Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9735
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9735, 483 aa
1>>>pF1KB9735 483 - 483 aa - 483 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7200+/-0.000981; mu= -9.2617+/- 0.060
mean_var=352.7364+/-71.015, 0's: 0 Z-trim(116.1): 22 B-trim: 180 in 1/54
Lambda= 0.068289
statistics sampled from 16725 (16745) to 16725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.514), width: 16
Scan time: 4.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44906.1 ATF7 gene_id:11016|Hs108|chr12 ( 483) 3224 331.0 1.7e-90
CCDS58738.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 ( 487) 1617 172.7 7.8e-43
CCDS2262.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 ( 505) 1617 172.7 8.1e-43
CCDS58737.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 ( 447) 1364 147.8 2.3e-35
CCDS58739.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 ( 209) 725 84.6 1.1e-16
CCDS43563.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 ( 369) 648 77.2 3.4e-14
CCDS43562.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 ( 475) 649 77.3 3.9e-14
CCDS5418.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 ( 501) 649 77.4 4.1e-14
CCDS5417.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 ( 508) 649 77.4 4.1e-14
CCDS58238.1 ATF7 gene_id:11016|Hs108|chr12 ( 117) 617 73.8 1.1e-13
>>CCDS44906.1 ATF7 gene_id:11016|Hs108|chr12 (483 aa)
initn: 3224 init1: 3224 opt: 3224 Z-score: 1738.2 bits: 331.0 E(32554): 1.7e-90
Smith-Waterman score: 3224; 100.0% identity (100.0% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSPPD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLISTPTPTIVRPGSLPLHLGYDPLHPTLPSPTSVITQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLISTPTPTIVRPGSLPLHLGYDPLHPTLPSPTSVITQAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPVLPGPPVQMPSVISLARPVSMVPNIPGIPGPPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPVLPGPPVQMPSVISLARPVSMVPNIPGIPGPPVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVGTASTMVTARPEQSQILIQHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVGTASTMVTARPEQSQILIQHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DAPSPAQPQVSPAQPTPSTGGRRRRTVDEDPDERRQRFLERNRAAASRCRQKRKLWVSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DAPSPAQPQVSPAQPTPSTGGRRRRTVDEDPDERRQRFLERNRAAASRCRQKRKLWVSSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 EKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTALQKKTQGYLESPKESSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTALQKKTQGYLESPKESSEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 TGSPAPVIQHSSATAPSNGLSVRSAAEAVATSVLTQMASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGSPAPVIQHSSATAPSNGLSVRSAAEAVATSVLTQMASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQS
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 AGR
:::
CCDS44 AGR
>>CCDS58738.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 (487 aa)
initn: 1078 init1: 555 opt: 1617 Z-score: 882.5 bits: 172.7 E(32554): 7.8e-43
Smith-Waterman score: 1680; 58.5% identity (76.6% similar) in 504 aa overlap (1-480:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKN
:.::.::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
CCDS58 MSDDKPFLCTAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARNDSVIVADQTPTPTRFLKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSPPD
:::::::::::: ::.:::::...: :: :::.: .:: :. : ::: :... :
CCDS58 CEEVGLFNELASPFENEFKKASEDDIKKM---PLDLSPLATPIIRSKIEEPSVVETTHQD
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 SPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLIST-PTPTIVRPGSL--P--LHLGYDP---LHPTLPSP
:: : : :::: :. .. :: .::::.:: : : . : .. ..:::
CCDS58 SPLPHPESTTSDEKEV---PLAQTAQPTSAIVRPASLQVPNVLLTSSDSSVIIQQAVPSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB9 TS--VITQAPPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPV-LPGP----PVQMPSVISLARPV
:: :::::: ::: . : .::..:: ::::::: .:. :..:... :.:::
CCDS58 TSSTVITQAPSSNRPIVPVPGPFPLLLHLPNGQTMPVAIPASITSSNVHVPAAVPLVRPV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 SMVPNIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVGTASTM
.:::..:::::: :: .:. :::::::::.::.: ...: : : .: .
