Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9847
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9847, 375 aa
1>>>pF1KB9847 375 - 375 aa - 375 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0941+/- 0.001; mu= 17.5472+/- 0.060
mean_var=94.1690+/-31.593, 0's: 0 Z-trim(104.0): 263 B-trim: 898 in 2/47
Lambda= 0.132166
statistics sampled from 7334 (7675) to 7334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 2505 488.6 3.9e-138
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 2494 486.5 1.7e-137
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 1110 222.6 4.7e-58
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 635 132.0 8.4e-31
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 580 121.5 1.2e-27
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 554 116.6 4.1e-26
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 553 116.4 4.7e-26
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 544 114.7 1.5e-25
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 539 113.7 2.9e-25
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 539 113.7 3e-25
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 539 113.8 3.4e-25
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 490 104.4 1.9e-22
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 470 100.5 2.5e-21
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 448 96.3 4.5e-20
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 448 96.3 4.6e-20
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 448 96.4 5.1e-20
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 429 92.7 5.8e-19
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 406 88.3 1.2e-17
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 394 86.1 5.9e-17
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 394 86.1 6.4e-17
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 372 81.9 1.1e-15
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 369 81.3 1.7e-15
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 368 81.2 2e-15
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 368 81.2 2.3e-15
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 362 80.0 4.4e-15
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 358 79.2 6.6e-15
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 353 78.2 1.2e-14
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 351 77.9 1.8e-14
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 351 77.9 1.8e-14
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 346 76.9 3.4e-14
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 341 75.9 6e-14
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 338 75.3 8.3e-14
CCDS81616.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 381) 332 74.2 2.1e-13
CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7 ( 613) 328 73.7 4.9e-13
CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 ( 427) 325 72.9 5.7e-13
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 323 72.5 6.7e-13
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 319 71.7 1.1e-12
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 318 71.6 1.4e-12
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 314 70.9 2.5e-12
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 310 70.0 3.6e-12
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 308 69.6 4.8e-12
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 308 69.7 5.2e-12
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 306 69.4 7.6e-12
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 298 67.7 1.7e-11
CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 ( 328) 297 67.5 1.9e-11
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 295 67.1 2.6e-11
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 292 66.6 3.9e-11
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 291 66.4 4.6e-11
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 291 66.4 4.8e-11
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 291 66.4 4.9e-11
>>CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 (375 aa)
initn: 2505 init1: 2505 opt: 2505 Z-score: 2593.5 bits: 488.6 E(32554): 3.9e-138
Smith-Waterman score: 2505; 100.0% identity (100.0% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICHG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB9 VSKGSLRLSGRSNPI
:::::::::::::::
CCDS81 VSKGSLRLSGRSNPI
370
>>CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 (375 aa)
initn: 2494 init1: 2494 opt: 2494 Z-score: 2582.1 bits: 486.5 E(32554): 1.7e-137
Smith-Waterman score: 2494; 99.7% identity (99.7% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICHG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB9 VSKGSLRLSGRSNPI
:::::::::::::::
CCDS73 VSKGSLRLSGRSNPI
370
>>CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 (384 aa)
initn: 1063 init1: 552 opt: 1110 Z-score: 1155.8 bits: 222.6 E(32554): 4.7e-58
Smith-Waterman score: 1110; 45.7% identity (76.0% similar) in 346 aa overlap (31-375:30-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNL
.. :. . .. .. .:. ..:: :::
CCDS34 MNSTLFSQVENHSVHSNFSEKNAQLLAFENDDCHLPLAMIFTLALAYGAVIILGVSGNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFI
:. . ..::: ::::.::.::.:::.:. ..: :.: :::.::.:.:::..::.. :.
CCDS34 ALIIIILKQKEMRNVTNILIVNLSFSDLLVAIMCLPFTFVYTLMDHWVFGEAMCKLNPFV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSIL
::.:.::::.::::.:.::::::::: ::.:. .::.::..:::.: . ::::: ...
CCDS34 QCVSITVSIFSLVLIAVERHQLIINPRGWRPNNRHAYVGIAVIWVLAVASSLPFLIYQVM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRR
. .: . :. :: :: ...: :: :::.::..:: :: ::..:: .:: :
CCDS34 TDEPFQNVT--LDAYKDKYVCFDQFPSDSHRLSYTTLLLVLQYFGPLCFIFICYFKIYIR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 LQRQGRVFHKGTYS-LRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICH
:.:.. .. : . :... :..:..:. .:::::: :::: .::.. ::.:. : :.
