Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9995
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9995, 585 aa
1>>>pF1KB9995 585 - 585 aa - 585 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3155+/-0.000914; mu= 18.9179+/- 0.055
mean_var=68.3810+/-13.598, 0's: 0 Z-trim(106.3): 27 B-trim: 36 in 1/47
Lambda= 0.155098
statistics sampled from 8863 (8889) to 8863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 3.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7149.1 GAD2 gene_id:2572|Hs108|chr10 ( 585) 4006 905.7 0
CCDS2239.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 ( 594) 2618 595.1 8.2e-170
CCDS8848.2 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 ( 520) 1789 409.6 5.1e-114
CCDS58235.1 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 ( 493) 1785 408.6 9.1e-114
CCDS2649.2 GADL1 gene_id:339896|Hs108|chr3 ( 521) 1719 393.9 2.7e-109
CCDS2240.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 ( 224) 565 135.5 7.1e-32
CCDS5511.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 480) 456 111.3 2.9e-24
CCDS75598.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 442) 442 108.1 2.4e-23
CCDS56485.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 402) 438 107.2 4.1e-23
CCDS10134.1 HDC gene_id:3067|Hs108|chr15 ( 662) 418 102.8 1.4e-21
CCDS56487.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 338) 361 89.9 5.5e-18
CCDS56486.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 387) 336 84.4 3e-16
CCDS76754.1 HDC gene_id:3067|Hs108|chr15 ( 629) 335 84.3 5.2e-16
CCDS75599.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 ( 432) 333 83.7 5.2e-16
>>CCDS7149.1 GAD2 gene_id:2572|Hs108|chr10 (585 aa)
initn: 4006 init1: 4006 opt: 4006 Z-score: 4840.7 bits: 905.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4006; 100.0% identity (100.0% similar) in 585 aa overlap (1-585:1-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYGDAEKPAESGG
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CCDS71 MASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYGDAEKPAESGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 YVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 YVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 MHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEY
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CCDS71 LYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB9 GTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
550 560 570 580
>>CCDS2239.1 GAD1 gene_id:2571|Hs108|chr2 (594 aa)
initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618 Z-score: 3162.1 bits: 595.1 E(32554): 8.2e-170
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (2-585:4-594)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
..:.:. : .. : . . : : .:: ::. : .: :.:..: .. :.
CCDS22 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
.. .. : .... .: ... ....... : : ::::: .::. :. :: .:
CCDS22 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
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CCDS22 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
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CCDS22 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
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CCDS22 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
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CCDS22 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
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CCDS22 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
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CCDS22 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
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CCDS22 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KB9 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS22 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
550 560 570 580 590
>>CCDS8848.2 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 (520 aa)
initn: 1456 init1: 782 opt: 1789 Z-score: 2160.5 bits: 409.6 E(32554): 5.1e-114
Smith-Waterman score: 1789; 50.4% identity (80.4% similar) in 510 aa overlap (80-585:15-520)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 GDAEKPAESGGSQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHA-TDLLPACDGERPTL
:. . .. .: : .. ::. :. ..
CCDS88 MSIPLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAV
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 -AFLQDVMNILLQYVV-KSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTT
:.:. :...... .. :. . : :: ... :.:: : . :: .: .. ..:: .:...
CCDS88 EALLRAVFGVVVDEAIQKGTSVSQKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQKQILERCRAV
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 LKYAIKTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMRE
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CCDS88 IRYSVKTGHPRFFNQLFSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRA
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 IIGWPGGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLK
..:: .:::::: :::.::::::. .::.. .:. :..:. .:: : :::.. :.:..
CCDS88 LVGW--SSGDGIFCPGGSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQ
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 KGAAALGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDP
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CCDS88 KGAAFLGLGTDSVRVVKADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDP
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LLAVADICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSA
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CCDS88 LEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSA
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 LLVREEG-LMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTT
::... . :.. :. .::::::::: ::.. :::::..::::.:: .::::::.:.:
CCDS88 LLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQ
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 GFEAHVDKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSR
:.: ..:. . ::.:: . .:.:::.:.:.. :. .:::::..::::: ... . :
CCDS88 GLERRIDQAFVLARYLVEEMKKREGFELVME--PEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHER
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 LSKVAPVIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
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CCDS88 LSKVAPVLKERMVKEGSMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
470 480 490 500 510 520
>>CCDS58235.1 CSAD gene_id:51380|Hs108|chr12 (493 aa)
initn: 1456 init1: 782 opt: 1785 Z-score: 2156.0 bits: 408.6 E(32554): 9.1e-114
Smith-Waterman score: 1785; 51.4% identity (81.4% similar) in 494 aa overlap (95-585:4-493)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTL-AFLQDVMNILLQYVV
.. ::. :. .. :.:. :...... ..
