Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9679
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9679, 129 aa
1>>>pF1KB9679 129 - 129 aa - 129 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7151+/-0.00126; mu= 4.3156+/- 0.073
mean_var=214.1497+/-44.660, 0's: 0 Z-trim(108.1): 904 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.087643
statistics sampled from 8994 (9987) to 8994 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 1.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 726 104.6 8.1e-23
CCDS46784.1 ZNF860 gene_id:344787|Hs108|chr3 ( 632) 716 103.4 2e-22
CCDS46171.1 ZNF765 gene_id:91661|Hs108|chr19 ( 523) 702 101.5 6.2e-22
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 705 102.2 6.6e-22
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 698 101.0 8.8e-22
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 695 100.8 1.4e-21
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 685 99.4 3e-21
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 668 97.3 1.4e-20
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 667 97.4 1.9e-20
CCDS54312.1 ZNF611 gene_id:81856|Hs108|chr19 ( 636) 642 94.0 1.3e-19
CCDS12855.1 ZNF611 gene_id:81856|Hs108|chr19 ( 705) 642 94.1 1.4e-19
CCDS33095.1 ZNF320 gene_id:162967|Hs108|chr19 ( 509) 631 92.5 3.1e-19
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 625 91.9 6.4e-19
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 618 90.9 9.7e-19
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 620 91.4 1e-18
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 619 91.1 1e-18
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 620 91.4 1.1e-18
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 325) 597 87.9 4.7e-18
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 597 88.2 6.4e-18
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 597 88.2 6.4e-18
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 596 88.4 8.9e-18
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 596 88.4 8.9e-18
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 586 86.9 1.7e-17
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 583 86.5 2.2e-17
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 584 86.8 2.4e-17
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 581 86.2 2.7e-17
CCDS33092.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 465) 579 85.9 2.8e-17
CCDS54311.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 531) 579 85.9 3e-17
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 578 85.8 3.4e-17
CCDS44344.1 ZNF695 gene_id:57116|Hs108|chr1 ( 515) 576 85.5 3.8e-17
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 575 85.3 3.9e-17
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 575 85.4 4.1e-17
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 575 85.4 4.3e-17
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 575 85.4 4.3e-17
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 575 85.5 4.4e-17
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 577 85.9 4.5e-17
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 577 85.9 4.6e-17
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 576 85.7 4.6e-17
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 577 86.0 5e-17
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 574 85.4 5.1e-17
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 576 85.9 5.5e-17
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 572 85.1 5.6e-17
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 573 85.3 5.7e-17
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 571 85.0 6.3e-17
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 573 85.4 6.4e-17
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 569 84.6 7.1e-17
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 569 84.7 7.1e-17
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 569 84.7 7.4e-17
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 569 84.7 7.7e-17
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 569 84.9 8.9e-17
>>CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 (590 aa)
initn: 3483 init1: 726 opt: 726 Z-score: 523.1 bits: 104.6 E(32554): 8.1e-23
Smith-Waterman score: 726; 75.8% identity (89.8% similar) in 128 aa overlap (1-128:226-353)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
::::::::::.:.::::::...: ::::::
CCDS54 ISCRPETHTPNNYGNNFFHSSLLTQKQEVHMREKSFQCNETGEAFNCSSFVRKHQIIHLG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPH
::.:: ::::::::.::::: :.::::.:::::::.:::.:::::::. :. ::::::.
