Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9864
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9864, 422 aa
1>>>pF1KB9864 422 - 422 aa - 422 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1329+/-0.000806; mu= 18.9027+/- 0.049
mean_var=141.6542+/-52.573, 0's: 0 Z-trim(109.6): 258 B-trim: 1291 in 2/49
Lambda= 0.107760
statistics sampled from 10538 (11033) to 10538 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16
Scan time: 2.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 2821 450.6 1.3e-126
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 753 129.1 7.7e-30
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 721 124.1 2.3e-28
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 709 122.3 8.8e-28
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 659 114.5 1.8e-25
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 648 112.7 5.9e-25
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 646 112.4 7.3e-25
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 582 102.8 9.2e-22
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 568 100.2 3.1e-21
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 568 100.4 3.6e-21
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 568 100.4 3.7e-21
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 568 100.4 3.7e-21
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 568 100.5 3.8e-21
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 567 100.3 4.1e-21
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 558 99.0 1.2e-20
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 550 97.6 2.6e-20
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 541 96.2 6.5e-20
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 541 96.2 6.7e-20
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 541 96.3 6.9e-20
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 528 94.2 2.7e-19
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 520 92.8 5.7e-19
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 491 88.4 1.5e-17
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 487 87.7 2e-17
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 487 87.8 2.1e-17
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 486 87.7 2.6e-17
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 483 87.1 3.1e-17
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 483 87.1 3.2e-17
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 464 84.2 2.5e-16
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 462 84.1 3.9e-16
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 455 82.9 7.2e-16
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 448 81.8 1.5e-15
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 440 80.5 3.4e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 436 80.0 6e-15
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 428 78.7 1.3e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 427 78.5 1.4e-14
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 417 77.0 4.4e-14
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 416 76.8 4.8e-14
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 409 75.6 8.9e-14
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 409 75.6 9.1e-14
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 409 75.6 9.3e-14
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 409 75.6 9.3e-14
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 409 75.6 9.6e-14
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 409 75.7 9.8e-14
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 406 75.3 1.4e-13
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 401 74.5 2.4e-13
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 386 72.2 1.3e-12
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 380 71.0 2e-12
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 372 69.9 5.4e-12
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 360 68.2 2.2e-11
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 360 68.2 2.2e-11
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 2821 init1: 2821 opt: 2821 Z-score: 2386.7 bits: 450.6 E(32554): 1.3e-126
Smith-Waterman score: 2821; 100.0% identity (100.0% similar) in 422 aa overlap (1-422:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RQ
::
CCDS34 RQ
>>CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (414 aa)
initn: 685 init1: 345 opt: 753 Z-score: 649.2 bits: 129.1 E(32554): 7.7e-30
Smith-Waterman score: 753; 33.2% identity (66.6% similar) in 386 aa overlap (42-417:40-414)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 TTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALERSLQNVA
:: :: :.::. : :.. :..::...
CCDS83 DDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVSREKALQTTT
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 NYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIA
:::: ::::.::.:..::.: .. .:...: .... ::.:..:::. ::.:::.::::.
CCDS83 NYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTASILNLCAIS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180
pF1KB9 LDRYWAITDPIDYVNKR--TPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPDACTI
.::: :.. :. : : : . ::....::..:...: :: : ..: . .: . : :
CCDS83 IDRYTAVAMPMLY-NTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGL----NNADQNECII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQ
. . ....::.. .::.:... :..: .:. . : : :: :. ... : : .: .
CCDS83 A-NPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRR-RKRVNTKRSSRAFRAHLRAPLKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PKKS--------VNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNS
. ... : . : . . : ..: .. . .. :..
CCDS83 AARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPF
:.: : .. : . : . .. ..::.. .:.:... :.:..:.::.:::::
CCDS83 KDH-PKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTM-SRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCR
::. .. :. :..: .: . ..:::: :: .::.::. :: .:..:: ::..:
CCDS83 FITHILNIHCD--CNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
370 380 390 400 410
pF1KB9 Q
>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 988 init1: 662 opt: 721 Z-score: 622.6 bits: 124.1 E(32554): 2.3e-28
Smith-Waterman score: 999; 40.0% identity (69.6% similar) in 415 aa overlap (11-420:24-388)
10 20 30 40
pF1KB9 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLI
: .: :. .. . ..... ..:. .::. .