CCDS58 TMVPSVPGIPGPS-------SP--QPVQSEAKMRLKAALTQQHPPVTNG-DTVKGHGSGL
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 VTARPEQSQIL-IQHPDAPSPAQPQVSPAQPTP---STGGRRRRTVDEDPDERRQRFLER
: .. :.:. .:.: : : .. .:::. :: ::.:::::...:::::.:..::::
CCDS58 VRTQSEESRPQSLQQP-ATSTTETPASPAHTTPQTQSTSGRRRRAANEDPDEKRRKFLER
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 NRAAASRCRQKRKLWVSSLEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVT
:::::::::::::.::.:::::::.:.: : ::..:::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRAAASRCRQKRKVWVQSLEKKAEDLSSLNGQLQSEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 ALQKKTQGYLESPKE-SSE----PTGSPAPVIQHSSATAPSNGLSVRSAAEAVATSVLTQ
:.:::. :: . :. ::: :.. . .:::::... :::.: : :::::::::::
CCDS58 AMQKKS-GYHTADKDDSSEDISVPSSPHTEAIQHSSVST-SNGVSSTSKAEAVATSVLTQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480
pF1KB9 MASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQSAGR
::.: :: : :...:.:.:::
CCDS58 MADQSTE---PALSQIVMAPSSQSQPSGS
470 480
>>CCDS2262.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 (505 aa)
initn: 1078 init1: 555 opt: 1617 Z-score: 882.2 bits: 172.7 E(32554): 8.1e-43
Smith-Waterman score: 1680; 58.5% identity (76.6% similar) in 504 aa overlap (1-480:19-500)
10 20 30 40
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPART
:.::.::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS22 MKFKLHVNSARQYKDLWNMSDDKPFLCTAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 DSVIIADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTP
::::.::::::::::::::::::::::::: ::.:::::...: :: :::.: .::
CCDS22 DSVIVADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASPFENEFKKASEDDIKKM---PLDLSPLATP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB9 DIKIKEEEPVEVDSSPPDSPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLIST-PTPTIVRPGSL--P--
:. : ::: :... ::: : : :::: :. .. :: .::::.:: :
CCDS22 IIRSKIEEPSVVETTHQDSPLPHPESTTSDEKEV---PLAQTAQPTSAIVRPASLQVPNV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 LHLGYDP---LHPTLPSPTS--VITQAPPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPV-LPGP
: . : .. ..::::: :::::: ::: . : .::..:: ::::::: .:.
CCDS22 LLTSSDSSVIIQQAVPSPTSSTVITQAPSSNRPIVPVPGPFPLLLHLPNGQTMPVAIPAS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB9 ----PVQMPSVISLARPVSMVPNIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQ
:..:... :.:::.:::..:::::: :: .:. :::::::::.::.:
CCDS22 ITSSNVHVPAAVPLVRPVTMVPSVPGIPGPS-------SP--QPVQSEAKMRLKAALTQQ
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 VSSINGGCGMVVGTASTMVTARPEQSQIL-IQHPDAPSPAQPQVSPAQPTP---STGGRR
...: : : .: .: .. :.:. .:.: : : .. .:::. :: ::.:::
CCDS22 HPPVTNG-DTVKGHGSGLVRTQSEESRPQSLQQP-ATSTTETPASPAHTTPQTQSTSGRR
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 RRTVDEDPDERRQRFLERNRAAASRCRQKRKLWVSSLEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRN
::...:::::.:..:::::::::::::::::.::.:::::::.:.: : ::..:::::::
CCDS22 RRAANEDPDEKRRKFLERNRAAASRCRQKRKVWVQSLEKKAEDLSSLNGQLQSEVTLLRN
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KB9 EVAQLKQLLLAHKDCPVTALQKKTQGYLESPKE-SSE----PTGSPAPVIQHSSATAPSN
:::::::::::::::::::.:::. :: . :. ::: :.. . .:::::... ::
CCDS22 EVAQLKQLLLAHKDCPVTAMQKKS-GYHTADKDDSSEDISVPSSPHTEAIQHSSVST-SN
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KB9 GLSVRSAAEAVATSVLTQMASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQSAGR
:.: : :::::::::::::.: :: : :...:.:.:::
CCDS22 GVSSTSKAEAVATSVLTQMADQSTE---PALSQIVMAPSSQSQPSGS
470 480 490 500
>>CCDS58737.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 (447 aa)
initn: 762 init1: 537 opt: 1364 Z-score: 748.3 bits: 147.8 E(32554): 2.3e-35
Smith-Waterman score: 1364; 55.5% identity (74.1% similar) in 456 aa overlap (49-480:9-442)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 TNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASSFEHEF
:::::::::::::::::::::::: ::.::
CCDS58 MYCAWMWPDQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASPFENEF
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 KKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSPPDSPASSPCSPPLKEKEVTP
:::...: :: :::.: .:: :. : ::: :... ::: : : ::::
CCDS58 KKASEDDIKKM---PLDLSPLATPIIRSKIEEPSVVETTHQDSPLPHPESTTSDEKEV--
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KB9 KPVLIST-PTPTIVRPGSL--P--LHLGYDP---LHPTLPSPTS--VITQAPPSNRQMGS
:. .. :: .::::.:: : : . : .. ..::::: :::::: ::: .