CCDS54 EKQYKFDICGKVFNEKRYLARHRRCHTSEKPYKCNECGKSFSYKSSLTCHRRCHTGEKPY
260 270 280 290 300 310
100 110 120
pF1KB9 KCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
::::::: :. :. :. ::: :::::::::.:: : ::
CCDS54 KCNECGKSFSYKSSLTCHHRCHTGEKPYKCNECGKSFSYKSSLRCHRRLHTGIKPYKCNE
320 330 340 350 360 370
CCDS54 CGKMFGQNSTLVIHKAIHTGEKPYKCNECGKAFNQQSHLSRHHRLHTGEKPYKCNDCGKA
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 570 init1: 570 opt: 570 Z-score: 416.5 bits: 84.9 E(32554): 7e-17
Smith-Waterman score: 570; 60.0% identity (80.8% similar) in 125 aa overlap (3-127:424-548)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:: ..::. :::: .: : . . .: :::
CCDS54 TGEKPYKCNECGKAFNQQSHLSRHHRLHTGEKPYKCNDCGKAFIHQSSLARHHRLHTGEK
400 410 420 430 440 450
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
.:::. : .::.:: : :. ::::::::::.: ::::..::: :. .:.::::.::
CCDS54 SYKCEECDRVFSQKSNLERHKIIHTGEKPYKCNECHKTFSHRSSLPCHRRLHSGEKPYKC
460 470 480 490 500 510
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::.:: ...:. :::::::::::::. :::.:
CCDS54 NECGKTFNVQSHLSRHHRLHTGEKPYKCKVCDKAFMCHSYLANHTRIHSGEKPYKCNECG
520 530 540 550 560 570
CCDS54 KAHNHLIDSSIKPCMSS
580 590
>>CCDS46784.1 ZNF860 gene_id:344787|Hs108|chr3 (632 aa)
initn: 2213 init1: 714 opt: 716 Z-score: 515.9 bits: 103.4 E(32554): 2e-22
Smith-Waterman score: 716; 72.9% identity (90.7% similar) in 129 aa overlap (1-129:225-353)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
.::::::::::::::::::::.: :::.::
CCDS46 ISSRPKIHISNNYENNFFHSSLLTLKQEVHIREKSFQCNESGKAFNCSSLLRKHQIIYLG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPH
:.::::.:::::::::::: ::::::::::::::.:::.:. .:.:. :. .::::::.
CCDS46 GKQYKCDVCGKVFNQKRYLACHHRCHTGEKPYKCNECGKVFNQQSNLASHHRLHTGEKPY
260 270 280 290 300 310
100 110 120
pF1KB9 KCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
::.:: :::..:. : :.:.:::::::::. :.:.: :
CCDS46 KCEECDKVFSRKSNLERHRRIHTGEKPYKCKVCEKAFRRDSHLTQHTRIHTGEKPYKCNE
320 330 340 350 360 370
CCDS46 CGKAFSGQSTLIHHQAIHGIGKLYKCNDCHKVFSNATTIANHWRIHNEERSYKCNKCGKF
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 621 init1: 621 opt: 621 Z-score: 451.0 bits: 91.4 E(32554): 8.4e-19
Smith-Waterman score: 621; 67.7% identity (81.1% similar) in 127 aa overlap (3-129:423-549)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:.:..::. :: : : : : :::
CCDS46 GIGKLYKCNDCHKVFSNATTIANHWRIHNEERSYKCNKCGKFFRRRSYLVVHWRTHTGEK
400 410 420 430 440 450
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:::. :::.:... :. :. ::::::::::.::::: ..:.:::::::::::::.::
CCDS46 PYKCNECGKTFHHNSALVIHKAIHTGEKPYKCNECGKTFRHNSALVIHKAIHTGEKPYKC
460 470 480 490 500 510
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::::::.: :: ::::::::::::::::: ::::
CCDS46 NECGKVFNQQATLARHHRLHTGEKPYKCEECDTVFSRKSHHETHKRIHTGEKPYKCDDFD
520 530 540 550 560 570
CCDS46 EAFSQASSYAKQRRIHMGEKHHKCDDCGKAFTSHSHRIRHQRIHTGQKSYKCHKRGKVFS
580 590 600 610 620 630
>>CCDS46171.1 ZNF765 gene_id:91661|Hs108|chr19 (523 aa)
initn: 1250 init1: 702 opt: 702 Z-score: 507.2 bits: 101.5 E(32554): 6.2e-22
Smith-Waterman score: 713; 65.6% identity (78.3% similar) in 157 aa overlap (1-129:210-366)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
:::::::::.::::.::::::.: :.::::
CCDS46 ISCRPETHISNDYGNNFLNSSLFTQKQEVHMREKSFQCNDSGKAYNCSSLLRKHQLIHLG
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFS------------------
::.:::::::::::.:::.: :.::::::::::::.::::::