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 FCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQV
. ..:.:: :.:.. :.:.. :::::.:::::::.::.::.:....: : ..::::::
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLI
.::.... :. :::.::::::.::::::::::: ..: ::::.:::..:.:.:.... :
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SIPPMLGWRTPEDRSDPDACTISKDHG-YTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRI
:.::.. :: . . . . :... :: ::.::: ::::.: ::...:::::. :: ::
CCDS49 SLPPFF-WRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRI
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 RKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDD
: . :... :.: : . . . :. . ..
CCDS49 LKQT-------------------PNRT-----GKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSI-----
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 GAALEVIEVHRVGNSKEHLP-LPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEA---KRKMALARERK
::. .: .:::.: .:. .. . : ..: :.:. :::::
CCDS49 -------------NSR--VPDVPSESG----SPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERK
280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 TVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAY
..::::::.:.::.:::::::..::.:.:...: . . ...:::: :::.::.::..
CCDS49 ATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTM
320 330 340 350 360 370
410 420
pF1KB9 FNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
:.::..::.:.:. : :
CCDS49 SNEDFKQAFHKLIRFK-CTS
380 390
>>CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 651 init1: 195 opt: 709 Z-score: 612.2 bits: 122.3 E(32554): 8.8e-28
Smith-Waterman score: 709; 32.5% identity (62.0% similar) in 418 aa overlap (16-417:18-418)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVL-GNACV
:: ..: ..:.. : ..:. :.:.. ::: ::. :
CCDS77 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAG-----QGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLN-KWTLGQVTCDLFIALD
...: ::.::. .: .: :::..::....::::. . .: . : :. :: ..:.:
CCDS77 CVSVATERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWR
:. ::.::..::::..::. :.. :. : . :: ::. :::.. .. : . :
CCDS77 VMLCTASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNRQGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TPEDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRA-ARFRIRKTVK---K
. : :: .: . .:. :..::. .:..: :::.:: ::. :... . .: .
CCDS77 DVRGR-DPAVCRL-EDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VEK--TGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAAL
. . .: . :::. .. : . . :. : :: .: .: .
CCDS77 APRRPSGPGPPSPTPPAPRLPQDPCGPDCAPPAP-GLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 EVIEVHRVGNSKEHLPLPSEAGPTPCAP------ASFERKNERNAEAKRKMALA-RERKT
. . :: :. : . ::: :.. .. ... .:. .. ::::.
CCDS77 D------CAPPAPGLP-PDPCG-SNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKA
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 VKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYF
...: ...:.:.::: :::.: .. .: . : .: : . ..:::: :: ::::::. :
CCDS77 MRVLPVVVGAFLLCWTPFFVVHITQALCPA-CSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVF
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB9 NKDFQNAFKKIIK-CKFCRQ
: .:.:.:.: .. :
CCDS77 NAEFRNVFRKALRACC
410
>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 968 init1: 637 opt: 659 Z-score: 570.7 bits: 114.5 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 950; 40.8% identity (70.7% similar) in 382 aa overlap (36-415:38-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
.. ...:... . .::.:: :...: : :
CCDS23 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
.:.. :::::::::.:::.::.::.:.. : . . :..::. ::.... :. :::.:::
CCDS23 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
:::.::::::::::: ..: ..:: .::..:...: :.. :::::.. :: . . . .
CCDS23 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLF-WRQAKAQEEMS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ACTISKDH-GYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
: .. .. .:::::: :::::: .:...:::::.:::: :: .
CCDS23 DCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNP---------------
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCA-NGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNSKE
:. :. .... . ..::..::. :.....: . : .:.
CCDS23 -PSLYGKRFTTAHL--------ITGSAGSSLCSLNSSLHEGHS---------HSAGS---
240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFI
:: . : ...::: ... :::::..: ::::.:.::.::::::.
CCDS23 --PLFFNHVKIKLADSALERK---------RISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFV
280 290 300 310
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pF1KB9 VALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
:.::::.:..:: . : ...:::: :::.::.::. ::..:..::.::.
CCDS23 VSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
320 330 340 350 360 370
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. .: :.. ... . : .. ..: : :. :
CCDS50 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMA
10 20 30 40
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:. ..:.. ::::: :::::::.:.:::.:.. .: :...: :: :......:. ::
CCDS50 IGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCC
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pF1KB9 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
: ::::::.::::::::::. :.:. ::: .::: .: .: :...::.::.. ::. .
CCDS50 TCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF-WRSHRR
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: : . :::..:: ::::::.::::::: :.:.:: ::..::. . .: :.
CCDS50 LSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRGS
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.:: .. . . ..: . : ..:.. : ... . : ..
