Result of FASTA (omim) for
pF1KB9933
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9933, 489 aa
1>>>pF1KB9933 489 - 489 aa - 489 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3326+/-0.000385; mu= 14.0328+/- 0.024
mean_var=126.9980+/-26.965, 0's: 0 Z-trim(115.4): 163 B-trim: 106 in 1/54
Lambda= 0.113809
statistics sampled from 25640 (25820) to 25640 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 9.980
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001018080 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapie ( 489) 3310 555.2 1.6e-157
NP_065174 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens] ( 489) 3310 555.2 1.6e-157
NP_001098707 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform a [ ( 527) 2476 418.2 2.7e-116
XP_016874610 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 527) 2476 418.2 2.7e-116
XP_016874611 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 474) 2474 417.9 3.2e-116
XP_016874612 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 474) 2474 417.9 3.2e-116
NP_001263400 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [ ( 474) 2474 417.9 3.2e-116
NP_055140 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Hom ( 474) 2474 417.9 3.2e-116
NP_009005 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Homo s ( 461) 2190 371.2 3.4e-102
XP_011544016 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 461) 2190 371.2 3.4e-102
NP_001180262 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Hom ( 461) 2190 371.2 3.4e-102
XP_016878374 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 463) 2190 371.2 3.4e-102
XP_016878375 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 463) 2190 371.2 3.4e-102
NP_003380 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] ( 525) 1434 247.2 8.7e-65
NP_438171 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] ( 525) 1434 247.2 8.7e-65
XP_011517288 (OMIM: 602159) PREDICTED: coronin-2A ( 525) 1434 247.2 8.7e-65
NP_001177386 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 1385 239.1 2.1e-62
NP_001310943 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 1385 239.1 2.1e-62
NP_001177385 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 1385 239.1 2.1e-62
NP_001310944 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 1385 239.1 2.1e-62
NP_006082 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 1 [Hom ( 480) 1385 239.1 2.1e-62
XP_011536427 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 286) 1214 210.8 4.2e-54
NP_078811 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 1 [Homo ( 925) 721 130.3 2.3e-29
NP_001188401 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 2 [H ( 907) 614 112.7 4.4e-24
NP_001188402 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 3 [H ( 840) 494 93.0 3.5e-18
NP_004805 (OMIM: 607797) U5 small nuclear ribonucl ( 357) 207 45.5 0.00029
NP_001309196 (OMIM: 607795,615922) U4/U6 small nuc ( 279) 184 41.7 0.0033
NP_001309195 (OMIM: 607795,615922) U4/U6 small nuc ( 279) 184 41.7 0.0033
NP_115737 (OMIM: 606929) THO complex subunit 3 [Ho ( 351) 184 41.8 0.0039
NP_001231855 (OMIM: 607795,615922) U4/U6 small nuc ( 521) 185 42.1 0.0047
NP_004688 (OMIM: 607795,615922) U4/U6 small nuclea ( 522) 185 42.1 0.0047
NP_004795 (OMIM: 604333) probable cytosolic iron-s ( 339) 176 40.4 0.0095
>>NP_001018080 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens] (489 aa)
initn: 3310 init1: 3310 opt: 3310 Z-score: 2949.2 bits: 555.2 E(85289): 1.6e-157
Smith-Waterman score: 3310; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LGRMENGDA
:::::::::
NP_001 LGRMENGDA
>>NP_065174 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens] (489 aa)
initn: 3310 init1: 3310 opt: 3310 Z-score: 2949.2 bits: 555.2 E(85289): 1.6e-157
Smith-Waterman score: 3310; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LGRMENGDA
:::::::::
NP_065 LGRMENGDA
>>NP_001098707 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform a [Homo (527 aa)
initn: 2447 init1: 2447 opt: 2476 Z-score: 2208.8 bits: 418.2 E(85289): 2.7e-116
Smith-Waterman score: 2540; 72.9% identity (91.5% similar) in 483 aa overlap (2-484:53-525)
10 20 30
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRV
..:.::::::::::::: :::::::.::::
NP_001 SIACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRV
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAFLVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWC
:::::::.::::::.:.:.:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::
NP_001 SRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWC
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSPLTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSA
::::.:::::::::::::::::::::: ::::::.::::.:::::.:::::::::::::
NP_001 PHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSA
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIYNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLV
::::...::::::.: : ::..: :.:::::::.::::.:.: :::.::.::::. .:
NP_001 GCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 AEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFSRMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGAL
::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.:
NP_001 AEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVL
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSK
:::::::::..:.::::::::::::::.: ::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:
NP_001 LPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNK
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 CEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILIS
::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :..:::::::
NP_001 CEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILIS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMAPGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAG
:...:.:.:.::::. ..:.: ::.:. . .. : .:: .:.. .::
NP_001 LKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-
450 460 470 480 490
460 470 480
pF1KB9 KLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQLGRMENGDA
::.:...:..... . .: .:: .::.:....