CCDS46 EKQYKCDICGKVFNSKRYVARHRRCHTGEKPYKCNECGKTFSQTYYLTCHRRLHTGEKPY
240 250 260 270 280 290
80 90 100 110 120
pF1KB9 ----------YKSSLVIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEE
.::.: ::. :::::::.:::::::.:.::.::. :.:::::::::::.:
CCDS46 KCEECDKAFHFKSKLQIHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSQKSYLTCHRRLHTGEKPYKCNE
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 CDKVFSR
: :.:::
CCDS46 CGKTFSRKSHFTCHHRVHTGEKPYKCNECSKTFSHKSSLTYHRRLHTEEKPYKCNECGKT
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 530 init1: 385 opt: 515 Z-score: 379.5 bits: 77.8 E(32554): 8.1e-15
Smith-Waterman score: 515; 55.6% identity (79.4% similar) in 126 aa overlap (3-128:380-504)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:: ..::: .:.:. .: : . .: ::
CCDS46 TGEKPYKCNECGKTFSRKSHFTCHHRVHTGEKPYKCNECSKTFSHKSSLTYHRRLHTEEK
350 360 370 380 390 400
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:::. :::.:::. : : :.:::::::..: :..:.::.: ::. ::: :.:.::
CCDS46 PYKCNECGKTFNQQLTLNIC-RLHSGEKPYKCEECDKAYSFKSNLEIHQKIHTEENPYKC
410 420 430 440 450 460
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::.:.. . :. :::::::.::::::.::..::
CCDS46 NECGKTFSRTSSLTYHHRLHTGQKPYKCEDCDEAFSFKSNLERHRRIYTGEKLHV
470 480 490 500 510 520
>>CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 (903 aa)
initn: 2770 init1: 705 opt: 705 Z-score: 506.8 bits: 102.2 E(32554): 6.6e-22
Smith-Waterman score: 705; 72.1% identity (90.7% similar) in 129 aa overlap (1-129:226-354)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
:::::: ::::::::::::::.: :: :::
CCDS46 ISCRPQIHISNNYGNNPLNSSLLPQKQEVHMREKSFPCNESGKAFNCSSLLRKHQIPHLG
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPH
.:.::::.:::.::.:.::: :.:::::::::::..:::.:::::::. :. .::: ::.
CCDS46 DKQYKCDVCGKLFNHKQYLACHRRCHTGEKPYKCKECGKSFSYKSSLTCHHRLHTGVKPY
260 270 280 290 300 310
100 110 120
pF1KB9 KCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
::::::::: :.. :. :. .:::::::::.:: :.:..
CCDS46 KCNECGKVFRQNSALVIHKAIHTGEKPYKCNECGKAFNQQSHLSRHQRLHTGVKPYKCKI
320 330 340 350 360 370
CCDS46 CEKAFACHSYLANHTRIHSGEKTYKCNECGKAFNHQSSLARHHILHTGEKPYKCEECDKV
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 1986 init1: 536 opt: 536 Z-score: 391.3 bits: 80.8 E(32554): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 536; 56.8% identity (80.8% similar) in 125 aa overlap (3-127:648-772)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
::...::: ::.:. .: : . .: :::
CCDS46 TGEKPYRCQVCDTAFTWNSQLARHTRIHTGEKTYKCNECGKTFSYKSSLVWHRRLHGGEK
620 630 640 650 660 670
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
.::: .: :.: . :.: : : :.: ::::::.:.:::: .:::: :. ::.::::.::
CCDS46 SYKCKVCDKAFVCRSYVAKHTRIHSGMKPYKCNECSKTFSNRSSLVCHRRIHSGEKPYKC
680 690 700 710 720 730
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
.::.:.:.::: : :.:::.:::::::..: ..:
CCDS46 SECSKTFSQKATLLCHRRLHSGEKPYKCNDCGNTFRHWSSLVYHRRLHTGEKSYKCTVCD
740 750 760 770 780 790
CCDS46 KAFVRNSYLARHIRIHTAEKPYKCNECGKAFNEQSHLSRHHRIHTGEKPYKCEACDKVFS
800 810 820 830 840 850
>--
initn: 2464 init1: 523 opt: 523 Z-score: 382.4 bits: 79.2 E(32554): 5.6e-15
Smith-Waterman score: 523; 56.0% identity (79.2% similar) in 125 aa overlap (3-127:396-520)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
::...::: ::::: .: : . .:.: :::
CCDS46 TGVKPYKCKICEKAFACHSYLANHTRIHSGEKTYKCNECGKAFNHQSSLARHHILHTGEK
370 380 390 400 410 420
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:::. : :::.:: : :.: :::::::::. : .:. .:.:. :. :::::: .::
