Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9836
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9836, 351 aa
1>>>pF1KB9836 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1629+/-0.000775; mu= 11.7545+/- 0.046
mean_var=74.2443+/-14.680, 0's: 0 Z-trim(108.5): 22 B-trim: 6 in 1/50
Lambda= 0.148848
statistics sampled from 10214 (10232) to 10214 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 2.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14 ( 351) 2313 505.8 2.2e-143
CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14 ( 353) 1290 286.2 2.9e-77
CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX ( 448) 1033 231.0 1.5e-60
CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8 ( 364) 1022 228.6 6.3e-60
CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX ( 455) 1001 224.1 1.8e-58
CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX ( 463) 1001 224.1 1.8e-58
CCDS46124.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19 ( 378) 481 112.4 6.2e-25
CCDS33059.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19 ( 439) 481 112.5 7.1e-25
CCDS14574.1 ZCCHC12 gene_id:170261|Hs108|chrX ( 402) 395 94.0 2.4e-19
CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX ( 403) 390 92.9 5e-19
CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX ( 399) 375 89.7 4.6e-18
CCDS59400.1 PNMAL2 gene_id:57469|Hs108|chr19 ( 635) 312 76.2 8.3e-14
>>CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14 (351 aa)
initn: 2313 init1: 2313 opt: 2313 Z-score: 2687.8 bits: 505.8 E(32554): 2.2e-143
Smith-Waterman score: 2313; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
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CCDS99 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS99 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQALEALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEEE
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CCDS99 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQALEALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEEV
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CCDS99 FGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVIA
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CCDS99 FGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 GAVHKTIRRELNLPEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT
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CCDS99 GAVHKTIRRELNLPEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT
310 320 330 340 350
>>CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14 (353 aa)
initn: 1011 init1: 659 opt: 1290 Z-score: 1500.5 bits: 286.2 E(32554): 2.9e-77
Smith-Waterman score: 1290; 57.0% identity (78.8% similar) in 358 aa overlap (1-350:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
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CCDS98 MAMTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLQAAM-PQVSYRMLGRMFWREE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
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CCDS98 NAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVLFKPPTSDAEFLERLHLFLAREGWTVQDV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQALE-ALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEE
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CCDS98 ARVLGFQNPT--PTPG--PEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKRLTLFSGRDIPGPGEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEE
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CCDS98 TFDPWLEHTNEVLEEWQVSDVEKRRRLMESLRGPAADVIRILKSNNPAITTAECLKALEQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVI
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CCDS98 VFGSVESSRDAQIKFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVVEKGAIDKDNVNQARLEQVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AGAVHK-TIRRELNLPE--DGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEE----ALLQAILEGNFT
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CCDS98 AGANHSGAIRRQLWLTGAGEGPAPNLFQLLVQIREEEAKEEEEEAEATLLQLGLEGHF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX (448 aa)
initn: 942 init1: 497 opt: 1033 Z-score: 1200.6 bits: 231.0 E(32554): 1.5e-60
Smith-Waterman score: 1033; 46.8% identity (74.4% similar) in 348 aa overlap (1-343:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
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CCDS14 MALTLLEDWCKGMDMDPRKALLIVGIPMECSEVEIQDTVKAGLQPLCAYRVLGRMFRRED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
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CCDS14 NAKAVFIELADTVNYTTLPSHIPGKGGSWEVVVKPRNPDDEFLSRLNYFLKDEGRSMTDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 SRALGHEN---GSLDPEQGMIPEMWAPMLAQALEALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPG
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CCDS14 ARALGCCSLPAESLDAE--VMPQVRSP-------PLEPPKESMWYRKLKVFSGTASPSPG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EEEFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQAL
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CCDS14 EETFEDWLEQVTEIMPIWQVSEVEKRRRLLESLRGPALSIMRVLQANNDSITVEQCLDAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EEVFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQ
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CCDS14 KQIFGDKEDFRASQFRFLQTSPKIGEKVSTFLLRLEPLLQKAVHKSPLSVRSTDMIRLKH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VIAG-AVHKTIRRELNL-PEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT
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CCDS14 LLARVAMTPALRGKLELLDQRGCPPNFLELMKLIRDEEEWENTEAVMKNKEKPSGRGRGA
300 310 320 330 340 350
CCDS14 SGRQARAEASVSAPQATVQARSFSDSSPQTIQGGLPPLVKRRRLLGSESTRGEDHGQATY
360 370 380 390 400 410
>>CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8 (364 aa)