NP_001 KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
500 510 520
>>XP_016874610 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof (527 aa)
initn: 2447 init1: 2447 opt: 2476 Z-score: 2208.8 bits: 418.2 E(85289): 2.7e-116
Smith-Waterman score: 2540; 72.9% identity (91.5% similar) in 483 aa overlap (2-484:53-525)
10 20 30
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRV
..:.::::::::::::: :::::::.::::
XP_016 SIACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRV
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAFLVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWC
:::::::.::::::.:.:.:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::
XP_016 SRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWC
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSPLTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSA
::::.:::::::::::::::::::::: ::::::.::::.:::::.:::::::::::::
XP_016 PHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSA
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIYNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLV
::::...::::::.: : ::..: :.:::::::.::::.:.: :::.::.::::. .:
XP_016 GCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 AEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFSRMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGAL
::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.:
XP_016 AEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVL
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSK
:::::::::..:.::::::::::::::.: ::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:
XP_016 LPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNK
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 CEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILIS
::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :..:::::::
XP_016 CEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILIS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMAPGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAG
:...:.:.:.::::. ..:.: ::.:. . .. : .:: .:.. .::
XP_016 LKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-
450 460 470 480 490
460 470 480
pF1KB9 KLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQLGRMENGDA
::.:...:..... . .: .:: .::.:....
XP_016 KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
500 510 520
>>XP_016874611 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof (474 aa)
initn: 2445 init1: 2445 opt: 2474 Z-score: 2207.6 bits: 417.9 E(85289): 3.2e-116
Smith-Waterman score: 2538; 73.2% identity (91.5% similar) in 481 aa overlap (4-484:2-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::.::::::.:.:.:.::::::::
XP_016 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
::::: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
XP_016 LVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
::::::.::::.:::::.:::::::::::::::::...::::::.: : ::..: :.::
XP_016 LTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
:::::.::::.:.: :::.::.::::. .:::.::::::::::::::::::.:::::::
XP_016 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFS
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pF1KB9 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.::::::::::..:.::::::::::::::.:
XP_016 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
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::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:::::::.::::::::::.:::::::::::
XP_016 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
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XP_016 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTAN
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
. .. : .:: .:.. .:: ::.:...:..... . .: .:: .::.:
XP_016 KKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
420 430 440 450 460
pF1KB9 LGRMENGDA
....
XP_016 MAKIAA
470
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initn: 2445 init1: 2445 opt: 2474 Z-score: 2207.6 bits: 417.9 E(85289): 3.2e-116
Smith-Waterman score: 2538; 73.2% identity (91.5% similar) in 481 aa overlap (4-484:2-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::.::::::.:.:.:.::::::::
XP_016 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
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::::: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
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::::::.::::.:::::.:::::::::::::::::...::::::.: : ::..: :.::
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:::::.::::.:.: :::.::.::::. .:::.::::::::::::::::::.:::::::
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pF1KB9 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.::::::::::..:.::::::::::::::.:
XP_016 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
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pF1KB9 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:::::::.::::::::::.:::::::::::
XP_016 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
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pF1KB9 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
::::::::::::::::::: :..::::::::...:.:.:.::::. ..:.: ::.:.
XP_016 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTAN
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pF1KB9 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
. .. : .:: .:.. .:: ::.:...:..... . .: .:: .::.:
XP_016 KKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
420 430 440 450 460
pF1KB9 LGRMENGDA
....
XP_016 MAKIAA
470
>>NP_001263400 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Homo (474 aa)
initn: 2445 init1: 2445 opt: 2474 Z-score: 2207.6 bits: 417.9 E(85289): 3.2e-116
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10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::.::::::.:.:.:.::::::::
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::::: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
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::::::.::::.:::::.:::::::::::::::::...::::::.: : ::..: :.::
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pF1KB9 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
:::::.::::.:.: :::.::.::::. .:::.::::::::::::::::::.:::::::
NP_001 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.::::::::::..:.::::::::::::::.:
NP_001 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
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pF1KB9 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:::::::.::::::::::.:::::::::::
NP_001 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
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pF1KB9 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
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NP_001 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTAN
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
. .. : .:: .:.. .:: ::.:...:..... . .: .:: .::.:
NP_001 KKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
420 430 440 450 460
pF1KB9 LGRMENGDA
....