CCDS46 PYKCEECDKVFSQKSTLERHKRIHTGEKPYKCKVCDTAFTCNSQLARHRRIHTGEKTYKC
430 440 450 460 470 480
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
::: :.:.... : :.:::.:::::::..: ..:
CCDS46 NECRKTFSRRSSLLCHRRLHSGEKPYKCNQCGNTFRHRASLVYHRRLHTLEKSYKCTVCN
490 500 510 520 530 540
CCDS46 KVFMRNSVLAVHTRIHTAKKPYKCNECGKAFNQQSHLSRHRRLHTGEKPYKCEACDKVFG
550 560 570 580 590 600
>--
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Smith-Waterman score: 464; 59.8% identity (81.4% similar) in 102 aa overlap (27-128:784-885)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCH
.: :::.::: .: :.: .. ::: : : :
CCDS46 RRLHSGEKPYKCNDCGNTFRHWSSLVYHRRLHTGEKSYKCTVCDKAFVRNSYLARHIRIH
760 770 780 790 800 810
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 TGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEK
:.:::::::.:::.:. .: : :. :::::::.::. : :::..:..: :. .:::::
CCDS46 TAEKPYKCNECGKAFNEQSHLSRHHRIHTGEKPYKCEACDKVFSRKSHLKRHRIIHTGEK
820 830 840 850 860 870
120
pF1KB9 PYKCEECDKVFSR
::::.:: :.::
CCDS46 PYKCNECGKAFSDRSTLIHHQAIHGIGKFD
880 890 900
>--
initn: 448 init1: 448 opt: 455 Z-score: 336.0 bits: 70.6 E(32554): 2.2e-12
Smith-Waterman score: 455; 56.9% identity (80.4% similar) in 102 aa overlap (27-128:532-633)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCH
.: ::.::: .:.::: .. :: : : :
CCDS46 RRLHSGEKPYKCNQCGNTFRHRASLVYHRRLHTLEKSYKCTVCNKVFMRNSVLAVHTRIH
510 520 530 540 550 560
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 TGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEK
:..::::::.:::.:. .: : :. .::::::.::. : :::.::. : ::.:.:::::
CCDS46 TAKKPYKCNECGKAFNQQSHLSRHRRLHTGEKPYKCEACDKVFGQKSALESHKRIHTGEK
570 580 590 600 610 620
120
pF1KB9 PYKCEECDKVFSR
::.:. :: .:.
CCDS46 PYRCQVCDTAFTWNSQLARHTRIHTGEKTYKCNECGKTFSYKSSLVWHRRLHGGEKSYKC
630 640 650 660 670 680
>>CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 (522 aa)
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Smith-Waterman score: 698; 72.7% identity (91.4% similar) in 128 aa overlap (1-128:210-337)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
::::::.: .: :.::::::::: :::::
CCDS33 ICCRPKTHISNKYGNNSLHSSLLTQKWEVHMREKSFECIQSFKSFNCSSLLKKHQIIHLE
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPH
::. :::.:::::::::::: :.::::::::::::.:::::...::: ::::.::::::.
CCDS33 EKQCKCDVCGKVFNQKRYLACHRRCHTGEKPYKCNECGKTFGHNSSLFIHKALHTGEKPY
240 250 260 270 280 290
100 110 120
pF1KB9 KCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
.:.:: :::..:..: :.:.:::::::::. ::..:.
CCDS33 ECEECDKVFSRKSHLERHKRIHTGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNE
300 310 320 330 340 350
CCDS33 CGKVFNRLSTLARHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKV
360 370 380 390 400 410
>--
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Smith-Waterman score: 530; 55.9% identity (79.5% similar) in 127 aa overlap (3-129:352-478)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:: . ::: ::.:: : : . . .: :::
CCDS33 TGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNECGKVFNRLSTLARHHRLHTGEK
330 340 350 360 370 380
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:::. : :::..: .: :.: :.:::::::..: :.:: ::.: :. :::::::.::
CCDS33 PYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKVFSRKSNLERHRRIHTGEKPYKC
390 400 410 420 430 440
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
. : :.:.. ..::.:.:.:::::::::.:: :.:..
