Result of FASTA (omim) for
pF1KB9668
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9668, 498 aa
1>>>pF1KB9668 498 - 498 aa - 498 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1895+/-0.000514; mu= 12.4732+/- 0.032
mean_var=266.8684+/-54.059, 0's: 0 Z-trim(118.1): 2058 B-trim: 93 in 1/50
Lambda= 0.078510
statistics sampled from 28359 (30666) to 28359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 9.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1736 210.5 1.1e-53
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1736 210.5 1.1e-53
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1736 210.5 1.1e-53
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1736 210.6 1.1e-53
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1736 210.6 1.1e-53
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1736 210.6 1.2e-53
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1736 210.6 1.2e-53
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1736 210.6 1.2e-53
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1736 210.6 1.2e-53
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1736 210.6 1.2e-53
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1724 209.1 2.6e-53
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1724 209.2 3e-53
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1724 209.2 3e-53
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1724 209.2 3e-53
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1724 209.2 3e-53
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1691 205.5 4e-52
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1691 205.5 4e-52
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1691 205.5 4.2e-52
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1691 205.5 4.2e-52
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1691 205.5 4.2e-52
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 1656 201.4 5.4e-51
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 1656 201.4 5.4e-51
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 1656 201.4 5.5e-51
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1656 201.4 5.8e-51
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1656 201.5 6e-51
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 1656 201.5 6e-51
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 1641 199.8 2.1e-50
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1641 199.9 2.2e-50
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1641 199.9 2.2e-50
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1641 199.9 2.2e-50
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1641 199.9 2.3e-50
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1641 200.0 2.3e-50
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1632 198.8 4.2e-50
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1632 198.8 4.2e-50
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1632 198.8 4.2e-50
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1632 198.8 4.2e-50
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1632 198.8 4.2e-50
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1632 198.8 4.2e-50
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.7 bits: 210.5 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:140-560)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
NP_001 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
NP_001 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
NP_001 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
NP_001 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
NP_001 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
NP_001 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
NP_001 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
NP_001 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
530 540 550 560 570 580
NP_001 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
590 600 610
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.9 bits: 46.1 E(85289): 0.00036
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:561-616)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
NP_001 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
540 550 560 570 580 590
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
NP_001 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.7 bits: 210.5 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:145-565)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
XP_016 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
XP_016 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
XP_016 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
XP_016 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
XP_016 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
XP_016 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
540 550 560 570 580 590
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610 620
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.9 bits: 46.1 E(85289): 0.00036
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:566-621)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
XP_016 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
540 550 560 570 580 590
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
XP_016 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610 620
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.7 bits: 210.5 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:152-572)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
XP_016 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
XP_016 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
XP_016 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
XP_016 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
XP_016 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
XP_016 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
540 550 560 570 580 590
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610 620
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.8 bits: 46.1 E(85289): 0.00036
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:573-628)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
XP_016 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
550 560 570 580 590 600
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
XP_016 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
610 620
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.5 bits: 210.6 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:182-602)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
XP_016 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
XP_016 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
XP_016 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
XP_016 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
XP_016 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
XP_016 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
570 580 590 600 610 620
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.6 bits: 46.1 E(85289): 0.00037
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:603-658)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
XP_016 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
580 590 600 610 620 630
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
XP_016 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650
>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.5 bits: 210.6 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:182-602)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
NP_001 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
NP_001 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
NP_001 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
NP_001 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
NP_001 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
NP_001 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
NP_001 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
NP_001 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
570 580 590 600 610 620
NP_001 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.6 bits: 46.1 E(85289): 0.00037
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:603-658)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
NP_001 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
580 590 600 610 620 630
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
NP_001 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650
>>XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.4 bits: 210.6 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:194-614)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
XP_006 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
XP_006 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
XP_006 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
XP_006 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
XP_006 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
XP_006 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
XP_006 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
XP_006 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
XP_006 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.5 bits: 46.1 E(85289): 0.00037
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:615-670)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
XP_006 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
XP_006 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
>>NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 isofo (670 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.4 bits: 210.6 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:194-614)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
NP_003 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
NP_003 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
NP_003 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
NP_003 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
NP_003 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
NP_003 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
NP_003 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
NP_003 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
NP_003 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.5 bits: 46.1 E(85289): 0.00037
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:615-670)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
NP_003 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
NP_003 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
>>XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.4 bits: 210.6 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:194-614)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
XP_006 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
XP_006 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
XP_006 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
XP_006 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
XP_006 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
XP_006 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
XP_006 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
XP_006 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
XP_006 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.5 bits: 46.1 E(85289): 0.00037
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:615-670)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
XP_006 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
XP_006 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
>>XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.4 bits: 210.6 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:194-614)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
XP_005 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
XP_005 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
XP_005 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
XP_005 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
XP_005 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
XP_005 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
XP_005 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
XP_005 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
XP_005 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.5 bits: 46.1 E(85289): 0.00037
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:615-670)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
XP_005 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
XP_005 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
>>NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 isofo (682 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1084.3 bits: 210.6 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:206-626)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
NP_009 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
NP_009 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
NP_009 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
NP_009 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
NP_009 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
NP_009 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
NP_009 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
540 550 560 570 580 590
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
NP_009 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
600 610 620 630 640 650
NP_009 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
660 670 680
>--
initn: 521 init1: 284 opt: 284 Z-score: 195.5 bits: 46.1 E(85289): 0.00038
Smith-Waterman score: 284; 64.3% identity (85.7% similar) in 56 aa overlap (131-186:627-682)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEK
:::: : .:::.: :..:.::.:::.:::
NP_009 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
600 610 620 630 640 650
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYEC
:::::.::::: :.: .::.::.:
NP_009 PYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
660 670 680
498 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:06:24 2016 done: Fri Nov 4 18:06:25 2016
Total Scan time: 9.820 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]