Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9839
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9839, 355 aa
1>>>pF1KB9839 355 - 355 aa - 355 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9064+/-0.00131; mu= 12.6871+/- 0.076
mean_var=122.5589+/-36.705, 0's: 0 Z-trim(102.3): 291 B-trim: 941 in 2/46
Lambda= 0.115852
statistics sampled from 6493 (6868) to 6493 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 2399 413.1 1.8e-115
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CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 609 113.9 2.1e-25
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 609 113.9 2.3e-25
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 609 113.9 2.3e-25
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 589 110.6 2.3e-24
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CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 568 107.0 2.4e-23
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 539 102.2 7.2e-22
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 528 100.4 2.5e-21
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 527 100.2 2.8e-21
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 522 99.3 5.1e-21
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 508 97.0 2.7e-20
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 508 97.0 2.7e-20
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 ( 356) 507 96.8 2.9e-20
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 504 96.4 4.3e-20
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 489 93.8 2.3e-19
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 489 93.8 2.3e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 489 93.9 2.4e-19
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 488 93.7 2.7e-19
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 484 93.0 4.4e-19
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CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 484 93.1 4.8e-19
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 484 93.1 5.2e-19
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 482 92.7 5.2e-19
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 482 92.7 5.2e-19
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 477 91.9 9.8e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 476 91.7 1.1e-18
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 473 91.2 1.5e-18
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 471 90.8 1.9e-18
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 471 90.8 1.9e-18
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 469 90.5 2.4e-18
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 465 89.8 3.7e-18
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 465 89.8 3.9e-18
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 462 89.3 5.4e-18
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 462 89.3 5.4e-18
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 460 89.0 6.6e-18
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 456 88.3 1.1e-17
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 455 88.1 1.2e-17
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 453 87.9 1.6e-17
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 451 87.4 1.7e-17
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 451 87.4 1.8e-17
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 451 87.5 2e-17
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 451 87.5 2e-17
>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa)
initn: 2399 init1: 2399 opt: 2399 Z-score: 2186.3 bits: 413.1 E(32554): 1.8e-115
Smith-Waterman score: 2399; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEDLEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MEDLEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 WFTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 WFTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FNNHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 FNNHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNSCLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNSCLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 PILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
310 320 330 340 350
>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 563 init1: 336 opt: 630 Z-score: 588.5 bits: 117.4 E(32554): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 630; 31.2% identity (68.1% similar) in 317 aa overlap (18-331:16-327)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEDLEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQ-LGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIV
: : .:.. ... . : : ..::.. ..:..:. :::.:
CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IWFTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQL
.: :.:. :.:....::::::.:::. : ::. .. .... ::::: :. :
CCDS33 VWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 NMFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTV
::.::...:..:: :... ...:. . : . :. : :: :. :.. .: .
CCDS33 NMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 E--FNNHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRS
: : ..:: ... :: :..... :....:.:.::::..::: ..... .:
CCDS33 EEYFPPKVLCGVDYS-HDKR----RERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ILISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNS
:.. . ....::..: . : ::.. .: .. .: . ... : ...:..:
CCDS33 ATRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLKKLDSLCVSFAYINC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 CLNPILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
:.:::.::. .. ::.:.:.:. .:. .: : :
CCDS33 CINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
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Smith-Waterman score: 609; 35.3% identity (69.2% similar) in 295 aa overlap (44-325:34-319)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 NYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWFTGFKWK-KTVT
:: . ::.:: ::..:. : : :::.
CCDS31 NSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVA
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pF1KB9 TLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMFASVFFLTVIS
....::::.::. ::: :::. :.::...:::: .::: : ....:..::::.:: .:
CCDS31 SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLS
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140 150 160 170 180 190
pF1KB9 LDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDT--VEFNNHTLCYNN
.:.:. ..::. :. .::. . .. :.:::::.: . ::. :.. .: .: :.: .
CCDS31 IDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFH
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KB9 FQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILISSRH------
..... : . : .: :.:.:::.: . : ::.:. :.. :.. .
