Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9826
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9826, 321 aa
1>>>pF1KB9826 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4701+/-0.000947; mu= -5.2389+/- 0.058
mean_var=293.3796+/-58.939, 0's: 0 Z-trim(115.7): 46 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.074879
statistics sampled from 16235 (16281) to 16235 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.792), E-opt: 0.2 (0.5), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 2164 246.3 2.4e-65
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 650 82.9 6.8e-16
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 631 80.7 1.6e-15
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 615 78.9 5.5e-15
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 615 78.9 5.5e-15
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 615 79.2 1.1e-14
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 615 79.3 1.4e-14
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 615 79.4 1.8e-14
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 602 77.8 3e-14
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 602 77.9 3.2e-14
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 541 71.2 2.8e-12
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 541 71.2 2.8e-12
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 541 71.2 2.8e-12
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 546 71.9 2.9e-12
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 532 70.0 3e-12
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 523 69.4 1.3e-11
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 518 68.8 1.9e-11
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 505 67.1 2.3e-11
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 491 65.6 6.1e-11
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 489 65.4 7.4e-11
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 489 65.4 7.5e-11
>>CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 (321 aa)
initn: 2164 init1: 2164 opt: 2164 Z-score: 1286.6 bits: 246.3 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 2164; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQA
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CCDS10 MSEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 FPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREALEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREALEE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB9 ARALREANPTAHYPRSSVSED
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CCDS10 ARALREANPTAHYPRSSVSED
310 320
>>CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX (606 aa)
initn: 722 init1: 630 opt: 650 Z-score: 398.8 bits: 82.9 E(32554): 6.8e-16
Smith-Waterman score: 650; 42.1% identity (69.6% similar) in 247 aa overlap (67-311:248-493)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQAPNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPA
::: . :.. :: . :. .: :: .
CCDS14 SRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARR-RAAKLQSSQEPEAPPPRDV
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 QLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMIIWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHL
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CCDS14 ALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQL
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 RLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLR
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CCDS14 KEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLR
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQI
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CCDS14 KLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKV
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320
pF1KB9 MEFLARVFKKDPQAWPSRYREALE-EARALREANPTAHYPRSSVSED
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CCDS14 LKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPC
460 470 480 490 500 510
CCDS14 NWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGASLT
520 530 540 550 560 570
>>CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 (304 aa)
initn: 633 init1: 430 opt: 631 Z-score: 391.9 bits: 80.7 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 631; 39.9% identity (68.1% similar) in 263 aa overlap (59-316:46-304)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 SEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQAPNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQP
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CCDS10 ERDRDWSHSGNPGASRAGEDARVLRDGFAEEAPSTSRGPGGSQ--GSQGPSPQGARRAQA
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 GPA--PPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLI
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CCDS10 APAVGPRSQKQLELKVSELVQFLLIKDQKKIPIKRADILKHVIGDYKDIFPDLFKRAAER
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 LARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVALSNR-MPMTGLLLMILSLIYVKGRGA
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CCDS10 LQYVFGYKLVELEPKSNTYILINTLEPVEEDAEMRGDQGTPTTGLLMIVLGLIFMKGNTI
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 RESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSR
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CCDS10 KETEAWDFLRRLGVYPTKKHLIFGDPKKLITEDFVRQRYLEYRRIPHTDPVDYEFQWGPR
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 ASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREAL--EEARALREANPTAHYPRSSVSED
.. : .::....:.:.: ..::. ::..: ::: :: :: . .:.. : :
CCDS10 TNLETSKMKVLKFVAKVHNQDPKDWPAQYCEALADEENRA--RPQPSGPAPSS
260 270 280 290 300
>>CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 (307 aa)
initn: 584 init1: 463 opt: 615 Z-score: 382.5 bits: 78.9 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 615; 40.3% identity (66.3% similar) in 288 aa overlap (29-311:7-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQA
:.:.: . .: .. : : :: :. .
