Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8977
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8977, 373 aa
1>>>pF1KB8977 373 - 373 aa - 373 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1403+/-0.000969; mu= -2.6187+/- 0.059
mean_var=330.9697+/-66.173, 0's: 0 Z-trim(115.7): 14 B-trim: 176 in 1/52
Lambda= 0.070499
statistics sampled from 16271 (16283) to 16271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.802), E-opt: 0.2 (0.5), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 ( 373) 2505 267.9 1.1e-71
CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 582) 637 78.0 2.3e-14
CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 589) 637 78.1 2.3e-14
CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 605) 637 78.1 2.3e-14
CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 742) 619 76.3 9.6e-14
CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 761) 619 76.3 9.7e-14
CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 772) 619 76.3 9.8e-14
CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 ( 694) 532 67.4 4.2e-11
>>CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 (373 aa)
initn: 2505 init1: 2505 opt: 2505 Z-score: 1400.8 bits: 267.9 E(32554): 1.1e-71
Smith-Waterman score: 2505; 100.0% identity (100.0% similar) in 373 aa overlap (1-373:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSPCPPQQSRNRVIQLSTSELGEMELTWQEIMSITELQGLNAPSEPSFEPQAPAPYLGPP
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CCDS88 MSPCPPQQSRNRVIQLSTSELGEMELTWQEIMSITELQGLNAPSEPSFEPQAPAPYLGPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PPTTYCPCSIHPDSGFPLPPPPYELPASTSHVPDPPYSYGNMAIPVSKPLSLSGLLSEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PPTTYCPCSIHPDSGFPLPPPPYELPASTSHVPDPPYSYGNMAIPVSKPLSLSGLLSEPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QDPLALLDIGLPAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRSEYVEMYPVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QDPLALLDIGLPAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRSEYVEMYPVEY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PYSLMPNSLAHSNYTLPAAETPLALEPSSGPVRAKPTARGEAGSRDERRALAMKIPFPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PYSLMPNSLAHSNYTLPAAETPLALEPSSGPVRAKPTARGEAGSRDERRALAMKIPFPTD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LTNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LTNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTI
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 FLVPRGTKMEATD
:::::::::::::
CCDS88 FLVPRGTKMEATD
370
>>CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (582 aa)
initn: 673 init1: 616 opt: 637 Z-score: 371.5 bits: 78.0 E(32554): 2.3e-14
Smith-Waterman score: 664; 40.3% identity (64.1% similar) in 320 aa overlap (89-368:264-576)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PPPPTTYCPCSIHPDSGFPLPPPPYELPASTSHVPDPPYSYGNMAIPVSKPLSLSGLLSE
.. . .: : ..: .: .:: :::
CCDS46 ILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISN---SMP--SPATLSHSLSE
240 250 260 270 280
120 130 140 150 160
pF1KB8 PLQDPLALLDIGL-----PAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDA--------ESLELEGTEA
:. :. . :..: : . : .::::.::: : . :: :
CCDS46 LLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHSVESSSYGDTLL
290 300 310 320 330 340
170 180 190 200
pF1KB8 GRRRSEYVEMYPVEYPYSLM---PNSLAHSNYTL----------------------PAAE
: :: :. . : :. :.. .::. . : :
CCDS46 GLSDSEVEELDSA--PGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKE
350 360 370 380 390 400
210 220 230 240 250
pF1KB8 TPLALEPSSGP-VRAKPTARGEAG-SRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYP
:.. . : .. : ..: :: .::: :: :..::::..::.:::: ::::....
CCDS46 LPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVDFNEMMSKEQ
410 420 430 440 450 460
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 LTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRT
..:.::::.::::::::::::::::::::::.::.::..:..: .:.:.::. .:: :..