CCDS31 YESQNSTLPIG----LGLTKNILGFLFPFLIILTSYT-LIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIH----HNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNSCLN
: :...:. : : :...:.. .. :. .. ......:.. .:..:.:::
CCDS31 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB9 PILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
:..: ...:::. : ..:::
CCDS31 PLFYGFLGKKFKRYF----LQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 470 init1: 367 opt: 609 Z-score: 569.0 bits: 113.9 E(32554): 2.3e-25
Smith-Waterman score: 609; 35.3% identity (69.2% similar) in 295 aa overlap (44-325:63-348)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 NYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWFTGFKWK-KTVT
:: . ::.:: ::..:. : : :::.
CCDS82 NSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVA
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 TLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMFASVFFLTVIS
....::::.::. ::: :::. :.::...:::: .::: : ....:..::::.:: .:
CCDS82 SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLS
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 LDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDT--VEFNNHTLCYNN
.:.:. ..::. :. .::. . .. :.:::::.: . ::. :.. .: .: :.: .
CCDS82 IDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFH
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240
pF1KB9 FQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILISSRH------
..... : . : .: :.:.:::.: . : ::.:. :.. :.. .
CCDS82 YESQNSTLPIG----LGLTKNILGFLFPFLIILTSYT-LIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIH----HNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNSCLN
: :...:. : : :...:.. .. :. .. ......:.. .:..:.:::
CCDS82 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KB9 PILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
:..: ...:::. : ..:::
CCDS82 PLFYGFLGKKFKRYF----LQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAP
330 340 350 360 370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 470 init1: 367 opt: 609 Z-score: 568.9 bits: 113.9 E(32554): 2.3e-25
Smith-Waterman score: 609; 35.3% identity (69.2% similar) in 295 aa overlap (44-325:69-354)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 NYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWFTGFKWK-KTVT
:: . ::.:: ::..:. : : :::.
CCDS82 NSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVA
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 TLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMFASVFFLTVIS
....::::.::. ::: :::. :.::...:::: .::: : ....:..::::.:: .:
CCDS82 SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLS
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 LDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDT--VEFNNHTLCYNN
.:.:. ..::. :. .::. . .. :.:::::.: . ::. :.. .: .: :.: .
CCDS82 IDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFH
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240
pF1KB9 FQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILISSRH------
..... : . : .: :.:.:::.: . : ::.:. :.. :.. .
CCDS82 YESQNSTLPIG----LGLTKNILGFLFPFLIILTSYT-LIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIH----HNSYSHHVMQAGIPLSTGLAFLNSCLN
: :...:. : : :...:.. .. :. .. ......:.. .:..:.:::
CCDS82 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KB9 PILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
:..: ...:::. : ..:::
CCDS82 PLFYGFLGKKFKRYF----LQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAP
340 350 360 370 380
>>CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 (395 aa)
initn: 549 init1: 329 opt: 589 Z-score: 550.8 bits: 110.6 E(32554): 2.3e-24
Smith-Waterman score: 589; 32.9% identity (64.5% similar) in 313 aa overlap (41-345:35-347)
20 30 40 50 60 70
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...:. :: .::. :..... .: . ..:
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:.: : :.::..:.. ::.. ..:.. : .: .:: .: :::::: :.:..
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: .: : : ..: :. ::....: :: .. . . .....:. .:
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. .::.::..:: :::.::. : : : . .. :.:. :.:::.:: ::.::
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CCDS79 VLTCPDMLRKLRRSLRTVLESVLVDDSELGGAGSSRRRRTSSTARSASPLALCSRPEEPR
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CCDS79 GPARLLGWLLGSCAASPQTGPLNRALSSTSS
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CCDS73 AIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGKVTCQ
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CCDS73 TLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
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CCDS12 WVAGFRMTRTVTTICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDIN
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CCDS12 IPNGDTYCTFNFASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKI
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.:.... ::: . .. .::..: .:: :..: ..: . . ...:. ... .
CCDS12 HKKGMIKSSRPLRVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYK--IIDILVNP
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...:::.::::::.:::.... :. :. :. :. .: : :
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CCDS12 ELQAM
350
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CCDS14 SSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFITCM
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CCDS14 AFP---PEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQV
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:.::::::::::.....:: :. :. :. .: :: :. .:
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pF1KB9 AQ
CCDS12 AM
355 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 19:37:41 2016 done: Fri Nov 4 19:37:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]