CCDS58 -PLAQTAQPTSAIVRPASLQVPNVLLTSSDSSVIIQQAVPSPTSSTVITQAPSSNRPIVP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PTGSLPLVMHLANGQTMPV-LPGP----PVQMPSVISLARPVSMVPNIPGIPGPPVNSSG
: .::..:: ::::::: .:. :..:... :.:::.:::..::::::
CCDS58 VPGPFPLLLHLPNGQTMPVAIPASITSSNVHVPAAVPLVRPVTMVPSVPGIPGPS-----
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVGTASTMVTARPEQSQIL-IQHPDA
:: .:. :::::::::.::.: ...: : : .: .: .. :.:. .:.: :
CCDS58 --SP--QPVQSEAKMRLKAALTQQHPPVTNG-DTVKGHGSGLVRTQSEESRPQSLQQP-A
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KB9 PSPAQPQVSPAQPTP---STGGRRRRTVDEDPDERRQRFLERNRAAASRCRQKRKLWVSS
: .. .:::. :: ::.:::::...:::::.:..:::::::::::::::::.::.:
CCDS58 TSTTETPASPAHTTPQTQSTSGRRRRAANEDPDEKRRKFLERNRAAASRCRQKRKVWVQS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 LEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTALQKKTQGYLESPKE-SS
::::::.:.: : ::..::::::::::::::::::::::::::.:::. :: . :. ::
CCDS58 LEKKAEDLSSLNGQLQSEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTAMQKKS-GYHTADKDDSS
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 E----PTGSPAPVIQHSSATAPSNGLSVRSAAEAVATSVLTQMASQRTELSMPIQSHVIM
: :.. . .:::::... :::.: : :::::::::::::.: :: : :...:
CCDS58 EDISVPSSPHTEAIQHSSVST-SNGVSSTSKAEAVATSVLTQMADQSTE---PALSQIVM
390 400 410 420 430
480
pF1KB9 TPQSQSAGR
.:.:::
CCDS58 APSSQSQPSGS
440
>>CCDS58739.1 ATF2 gene_id:1386|Hs108|chr2 (209 aa)
initn: 748 init1: 544 opt: 725 Z-score: 412.8 bits: 84.6 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 725; 63.1% identity (76.4% similar) in 195 aa overlap (1-186:19-208)
10 20 30 40
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPART
:.::.::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 MKFKLHVNSARQYKDLWNMSDDKPFLCTAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 DSVIIADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTP
::::.::::::::::::::::::::::::: ::.:::::...: :: :::.: .::
CCDS58 DSVIVADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASPFENEFKKASEDDIKKM---PLDLSPLATP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB9 DIKIKEEEPVEVDSSPPDSPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLISTPTPTIVRPGSL--P--L
:. : ::: :... ::: : : :::: : . . :: .::::.:: : :
CCDS58 IIRSKIEEPSVVETTHQDSPLPHPESTTSDEKEV-PL-AQTAQPTSAIVRPASLQVPNVL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 HLGYDP---LHPTLPSPTS--VITQAPPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPVLPGPPV
. : .. ..::::: :::::: ::: .
CCDS58 LTSSDSSVIIQQAVPSPTSSTVITQAPSSNRPIV
180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 QMPSVISLARPVSMVPNIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSING
>>CCDS43563.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 (369 aa)
initn: 737 init1: 538 opt: 648 Z-score: 368.3 bits: 77.2 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 744; 43.6% identity (61.7% similar) in 360 aa overlap (191-468:20-368)
170 180 190 200 210
pF1KB9 GYDPLHPTLPSPTSVITQAPPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPV---LPG--PPVQM
::: ..:: : : .:. .:: : :
CCDS43 MFCTSGGNSASVMSMRPVPGSLSSLLHLHNRQRQPMPASMPGTLPNPTM
10 20 30 40
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 PS----VISLARPVSMVPNIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSI
:. .. . : .:. .: :. :: . :. ::. .:. :::::::::.:::. ...
