Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0001
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0001, 497 aa
1>>>pF1KE0001 497 - 497 aa - 497 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0099+/-0.000894; mu= 15.2076+/- 0.054
mean_var=85.0300+/-16.797, 0's: 0 Z-trim(108.0): 37 B-trim: 94 in 2/50
Lambda= 0.139088
statistics sampled from 9873 (9906) to 9873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10949.1 CRISPLD2 gene_id:83716|Hs108|chr16 ( 497) 3545 721.3 6.1e-208
CCDS6219.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 ( 500) 2145 440.3 2.2e-123
CCDS75754.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 ( 312) 1320 274.7 1e-73
CCDS69497.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 ( 314) 1196 249.8 3.2e-66
CCDS6218.1 PI15 gene_id:51050|Hs108|chr8 ( 258) 975 205.4 6.1e-53
CCDS13329.1 R3HDML gene_id:140902|Hs108|chr20 ( 253) 862 182.7 4e-46
CCDS9011.1 GLIPR1 gene_id:11010|Hs108|chr12 ( 266) 454 100.9 1.8e-21
CCDS9009.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 ( 233) 361 82.2 6.9e-16
CCDS76578.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 ( 242) 361 82.2 7.1e-16
CCDS9010.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 ( 253) 355 81.0 1.7e-15
CCDS58258.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 ( 344) 355 81.1 2.2e-15
CCDS4931.1 CRISP1 gene_id:167|Hs108|chr6 ( 249) 306 71.2 1.5e-12
CCDS32473.1 CLEC18C gene_id:283971|Hs108|chr16 ( 446) 289 67.9 2.6e-11
CCDS10886.1 CLEC18A gene_id:348174|Hs108|chr16 ( 446) 289 67.9 2.6e-11
CCDS32484.1 CLEC18B gene_id:497190|Hs108|chr16 ( 455) 287 67.5 3.5e-11
>>CCDS10949.1 CRISPLD2 gene_id:83716|Hs108|chr16 (497 aa)
initn: 3545 init1: 3545 opt: 3545 Z-score: 3846.7 bits: 721.3 E(32554): 6.1e-208
Smith-Waterman score: 3545; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSCVLGGVIPLGLLFLVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDKEEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSCVLGGVIPLGLLFLVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDKEEIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHGPTSLLVSIGQNLGAHWGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHGPTSLLVSIGQNLGAHWGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TPKPETDEMNEVETAPIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPKPETDEMNEVETAPIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 STCNRYQCPAGCLNHKAKIFGTLFYESSSSICRAAIHYGILDDKGGLVDITRNGKVPFFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STCNRYQCPAGCLNHKAKIFGTLFYESSSSICRAAIHYGILDDKGGLVDITRNGKVPFFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KSERHGVQSLSKYKPSSSFMVSKVKVQDLDCYTTVAQLCPFEKPATHCPRIHCPAHCKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KSERHGVQSLSKYKPSSSFMVSKVKVQDLDCYTTVAQLCPFEKPATHCPRIHCPAHCKDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PSYWAPVFGTNIYADTSSICKTAVHAGVISNESGGDVDVMPVDKKKTYVGSLRNGVQSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PSYWAPVFGTNIYADTSSICKTAVHAGVISNESGGDVDVMPVDKKKTYVGSLRNGVQSES
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE0 LGTPRDGKAFRIFAVRQ
:::::::::::::::::
CCDS10 LGTPRDGKAFRIFAVRQ
490
>>CCDS6219.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 (500 aa)
initn: 1926 init1: 1131 opt: 2145 Z-score: 2328.4 bits: 440.3 E(32554): 2.2e-123
Smith-Waterman score: 2145; 59.3% identity (82.5% similar) in 491 aa overlap (13-495:14-499)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSCVLGGVIPLGLLFLVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNE-----SHSRVRRAIPRE
.::.. . ....::.::::.:: ::. .. ...: .::: .