CCDS58 MADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAI
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 -KSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFNQL
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CCDS58 QKGTSVSQKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 STGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFSPG
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CCDS58 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGW--SSGDGIFCPG
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVILI
:.::::::. .::.. .:. :..:. .:: : :::.. :.:..:::: ::.::::: ..
CCDS58 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIWMH
: ::::::.: ::::.: :. .: ::::::::.:::: :::::: :.::.:... .:.:
CCDS58 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 VDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEG-LMQNCNQM
:::::::..:.:. :. :.:..::.::.:::::.... :::::::... . :.. :.
CCDS58 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEYL
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CCDS58 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 YNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEYG
. .:.:::.:.:.. :. .:::::..::::: ... . ::::::::.: ::.. :
CCDS58 VEEMKKREGFELVME--PEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
400 410 420 430 440
550 560 570 580
pF1KB9 TTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
. :..::: : . ::::.:..: : : :.:::..:.:::::::
CCDS58 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
450 460 470 480 490
>>CCDS2649.2 GADL1 gene_id:339896|Hs108|chr3 (521 aa)
initn: 1371 init1: 770 opt: 1719 Z-score: 2075.8 bits: 393.9 E(32554): 2.7e-109
Smith-Waterman score: 1719; 49.1% identity (81.4% similar) in 489 aa overlap (99-585:38-521)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQYVV-KSFD
:. :. . :.... .... :: :. :
CCDS26 QCPVDGDIDQQEMIPSKKNAVLVDGVVLNGPTTDA-KAGEKFVEEACRLIMEEVVLKATD
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFNQLSTGLD
. :: ... :..: : . :. :. . ...: :. ...:..::.:::.:::: .:::
CCDS26 VNEKVCEWRPPEQLKQLLDLEMRDSGEPPHKLLELCRDVIHYSVKTNHPRFFNQLYAGLD
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 MVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFSPGGAISN
. .:.: ..: . : ...:::..:::.:.: ..:::: :.::: :::::.:::..::
CCDS26 YYSLVARFMTEALNPSVYTYEVSPVFLLVEEAVLKKMIEFIGWK--EGDGIFNPGGSVSN
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 MYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVILIKCDER
:::: .::.:. :..::::... :::: ::: . :.:.::.:. :::::..: ... : :
CCDS26 MYAMNLARYKYCPDIKEKGLSGSPRLILFTSAECHYSMKKAASFLGIGTENVCFVETDGR
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIWMHVDAAW
::::: .::... .:...: .:::: ::.:::: :::::: .::::.....:.::::.:
CCDS26 GKMIPEELEKQVWQARKEGAAPFLVCATSGTTVLGAFDPLDEIADICERHSLWLHVDASW
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEG-LMQNCNQMHASYL
::. ::::::. : :..::.::.::::::. . .:: ::::.... :...: . .::::
CCDS26 GGSALMSRKHRKLLHGIHRADSVAWNPHKMLMAGIQCCALLVKDKSDLLKKCYSAKASYL
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 FQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEYLYNIIK
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CCDS26 FQQDKFYDVSYDTGDKSIQCSRRPDAFKFWMTWKALGTLGLEERVNRALALSRYLVDEIK
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 NREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEYGTTMVS
.:::...... :...:.:::::::::: .:.. : ..:. :::.:: :::. :. :..
CCDS26 KREGFKLLME--PEYANICFWYIPPSLREMEEGPEFWAKLNLVAPAIKERMMKKGSLMLG
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580
pF1KB9 YQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
::: ::::::.:. .: ....:.:::..::. ::.:.
CCDS26 YQPHRGKVNFFRQVVISPQVSREDMDFLLDEIDLLGKDM
490 500 510 520
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10 20 30 40 50
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..:.:. : .. : . . : : .:: ::. : .: :.:..: .. :.
CCDS22 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
.. .. : .... .: ... ....... : : ::::: .::. :. :: .:
CCDS22 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
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CCDS22 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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CCDS22 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMPSDMRECWLLR
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pF1KB9 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
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CCDS55 YFPTASSYPAMLADMLCGAIGCIGFSWAASPACTELETVMMDWLGKMLELPKAFLNEKAG
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: :... ... ... :.. :: :.. ::. . : . .:.:..:...: :..
