Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9700
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9700, 296 aa
1>>>pF1KB9700 296 - 296 aa - 296 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4979+/-0.00141; mu= 11.6708+/- 0.084
mean_var=254.9547+/-47.086, 0's: 0 Z-trim(108.8): 934 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.080324
statistics sampled from 9414 (10463) to 9414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10501.1 ZNF75A gene_id:7627|Hs108|chr16 ( 296) 2080 254.3 8.1e-68
CCDS55503.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX ( 415) 1229 155.9 4.7e-38
CCDS14648.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX ( 510) 1229 156.0 5.2e-38
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 737 99.2 8.4e-21
CCDS59177.1 ZFP92 gene_id:139735|Hs108|chrX ( 416) 732 98.3 1e-20
CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 726 97.9 2.1e-20
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 722 97.4 2.8e-20
CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 425) 713 96.1 4.7e-20
CCDS77434.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 438) 708 95.6 7.2e-20
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 705 95.2 8.9e-20
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 705 95.4 1e-19
CCDS12212.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19 ( 321) 669 90.8 1.4e-18
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 659 90.2 4.6e-18
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 652 89.3 7.5e-18
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 650 88.9 7.9e-18
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 652 89.4 8.2e-18
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 652 89.4 8.2e-18
CCDS12208.1 ZNF558 gene_id:148156|Hs108|chr19 ( 402) 644 88.1 1.2e-17
CCDS42713.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 383) 642 87.8 1.3e-17
CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16 ( 458) 643 88.1 1.4e-17
CCDS64660.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 319) 637 87.1 1.8e-17
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 641 88.2 2.1e-17
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 637 87.5 2.4e-17
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 637 87.6 2.7e-17
CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 638 87.9 2.7e-17
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 637 87.7 2.8e-17
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 637 87.7 2.9e-17
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 632 86.8 3.3e-17
CCDS54330.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 390) 631 86.6 3.3e-17
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 635 87.6 3.6e-17
CCDS10495.1 ZNF213 gene_id:7760|Hs108|chr16 ( 459) 629 86.4 4.2e-17
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 627 86.1 4.4e-17
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 631 87.0 4.7e-17
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 630 86.8 4.8e-17
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 631 87.1 4.8e-17
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 627 86.2 5e-17
CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 563) 628 86.5 5.1e-17
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 629 86.7 5.1e-17
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 629 86.7 5.1e-17
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 627 86.3 5.1e-17
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 629 86.7 5.2e-17
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 626 86.1 5.2e-17
CCDS10685.1 ZNF785 gene_id:146540|Hs108|chr16 ( 405) 625 85.9 5.4e-17
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 627 86.4 5.6e-17
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 625 86.0 5.8e-17
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 627 86.6 6.7e-17
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 627 86.6 6.7e-17
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 624 86.0 6.8e-17
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 624 86.0 7e-17
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 622 85.6 7e-17
>>CCDS10501.1 ZNF75A gene_id:7627|Hs108|chr16 (296 aa)
initn: 2080 init1: 2080 opt: 2080 Z-score: 1331.0 bits: 254.3 E(32554): 8.1e-68
Smith-Waterman score: 2080; 100.0% identity (100.0% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETVISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWVQVSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETVISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWVQVSPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FKDSAGKSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLEIQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FKDSAGKSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLEIQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKLMDRHKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKLMDRHKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTTHQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTTHQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB9 GEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
250 260 270 280 290
