Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8816, 379 aa
1>>>pF1KB8816 379 - 379 aa - 379 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3724+/-0.000965; mu= 16.7569+/- 0.058
mean_var=75.4407+/-14.831, 0's: 0 Z-trim(104.8): 45 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.147663
statistics sampled from 8059 (8092) to 8059 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14489.1 ARMCX3 gene_id:51566|Hs108|chrX ( 379) 2474 536.7 1.3e-152
CCDS14487.1 ARMCX1 gene_id:51309|Hs108|chrX ( 453) 997 222.1 8e-58
CCDS14490.1 ARMCX2 gene_id:9823|Hs108|chrX ( 632) 875 196.2 6.9e-50
CCDS55146.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 308) 862 193.2 2.7e-49
CCDS5728.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 343) 848 190.2 2.3e-48
CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290) 787 177.8 8.5e-44
CCDS14488.1 ARMCX6 gene_id:54470|Hs108|chrX ( 300) 581 133.3 2.7e-31
CCDS55147.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 284) 558 128.4 7.8e-30
CCDS14500.1 ARMCX5 gene_id:64860|Hs108|chrX ( 558) 520 120.5 3.7e-27
CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395) 440 103.7 1e-21
CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX ( 838) 415 98.3 2.7e-20
CCDS14502.1 BHLHB9 gene_id:80823|Hs108|chrX ( 547) 406 96.2 7.4e-20
CCDS55148.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 249) 337 81.3 1.1e-15
CCDS55149.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 225) 332 80.2 2e-15
CCDS55145.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 284) 323 78.3 9.2e-15
>>CCDS14489.1 ARMCX3 gene_id:51566|Hs108|chrX (379 aa)
initn: 2474 init1: 2474 opt: 2474 Z-score: 2853.2 bits: 536.7 E(32554): 1.3e-152
Smith-Waterman score: 2474; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
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CCDS14 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:::::::::::::::::::
CCDS14 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
370
>>CCDS14487.1 ARMCX1 gene_id:51309|Hs108|chrX (453 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 1151.6 bits: 222.1 E(32554): 8e-58
Smith-Waterman score: 997; 51.9% identity (82.5% similar) in 297 aa overlap (80-369:159-453)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 GDCSGARYNDWSDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRA-------R
.: : .:. .....::...::: :
CCDS14 VGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRAPATTWPVR
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDL
:. : : . : .:: .::::: ..: .. :.: :.::..:::::::.::.. ::.:
CCDS14 RG--KFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQNAIREL
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 GGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQL
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CCDS14 GGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDSAVQM
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 AGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLR
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CCDS14 AGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAMTRELVS
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 AQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQV
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CCDS14 CKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFKESGV
370 380 390 400 410 420
350 360 370
pF1KB8 CADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:. :. .. .:.:..::::: : ..::
CCDS14 CVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
430 440 450
>>CCDS14490.1 ARMCX2 gene_id:9823|Hs108|chrX (632 aa)
initn: 1007 init1: 742 opt: 875 Z-score: 1009.1 bits: 196.2 E(32554): 6.9e-50
Smith-Waterman score: 875; 42.9% identity (73.8% similar) in 347 aa overlap (29-369:294-632)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGR-KQNKEKMAEGGSG--DVDDAGDCSGA
.:. :..: .. : : : : :. ..:
CCDS14 HTGAIPKATSATGAVPKGGGKGVTRSRNGGKGKGKKSKVEVDELGMGFRPGDGAAAAAAA
270 280 290 300 310 320
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RYND---WSDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPN
: . . ::.:..: :. ... .. ... :.:. : :.::: :
CCDS14 SANGGQAFLAEVPDSEEGES-----GWTDTESDSDSEPETQRRGRGRRPV-AMQKRPFPY
330 340 350 360 370
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKIL
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CCDS14 EIDEILGVRDLRKVLALLQKSDDPFIQQVALLTLSNNANYSCNQETIRKLGGLPIIANMI
380 390 400 410 420 430
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMT
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CCDS14 NKTDPHIKEKALMAMNNLSENYENQGRLQVYMNKVMDDIMASNLNSAVQVVGLKFLTNMT
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSL
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CCDS14 ITNDYQHLLVNSIANFFRLLSQGGGKIKVEILKILSNFAENPDMLKKLLSTQVPASFSSL
500 510 520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIES
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CCDS14 YNSYVESEILINALTLFEIIYDNLRAEVF--NYREFNKGSLFYLCTTSGVCVKKIRALAN
560 570 580 590 600 610
360 370
pF1KB8 HHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:::.:::::: :.. :.
CCDS14 HHDLLVKVKVIKLVNKF
620 630
>>CCDS55146.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 (308 aa)
initn: 1041 init1: 785 opt: 862 Z-score: 998.6 bits: 193.2 E(32554): 2.7e-49
Smith-Waterman score: 913; 45.3% identity (68.3% similar) in 369 aa overlap (1-369:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
:: : .:::.:::..:::::::::::::::... ... : : .
CCDS55 MGGPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGDREL---------------GIRSSKS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
..: :. : : ::.