CCDS33 KVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTSSLIIHRRLHTGEKPYKCNECG
450 460 470 480 490 500
CCDS33 KTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP
510 520
>>CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 (722 aa)
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10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
:::::::::::::::::::::.: :: :::
CCDS12 ISPRPQIHISNNYGNNSPNSSLLPQKQEVYMREKSFQCNESGKAFNCSSLLRKHQIPHLG
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSL-------------
.:.::::.:::.::.:.::. : ::::::::::::.:::.:: :::
CCDS12 DKQYKCDVCGKLFNHKQYLTCHCRCHTGEKPYKCNECGKSFSQVSSLTCHRRLHTAVKSH
190 200 210 220 230 240
80 90 100 110 120
pF1KB9 ---------------VIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEE
::::::::::::.::::: :.:::.. :: :.:.:::::::::::
CCDS12 KCNECGKIFGQNSALVIHKAIHTGEKPYKCNECDKAFNQQSNLARHRRIHTGEKPYKCEE
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CDKVFSR
:::::::
CCDS12 CDKVFSRKSTLESHKRIHTGEKPYKCKVCDTAFTWNSQLARHKRIHTGEKTYKCNECGKT
310 320 330 340 350 360
>--
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Smith-Waterman score: 550; 56.3% identity (80.2% similar) in 126 aa overlap (3-128:439-564)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:. .. .: :.:.:.: :. .::: :::
CCDS12 SGGKPYKCNECGKTFGQNSDLLIHKSIHTGEQPYKYEECEKVFSCGSTLETHKIIHTGEK
410 420 430 440 450 460
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
::: .: :.: . ::: : : :.::::::::.:.::: .: :. :. .:.::::.::
CCDS12 PYKCKVCDKAFACHSYLAKHTRIHSGEKPYKCNECSKTFRLRSYLASHRRVHSGEKPYKC
470 480 490 500 510 520
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::.:.:.:..:: :.:::.:::::::.:: :.::
CCDS12 NECSKTFSQRSYLHCHRRLHSGEKPYKCNECGKTFSHKPSLVHHRRLHTGEKSYKCTVCD
530 540 550 560 570 580
CCDS12 KAFVRNSYLARHTRIHTAEKPYKCNECGKAFNQQSQLSLHHRIHAGEKLYKCETCDKVFS
590 600 610 620 630 640
>--
initn: 914 init1: 488 opt: 488 Z-score: 359.5 bits: 74.6 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 488; 53.5% identity (74.0% similar) in 127 aa overlap (3-129:579-705)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:::..:. ::: .: : . :: .::
CCDS12 SGEKPYKCNECGKTFSHKPSLVHHRRLHTGEKSYKCTVCDKAFVRNSYLARHTRIHTAEK
550 560 570 580 590 600
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:::. :::.:::. :. ::: :.::: :::. : :.:: :: : :. :: :.::.::
CCDS12 PYKCNECGKAFNQQSQLSLHHRIHAGEKLYKCETCDKVFSRKSHLKRHRRIHPGKKPYKC
610 620 630 640 650 660
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
. : :.:.. ..: .: ::::::::::.:: :.::.
CCDS12 KVCDKTFGSDSHLKQHTGLHTGEKPYKCNECGKAFSKQSTLIHHQAVHGVGKLD
670 680 690 700 710 720
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Smith-Waterman score: 685; 71.3% identity (88.4% similar) in 129 aa overlap (1-129:210-338)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
:::::::::::::::: ::::.: ::::::
CCDS46 ISCRPKTHISNNYGNNFRNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLG
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40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPH
::.::::.::::::.:: :. :.:::::::::.::.:::::: ::. :. .::::::.
CCDS46 EKQYKCDVCGKVFNRKRNLVCHRRCHTGEKPYRCNECGKTFSQTYSLTCHRRLHTGEKPY
240 250 260 270 280 290
100 110 120
pF1KB9 KCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
::.:: :.:. :. : :.:.:.:::::::.:: :.::.