>>CCDS55503.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 1229 init1: 1229 opt: 1229 Z-score: 796.7 bits: 155.9 E(32554): 4.7e-38
Smith-Waterman score: 1312; 66.4% identity (76.9% similar) in 295 aa overlap (1-295:147-404)
10 20 30
pF1KB9 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETV
.:::.:::.::.: .:.:::::::. ::::
CCDS55 VKQALVLVEFLQREPDGTKNESLLTFEDVAVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETV
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 ISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWVQVSPEFKDSAGKSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLE
::: :::::::: : .:.:.: :
CCDS55 ISL-------------------------------------GLKLKNDTGNDHPISVSTSE
180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 IQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKLMDR
::.:. .:::...:. ::: :.:: : : : :::. :: ::::: .: :::: ::::
CCDS55 IQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDL
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 HKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTT
: : . :::::::::::.::::::::::.:::: ::::::::::.:::::::::::. :
CCDS55 HGKGPTGEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMT
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 HQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGE
:::::::.:::::::::.::::::::: ::::::: : ::::.: ::::::::.::::::
CCDS55 HQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGE
320 330 340 350 360 370
280 290
pF1KB9 QPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
::::::.:.::::::::::::::::
CCDS55 QPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
380 390 400 410
>>CCDS14648.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX (510 aa)
initn: 1229 init1: 1229 opt: 1229 Z-score: 795.9 bits: 156.0 E(32554): 5.2e-38
Smith-Waterman score: 1312; 66.4% identity (76.9% similar) in 295 aa overlap (1-295:242-499)
10 20 30
pF1KB9 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETV
.:::.:::.::.: .:.:::::::. ::::
CCDS14 SEQKRIKHWKMASKLILPESLSLLTFEDVAVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETV
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 ISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWVQVSPEFKDSAGKSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLE
::: :::::::: : .:.:.: :
CCDS14 ISL-------------------------------------GLKLKNDTGNDHPISVSTSE
280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 IQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKLMDR
::.:. .:::...:. ::: :.:: : : : :::. :: ::::: .: :::: ::::
CCDS14 IQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDL
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 HKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTT
: : . :::::::::::.::::::::::.:::: ::::::::::.:::::::::::. :
CCDS14 HGKGPTGEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMT
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 HQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGE
:::::::.:::::::::.::::::::: ::::::: : ::::.: ::::::::.::::::
CCDS14 HQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGE
420 430 440 450 460 470
280 290
pF1KB9 QPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
::::::.:.::::::::::::::::
CCDS14 QPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
480 490 500 510
>>CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 (626 aa)
initn: 4865 init1: 609 opt: 737 Z-score: 486.9 bits: 99.2 E(32554): 8.4e-21
Smith-Waterman score: 737; 39.2% identity (65.8% similar) in 301 aa overlap (1-295:21-310)
10 20 30 40
pF1KB9 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETVISLALFVLPK
..:.::::. :::.:..::.:::.::: ...:: .. :
CCDS67 MASPSPPPESKGLLTFEDVAVFFTQEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 PKVISCLEQGEEPWVQVSPEFKDSAGKSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLEIQASAGVISK
. . .. :: .: :. : : .: . : . :.. .:. .: ..:
CCDS67 DEEPTVKQEIEEIEEEVEPQ-----GVIVTRIKSEIDQD---PMGRETFEL---VGRLDK
70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KB9 KAKV---KVPQKTAGKENHF--DMHRVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKL-MDRHKKD
. . ..:... .:... . . . . . : .: : . : . .:..
CCDS67 QRGIFLWEIPRESLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRV
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 CAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTTHQGI
. ::::.:.::::.: :: .:.:::::: :.::.:. : : : :: : .: : :
CCDS67 HTGEKPFQCNECGKSFSRSSFVIEHQRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGE
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 KPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGEQPYT
.::.:. : .:::: .: ::: :::::: : .::: :: .::::.:.::::::.::
CCDS67 RPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYH
230 240 250 260 270 280
280 290
pF1KB9 CSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
:. :...::: : :..::..:
CCDS67 CTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIEC
290 300 310 320 330 340
>--
initn: 3631 init1: 587 opt: 591 Z-score: 395.5 bits: 82.3 E(32554): 1e-15
Smith-Waterman score: 591; 46.6% identity (66.5% similar) in 191 aa overlap (105-295:407-590)
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 KNDTENHQPVSLSDLEIQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKR
:. ....: .: .:. .. .: ..