CCDS50 -SRHLSNRSTDSQNSFAS------------CKLTQTFCVS------DFSTSDPTTEFEKF
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pF1KB9 GNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCW
: . :. .. ... .:: .... .::::... ::.:.:.::: :
CCDS50 HASIRIPPFDND----------LDHPGER-----QQISSTRERKAARILGLILGAFILSW
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pF1KB9 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCK
::::: :.. . : . . .. ...:::: :::.::..:. ::.::. ::::.:.:.
CCDS50 LPFFIKELIVGL--SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCR
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420
pF1KB9 FCRQ
CCDS50 EHT
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....:: :. : . .. :. :.::: . :
CCDS29 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
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.:.. ::::: ::::::..:.:::.:.. .: : ..: .:::.::.....:. ::: :::
CCDS29 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
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pF1KB9 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
:: ::::::: :::: ..:. ::::..:. .:...:.:. .::.::.. :: . : :
CCDS29 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF-WRH-QGTSRDD
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pF1KB9 ACTISKDHGY-TIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
: :..:: ::::::::::::: :.:.:: .:.:::. .: :...
CCDS29 ECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHK------------RQAS
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: :. :::. : :. .. .. ..... . . . ..: . :
CCDS29 RIA---KEEVNGQV-----LLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRS---
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pF1KB9 LPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIV
: :: : :.:.. . ..:.. .::::.. :::.:.:.:..::::::.
CCDS29 --LRSE----------F--KHEKSWR-RQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVK
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::. :.. :.. .. .. :::: :::.::.::. ::.::..::.:...:. :
CCDS29 ELVVNVCDK-CKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCR-C
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10 20
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CCDS13 GGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTA
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 -ISDVTVSYQ-VITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMV
.. ..:: : : ....:...:. :: :: :. ..: .: ::.:.::.: .:::.::..
CCDS13 AVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLL
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90 100 110 120 130 140
pF1KB9 SVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYV
:. :::..: ..::. :..:.. ::.. :.::::::.::: ::.:..::: .. . :
CCDS13 SATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYP
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150 160 170 180 190 200
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: :.:::...: :......:. :.:::. : : : :... ::...:. .::
CCDS13 AIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVP-PDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFY
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210 220 230 240 250 260
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.:. ...:.: :.. .:: .:....: .:. : :... :.
CCDS13 LPMAVIVVMYCRVYVVAR----STTRSLE-AGV-------------KRERGKASEVVLRI
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270 280 290 300 310 320
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.. : :: ::: : . ..: : .:
CCDS13 HCRGAATGA-----------DGA-------HGMRSAKGH---------------TF----
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:.. . : . ..::.:..:::.:..:.:.:::.::: .:::. .. :.
CCDS13 -RSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPFF---FVLPLGSLFPQLKPSEGVFK
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pF1KB9 IINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
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CCDS13 VIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ-CRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSG
390 400 410 420 430 440
CCDS13 LRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFR
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CCDS83 LSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVL
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:::.::. :: :..::: ... :. : . : ::. . .: ....::: :..::: :
CCDS83 CCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLFGWRQP
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pF1KB9 EDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGA
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CCDS83 APE-DETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGL-----KSGL
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pF1KB9 DTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRV
: .: :.. : .. : . : : .: :
CCDS83 KT---------------DKSDSEQVTLRIHRKNAPA---------GGSGMA--------S
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pF1KB9 GNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCW
...: :. . : . ..::.:..:::::..: :.:::
CCDS83 AKTKTHFSV-------------------------RLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCW
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pF1KB9 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCK
:::: ::.:. : .
CCDS83 LPFF---LVMPIDEETEAQEGKNDSPSFKQPVHHAAVLGLEVMEKENLEGVSRKDTCGVW
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVV
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CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAP------------VNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVI
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pF1KB9 AAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVL
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CCDS60 LSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVL
50 60 70 80 90 100
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:::.::. :: :..::: ... :. : . : ::. . .: ....::: :..::: :
CCDS60 CCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLFGWRQP
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pF1KB9 EDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGA
. : : :... ::...:..:.::.:: ..::.: :.. .:. . : :.:
CCDS60 APE-DETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGL-----KSGL
170 180 190 200 210 220
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: .: :.. : .. : . : : .: :
CCDS60 KT---------------DKSDSEQVTLRIHRKNAPA---------GGSGMA--------S
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CCDS60 AKTKTHFSV-------------------------RLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCW
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pF1KB9 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKI--IK
::::.: . : . :.. :. :::: :: .::.:: ...:..::... :.
CCDS60 LPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVF-KIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLRIQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 CKFCRQ
: .::.
CCDS60 C-LCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFSSM
350 360 370 380 390 400
422 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]