CCDS34 LKRRNNMMDKMRDNKYRSSETKRINIMLLSIVVAFAVCWLPLTIFNTVFDWNHQIIATCN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 GNLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHT
::.::.::: :: ::::::..::::: ::..... . :. . .. : . .::.::
CCDS34 HNLLFLLCHLTAMISTCVNPIFYGFLNKNFQRDLQFFFNFCDFRSRDDDYETIAMSTMHT
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 EVSKGSLRLSGRSNPI
.::: ::. ...:.
CCDS34 DVSKTSLK---QASPVAFKKINNNDDNEKI
360 370 380
>>CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 (370 aa)
initn: 625 init1: 251 opt: 635 Z-score: 666.5 bits: 132.0 E(32554): 8.4e-31
Smith-Waterman score: 635; 37.6% identity (66.8% similar) in 322 aa overlap (43-357:62-369)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 KSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNLCLMCVTVRQKEK
.:: ::. .:::..:: :. : .: ..
CCDS76 ASAGNGSVAGADAPAVTPFQSLQLVHQLKGLIVLLYSVVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRL
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 ANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDY-WIFGETLCKMSAFIQCMSVTVSILS
::::.::.:::.:: ::: : ::: .:.. :.:: ::.. :.: ..: ::...
CCDS76 HNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFT
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 LVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPFLANSILENVFHKNHSKA
:. .:..:. ....: . :. . ... ::... ::.:: ... .: : :
CCDS76 LTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTY--HVELKPH---
160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KB9 LEFLADKVVCTESW-PLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRRLQRQ---GRV
: .: : : ..: .:. ::: : ::: ::. :.:. .:. . : :
CCDS76 -----DVRLCEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCV
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAI-PICHGNLIFLV
.. . :: . ... .:::.::.::: :::::::: :.: .:: : : :. :.
CCDS76 TQSQADWDRA-RRRRTFCLLVVIVVVFAVCWLPLHVFNLLRDLDPHAIDPYAFG-LVQLL
270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 CHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLT-CQQSAPLEESEHLPLSTVHTEVSKGS
:: :::.:.: :::::..:. .:..:.. :... .. :: ..... .:.:
CCDS76 CHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAP--HGQNMTVSVVI
320 330 340 350 360 370
370
pF1KB9 LRLSGRSNPI
>>CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 (381 aa)
initn: 576 init1: 286 opt: 580 Z-score: 609.7 bits: 121.5 E(32554): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 592; 32.9% identity (61.7% similar) in 371 aa overlap (15-374:24-371)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIE
:: :.. . : ..:.: .. .:
CCDS37 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 TVVGVLGNLCLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGE
..::.:: .. :... : .:::..::::: .:.:. :: :.: .::.: : .:
CCDS37 ILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWKMGP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TLCKMSAFIQCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLS
.::.. . : ..: :: ..:...::.::. :. : : ..: : : : :. .:.
CCDS37 VLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB9 LPFLANSILENVFHKNHSKALEFLAD--KVVCTESWPLAHHR---TIYTTFLLLFQYCLP
: :: .: ...: .:.. : :.:::.:: .. :.:. ::. : ::
CCDS37 SP-LA------IF-REYS-LIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LGFILVCYARIYRRLQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNV-VLVVMVVAFAVLWLPLHVFN
::.: :.::. .:. . :. . . . .: .. .:: .::.::: :::::.:.
CCDS37 LGIISFSYTRIWSKLKNH---VSPGAANDHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQ
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 SLEDWHHEAIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAP
: ... . . .::: : :..:: :: .::..::..:.:..: . . .. :.:
CCDS37 LAVDIDSQVLDLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLS-AFRCEQR--
290 300 310 320 330 340
350 360 370
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:...:.::: : .:.. :.:
CCDS37 --------LDAIHSEVSVTFKAKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
350 360 370 380
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10 20 30 40 50 60
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: ......::. : ...::. :.: : .
CCDS82 HFFSWNNYTFSDWQNFVGRRRYGAESQNPTVKALLIVAYSFIIVFSLFGNV-LVCHVIFK
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70 80 90 100 110 120
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... ..:.:.:.::: .:... :: :.: : . . ::::. .:..: : : :. ::
CCDS82 NQRMHSATSLFIVNLAVADIMITLLNTPFTLVRFVNSTWIFGKGMCHVSRFAQYCSLHVS
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130 140 150 160 170 180
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:.:. .:..:::.:..: . ::... . :..::..: .::: ..: ...: ..