CCDS67 CGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQH---QRIHTREKTYPYNET
380 390 400 410 420 430
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 KKLSTWKQELLKLMDRHKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQC
:. . :. .. . : :: .::.:::::: ::. :..:::::: :::: : :
CCDS67 KESFDPNCSLVIQQEVYPK----EKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVC
440 450 460 470 480
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 DKRFRWSSDLNKHLTTHQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKF
: : :: : .: : : .:: : ::::::: :: :: .:::.:: : :::: :
CCDS67 GKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAF
490 500 510 520 530 540
260 270 280 290
pF1KB9 SQNSHLIKHRRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
:.:: ::.:.: ::::.:: : : ..::.. ::. :::.:
CCDS67 SRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFN
550 560 570 580 590 600
CCDS67 CRISLIQHQKLHTAWMQ
610 620
>>CCDS59177.1 ZFP92 gene_id:139735|Hs108|chrX (416 aa)
initn: 3129 init1: 558 opt: 732 Z-score: 485.4 bits: 98.3 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 732; 39.9% identity (65.8% similar) in 301 aa overlap (1-295:21-314)
10 20 30 40
pF1KB9 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETVISLALFVLPK
.::.. ::.::: ::.::. :: ::: ..::. : . :
CCDS59 MAAILLTTRPKVPVSFEDVSVYFTKTEWKLLDLRQKVLYKRVMLENYSHLVSLG-FSFSK
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB9 PKVISCLEQGEEPWVQVSPEFKDSAG---KSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLEIQASAGV
:..:: ::.:: ::: :. .:: . : : ...:..:. .: . :. :
CCDS59 PHLISQLERGEGPWVADIPRTWATAGLHIGDRTQSKTSTSTQKHSGRQLPGADPQG--GK
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 ISKKAKVKVPQKTA---GKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKLMDRHKKD
.. :. .: :. : :. . . .. . .. : . ...:.: :.
CCDS59 EGQAARSSVLQRGAQGLGQSSAAGPQGPKGAEKRYLCQQCGKAFSRSSNLIK----HRII
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 CAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTTHQGI
. :::. : :::: :: : :..:::::. :::: : .:.: : ::.: :: . :.:
CCDS59 HSGEKPYACPECGKLFRRSFALLEHQRIHSGEKPYACPECSKTFTRSSNLIKHQVIHSGE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 KPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGEQPYT
.:. :. ::: : .. : : :.:.::.:..: :::: ::..:.::.:.::: ::.::.
CCDS59 RPFACGDCGKLFRRSFALLEHARVHSGERPYACPECGKAFSRSSNLIEHQRTHRGEKPYA
240 250 260 270 280 290
280 290
pF1KB9 CSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
:. : . :. :.:..::. :
CCDS59 CGQCAKAFKGVSQLIHHQRSHSGERPFACRECGKAFRGRSGLSQHRRVHSGEKPYECSDC
300 310 320 330 340 350
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10 20 30
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::..::: :::.:. :: ::: :::....:
CCDS59 PHQVGLIRSYNSKTMTCFQELVTFRDVAIDFSRQEWEYLDPNQRDLYRDVMLENYRNLVS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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:. . :: :.. ::.:.:::. . : . : : :. . .. : . .:.
CCDS59 LGGHSISKPVVVDLLERGKEPWMILREETQ------FTDLDLQCEIISYIEVPTYETDIS
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100 110 120 130 140
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.. : :. :. : .: .. . . :: .. . :. :.. . : :
CCDS59 STQLQSIYKREKLYECKKCQKKFSSGYQLILHHRFHVIERPYECKECGKNFRSGYQLTL-
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
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:.. . :::..: ::::.:: . .: :::.:: :: :.:.:: : : ..: . .