CCDS62 MKCTAREWLRVTTVLFMARAIPAMVVPNATLLEKLLEKYMDEDGEWWIAKQRGKRAITDN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DKEEILMLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHGPTSLLVSIGQNL
: . :: ::::::.:: : :::::::::: :::.:: .:: .:.:::::.::: ::::::
CCDS62 DMQSILDLHNKLRSQVYPTASNMEYMTWDVELERSAESWAESCLWEHGPASLLPSIGQNL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GAHWGRYRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIG
:::::::: : ::::::::::::..::: ::::.:: :::::.::::::.::::.:.::
CCDS62 GAHWGRYRPPTFHVQSWYDEVKDFSYPYEHECNPYCPFRCSGPVCTHYTQVVWATSNRIG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLC
::.: :..:..::..: .:::.:::::::::: :.::::.::::: ::::.::.::.:::
CCDS62 CAINLCHNMNIWGQIWPKAVYLVCNYSPKGNWWGHAPYKHGRPCSACPPSFGGGCRENLC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YRE--ETYTPKPETDEMNEVETAPIP-EENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCD
:.: . : : :. .: ::.: ...:: . : .. . :: . :.:.: :.
CCDS62 YKEGSDRYYP-PREEETNEIERQQSQVHDTHV--RTRSDDSSRNEVISA-QQMSQIVSCE
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TKMKDRCKGSTCNRYQCPAGCLNHKAKIFGTLFYESSSSICRAAIHYGILDDKGGLVDIT
....:.:::.:::::.::::::. :::..:.. :: .::::::::::::.:. :: ::::
CCDS62 VRLRDQCKGTTCNRYECPAGCLDSKAKVIGSVHYEMQSSICRAAIHYGIIDNDGGWVDIT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RNGKVPFFVKSERHGVQSLSKYKPSSSFMVSKVKVQDLDCYTTVAQLCPFEKPATHCPRI
:.:. .:.::.:.:.:...::. ..:: :::: :: . : ::: :::::.:::.::::.
CCDS62 RQGRKHYFIKSNRNGIQTIGKYQSANSFTVSKVTVQAVTCETTVEQLCPFHKPASHCPRV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 HCPAHCKDEPSYWAPVFGTNIYADTSSICKTAVHAGVISNESGGDVDVMPVDKKKTYVGS
.:: .: . ..: :.:: .:.: ::::..::::::. :. :: ::::::::.:::..:
CCDS62 YCPRNCMQANPHYARVIGTRVYSDLSSICRAAVHAGVVRNH-GGYVDVMPVDKRKTYIAS
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE0 LRNGVQSESLGTPRDGKAFRIFAVRQ
..::. :::: .: :::::.:::
CCDS62 FQNGIFSESLQNPPGGKAFRVFAVV
480 490 500
>>CCDS75754.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 (312 aa)
initn: 1096 init1: 724 opt: 1320 Z-score: 1436.8 bits: 274.7 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 1320; 56.6% identity (81.6% similar) in 316 aa overlap (183-495:1-311)
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 RCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPY
:..::..: .:::.:::::::::: :.:::
CCDS75 MNIWGQIWPKAVYLVCNYSPKGNWWGHAPY
10 20 30
220 230 240 250 260
pF1KE0 KNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYRE--ETYTPKPETDEMNEVETAPIP-EENHVWLQPRV
:.::::: ::::.::.::.::::.: . : : :. .: ::.: ...:: . :
CCDS75 KHGRPCSACPPSFGGGCRENLCYKEGSDRYYP-PREEETNEIERQQSQVHDTHV--RTRS
40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 MRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKGSTCNRYQCPAGCLNHKAKIFGTLFYESSS
.. . :: . :.:.: :.....:.:::.:::::.::::::. :::..:.. :: .:
CCDS75 DDSSRNEVISA-QQMSQIVSCEVRLRDQCKGTTCNRYECPAGCLDSKAKVIGSVHYEMQS
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 SICRAAIHYGILDDKGGLVDITRNGKVPFFVKSERHGVQSLSKYKPSSSFMVSKVKVQDL
:::::::::::.:. :: :::::.:. .:.::.:.:.:...::. ..:: :::: :: .
CCDS75 SICRAAIHYGIIDNDGGWVDITRQGRKHYFIKSNRNGIQTIGKYQSANSFTVSKVTVQAV
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 DCYTTVAQLCPFEKPATHCPRIHCPAHCKDEPSYWAPVFGTNIYADTSSICKTAVHAGVI
: ::: :::::.:::.::::..:: .: . ..: :.:: .:.: ::::..::::::.
