Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9823
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9823, 314 aa
1>>>pF1KB9823 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8312+/-0.000711; mu= 8.9198+/- 0.043
mean_var=94.9458+/-18.844, 0's: 0 Z-trim(111.8): 49 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.131624
statistics sampled from 12635 (12684) to 12635 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 2074 403.5 1.1e-112
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 1841 359.2 2.3e-99
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 1841 359.2 2.3e-99
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 1797 350.9 7.7e-97
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 1779 347.5 8.2e-96
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 1368 269.4 2.6e-72
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 1294 255.4 4.3e-68
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 1265 249.8 2e-66
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 1173 232.4 4.7e-61
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 1169 231.6 6.1e-61
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 1169 231.6 6.1e-61
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 929 186.1 3.7e-47
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 794 160.4 1.7e-39
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 739 150.0 2.5e-36
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 726 147.5 1.4e-35
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 706 143.7 1.9e-34
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 697 142.0 6.3e-34
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 692 141.1 1.2e-33
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 677 138.2 9.4e-33
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 660 135.0 7.7e-32
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 657 134.4 1.2e-31
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 653 133.6 2e-31
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 574 118.7 7.9e-27
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 571 118.2 3e-26
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 546 113.3 2.2e-25
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 509 106.3 3.2e-23
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 493 103.4 5.1e-22
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 451 95.3 6.6e-20
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 455 96.1 7.2e-20
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 440 93.3 6.5e-19
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 443 94.0 6.7e-19
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 440 93.3 6.9e-19
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 433 91.9 7.1e-19
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 436 92.5 1e-18
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 434 92.2 1.7e-18
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 436 92.6 1.9e-18
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 433 92.0 2.1e-18
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 425 90.5 4.4e-18
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 425 90.5 4.4e-18
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 425 90.5 4.4e-18
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 383 82.5 1.4e-15
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 333 72.9 3.8e-13
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 315 69.5 6.3e-12
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 296 65.8 3.5e-11
>>CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 2074 init1: 2074 opt: 2074 Z-score: 2136.4 bits: 403.5 E(32554): 1.1e-112
Smith-Waterman score: 2074; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 YPPLHEWAFREGEE
::::::::::::::
CCDS76 YPPLHEWAFREGEE
310
>>CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1841 init1: 1841 opt: 1841 Z-score: 1897.3 bits: 359.2 E(32554): 2.3e-99
Smith-Waterman score: 1841; 88.2% identity (94.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::: :::::.:::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVTLGEVPAADSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHFL
:::::::::.. :::::::: ::::::::.:.::: :::::. ::.:.::::.::::::
CCDS76 PPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLESEFQAAISRKMVELVHFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILVT
::::::::: :::::: ::.:: ::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYILVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVFA
::::::::::::::..:::::::::::::: :::::::::::::::.::. .::::::::
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSMLEVFEGREDSVFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::.: ::::
CCDS76 HPRKLLMQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHTLKIGGEPHIS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 YPPLHEWAFREGEE
:::::: :.:::::
CCDS76 YPPLHERALREGEE
310
>>CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1841 init1: 1841 opt: 1841 Z-score: 1897.3 bits: 359.2 E(32554): 2.3e-99
Smith-Waterman score: 1841; 88.2% identity (94.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::: :::::.:::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVTLGEVPAADSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHFL
:::::::::.. :::::::: ::::::::.:.::: :::::. ::.:.::::.::::::
CCDS76 PPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLESEFQAAISRKMVELVHFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILVT
::::::::: :::::: ::.:: ::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYILVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVFA
::::::::::::::..:::::::::::::: :::::::::::::::.::. .::::::::
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSMLEVFEGREDSVFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::.: ::::
CCDS76 HPRKLLMQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHTLKIGGEPHIS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 YPPLHEWAFREGEE
:::::: :.:::::
CCDS76 YPPLHERALREGEE
310
>>CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1797 init1: 1797 opt: 1797 Z-score: 1852.1 bits: 350.9 E(32554): 7.7e-97
Smith-Waterman score: 1797; 85.4% identity (95.2% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::.
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHFL
::.::::::.::::.:: ::::: : :::.:.::::::::::. ::.:::::.:::::::
CCDS76 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVHFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILVT
::::::::: :::::::::. :.: :::::::::: ::::::::..:: ::::::..:
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVFA
:::::::::::::::.::.:::::::::::.::::::::::::::::::. .:::::...
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
:.::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::
CCDS76 DPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHIS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 YPPLHEWAFREGEE
:::::::..:::::
CCDS76 YPPLHEWVLREGEE
310
>>CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1779 init1: 1779 opt: 1779 Z-score: 1833.6 bits: 347.5 E(32554): 8.2e-96
Smith-Waterman score: 1779; 84.4% identity (95.2% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::.
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHFL
::.::::::.::::.:: ::::: : :::.:.::::::::::. ::.:::::.:.:::::
CCDS76 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAKLVHFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILVT
::::::::: :::::::::. :.: ::::::::::. ::::::::..:: :::.::..:
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASDSLQLVFGIELMEVDPIGHVYIFAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVFA
:::::::::::::::.::::.:::.::::::::::::::::::::::::. .:::::.:.
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIILAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSIFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
:.::::: .::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..::::::.::
CCDS76 DPKKLLTQYFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHMVKISGGPRIS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 YPPLHEWAFREGEE
:: :::::.:::::
CCDS76 YPLLHEWALREGEE
310
>>CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX (317 aa)
initn: 1179 init1: 1179 opt: 1368 Z-score: 1411.8 bits: 269.4 E(32554): 2.6e-72
Smith-Waterman score: 1368; 68.6% identity (85.1% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETA-SSSSTLVEVTLREVPAAESP
: ::.:::::::::.::: :::::::::::.:::::.: :::: :: ::.:::::::
CCDS14 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SPPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPDLETSFQVALSRKMAELVHF
.::.::::::.:::::..: : : .::::..:.::::: :: :. :. ::: :. ::.::
CCDS14 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LLLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYILV
:: ::::.: :::::: ::.:.. :::::.:::: :...:::.: :: .. : ::
CCDS14 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPASNTYTLV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVF
::::::::::::.::: ::::::::::. :: ::: : ::.:::::.:. . :::: .:.
CCDS14 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AHPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHI
..:::::::: ::::::::::::::.:: ::::::::::.::::::::.:...... .:
CCDS14 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB9 SYPPLHEWAFREGEE
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CCDS14 AYPSLREAALLEEEEGV
310
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10 20 30 40 50 60
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310
pF1KB9 YPPLHEWAFREGEE
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CCDS76 FPSLREAALREEEEGV
300
>>CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX (318 aa)
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CCDS14 LVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHS
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240 250 260 270 280 290
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CCDS14 VYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARV
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300 310
pF1KB9 HISYPPLHEWAFREGEE
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CCDS14 RISYPSLHEEAL--GEEKGV
310
>>CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX (429 aa)
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10 20 30
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CCDS48 EKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVKGLITKAEMLGSVIKNYEDYF
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CCDS48 VIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDPA
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CCDS48 CYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV
390 400 410 420
>>CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX (315 aa)
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CCDS14 PPQSPQGGASSSISVYYTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAELV
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120 130 140 150 160 170
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300 310
314 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]