CCDS59 ----HQRFHTGEKPYECTECGKNFRSGYQLTVHQRFHTGEKTYECRQCGKAFIYASHIVQ
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: : : :::.:. ::..:::. .:. :::.::::::. :.:::: ::. :.:..: .
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270 280 290
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:: :.:: : : . : : .: ::..:
CCDS59 HTDEKPYICEKCGKAFRRGHQLTVHQRVHTGKKPYECKECGKGYTTASYFLLHQRIHKGG
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:..: : :.: ..:. : :.:. :: :: :::.: : :.:::: .: .:.::.:
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pF1KB9 RRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
:.:::::.:: :. : ..:: .. : .:::.:
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pF1KB9 FPVKKRKKLSTWKQELLKLMDRHKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKP
::..:. : ::: .: :: :::.:::
CCDS59 GEKPYKCKECGKTFSLHGYLNQHQKIHTGMKPYECKVCRKTFTFYRNLTLHQSIHTDEKP
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CCDS59 ECGKAFSRASNLVQHERIHTGEKPYVCKQCGKTFRYGSALKAHQRIHRSIKV
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.:... . . . . . : .: : . : . .:.. . ::::.:.::::
CCDS65 TQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGK
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CCDS65 SFSRSSFVIEHQRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSFSQ
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.: ::: :::::: : .::: :: .::::.:.::::::.:: :. :...::: : :
CCDS65 RRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLL
230 240 250 260 270 280
290
pF1KB9 LRHQKLHL
..::..:
CCDS65 VEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQ
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pF1KB9 KNDTENHQPVSLSDLEIQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKR
:. ....: .: .:. .. .: ..
CCDS65 CGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQH---QRIHTREKTYPYNET
370 380 390 400 410
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pF1KB9 KKLSTWKQELLKLMDRHKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQC
:. . :. .. . : :: .::.:::::: ::. :..:::::: :::: : :
CCDS65 KESFDPNCSLVIQQEVYPK----EKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVC
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pF1KB9 DKRFRWSSDLNKHLTTHQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKF
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CCDS65 GKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAF
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pF1KB9 SQNSHLIKHRRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
:.:: ::.:.: ::::.:: : : ..::.. ::. :::.:
CCDS65 SRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFN
540 550 560 570 580 590
CCDS65 CRISLIQHQKLHTAWMQ
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. . : : : :.: .:. . ::: . . : . .. ..:.
CCDS42 ECLGRQSPL-CPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKGLRRRSALSREILTKER
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pF1KB9 PFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTTHQGIKPYKC
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CCDS42 HQECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRHLMSHTGESPYEC
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: :.:.: . ..: .::: ::::::: :.:::: : . : : .:.: ::::.:: : :
CCDS42 SVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESPYECHQCG
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. ::..: : ::: .:
CCDS42 KAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDPRYQCNECGKAFF
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CCDS77 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLGLPV-PQ
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CCDS77 PDVIFQLKRGDKPWMV---DLHGSEEREWPESVSLAQEKNCICFLFVPDWETKPEIHDAS
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: . .. :... .:..: :.: .:. . ::: . . : .
CCDS77 DKKSEGSLRECLGRQSPLCPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKGLRRRSALS
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.. ..:. .:..::::: :.: .::: :: :::: :..: : : :.:..:: .:
CCDS77 REILTKERHQECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRHLMSH
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CCDS77 TGESPYECSVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGES
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CCDS77 PYECHQCGKAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDPRYQC
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CCDS47 SKPDLITCLEQNKEPWNIKRNEMVTKHPVMCSHFTQDLPPELGIKDSLQKVIPRRYGKSG
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CCDS47 YRCEECGKAFTWSSTLTKHRRIHTGEKPYTCEECGQAFSRSSTLANHKRIHTGEKPYTCE
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pF1KB9 ECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
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CCDS47 ECGKAFSLSSSLTYHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNCSSTLKKHKIIHTGEKPYKCKECGK
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296 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]