CCDS55 EGGGVIQGSASEATLVALLAARTKVIHRLQAASPELTQA--AIMEKLVAYSSDQAHSSVE
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. :.: :: .. : : : : :.. . . : :..::.. :: :::. .::
CCDS55 R--AGL-IGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQEALERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCSFDN
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CCDS55 LLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPEFRHLLNGVEFADSFNFNPHKWLLVNFDCSA
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pF1KB9 LLVREEGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTG
. :... . . .. .:: .. . : : . ::. .:.:...: :. :
CCDS55 MWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLITDYRHWQIPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVKG
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pF1KB9 FEAHVDKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRL
..:.. : ..:.. . ..... .:.
CCDS55 LQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEICVEVILGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKKI
380 390 400 410 420 430
>>CCDS75598.1 DDC gene_id:1644|Hs108|chr7 (442 aa)
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.:. . :: : . . ... : .
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240 250 260 270 280
pF1KB9 GSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMF-------PEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSL
: : :... ... ... :.. :: :.. ::. . : . .:.:..:...: :.
CCDS75 GEGGGVIQGSASEATLVALLAARTKVIHRLQAASPELTQ--AAIMEKLVAYSSDQAHSSV
100 110 120 130 140 150
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pF1KB9 KKGAAALGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFD
.. :.: :: .. : : : : :.. . . : :..::.. :: :::. .::
CCDS75 ER--AGL-IGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQEALERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCSFD
160 170 180 190 200 210
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pF1KB9 PLLAVADICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCS
:: :. ::.: ::.:::::..:. .. . . :.::: :.: ..:::: . : ..::
CCDS75 NLLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPEFRHLLNGVEFADSFNFNPHKWLLVNFDCS
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pF1KB9 ALLVREEGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTT
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CCDS75 AMWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLITDYRHWQIPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB9 GFEAHVDKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSR
:..:.. : ..:.. . ..... .:.
CCDS75 GLQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEICVEVILGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKK
340 350 360 370 380 390
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pF1KB9 EIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFSPGGAISN--MYAMMIARFKMF------
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CCDS56 VEPGYLRPLIPAAAPQEPDTFEDIINDVEKIIMPGGSASEATLVALLAARTKVIHRLQAA
40 50 60 70 80 90
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pF1KB9 -PEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERR
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CCDS56 SPELTQA--AIMEKLVAYSSDQAHSSVER--AGL-IGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQEA
100 110 120 130 140
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pF1KB9 ILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHK
. . : :..::.. :: :::. .:: :: :. ::.: ::.:::::..:. .. . .
CCDS56 LERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCSFDNLLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPEFR
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pF1KB9 WKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYD
:.::: :.: ..:::: . : ..:::. :... . . .. .:: .. . : :
CCDS56 HLLNGVEFADSFNFNPHKWLLVNFDCSAMWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLITD
210 220 230 240 250 260
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pF1KB9 TGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGK
. ::. .:.:...: :. :..:.. : ..:.. . ..... .:.
CCDS56 YRHWQIPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVKGLQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEICVEVI
270 280 290 300 310 320
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pF1KB9 PQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFR
CCDS56 LGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKKIHLVPCHLRDKFVLRFAICSRTVESAHVQRAWE
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pF1KB9 CSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNEL
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CCDS10 MMEPEEYRERGREMVDYICQYL--STVRERRVTPDVQPGYL
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB9 LQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI---KTGHPR-YFNQLSTGLDMVGLAADWLT
. ..:.. . :. . . .. .. : . :. :.. ...: : :.
CCDS10 RAQLPESAPEDPDSWDSIFGDIERIIMPGVVHWQSPHMHAYYPALTSWPSLLG---DMLA
40 50 60 70 80 90
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CCDS10 DAINCLGFTWASSPACTELEMNVMDWLAKMLGLPEHFLHHHPSSQGGGVLQSTVSESTLI
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CCDS10 ALLAARKNKILEMKTSEPDADESCLNA--RLVAYASDQAHSSVEK--AGL-ISLVKMKFL
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CCDS10 PVDDNFSLRGEALQKAIEEDKQRGLVPVFVCATLGTTGVCAFDCLSELGPICAREGLWLH
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CCDS10 IDAAYAGTAFLCPEFRGFLKGIEYADSFTFNPSKWMMVHFDCTGFWVKDKYKLQQTFSVN
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pF1KB9 ASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEYLY
:: . .. .. : . .:. :::.. :. :. ...::: . :.:.:.
CCDS10 PIYLRHANS--GVATDFMHWQIPLSRRFRSVKLWFVIRSFGVKNLQAHVRHGTEMAKYFE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]