16 AIASRSVADKILDLYKHPDNIDVWLGGLAENFLPRARTGPLFACLIGKQMKALRDGDWFW
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CCDS16 WENSHVFTDAQRRELEKHSLSRVICDNTGLTRVPMDAFQVGKFPEDFESCDSITGMNLEA
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pF1KE0 WRGT
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CCDS16 WRETFPQDDKCGFPESVENGDFVHCEESGRRVLVYSCRHGYELQGREQLTCTQEGWDFQP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]