CCDS46 FNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKS
470 480 490 500 510 520
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 LEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD
:.....::. :: ..:. ::::.:. ::: ::.:::. ::..::::.. :
CCDS46 LHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN
530 540 550 560 570 580
>>CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (589 aa)
initn: 673 init1: 616 opt: 637 Z-score: 371.4 bits: 78.1 E(32554): 2.3e-14
Smith-Waterman score: 664; 40.3% identity (64.1% similar) in 320 aa overlap (89-368:271-583)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PPPPTTYCPCSIHPDSGFPLPPPPYELPASTSHVPDPPYSYGNMAIPVSKPLSLSGLLSE
.. . .: : ..: .: .:: :::
CCDS46 ILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISN---SMP--SPATLSHSLSE
250 260 270 280 290
120 130 140 150 160
pF1KB8 PLQDPLALLDIGL-----PAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDA--------ESLELEGTEA
:. :. . :..: : . : .::::.::: : . :: :
CCDS46 LLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHSVESSSYGDTLL
300 310 320 330 340 350
170 180 190 200
pF1KB8 GRRRSEYVEMYPVEYPYSLM---PNSLAHSNYTL----------------------PAAE
: :: :. . : :. :.. .::. . : :
CCDS46 GLSDSEVEELDSA--PGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKE
360 370 380 390 400 410
210 220 230 240 250
pF1KB8 TPLALEPSSGP-VRAKPTARGEAG-SRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYP
:.. . : .. : ..: :: .::: :: :..::::..::.:::: ::::....
CCDS46 LPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVDFNEMMSKEQ
420 430 440 450 460 470
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 LTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRT
..:.::::.::::::::::::::::::::::.::.::..:..: .:.:.::. .:: :..
CCDS46 FNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKS
480 490 500 510 520 530
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 LEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD
:.....::. :: ..:. ::::.:. ::: ::.:::. ::..::::.. :
CCDS46 LHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN
540 550 560 570 580
>>CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (605 aa)
initn: 673 init1: 616 opt: 637 Z-score: 371.3 bits: 78.1 E(32554): 2.3e-14
Smith-Waterman score: 664; 40.3% identity (64.1% similar) in 320 aa overlap (89-368:287-599)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PPPPTTYCPCSIHPDSGFPLPPPPYELPASTSHVPDPPYSYGNMAIPVSKPLSLSGLLSE
.. . .: : ..: .: .:: :::
CCDS42 ILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISN---SMP--SPATLSHSLSE
260 270 280 290 300 310
120 130 140 150 160
pF1KB8 PLQDPLALLDIGL-----PAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDA--------ESLELEGTEA
:. :. . :..: : . : .::::.::: : . :: :
CCDS42 LLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHSVESSSYGDTLL
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200
pF1KB8 GRRRSEYVEMYPVEYPYSLM---PNSLAHSNYTL----------------------PAAE
: :: :. . : :. :.. .::. . : :
CCDS42 GLSDSEVEELDSA--PGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKE
380 390 400 410 420
210 220 230 240 250
pF1KB8 TPLALEPSSGP-VRAKPTARGEAG-SRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYP
:.. . : .. : ..: :: .::: :: :..::::..::.:::: ::::....
CCDS42 LPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVDFNEMMSKEQ
430 440 450 460 470 480
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 LTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRT
..:.::::.::::::::::::::::::::::.::.::..:..: .:.:.::. .:: :..
CCDS42 FNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKS
490 500 510 520 530 540
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 LEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD
:.....::. :: ..:. ::::.:. ::: ::.:::. ::..::::.. :
CCDS42 LHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN
550 560 570 580 590 600
>>CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (742 aa)
initn: 698 init1: 600 opt: 619 Z-score: 360.3 bits: 76.3 E(32554): 9.6e-14
Smith-Waterman score: 628; 47.2% identity (71.9% similar) in 235 aa overlap (144-365:489-723)
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GLLSEPLQDPLALLDIGLPAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTE-AGRRRSEY
:. : ::.:.:.:: .: : . ::
CCDS82 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEY
460 470 480 490 500 510
180 190 200 210 220
pF1KB8 VEMYPVEY--PYSL--MP--NSLAHSN-YTL-PAAETPLALEPSS----GPVRAKPTARG
.. . : : .: .: . ..:.. :.. :.: : : : : . .