CCDS82 ALTLTAIAVDRHQVIMHPLKPRISITKGVIYIAVIWTMATFFSLP---HAICQKLFTFKY
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190 200 210 220 230 240
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:. . . .: ..: : . .::.:: : ::: .: : :::. ..:
CCDS82 SEDIV----RSLCLPDFPEPADLFWKYLDLATFILL--YILPLLIISVAYARVAKKLWLC
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
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. : : . ..:: . : ......: :: ::. :.::. . : . . : .:
CCDS82 NMIGDVTTEQYFALRRKKKKTIKMLMLV-VVLFALCWFPLNCYVLLLS----SKVIRTNN
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310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTEV
.... : .::.::: ::::: .:: ::. :.:::. ::. : . .: : : : .
CCDS82 ALYFAFHWFAMSSTCYNPFIYCWLNENFRIELKALLSMCQR--PPKPQEDRPPSPVPSFR
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370
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. . .:. :.
CCDS82 VAWTEKNDGQRAPLANNLLPTSQLQSGKTDLSSVEPIVTMS
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: : .: : .: .:: . : . : ......:.. .. ..:
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CCDS53 NT-LVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMS
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...: :::..:...:: .:.:: . :..: : .. .: . :..::..: .. : .
CCDS53 GLVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCP---S
120 130 140 150 160 170
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.. .: ...: .:..: : :.:: : .::: :. : ::..:
CCDS53 AVTLTVTREEH----HFMVDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALI
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.: :::: :.: . : . ::.. . : ..:::. : .: :::: .. :
CCDS53 VVMYARIARKLCQAPGPAPGGEEAADPRASRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLL
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:. . . : : . : : ::. .. .::.:::..: ::.. ..:
CCDS53 IDYGQLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRP
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350 360 370
pF1KB9 LEESEHLPLSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
CCDS53 SGSHKEAYSERPGGLLHRRVFVVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLP
360 370 380 390 400 410
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20 30 40 50 60 70
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CCDS37 RDHNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLI-FALALFGNALVFYVVTRSK
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CCDS37 AMRTVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAFICKMVPFVQSTAVVTEIL
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CCDS37 TMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIVGSPMWHVQQLEIKY----
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.:: .: . : : : :. :::::.:.. . ::: .:. :..: .: .:
CCDS37 ----DFLYEKEHICCLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMVMLILYSKIGYELWIKKR
200 210 220 230 240
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: :..: .: : . :.. ...:..:. ::: : :.:: . . .. ...
CCDS37 VGDGSVLRTIHGKEMSKIARKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPFHVVHMMIEYSNFEKEYD
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. : ..:: . ........ ::..:.:.: ::::.. . : : . . ...
CCDS37 DVTI---KMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNVLSAVCYCIVNKTFSPAQRHG
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: . .:. ..: : ::.
CCDS37 NSGITMMRKKA--KFSLRENPVEETKGEAFSDGNIEVKLCEQTEEKKKLKRHLALFRSEL
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10 20 30 40 50
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CCDS35 EKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLH-QPQV-AAIFII-SYFLIFFLC
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CCDS35 MMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCK
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.:...: .::..:...:: .:..: : .. : : .:. :.. :..:::.: ..:
CCDS35 ISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 LANSILENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCY
. . :. ... . .. . . : :.:: . : :::: :. : ::..:.. :
CCDS35 VMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVIMY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
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.:: : : . : : : . . :. :. ... ....:: : . :::: .. : :
CCDS35 GRIGISLFRAA-VPHTGRKNQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSD
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 WHH---EAIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIK-ALVLT-CQQSA
. . . : . :. : ::.... :::.::::.: ::.. .. :. : ::. :
CCDS35 YADLSPNELQIIN-IYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRA
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pF1KB9 -PLEESEHLPLSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
:.: : : ..:. .. : .::
CCDS35 KPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNS
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CCDS35 SEI
420
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CCDS47 EKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLH-QPQV-AAIFII-SYFLIFFLC
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CCDS47 MMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MSAFIQCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIA-CVLSLPF
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CCDS47 ISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPSA
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180 190 200 210 220 230
pF1KB9 LANSILENVFHKNHSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCY
. . :. ... . .. . . : :.:: . : :::: :. : ::..:.. :
CCDS47 VMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVIMY
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CCDS47 GRIGISLFRAA-VPHTGRKNQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSD
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pF1KB9 WHH---EAIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIK-ALVLT-CQQSA
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CCDS47 YADLSPNELQIIN-IYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRA
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KB9 -PLEESEHLPLSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
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CCDS47 KPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNS
370 380 390 400 410 420
CCDS47 SEI
375 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]