CCDS75 TCETTVEQLCPFHKPASHCPRVYCPRNCMQANPHYARVIGTRVYSDLSSICRAAVHAGVV
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490
pF1KE0 SNESGGDVDVMPVDKKKTYVGSLRNGVQSESLGTPRDGKAFRIFAVRQ
:. :: ::::::::.:::..:..::. :::: .: :::::.:::
CCDS75 RNH-GGYVDVMPVDKRKTYIASFQNGIFSESLQNPPGGKAFRVFAVV
270 280 290 300 310
>>CCDS69497.1 CRISPLD1 gene_id:83690|Hs108|chr8 (314 aa)
initn: 976 init1: 724 opt: 1196 Z-score: 1302.3 bits: 249.8 E(32554): 3.2e-66
Smith-Waterman score: 1196; 55.7% identity (80.7% similar) in 296 aa overlap (203-495:23-313)
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNN
.::: :.::::.::::: ::::.::.::.:
CCDS69 MNMNATHIVHSGVLALYVHIIHRGNWWGHAPYKHGRPCSACPPSFGGGCREN
10 20 30 40 50
240 250 260 270 280
pF1KE0 LCYRE--ETYTPKPETDEMNEVETAPIP-EENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVR
:::.: . : : :. .: ::.: ...:: . : .. . :: . :.:.:
CCDS69 LCYKEGSDRYYP-PREEETNEIERQQSQVHDTHV--RTRSDDSSRNEVISA-QQMSQIVS
60 70 80 90 100
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 CDTKMKDRCKGSTCNRYQCPAGCLNHKAKIFGTLFYESSSSICRAAIHYGILDDKGGLVD
:.....:.:::.:::::.::::::. :::..:.. :: .::::::::::::.:. :: ::
CCDS69 CEVRLRDQCKGTTCNRYECPAGCLDSKAKVIGSVHYEMQSSICRAAIHYGIIDNDGGWVD
110 120 130 140 150 160
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 ITRNGKVPFFVKSERHGVQSLSKYKPSSSFMVSKVKVQDLDCYTTVAQLCPFEKPATHCP
:::.:. .:.::.:.:.:...::. ..:: :::: :: . : ::: :::::.:::.:::
CCDS69 ITRQGRKHYFIKSNRNGIQTIGKYQSANSFTVSKVTVQAVTCETTVEQLCPFHKPASHCP
170 180 190 200 210 220
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 RIHCPAHCKDEPSYWAPVFGTNIYADTSSICKTAVHAGVISNESGGDVDVMPVDKKKTYV
:..:: .: . ..: :.:: .:.: ::::..::::::. :. :: ::::::::.:::.
CCDS69 RVYCPRNCMQANPHYARVIGTRVYSDLSSICRAAVHAGVVRNH-GGYVDVMPVDKRKTYI
230 240 250 260 270 280
470 480 490
pF1KE0 GSLRNGVQSESLGTPRDGKAFRIFAVRQ
.:..::. :::: .: :::::.:::
CCDS69 ASFQNGIFSESLQNPPGGKAFRVFAVV
290 300 310
>>CCDS6218.1 PI15 gene_id:51050|Hs108|chr8 (258 aa)
initn: 956 init1: 956 opt: 975 Z-score: 1063.9 bits: 205.4 E(32554): 6.1e-53
Smith-Waterman score: 975; 64.9% identity (83.8% similar) in 191 aa overlap (45-235:56-246)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 FLVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDKEEILMLHNKLRGQVQPQA
.: .: : ..: :: ::..::.: : :
CCDS62 NSTDSSPPTNNFTDIEAALKAQLDSADIPKARRKRYISQNDMIAILDYHNQVRGKVFPPA
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 SNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHGPTSLLVSIGQNLGAHWGRYRSPGFHVQSWYDE
.:::::.::..: ::: :::. :::.:::. :: .::::... ::::: :. ::::
CCDS62 ANMEYMVWDENLAKSAEAWAATCIWDHGPSYLLRFLGQNLSVRTGRYRSILQLVKPWYDE
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 VKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAV
::::..:::..::: :: :: :::::::::.::::.:.::::..::..:.::: ::. ::
CCDS62 VKDYAFPYPQDCNPRCPMRCFGPMCTHYTQMVWATSNRIGCAIHTCQNMNVWGSVWRRAV
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 YFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETYTPKPETDEMNEVET
:.::::.:::::::::::: : ::: ::::::::: .:::.