initn: 1011 init1: 959 opt: 1022 Z-score: 1189.3 bits: 228.6 E(32554): 6.3e-60
Smith-Waterman score: 1022; 47.5% identity (74.9% similar) in 343 aa overlap (1-340:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
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CCDS34 MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
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CCDS34 NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLERLNLFLEKEGQTVSGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQAL-EALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEE
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CCDS34 FRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPEEE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEE
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CCDS34 SFEVWLEQATEIVKEWPVTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEAFKQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVI
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CCDS34 VFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLEQVM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AGAVHKTIR--RELNLPEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT
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CCDS34 AGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIRE---EEEEEASFENESIEEPEERDGYG
300 310 320 330 340 350
CCDS34 RWNHEGDD
360
>>CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX (455 aa)
initn: 1000 init1: 505 opt: 1001 Z-score: 1163.3 bits: 224.1 E(32554): 1.8e-58
Smith-Waterman score: 1001; 46.2% identity (71.2% similar) in 351 aa overlap (1-348:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
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CCDS65 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
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CCDS65 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLNRLNRFLEEERRTVSDM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQAL-EALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEE
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CCDS65 NRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWT--WAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEE
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CCDS65 AFDAWLEHTTEMLQMWQVPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVI
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CCDS65 VFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AGA-VHKTIRRELNL-PEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT
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CCDS65 SGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPDRESLEGLEVAPRPPA
300 310 320 330 340 350
CCDS65 RITGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHTFCYSCG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX (463 aa)
initn: 1000 init1: 505 opt: 1001 Z-score: 1163.2 bits: 224.1 E(32554): 1.8e-58
Smith-Waterman score: 1001; 46.2% identity (71.2% similar) in 351 aa overlap (1-348:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMFRRDE
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CCDS35 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMTVGEL
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CCDS35 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLNRLNRFLEEERRTVSDM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 SRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQAL-EALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEPGEE
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CCDS35 NRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWT--WAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQALEE
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CCDS35 AFDAWLEHTTEMLQMWQVPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VFGVTDNPRELQVKYLTTYQKDEEKLSAYVLRLEPLLQKLVQRGAIERDAVNQARLDQVI
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CCDS35 VFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AGA-VHKTIRRELNL-PEDGPAPGFLQLLVLIKDYEAAEEEEALLQAILEGNFT
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CCDS35 SGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPDRESLEGLEVAPRPPA
300 310 320 330 340 350
CCDS35 RITGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHTFCYSCG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS46124.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19 (378 aa)
initn: 478 init1: 478 opt: 481 Z-score: 561.2 bits: 112.4 E(32554): 6.2e-25
Smith-Waterman score: 481; 38.7% identity (69.6% similar) in 194 aa overlap (1-193:5-197)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGISQSCSVAEIEEALQAGLAPLGEYRLLGRMF
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CCDS46 MSKTMAMNLLEDWCRGMEVDIHRSLLVTGIPEDCGQAEIEETLNGVLSPLGPYRVLNKIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 RRDENRKVALVGLTAETSHALVPKEIPGKGGIWRVIFKPPDPDNTFLSRLNEFLAGEGMT
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CCDS46 VREENVKAALIEVGEGVNLSTIPREFPGRGGVWRVVCRDPTQDAEFLKNLNEFLDAEGRT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VGELSRALGHENGSLDPEQGMIPEMWAPMLAQALEALQPALQCLKYKKLRVFSGRESPEP
.. : : .. .:. .: . :: :: :. : :. . :. ..: .. :
CCDS46 WEDVVRLLQLNHPTLSQNQHQPPENWAEALGVLLGAVVQIIFCMD-AEIRSREEARAQEA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 GE-EEFGRWMFHTTQMIKAWQVPDVEKRRRLLESLRGPALDVIRVLKINNPLITVDECLQ
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CCDS46 AEFEEMAAWALAAGRKVKKEPGLAAEVGSALKAETPNNWNATEDQHEPTKPLVRRAGAKS
180 190 200 210 220 230
>>CCDS33059.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19 (439 aa)
initn: 478 init1: 478 opt: 481 Z-score: 560.1 bits: 112.5 E(32554): 7.1e-25
Smith-Waterman score: 481; 38.7% identity (69.6% similar) in 194 aa overlap (1-193:5-197)
10 20 30 40 50
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