CCDS43 PGSSAVLMPMERQMSVNSSIMGMQGPNL-SNPCASPQVQPMHSEAKMRLKAALTHHPAAM
50 60 70 80 90 100
280 290 300
pF1KB9 NGGCGMVVGTASTMVTAR------------PEQSQILI---------QHP----------
..: ..: :. .: :.: : : :::
CCDS43 SNGNMNTMGHMMEMMGSRQDQTPHHHMHSHPHQHQTLPPHHPYPHQHQHPAHHPHPQPHH
110 120 130 140 150 160
310 320
pF1KB9 ---------------------DAPSPA-----QPQVSPA----------QPTPSTGGRRR
.: : : ::::: :: ::::::
CCDS43 QQNHPHHHSHSHLHAHPAHHQTSPHPPLHTGNQAQVSPATQQMQPTQTIQPPQPTGGRRR
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 RTVDEDPDERRQRFLERNRAAASRCRQKRKLWVSSLEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNE
:.:::::::::..:::::::::.:::::::.:: ::::::::::. :.::.:::..:.::
CCDS43 RVVDEDPDERRRKFLERNRAAATRCRQKRKVWVMSLEKKAEELTQTNMQLQNEVSMLKNE
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430
pF1KB9 VAQLKQLLLAHKDCPVTALQKKTQGYLESPKESSEPTGSPAP------VIQHSSATAPSN
:::::::::.:::::.::.::..:::: :: ::: : .::.: ::::.. :. :
CCDS43 VAQLKQLLLTHKDCPITAMQKESQGYL-SP-ESS-PPASPVPACSQQQVIQHNTITTSS-
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480
pF1KB9 GLSVRSAAEAVATSVLTQMASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQSAGR
:..:.:..:.:.:....::.:. ::
CCDS43 -----SVSEVVGSSTLSQLTTHRTDLN-PIL
350 360
>>CCDS43562.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 (475 aa)
initn: 972 init1: 538 opt: 649 Z-score: 367.2 bits: 77.3 E(32554): 3.9e-14
Smith-Waterman score: 1032; 41.7% identity (59.6% similar) in 527 aa overlap (26-468:2-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKN
.:.::::::::: .::. ...::::::::::::
CCDS43 MIHRHKHEMTLKFPSIKTDN-MLSDQTPTPTRFLKN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSPPD
:::::::.:: :.::::.:: .:. .: ..:. .. . ..:
CCDS43 CEEVGLFSELDCSLEHEFRKAQEEESSKR-----NISMHNAVGGAM---------TGPGT
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KB9 SPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLISTPTPTIVRPGSLPLHLGYDPLHPTLPSP--TSVITQ
:: . :: : .. ..::: .:::::
CCDS43 HQLSS----------------------------ARLPNHDTNVVIQQAMPSPQSSSVITQ
90 100 110
180 190 200 210 220
pF1KB9 APPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPV---LPG--PPVQMPS----VISLARPVSMVP
:: .:::.: ::: ..:: : : .:. .:: : ::. .. . : .:.
