Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9716
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9716, 393 aa
1>>>pF1KB9716 393 - 393 aa - 393 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3690+/-0.000878; mu= 3.7856+/- 0.053
mean_var=163.6793+/-33.377, 0's: 0 Z-trim(112.3): 38 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.100248
statistics sampled from 13059 (13095) to 13059 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41561.1 PAX2 gene_id:5076|Hs108|chr10 ( 394) 2641 393.6 1.7e-109
CCDS7499.1 PAX2 gene_id:5076|Hs108|chr10 ( 396) 2278 341.1 1.1e-93
CCDS6607.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 391) 1848 278.9 5.6e-75
CCDS65048.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 362) 1552 236.0 4.1e-62
CCDS65047.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 357) 1352 207.1 2e-53
CCDS65046.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 328) 1338 205.1 7.7e-53
CCDS46399.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 398) 1287 197.7 1.5e-50
CCDS46398.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 450) 1267 194.9 1.2e-49
CCDS65045.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 324) 1228 189.2 4.7e-48
CCDS65040.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 283) 1225 188.7 5.7e-48
CCDS65044.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 295) 1214 187.1 1.8e-47
CCDS42736.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 321) 1186 183.1 3.2e-46
CCDS42735.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 287) 1166 180.2 2.1e-45
CCDS65042.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 319) 875 138.1 1.1e-32
CCDS65043.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 348) 875 138.1 1.2e-32
CCDS31451.1 PAX6 gene_id:5080|Hs108|chr11 ( 422) 780 124.4 1.9e-28
CCDS13146.2 PAX1 gene_id:5075|Hs108|chr20 ( 534) 723 116.2 7e-26
CCDS65039.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 220) 715 114.9 7.4e-26
CCDS74709.1 PAX1 gene_id:5075|Hs108|chr20 ( 457) 700 112.9 6.1e-25
CCDS9662.1 PAX9 gene_id:5083|Hs108|chr14 ( 341) 669 108.3 1.1e-23
CCDS46522.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 483) 654 106.2 6.5e-23
CCDS2451.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 206) 642 104.3 1.1e-22
CCDS46523.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 215) 642 104.3 1.1e-22
CCDS2450.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 403) 643 104.6 1.7e-22
CCDS2449.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 407) 643 104.6 1.7e-22
CCDS42826.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 479) 643 104.6 1.9e-22
CCDS42825.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 484) 643 104.6 1.9e-22
CCDS2448.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 505) 643 104.7 2e-22
CCDS44075.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 ( 518) 642 104.5 2.3e-22
CCDS44074.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 ( 505) 628 102.5 9.1e-22
CCDS186.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 ( 520) 628 102.5 9.3e-22
CCDS5797.1 PAX4 gene_id:5078|Hs108|chr7 ( 343) 565 93.3 3.6e-19
CCDS31452.1 PAX6 gene_id:5080|Hs108|chr11 ( 436) 532 88.6 1.2e-17
CCDS65041.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 291) 398 69.1 5.9e-12
>>CCDS41561.1 PAX2 gene_id:5076|Hs108|chr10 (394 aa)
initn: 2642 init1: 2547 opt: 2641 Z-score: 2079.3 bits: 393.6 E(32554): 1.7e-109
Smith-Waterman score: 2641; 99.5% identity (99.5% similar) in 394 aa overlap (1-393:1-394)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDMHCKADPFSAMHR-HGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLRV
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDMHCKADPFSAMHPGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLRV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 EGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFHPTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSASND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFHPTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSASND
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 PVGSYSINGILGIPRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQQQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PVGSYSINGILGIPRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQQQLEA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYSLPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGSNVSGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYSLPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGSNVSGTQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEFSGNPYSHPQYTAYNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEFSGNPYSHPQYTAYNEA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB9 WRFSNPALLSSPYYYSAAPRGSAPAAAAAAYDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WRFSNPALLSSPYYYSAAPRGSAPAAAAAAYDRH
370 380 390
>>CCDS7499.1 PAX2 gene_id:5076|Hs108|chr10 (396 aa)
initn: 2267 init1: 2172 opt: 2278 Z-score: 1795.6 bits: 341.1 E(32554): 1.1e-93
Smith-Waterman score: 2278; 91.3% identity (94.0% similar) in 381 aa overlap (1-378:1-380)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDMHCKADPFSAMHR-HGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLRV
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MDMHCKADPFSAMHPGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLRV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 EGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFHPTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSASND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFHPTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSASND
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 PVGSYSINGILGIPRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQQQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PVGSYSINGILGIPRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQQQLEA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYSLPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGSNVSGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYSLPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGSNVSGTQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEF--SGNPYSHPQYTAYN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . :.. .:.:
CCDS74 TYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPEAAVGPSSSLMSKPGRK-LA
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB9 EAWRFSNPALLSSPYYYSAAPRGSAPAAAAAAYDRH
:. .:. ::: .:.:
CCDS74 EVPPCVQPTGASSPATRTATPSTRPTTRLGDSATPPY
360 370 380 390
>>CCDS6607.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 (391 aa)
initn: 1552 init1: 872 opt: 1848 Z-score: 1459.6 bits: 278.9 E(32554): 5.6e-75
Smith-Waterman score: 1848; 71.0% identity (84.8% similar) in 400 aa overlap (1-393:1-391)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDMHCKADPFSAMHR--HGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
::.. : : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MDLE-KNYPTPRTSRTGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS66 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AEGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFH-PTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSAS
:: .::::::::::::::::::::::: . :.: : .:.:: . . :::.:
CCDS66 AERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPPNQPVP--------ASSHSIVSTGSVTQVSSVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 NDPVGS-YSINGILGI--PRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQ
.: .:: :::.::::: : .. .:::::: ..:. :::: : : : :::..:.: :::
CCDS66 TDSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QQLEALDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYS-LPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGS
::::.::::::: : :.: ..: :: :: .::: . .:. :::..:..:.. : ..::
CCDS66 QQLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLASPTPADIGS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NVSGTQTYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEFSGNPYSHPQY
.: : :.::.:::::.::::::::::::::.::::: . ::.::::::::::.:::::::
CCDS66 SVPGPQSYPIVTGRDLASTTLPGYPPHVPPAGQGSYSAPTLTGMVPGSEFSGSPYSHPQY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB9 TAYNEAWRFSNPALLSSPYYYSAAPRGSAPAAAAAAYDRH
..::..::: ::.::.:::::::: ::.:: :::.:::::
CCDS66 SSYNDSWRFPNPGLLGSPYYYSAAARGAAPPAAATAYDRH
360 370 380 390
>>CCDS65048.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 (362 aa)
initn: 1519 init1: 872 opt: 1552 Z-score: 1228.7 bits: 236.0 E(32554): 4.1e-62
Smith-Waterman score: 1612; 65.8% identity (77.8% similar) in 400 aa overlap (1-393:1-362)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDMHCKADPFSAMHR--HGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
::.. : : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MDLE-KNYPTPRTSRTGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS65 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AEGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFH-PTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSAS
:: .::::::::::::::::::::::: . :.: : .:.:: . . :::.:
CCDS65 AERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPPNQPVP--------ASSHSIVSTGSVTQVSSVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 NDPVGS-YSINGILGI--PRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQ
.: .:: :::.::::: : .. .:::::: ..:. :::: : : : :::..:.: :::
CCDS65 TDSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QQLEALDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYS-LPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGS
::::.::::::: : :.: ..: :: :: .::: . .:. :::..:..:.. : ..::
CCDS65 QQLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLASPTPADIGS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NVSGTQTYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEFSGNPYSHPQY
.: : :.::.:::::.::::::::::::::.::::: . ::.::::::
CCDS65 SVPGPQSYPIVTGRDLASTTLPGYPPHVPPAGQGSYSAPTLTGMVPGS------------
300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KB9 TAYNEAWRFSNPALLSSPYYYSAAPRGSAPAAAAAAYDRH
::::::: ::.:: :::.:::::
CCDS65 -----------------PYYYSAAARGAAPPAAATAYDRH
340 350 360
>>CCDS65047.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 (357 aa)
initn: 1461 init1: 872 opt: 1352 Z-score: 1072.5 bits: 207.1 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 1564; 64.0% identity (76.8% similar) in 400 aa overlap (1-393:1-357)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDMHCKADPFSAMHR--HGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
::.. : : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MDLE-KNYPTPRTSRTGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS65 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AEGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFH-PTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSAS
:: .::::::::::::::::::::::: . :.: : .:.:: . . :::.:
CCDS65 AERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPPNQPVP--------ASSHSIVSTGSVTQVSSVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 NDPVGS-YSINGILGI--PRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQ
.: .:: :::.::::: : .. .:::::: ..:. :::: : : : :::..:.: :::
CCDS65 TDSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QQLEALDRVFERPSYPDVFQASEHIKSEQGNEYS-LPALTPGLDEVKSSLSASTNPELGS
::::.::::::: : :.: ..: :: :: .::: . .:. :::..:..:.. : ..::
CCDS65 QQLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLASPTPADIGS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NVSGTQTYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEFSGNPYSHPQY
.: : :.::.::: :::::.:::::::
CCDS65 SVPGPQSYPIVTG----------------------------------SEFSGSPYSHPQY
300 310
360 370 380 390
pF1KB9 TAYNEAWRFSNPALLSSPYYYSAAPRGSAPAAAAAAYDRH
..::..::: ::.::.:::::::: ::.:: :::.:::::
CCDS65 SSYNDSWRFPNPGLLGSPYYYSAAARGAAPPAAATAYDRH
320 330 340 350
>>CCDS65046.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 (328 aa)
initn: 1291 init1: 872 opt: 1338 Z-score: 1062.1 bits: 205.1 E(32554): 7.7e-53
Smith-Waterman score: 1338; 68.9% identity (82.1% similar) in 312 aa overlap (1-306:1-304)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDMHCKADPFSAMHR--HGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
::.. : : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MDLE-KNYPTPRTSRTGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS65 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AEGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFHPTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSASN
:: .::::::::::::::::::::::: :. : : .:.:: . . :::.:.