CCDS62 YLVCNYAPKGNWIGEAPYKVGVPCSSCPPSYGGSCTDNLCFPGVTSNYLYWFK
210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 APIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKGSTCNRYQCPAGCLN
>>CCDS13329.1 R3HDML gene_id:140902|Hs108|chr20 (253 aa)
initn: 862 init1: 842 opt: 862 Z-score: 941.5 bits: 182.7 E(32554): 4e-46
Smith-Waterman score: 862; 53.9% identity (79.6% similar) in 191 aa overlap (46-236:53-243)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 LVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDKEEILMLHNKLRGQVQPQAS
: .: : .: . .: ::..:..: : :.
CCDS13 ALIMPNATPAPAQPESTAMRLLSGLEVPRYRRKRHISVRDMNALLDYHNHIRASVYPPAA
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 NMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHGPTSLLVSIGQNLGAHWGRYRSPGFHVQSWYDEV
:::::.:: .: ..: :::.:::: :::..:. .::::. : :.::: ..:: .:
CCDS13 NMEYMVWDKRLARAAEAWATQCIWAHGPSQLMRYVGQNLSIHSGQYRSVVDLMKSWSEEK
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 KDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVY
: .: : .::: :: ::.:: :.::::.:::..:..:::..:: ...:::..:. :.:
CCDS13 WHYLFPAPRDCNPHCPWRCDGPTCSHYTQMVWASSNRLGCAIHTCSSISVWGNTWHRAAY
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 FVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETYTPKPETDEMNEVETA
.::::. :::::::.::: :.::: ::::: ::: .:.:..
CCDS13 LVCNYAIKGNWIGESPYKMGKPCSSCPPSYQGSCNSNMCFKGLKSNKFTWF
210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 PIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKGSTCNRYQCPAGCLNH
>>CCDS9011.1 GLIPR1 gene_id:11010|Hs108|chr12 (266 aa)
initn: 406 init1: 163 opt: 454 Z-score: 498.7 bits: 100.9 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 454; 36.3% identity (60.1% similar) in 223 aa overlap (25-234:5-206)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSCVLGGVIPLGLLFLVCGSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPRED-KEEI
: ... . ..:.:.:. . . : :: ..
CCDS90 MRVTLATIAWMVSFVSNYSHTAN---ILPDIENEDFIKDC
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LMLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHG-----PTSL---LVSIG
. .:::.:..:.: ::.: ::::: : . : ::::.: . :. : .: ..:.:
CCDS90 VRIHNKFRSEVKPTASDMLYMTWDPALAQIAKAWASNCQFSHNTRLKPPHKLHPNFTSLG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KE0 QNLGAHWGRYRSPGFHVQS----WYDEVKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVW
.:. : : : :.: ::::..:: . : .: ::::.::
CCDS90 ENI---W-TGSVPIFSVSSAITNWYDEIQDYDFK----------TRICKKVCGHYTQVVW
100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGG
: . :.::::. : :.. . .. :...:.:::.: ::. ::: : :: :: .