CCDS46 KCEECDKAFSFKSNLKRHRRIHAGEKPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPFKCNE
300 310 320 330 340 350
CCDS46 CGKTFSRKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQELTLKCHRRLHTGEKPYKCNECGKV
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 2872 init1: 619 opt: 619 Z-score: 449.8 bits: 91.1 E(32554): 9.9e-19
Smith-Waterman score: 619; 66.1% identity (81.9% similar) in 127 aa overlap (3-129:464-590)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:: ..::: ::.:. : : :: :::
CCDS46 SGEKPYKCTECVKTFSRNSALVIHKAIHIGEKRYKCNECGKTFSRISALVIHTAIHTGEK
440 450 460 470 480 490
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:::. ::: ::.: .:: ::: ::::::::::.:::.:. :. :. :. .:::.::.::
CCDS46 PYKCNECGKGFNRKTHLACHHRLHTGEKPYKCNECGKVFNRKTHLAHHHRLHTGDKPYKC
500 510 520 530 540 550
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::::::::.:: :::::::::::::.:: :::..
CCDS46 NECGKVFNQKAHLARHHRLHTGEKPYKCNECGKVFNQKANLARHHRLHTGEKPYKFNECG
560 570 580 590 600 610
CCDS46 KAFN
>--
initn: 780 init1: 543 opt: 543 Z-score: 397.8 bits: 81.5 E(32554): 7.7e-16
Smith-Waterman score: 543; 68.9% identity (84.5% similar) in 103 aa overlap (27-129:348-450)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCH
.: ::: .::. :::.:..: :. ::: :
CCDS46 RRIHAGEKPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPFKCNECGKTFSRKSSLTCHHRLH
320 330 340 350 360 370
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 TGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEK
:::::::::.:::::: . .: :. .::::::.::::::::::.:: :: :::::.:::
CCDS46 TGEKPYKCNECGKTFSQELTLKCHRRLHTGEKPYKCNECGKVFNKKANLARHHRLHSGEK
380 390 400 410 420 430
120
pF1KB9 PYKCEECDKVFSR
:::: :: :.:::
CCDS46 PYKCTECVKTFSRNSALVIHKAIHIGEKRYKCNECGKTFSRISALVIHTAIHTGEKPYKC
440 450 460 470 480 490
>>CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 (651 aa)
initn: 3297 init1: 668 opt: 668 Z-score: 483.0 bits: 97.3 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 668; 68.2% identity (86.0% similar) in 129 aa overlap (1-129:224-352)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
:::: : :: ::::: ::::.. .: :
CCDS33 RISCRLKTHISNKYGKNFLHSSFTQIQEICMREKPCQSNECGKAFNYSSLLRRHHITHSR
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPH
:..::::.:::.::::.:..:::::::::: ::::.:::::. :::: :. .::::::.
CCDS33 EREYKCDVCGKIFNQKQYIVYHHRCHTGEKTYKCNECGKTFTQMSSLVCHRRLHTGEKPY
260 270 280 290 300 310
100 110 120
pF1KB9 KCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::::.:..:. : :.:::::::::::.:: :.:.:
CCDS33 KCNECGKTFSEKSSLRCHRRLHTGEKPYKCNECGKTFGRNSALVIHKAIHTGEKPYKCNE
320 330 340 350 360 370
CCDS33 CGKTFSQKSSLQCHHILHTGEKPYKCEECDNVYIRRSHLERHRKIHTGEGSYKCKVCDKV
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 2032 init1: 587 opt: 587 Z-score: 427.7 bits: 87.1 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 587; 61.4% identity (80.3% similar) in 127 aa overlap (3-129:394-520)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:: ..:.: ... : :.. . :: ::
CCDS33 TGEKPYKCNECGKTFSQKSSLQCHHILHTGEKPYKCEECDNVYIRRSHLERHRKIHTGEG
370 380 390 400 410 420
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
.::: .: ::: . ::: :.: ::::::::::.::..:: :::: :...::::::. :
CCDS33 SYKCKVCDKVFRSDSYLAEHQRVHTGEKPYKCNKCGRSFSRKSSLQYHHTLHTGEKPYTC
430 440 450 460 470 480
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::::... :: :::::.::::::::::::::::
CCDS33 NECGKVFSRRENLARHHRLHAGEKPYKCEECDKVFSRRSHLERHRRIHTGEKPYKCKVCD
490 500 510 520 530 540
CCDS33 KAFRSDSCLANHTRVHTGEKPYKCNKCAKVFNQKGILAQHQRVHTGEKPYKCNECGKVFN
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 1166 init1: 501 opt: 506 Z-score: 372.3 bits: 76.8 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 506; 61.8% identity (81.8% similar) in 110 aa overlap (19-128:522-631)
10 20 30 40
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEKKYKCDICGKVFNQKRY
: :.. . :: ::: ::: .: :.: .