CCDS43 APSTNRQIGPVPGSLSSLLHLHNRQRQPMPASMPGTLPNPTMPGSSAVLMPMERQMSVNS
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 NIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVGTASTMVTAR
.: :. :: . :. ::. .:. :::::::::.:::. .....: ..: :. .:
CCDS43 SIMGMQGPNL-SNPCASPQVQPMHSEAKMRLKAALTHHPAAMSNGNMNTMGHMMEMMGSR
180 190 200 210 220 230
290 300
pF1KB9 ------------PEQSQILI---------QHP----------------------------
:.: : : :::
CCDS43 QDQTPHHHMHSHPHQHQTLPPHHPYPHQHQHPAHHPHPQPHHQQNHPHHHSHSHLHAHPA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB9 ---DAPSPA-----QPQVSPA----------QPTPSTGGRRRRTVDEDPDERRQRFLERN
.: : : ::::: :: :::::::.:::::::::..:::::
CCDS43 HHQTSPHPPLHTGNQAQVSPATQQMQPTQTIQPPQPTGGRRRRVVDEDPDERRRKFLERN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 RAAASRCRQKRKLWVSSLEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTA
::::.:::::::.:: ::::::::::. :.::.:::..:.:::::::::::.:::::.::
CCDS43 RAAATRCRQKRKVWVMSLEKKAEELTQTNMQLQNEVSMLKNEVAQLKQLLLTHKDCPITA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB9 LQKKTQGYLESPKESSEPTGSPAP------VIQHSSATAPSNGLSVRSAAEAVATSVLTQ
.::..:::: :: ::: :. ::.: ::::.. :. : :..:.:..:.:.:
CCDS43 MQKESQGYL-SP-ESSPPA-SPVPACSQQQVIQHNTITTSS------SVSEVVGSSTLSQ
420 430 440 450 460
460 470 480
pF1KB9 MASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQSAGR
....::.:. ::
CCDS43 LTTHRTDLN-PIL
470
>>CCDS5418.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 (501 aa)
initn: 987 init1: 538 opt: 649 Z-score: 366.9 bits: 77.4 E(32554): 4.1e-14
Smith-Waterman score: 1163; 43.0% identity (60.8% similar) in 549 aa overlap (4-468:6-500)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFL
.:::::.::::.::: .:::: .:.::::::::: .::. ...::::::::::
CCDS54 MNLEQERPFVCSAPGCSQRFPTEDHLMIHRHKHEMTLKFPSIKTDN-MLSDQTPTPTRFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KNCEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSP
:::::::::.:: :.::::.:: .:. .: ..:. .. . ..:
CCDS54 KNCEEVGLFSELDCSLEHEFRKAQEEESSKR-----NISMHNAVGGAM---------TGP
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 PDSPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLISTPTPTIVRPGSLPLHLGYDPLHPTLPSP--TSVI
:: . :: : .. ..::: .:::
CCDS54 GTHQLSS----------------------------ARLPNHDTNVVIQQAMPSPQSSSVI
110 120 130
180 190 200 210 220
pF1KB9 TQAPPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPV---LPG--PPVQMPS----VISLARPVSM
:::: .:::.: ::: ..:: : : .:. .:: : ::. .. . : .:.
CCDS54 TQAPSTNRQIGPVPGSLSSLLHLHNRQRQPMPASMPGTLPNPTMPGSSAVLMPMERQMSV
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 VPNIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVGTASTMVT
.: :. :: . :. ::. .:. :::::::::.:::. .....: ..: :.
CCDS54 NSSIMGMQGPNL-SNPCASPQVQPMHSEAKMRLKAALTHHPAAMSNGNMNTMGHMMEMMG
200 210 220 230 240 250
290 300
pF1KB9 AR------------PEQSQILI---------QHP--------------------------
.: :.: : : :::
CCDS54 SRQDQTPHHHMHSHPHQHQTLPPHHPYPHQHQHPAHHPHPQPHHQQNHPHHHSHSHLHAH
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340
pF1KB9 -----DAPSPA-----QPQVSPA----------QPTPSTGGRRRRTVDEDPDERRQRFLE
.: : : ::::: :: :::::::.:::::::::..:::
CCDS54 PAHHQTSPHPPLHTGNQAQVSPATQQMQPTQTIQPPQPTGGRRRRVVDEDPDERRRKFLE
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 RNRAAASRCRQKRKLWVSSLEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPV
::::::.:::::::.:: ::::::::::. :.::.:::..:.:::::::::::.:::::.
CCDS54 RNRAAATRCRQKRKVWVMSLEKKAEELTQTNMQLQNEVSMLKNEVAQLKQLLLTHKDCPI
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450
pF1KB9 TALQKKTQGYLESPKESSEPTGSPAP------VIQHSSATAPSNGLSVRSAAEAVATSVL
::.::..:::: :: ::: : .::.: ::::.. :. : :..:.:..:.:
CCDS54 TAMQKESQGYL-SP-ESS-PPASPVPACSQQQVIQHNTITTSS------SVSEVVGSSTL
440 450 460 470 480
460 470 480
pF1KB9 TQMASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQSAGR
.:....::.:. ::
CCDS54 SQLTTHRTDLN-PIL
490 500
>>CCDS5417.1 CREB5 gene_id:9586|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 987 init1: 538 opt: 649 Z-score: 366.8 bits: 77.4 E(32554): 4.1e-14
Smith-Waterman score: 1163; 43.0% identity (60.8% similar) in 549 aa overlap (4-468:13-507)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQT
.:::::.::::.::: .:::: .:.::::::::: .::. ...:::
CCDS54 MIYEESKMNLEQERPFVCSAPGCSQRFPTEDHLMIHRHKHEMTLKFPSIKTDN-MLSDQT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PTPTRFLKNCEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEP
::::::::::::::::.:: :.::::.:: .:. .: ..:. .. .