CCDS32 MLQTPESRGLPVPQAEGEKDGGHDGETRAPTASQ--ER
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB9 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSA--AQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMI
:..: . ::: . .... : :. : .: . . ::. ..::::.::
CCDS32 PKEELGAGREEGAAEPALTRKGARALAAKALARRRAYRRLNRTVAELVQFLLVKDKKKSP
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEP-EELD
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CCDS32 ITRSEMVKYVIGDLKILFPDIIARAAEHLRYVFGFELKQFDRKHHTYILINKLKPLEEEE
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RVALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITE
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CCDS32 EEDLGGDGPRLGLLMMILGLIYMRGNSAREAQVWEMLRRLGVQPSKYHFLFGYPKRLIME
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EFVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREA
.:::. ::.:.:::...:::::: :: :.. ::.::... :.:.. ::.:: :: .::::
CCDS32 DFVQQRYLSYRRVPHTNPPEYEFSWGPRSNLEISKMEVLGFVAKLHKKEPQHWPVQYREA
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KB9 L-EEA-RALREANPTAHYPRSSVSED
: .:: :: .: :
CCDS32 LADEADRARAKARAEASMRARASARAGIHLW
280 290 300
>>CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 570 init1: 460 opt: 615 Z-score: 382.5 bits: 78.9 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:38-247)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 APNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMI
:::: . ..: .:..:. :.::::: :.
CCDS59 GYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDR
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CCDS59 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEE
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CCDS59 LGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDE
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREAL
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CCDS59 FVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAV
190 200 210 220 230 240
300 310 320
pF1KB9 EEARALREANPTAHYPRSSVSED
:
CCDS59 EMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPCLQIPLINCSSPSHGAKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAE
250 260 270 280 290 300
>>CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (706 aa)
initn: 577 init1: 460 opt: 615 Z-score: 377.4 bits: 79.2 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:435-644)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 APNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMI
:::: . ..: .:..:. :.::::: :.
CCDS43 TRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
410 420 430 440 450 460
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDR
: ::..::: : .. :..:.: : ..: ..:. . .. . :... :
CCDS43 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
470 480 490 500 510 520
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEE
.. .. : :::..:::.:...: : :...:.::: ::::: .:: ::.::::::.:
CCDS43 LGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDE
530 540 550 560 570 580
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREAL
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CCDS43 FVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAV
590 600 610 620 630 640
300 310 320
pF1KB9 EEARALREANPTAHYPRSSVSED
:
CCDS43 EMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPCLQIPLINCSSPSHGAKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAE
650 660 670 680 690 700
>>CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034 aa)
initn: 551 init1: 460 opt: 615 Z-score: 375.1 bits: 79.3 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:38-247)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 APNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMI
:::: . ..: .:..:. :.::::: :.
CCDS59 GYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDR
: ::..::: : .. :..:.: : ..: ..:. . .. . :... :
CCDS59 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEE
.. .. : :::..:::.:...: : :...:.::: ::::: .:: ::.::::::.:
CCDS59 LGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDE
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREAL
::...::.:.::: .::::::::: :. .: .::....: :: ::::. : .::::.
CCDS59 FVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAV
190 200 210 220 230 240
300 310 320
pF1KB9 EEARALREANPTAHYPRSSVSED
:
CCDS59 EMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRF
250 260 270 280 290 300
>>CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431 aa)
initn: 577 init1: 460 opt: 615 Z-score: 373.1 bits: 79.4 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:435-644)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 APNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMI
:::: . ..: .:..:. :.::::: :.
CCDS43 TRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
410 420 430 440 450 460
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDR
: ::..::: : .. :..:.: : ..: ..:. . .. . :... :
CCDS43 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
470 480 490 500 510 520
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEE
.. .. : :::..:::.:...: : :...:.::: ::::: .:: ::.::::::.:
CCDS43 LGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDE
530 540 550 560 570 580
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