NP_001 MAKIAA
470
>>NP_055140 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Homo sa (474 aa)
initn: 2445 init1: 2445 opt: 2474 Z-score: 2207.6 bits: 417.9 E(85289): 3.2e-116
Smith-Waterman score: 2538; 73.2% identity (91.5% similar) in 481 aa overlap (4-484:2-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::.::::::.:.:.:.::::::::
NP_055 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
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::::: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_055 LVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLS
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pF1KB9 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
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NP_055 LTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
:::::.::::.:.: :::.::.::::. .:::.::::::::::::::::::.:::::::
NP_055 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.::::::::::..:.::::::::::::::.:
NP_055 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:::::::.::::::::::.:::::::::::
NP_055 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KB9 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
::::::::::::::::::: :..::::::::...:.:.:.::::. ..:.: ::.:.
NP_055 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTAN
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
. .. : .:: .:.. .:: ::.:...:..... . .: .:: .::.:
NP_055 KKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
420 430 440 450 460
pF1KB9 LGRMENGDA
....
NP_055 MAKIAA
470
>>NP_009005 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Homo sapie (461 aa)
initn: 2244 init1: 1235 opt: 2190 Z-score: 1955.7 bits: 371.2 E(85289): 3.4e-102
Smith-Waterman score: 2217; 66.5% identity (86.2% similar) in 477 aa overlap (4-479:3-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
:.:::.::::::::::.: ::::::.:::..:::: ::::::::.:.: ::::::::
NP_009 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAF
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pF1KB9 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
:::::.::::.:: :::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.::..:: :
NP_009 LVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLP
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pF1KB9 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDS-LHPDLI
: ::::.::::::::::.::: ::.:::::::::::...:.:::. . : .::: :
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pF1KB9 YNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGF
:.:.:...:.:.:..:.:: ::::.::.::.:::... :::.::.::.:...::..::::
NP_009 YSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGF
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 SRMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITE
:::::::.:::: ..::::..:::::.:.:.::::.::::..::.::::::::::::::
NP_009 SRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITS
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 EPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLF
: :..:.:. :.::: ::::: ::::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::
NP_009 EAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLF
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pF1KB9 QDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAM
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NP_009 QEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRG--LDTGRRRA
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pF1KB9 APGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEE
:: .: :.:.: :: ...::: :.: :.: :.: :. ::::
NP_009 APEAS--GTPSS-----DA-----------VSRLEE---EMRKLQATVQELQKRLDRLEE
420 430 440 450
480
pF1KB9 QLGRMENGDA
NP_009 TVQAK
460
>>XP_011544016 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coronin- (461 aa)
initn: 2244 init1: 1235 opt: 2190 Z-score: 1955.7 bits: 371.2 E(85289): 3.4e-102
Smith-Waterman score: 2217; 66.5% identity (86.2% similar) in 477 aa overlap (4-479:3-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
:.:::.::::::::::.: ::::::.:::..:::: ::::::::.:.: ::::::::
XP_011 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
:::::.::::.:: :::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.::..:: :
XP_011 LVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDS-LHPDLI
: ::::.::::::::::.::: ::.:::::::::::...:.:::. . : .::: :
XP_011 LREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 YNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGF
:.:.:...:.:.:..:.:: ::::.::.::.:::... :::.::.::.:...::..::::
XP_011 YSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SRMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITE
:::::::.:::: ..::::..:::::.:.:.::::.::::..::.::::::::::::::
XP_011 SRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 EPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLF
: :..:.:. :.::: ::::: ::::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::
XP_011 EAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 QDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAM
:.:::: ::::. :: ::::..:::: :.::::...::: :.:.:...: :. .:
XP_011 QEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRG--LDTGRRRA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 APGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEE
:: .: :.:.: :: ...::: :.: :.: :.: :. ::::
XP_011 APEAS--GTPSS-----DA-----------VSRLEE---EMRKLQATVQELQKRLDRLEE
420 430 440 450
480
pF1KB9 QLGRMENGDA
XP_011 TVQAK
460
489 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 14:52:43 2016 done: Sat Nov 5 14:52:44 2016
Total Scan time: 9.980 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]