CCDS33 RRENLARHHRLHAGEKPYKCEECDKVFSRRSHLERHRRIHTGEKPYKCKVCDKAFRSDSC
500 510 520 530 540 550
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pF1KB9 LAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASH
:: : : ::::::::::.:.:.:. :. :. :. .::::::.::::::::::::: ::.:
CCDS33 LANHTRVHTGEKPYKCNKCAKVFNQKGILAQHQRVHTGEKPYKCNECGKVFNQKASLAKH
560 570 580 590 600 610
110 120
pF1KB9 HRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
.:.::.::::::.:: :.:.
CCDS33 QRVHTAEKPYKCNECGKAFTGQSTLIHHQAIHGCRETLQM
620 630 640 650
>>CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 (970 aa)
initn: 2319 init1: 667 opt: 667 Z-score: 480.5 bits: 97.4 E(32554): 1.9e-20
Smith-Waterman score: 700; 67.9% identity (77.6% similar) in 156 aa overlap (1-128:210-365)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLG
:::::::::::::::: ::.:.: ::::::
CCDS46 ISCRPKTHISKNYGNNFLNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSVLRKHQIIHLG
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70
pF1KB9 EKKYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFS-----------------Y
:.::::.:::::::::::: :.:::::.::::::.:::::: :
CCDS46 AKQYKCDVCGKVFNQKRYLACHRRCHTGKKPYKCNDCGKTFSQELTLTCHHRLHTGEKHY
240 250 260 270 280 290
80 90 100 110 120
pF1KB9 K-----------SSLVIHKAIHTGEKPHKCNECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEE
: :.:::::::::::: .:::::::.:.: .::. :.:::::::::::::
CCDS46 KCSECGKTFSRNSALVIHKAIHTGEKSYKCNECGKTFSQTSYLVYHRRLHTGEKPYKCEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 CDKVFSR
:::.::
CCDS46 CDKAFSFKSNLERHRKIHTGEKPYKCNECSRTFSRKSSLTRHRRLHTGEKPYKCNDCGKT
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 3288 init1: 626 opt: 626 Z-score: 452.5 bits: 92.2 E(32554): 7e-19
Smith-Waterman score: 626; 66.1% identity (86.6% similar) in 127 aa overlap (3-129:632-758)
10 20 30
pF1KB9 MREKSFQCNESGKAFNCSSLLKKCQIIHLGEK
:: ..:.: .::. .: :.. . :: :::
CCDS46 NEERSYKCNRCGKFFRHRSYLAVHWRTHSGEKPYKCEECDEAFSFKSNLQRHRRIHTGEK
610 620 630 640 650 660
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KYKCDICGKVFNQKRYLAYHHRCHTGEKPYKCNQCGKTFSYKSSLVIHKAIHTGEKPHKC
:.:. :::.:..: ::. :.: ::::::::::.:::::. .:.:.:::::::::::.::
CCDS46 PYRCNECGKTFSRKSYLTCHRRLHTGEKPYKCNECGKTFGRNSALIIHKAIHTGEKPYKC
670 680 690 700 710 720
100 110 120
pF1KB9 NECGKVFNQKAYLASHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSR
:::::.:.::. :. : ::::::::::::::::::::
CCDS46 NECGKAFSQKSSLTCHLRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSSLEKHRRIHTGEKPYKCKVCD
730 740 750 760 770 780
CCDS46 KAFGRDSHLAQHTRIHTGEKPYKCNECGKNFRHNSALVIHKAIHSGEKPYKCNECGKTFR
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:::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]