CCDS90 ADSYKVGCAVQFCPKVSGF-DALSNGAHFICNYGPGGNY-PTWPYKRGATCSACPNN--D
150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SCRNNLCYREETYTPKPETDEMNEVETAPIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQV
.: .:::
CCDS90 KCLDNLCVNRQRDQVKRYYSVVYPGWPIYPRNRYTSLFLIVNSVILILSVIITILVQHKY
200 210 220 230 240 250
>>CCDS9009.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 (233 aa)
initn: 375 init1: 168 opt: 361 Z-score: 398.7 bits: 82.2 E(32554): 6.9e-16
Smith-Waterman score: 379; 36.1% identity (57.2% similar) in 180 aa overlap (63-234:41-203)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDKEEILMLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAA
::. ::.:.: :..:.:: :: : : : :
CCDS90 WILGLCLVATTSSKIPSITDPHFIDNCIEAHNEWRGKVNPPAADMKYMIWDKGLAKMAKA
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140
pF1KE0 WASQCIWEHGPT--------SLLVSIGQNLGAHWGRYRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPS
::.:: .::. . . .:.:. . .: . .::.:.. : . :
CCDS90 WANQCKFEHNDCLDKSYKCYAAFEYVGENIWLGGIKSFTPRHAITAWYNETQFYDFDSLS
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 ECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKG
:: .: ::::.:::.. .:::: : .. : ... :::::.: :
CCDS90 ---------CSR-VCGHYTQLVWANSFYVGCAVAMCPNLG--GA---STAIFVCNYGPAG
140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 NWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETYTPKPETDEMNEVETAPIPEENHVW
:. . :: :. :: : : .: .:::
CCDS90 NFANMPPYVRGESCSLC--SKEEKCVKNLCKNPFLKPTGRAPQQTAFNPFSLGFLLLRIF
180 190 200 210 220 230
>>CCDS76578.1 GLIPR1L1 gene_id:256710|Hs108|chr12 (242 aa)
initn: 375 init1: 168 opt: 361 Z-score: 398.5 bits: 82.2 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 385; 35.1% identity (56.4% similar) in 188 aa overlap (63-242:41-211)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDKEEILMLHNKLRGQVQPQASNMEYMTWDDELEKSAAA
::. ::.:.: :..:.:: :: : : : :
CCDS76 WILGLCLVATTSSKIPSITDPHFIDNCIEAHNEWRGKVNPPAADMKYMIWDKGLAKMAKA
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140
pF1KE0 WASQCIWEHGPT--------SLLVSIGQNLGAHWGRYRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPS
::.:: .::. . . .:.:. . .: . .::.:.. : . :
CCDS76 WANQCKFEHNDCLDKSYKCYAAFEYVGENIWLGGIKSFTPRHAITAWYNETQFYDFDSLS
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 ECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTCRKMTVWGEVWENAVYFVCNYSPKG
:: .: ::::.:::.. .:::: : .. : . ... :::::.: :
CCDS76 ---------CSR-VCGHYTQLVWANSFYVGCAVAMCPNL---GGA--STAIFVCNYGPAG
140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 NWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETYTPKPETDEMNEVETAPIPEENHVW
:. . :: :. :: : : .: .::: . :
CCDS76 NFANMPPYVRGESCSLC--SKEEKCVKNLCRTPQLIIPNQNPFLKPTGRAPQQTAFNPFS
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 LQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKGSTCNRYQCPAGCLNHKAKIFGTLF
CCDS76 LGFLLLRIF
240
>>CCDS9010.1 GLIPR1L2 gene_id:144321|Hs108|chr12 (253 aa)
initn: 261 init1: 168 opt: 355 Z-score: 391.7 bits: 81.0 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 365; 32.5% identity (60.0% similar) in 200 aa overlap (49-236:43-225)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 GSQGYLLPNVTLLEELLSKYQHNESHSRVRRAIPREDK----EEILMLHNKLRGQVQPQA
: .: :. .: . :::.:::.: :..
CCDS90 AQSLPLAVGGVLKLRLCELWLLLLGSSLNARFLPDEEDVDFINEYVNLHNELRGDVIPRG
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KE0 SNMEYMTWDDELEKSAAAWASQCIWEHG---PTSLLV-----SIGQNLGAHWGRYRSPGF
::...:::: : ..: ::...:.. :. .: .::.:. . . ..
CCDS90 SNLRFMTWDVALSRTARAWGKKCLFTHNIYLQDVQMVHPKFYGIGENMWVGPENEFTASI
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HVQSWYDEVKDYTYPYPSECNPWCPERCSGPMCTHYTQIVWATTNKIGCAVNTCRKMTVW
..::. : : :.. : ::: :..: :.:: . :.::::. : :.
CCDS90 AIRSWHAEKKMYNFENGS---------CSGD-CSNYIQLVWDHSYKVGCAVTPCSKI---
140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GEVWENAVYFVCNYSPKGNWIGEAPYKNGRPCSECPPSYGGSCRNNLCYREETYTPKPET
:.. . :. :.:::.: :. . . ::. : :..: . .: . :: .
CCDS90 GHIIHAAI-FICNYAPGGT-LTRRPYEPGIFCTRC--GRRDKCTDFLCSKIKKINMKKMH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DEMNEVETAPIPEENHVWLQPRVMRPTKPKKTSAVNYMTQVVRCDTKMKDRCKGSTCNRY
CCDS90 NGLDKKNKRLNTSFLWSC
240 250
497 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 21:53:30 2016 done: Sat Nov 5 21:53:31 2016
Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]