CCDS82 SKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLD
520 530 540 550 560 570
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAA
. ::::.:: :::::: .:::.::::..:::::..: :.:.::.:.::::::::::.::
CCDS82 KQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAA
580 590 600 610 620 630
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDE
::::::::.::..:::..: : .. :::: . : :.:. :.:.. ::...: .::::
CCDS82 QNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDE
640 650 660 670 680 690
350 360 370
pF1KB8 SGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD
.: ::: .:::: :.::...:.::
CCDS82 NGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
700 710 720 730 740
>>CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 698 init1: 600 opt: 619 Z-score: 360.1 bits: 76.3 E(32554): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 628; 47.2% identity (71.9% similar) in 235 aa overlap (144-365:508-742)
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GLLSEPLQDPLALLDIGLPAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTE-AGRRRSEY
:. : ::.:.:.:: .: : . ::
CCDS82 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEY
480 490 500 510 520 530
180 190 200 210 220
pF1KB8 VEMYPVEY--PYSL--MP--NSLAHSN-YTL-PAAETPLALEPSS----GPVRAKPTARG
.. . : : .: .: . ..:.. :.. :.: : : : : . .
CCDS82 SKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLD
540 550 560 570 580 590
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAA
. ::::.:: :::::: .:::.::::..:::::..: :.:.::.:.::::::::::.::
CCDS82 KQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAA
600 610 620 630 640 650
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDE
::::::::.::..:::..: : .. :::: . : :.:. :.:.. ::...: .::::
CCDS82 QNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDE
660 670 680 690 700 710
350 360 370
pF1KB8 SGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD
.: ::: .:::: :.::...:.::
CCDS82 NGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
720 730 740 750 760
>>CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (772 aa)
initn: 698 init1: 600 opt: 619 Z-score: 360.0 bits: 76.3 E(32554): 9.8e-14
Smith-Waterman score: 628; 47.2% identity (71.9% similar) in 235 aa overlap (144-365:519-753)
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GLLSEPLQDPLALLDIGLPAGPPKPQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTE-AGRRRSEY
:. : ::.:.:.:: .: : . ::
CCDS11 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEY
490 500 510 520 530 540
180 190 200 210 220
pF1KB8 VEMYPVEY--PYSL--MP--NSLAHSN-YTL-PAAETPLALEPSS----GPVRAKPTARG
.. . : : .: .: . ..:.. :.. :.: : : : : . .
CCDS11 SKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLD
550 560 570 580 590 600
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAA
. ::::.:: :::::: .:::.::::..:::::..: :.:.::.:.::::::::::.::
CCDS11 KQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAA
610 620 630 640 650 660
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDE
::::::::.::..:::..: : .. :::: . : :.:. :.:.. ::...: .::::
CCDS11 QNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDE
670 680 690 700 710 720
350 360 370
pF1KB8 SGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD
.: ::: .:::: :.::...:.::
CCDS11 NGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
730 740 750 760 770
>>CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 (694 aa)
initn: 624 init1: 522 opt: 532 Z-score: 312.8 bits: 67.4 E(32554): 4.2e-11
Smith-Waterman score: 537; 37.2% identity (67.5% similar) in 274 aa overlap (109-365:405-677)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 PPPPYELPASTSHVPDPPYSYGNMAIPVSKPLSLSGLLSEPLQDPLALLDIGLPAGPPKP
:...: :..:: .: :: .
CCDS53 LTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSVIK
380 390 400 410 420 430
140 150 160 170 180
pF1KB8 QEDPES--DSGLSLNY-SDAESL---ELEGTEAGRR----RSEYVEMYPVEYPYSL----
... .: : : ...: .: :: .:::. .: . .... .. .:
CCDS53 SNSSHSVCDEG-AIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQSDSDFHGDLTFQH
440 450 460 470 480 490
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 -MPNSLAHSNYTLPAAET-PLALEPSSGPVRAKPTARGEAG-SRDERRALAMKIPFPTDK
. : : . : : . . :. .: .:.. . . ::::.:: :..::: .:.
CCDS53 VFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDE
500 510 520 530 540 550
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELERL
::..:::.:: .:.:: ::. :..:.:::::::::::::::::::::. :..:: .. :
CCDS53 IVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNL
560 570 580 590 600 610
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 TNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTIF
..: : : ... ......:.:.: .::.:::..:::..: .:..:::: . ::.:.
CCDS53 QAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPNHYALQCTHDGSIL
620 630 640 650 660 670
370
pF1KB8 LVPRGTKMEATD
.::.
CCDS53 IVPKELVASGHKKETQKGKRK
680 690
373 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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