FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9668, 498 aa
1>>>pF1KB9668 498 - 498 aa - 498 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0661+/-0.00117; mu= 13.0020+/- 0.070
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Lambda= 0.084369
statistics sampled from 11108 (12126) to 11108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1633 212.3 1.7e-54
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CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1623 211.2 4.1e-54
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CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1621 210.8 4.4e-54
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1621 210.8 4.5e-54
>>CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 (498 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MESPRGWTLQVAPEEGQVLCNVKTATRGLSEGAVSGGWGAWENSTEVPREAGDGQRQQAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHH
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHAC
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECG
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFS
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490
pF1KB9 HRCNLNEHQKRHGGRAAP
::::::::::::::::::
CCDS12 HRCNLNEHQKRHGGRAAP
490
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
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: :. . : : : : .: .:. .
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. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
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::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
CCDS74 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
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.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
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.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
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:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
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>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
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pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
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. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
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::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
CCDS74 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
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280 290 300 310 320 330
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::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS74 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
CCDS74 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
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pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
CCDS74 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
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460 470 480 490
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:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
CCDS74 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
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CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
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pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
CCDS12 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
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CCDS12 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
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CCDS12 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
CCDS12 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS12 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
CCDS12 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
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400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
CCDS12 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
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460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
CCDS12 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
CCDS12 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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: :. . : : : : .: .:. .
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::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
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: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
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::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS54 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
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.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
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CCDS54 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
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pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
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CCDS54 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
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CCDS54 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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CCDS64 ECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGK
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pF1KB9 SFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQ
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CCDS64 AFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQ
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pF1KB9 SSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQL
::.: .: .::.: .::.: ::::: . ::.:. :..:::. :. ::::: .:: :
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pF1KB9 LQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHR
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CCDS64 IQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQ
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pF1KB9 RTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHS
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CCDS64 RIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHT
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CCDS64 GERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
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pF1KB9 P
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CCDS12 KPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYK
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: .:::.: ::. :..:...::::::::: ::::::. ::.. :.:.::: . . :..:
CCDS12 CEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKEC
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CCDS12 RKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAF
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pF1KB9 RESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRS
..: :.:::: ::::.:..: :::.::. :: :..:.:.::.:::. : .::: ::. :
CCDS12 IRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGS
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:.:.:.::.:. : .:.:.:.: :.: .:.: ::::.:: : :: :.. .:..::.
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: :
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>--
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CCDS12 TGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEK
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pF1KB9 PFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHAC
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CCDS12 PYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYEC
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CCDS12 RECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECG
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pF1KB9 KAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFS
: ..::.
CCDS12 IDFSHGSQVYM
680
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CCDS12 KPFECKECGKAFGSGSNLTHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGEKPYE
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pF1KB9 CPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDC
: .:::::. ..:..:.: ::::::::: .:::::. .::. .:::.::: .:. :. :
CCDS12 CKECGKSFSFESALIRHHRIHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYECKAC
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pF1KB9 GKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAF
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CCDS12 GMAFSSGSALTRHQRIHTGEKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKECGKAF
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CCDS12 NSGSDLTQHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTFSSGS
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CCDS12 DLTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGSALNR
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pF1KB9 HGGRAAP
:.:.
CCDS12 HNGKKLCELETIN
480
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CCDS31 TGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPY-ECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGE
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pF1KB9 KPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFR
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CCDS31 KPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFG
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CCDS31 CSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQC
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CCDS31 GKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAF
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CCDS31 SEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKS
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CCDS31 SLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIR
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CCDS31 HLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRT
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pF1KB9 HGGRAAP
: :
CCDS31 HTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVK
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CCDS46 TGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKPY-KCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGE
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CCDS46 KPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYK
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