CCDS65 AERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQP----PNQP---VPASSHSIVSTGSVTQVSSVST
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 DPVGS-YSINGILGI--PRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQQ
: .:: :::.::::: : .. .:::::: ..:. :::: : : : :::..:.: ::::
CCDS65 DSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
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:::.::::::: : :.: ..: :: :: .::: . .:. :::..:..:.. : ..::.
CCDS65 QLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLASPTPADIGSS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VSGTQTYPVVTGRDMASTTLPGYPPHVPPTGQGSYPTSTLAGMVPGSEFSGNPYSHPQYT
: : :.::.:::
CCDS65 VPGPQSYPIVTGSPYYYSAAARGAAPPAAATAYDRH
300 310 320
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:::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::..::::::::::::::::::::
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:.::::::::::::::::::::::::. : . ..: .::::..::.: : : ..:
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.:: :::::.::: . ...::: :.. ... . ::::. .. :::::.:.:.:..::
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:. ::: ::... . : :.::: : :: :. ::. :..:. :..: :: :.:
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::::::.. . : . :: : .: : .: : .. : : .::
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..: . : : :. .. : : .. :. .:
CCDS46 PPADRA---AMPPLPSQAWWQEVNTLAMPMATPPTPPTARPGASPTPAC
360 370 380 390
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:::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::..::::::::::::::::::::
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:.::::::::::::::::::::::::. : . ..: .::::..::.: : : ..:
CCDS46 GVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFNLPMDSCVATKSLSPGHTLIPSSAVTPPESPQSD
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.:: :::::.::: . ...::: :.. ... . ::::. .. :::::.:.:.:..::
CCDS46 SLGSTYSINGLLGIAQPGSDKRKMDDSDQDSCRLSIDSQSSSSGPRKHLRTDAFSQHHLE
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:. ::: ::... . : :.::: : :: :. ::. :..:. :..: :: :.:
CCDS46 PLECPFERQHYPEAYASPSHTKGEQG-LYPLPLLNSTLDDGKATLTPSNTP-LGRNLSTH
240 250 260 270 280 290
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::::::
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300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350
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.::.:.. ::::::::.: .::::: .:..:::: :::.::: :.: :..
CCDS46 GQFTGQALLSGREMVGPTLPGYPPHIPTSGQGSYASSAIAGMVAGSEYSGNAYGHTPYSS
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360 370 380 390
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:.:::::
CCDS46 YSEAWRFPNSSLLSSPYYYSSTSRPSAPPTTATAFDHL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS65 VSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AEGICDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFH-PTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSAS
:: .::::::::::::::::::::::: . :.: : .:.:: . . :::.:
CCDS65 AERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPPNQPVP--------ASSHSIVSTGSVTQVSSVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 NDPVGS-YSINGILGI--PRSNGEKRKRDEDVSEGSVPNGDSQSGVDSLRKHLRADTFTQ
.: .:: :::.::::: : .. .:::::: ..:. :::: : : : :::..:.: :::
CCDS65 TDSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQ
180 190 200 210 220 230
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CCDS65 QQLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQGVSF------PGVPTATLSIPRTTTPG-GSP
240 250 260 270 280
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CCDS65 TRGCLAPPTIIALP------PEEPPHLQPPLPMTVTDPWSQAGTKH
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pF1KB9 KPGVIGGSKPKVATPKVVDKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLAEGICDNDTVPSVSSINRI
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CCDS65 MFAWEIRDRLLAERVCDNDTVPSVSSINRI
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 IRTKVQQPFHPTPDGAGTGVTAPGHTIVPSTASPPVSSASNDPVGS-YSINGILGI--PR
:::::::: :. : : .:.:: . . :::.:.: .:: :::.::::: :
CCDS65 IRTKVQQP----PN---QPVPASSHSIVSTGSVTQVSSVSTDSAGSSYSISGILGITSPS
40 50 60 70 80
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90 100 110 120 130 140
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CCDS65 TTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLASPTPADIGSSVPGPQSYPIVTGRDLASTT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]