CCDS54 PTPTRFLKNCEEVGLFSELDCSLEHEFRKAQEEESSKR-----NISMHNAVGGAM-----
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VEVDSSPPDSPASSPCSPPLKEKEVTPKPVLISTPTPTIVRPGSLPLHLGYDPLHPTLPS
..: :: . :: : .. ..::
CCDS54 ----TGPGTHQLSS----------------------------ARLPNHDTNVVIQQAMPS
110 120 130
180 190 200 210 220
pF1KB9 P--TSVITQAPPSNRQMGSPTGSLPLVMHLANGQTMPV---LPG--PPVQMPS----VIS
: .::::::: .:::.: ::: ..:: : : .:. .:: : ::. ..
CCDS54 PQSSSVITQAPSTNRQIGPVPGSLSSLLHLHNRQRQPMPASMPGTLPNPTMPGSSAVLMP
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LARPVSMVPNIPGIPGPPVNSSGSISPSGHPIPSEAKMRLKATLTHQVSSINGGCGMVVG
. : .:. .: :. :: . :. ::. .:. :::::::::.:::. .....: ..:
CCDS54 MERQMSVNSSIMGMQGPNL-SNPCASPQVQPMHSEAKMRLKAALTHHPAAMSNGNMNTMG
200 210 220 230 240 250
290 300
pF1KB9 TASTMVTAR------------PEQSQILI---------QHP-------------------
:. .: :.: : : :::
CCDS54 HMMEMMGSRQDQTPHHHMHSHPHQHQTLPPHHPYPHQHQHPAHHPHPQPHHQQNHPHHHS
260 270 280 290 300 310
310 320 330
pF1KB9 ------------DAPSPA-----QPQVSPA----------QPTPSTGGRRRRTVDEDPDE
.: : : ::::: :: :::::::.:::::::
CCDS54 HSHLHAHPAHHQTSPHPPLHTGNQAQVSPATQQMQPTQTIQPPQPTGGRRRRVVDEDPDE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 RRQRFLERNRAAASRCRQKRKLWVSSLEKKAEELTSQNIQLSNEVTLLRNEVAQLKQLLL
::..:::::::::.:::::::.:: ::::::::::. :.::.:::..:.:::::::::::
CCDS54 RRRKFLERNRAAATRCRQKRKVWVMSLEKKAEELTQTNMQLQNEVSMLKNEVAQLKQLLL
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440
pF1KB9 AHKDCPVTALQKKTQGYLESPKESSEPTGSPAP------VIQHSSATAPSNGLSVRSAAE
.:::::.::.::..:::: :: ::: : .::.: ::::.. :. : :..:
CCDS54 THKDCPITAMQKESQGYL-SP-ESS-PPASPVPACSQQQVIQHNTITTSS------SVSE
440 450 460 470 480
450 460 470 480
pF1KB9 AVATSVLTQMASQRTELSMPIQSHVIMTPQSQSAGR
.:..:.:.:....::.:. ::
CCDS54 VVGSSTLSQLTTHRTDLN-PIL
490 500
>>CCDS58238.1 ATF7 gene_id:11016|Hs108|chr12 (117 aa)
initn: 617 init1: 617 opt: 617 Z-score: 358.9 bits: 73.8 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 617; 100.0% identity (100.0% similar) in 89 aa overlap (1-89:1-89)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGDDRPFVCNAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARTDSVIIADQTPTPTRFLKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKAAAGPLDMSLPSTPDIKIKEEEPVEVDSSPPD
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CEEVGLFNELASSFEHEFKKAADEDEKKARSRTVAKKLVVFRPRLFLLCFGIIFLIG
70 80 90 100 110
483 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:36:12 2016 done: Fri Nov 4 18:36:13 2016
Total Scan time: 4.050 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]