CCDS55 AEDLTDG---------------------------------------------SYDDVLNA
50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
..:::.: :.: .: : :.: :::.::::::.. :. :::.:::.::::. .: . .:
CCDS55 EQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLGNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIK
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
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CCDS55 EKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQVCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHM
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
: . :.:.:... .:: .::.:::::::::.::::::. :::::: ::. ::.... ::
CCDS55 LHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLLLNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKE
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
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CCDS55 ILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPTFTEGSLFFLLHG-EECAQKIRALVDHHDAEVKE
250 260 270 280 290
370
pF1KB8 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:: .. :.
CCDS55 KVVTIIPKI
300
>>CCDS5728.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 (343 aa)
initn: 1029 init1: 785 opt: 848 Z-score: 981.8 bits: 190.2 E(32554): 2.3e-48
Smith-Waterman score: 966; 46.1% identity (72.5% similar) in 371 aa overlap (1-369:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
:: : .:::.:::..:::::::::::::::... ... : . .::
CCDS57 MGGPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGDREL---GIRSSKSAGAL--------
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARA--RATRARRAVQKRASPNSDDTVL
.. ..: : : :: .. . .. .. . . . .: : ::
CCDS57 ---EEGTSE-------------GQLCGRSARPQTGGTWESQWSKTSQPEDLTDGSYDDVL
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPI
. ..:::.: :.: .: : :.: :::.::::::.. :. :::.:::.::::. .: .
CCDS57 NAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLGNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQS
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQ
.::::: .:::::::.::: ..:.:..:::.:.... :::.:::::: :::::::::..:
CCDS57 IKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQVCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQ
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKEN
::: . :.:.:... .:: .::.:::::::::.::::::. :::::: ::. ::....
CCDS57 HMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLLLNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 KEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLV
::..:..:..:.::.. .: : . .: : ::::::.:. . ::.:. .. .::: :
CCDS57 KEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPTFTEGSLFFLLHG-EECAQKIRALVDHHDAEV
280 290 300 310 320 330
360 370
pF1KB8 KVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
: :: .. :.
CCDS57 KEKVVTIIPKI
340
>>CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290 aa)
initn: 874 init1: 715 opt: 787 Z-score: 899.8 bits: 177.8 E(32554): 8.5e-44
Smith-Waterman score: 787; 41.1% identity (78.6% similar) in 299 aa overlap (72-369:1993-2290)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 GSGDVDDAGDCSGARYNDWSDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRA
...: .::. .. ..: . ::.
CCDS59 APKAKAKKSSESRGIYPYMVPGAGMGSWDGAMIWSETKFAHQSEASFPVEDESR-KQTRT
1970 1980 1990 2000 2010 2020
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RRAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRD
. .. . . .. ..:..:.:..:..::.: : . : : :: :.: :.......:.
CCDS59 GEKTRPWSCRCKHEANMDPRDLEKLICMIEMTEDPSVHEIANNALYNSADYSYSHEVVRN
2030 2040 2050 2060 2070 2080
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQ
.::. .. ..::. : :..::: .:::.:: :::.:..:.:.::::.::.: :::.::
CCDS59 VGGISVIESLLNNPYPSVRQKALNALNNISVAAENHRKVKTYLNQVCEDTVTYPLNSNVQ
2090 2100 2110 2120 2130 2140
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LAGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELL
::::::. ..:.:.:::::..: ::.:.::...:. ::: .:: .:::...::.::..::
CCDS59 LAGLRLIRHLTITSEYQHMVTNYISEFLRLLTVGSGETKDHVLGMLLNFSKNPSMTKDLL
2150 2160 2170 2180 2190 2200
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 RAQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQ
:..:.:: ..:.:::.:: ::. : .::::: .:: . . ::..:...::.:.... .
CCDS59 IANAPTSLINIFSKKETKENILNALSLFENINYHFKRRAKAFTQDKFSKNSLYFLFQRPK
2210 2220 2230 2240 2250 2260
350 360 370
pF1KB8 VCADKVLGIESH-HDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
.:: :. .. .. .: :: .: ...::
CCDS59 ACAKKLRALAAECNDPEVKERVELLISKL
2270 2280 2290
>>CCDS14488.1 ARMCX6 gene_id:54470|Hs108|chrX (300 aa)
initn: 462 init1: 186 opt: 581 Z-score: 675.2 bits: 133.3 E(32554): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 604; 37.5% identity (67.8% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
:: ::.:::..:::.::::::::.:.:: :: ...::. : : . :: . . . . :
CCDS14 MGRAREVGWMAAGLMIGAGACYCVYKLTIGR-DDSEKLEEEGEEEWDDDQELDEEEPDIW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPP--WARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVL
: :. . : :.. :. .::. : . ..:.::. ...: : ..
CCDS14 FD-----FETMARPWTEDGDWTEPGAPGGTEDRPSGGGKANRAH-PIKQRPFPYEHKNTW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPI
: :. .. :....:. .: :.: ..:.. :..:: :..: .. . : ::
CCDS14 SAQNCKNGSCVLDLSKCLFIQGKLLFAEPKDAGFPFSQDINSHLASLSMARNTSPTPDPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQ
:.: :: . .::... :.: ..:.:.:.:: .:.. :: .: ::: :: .::: :
CCDS14 VRE-ALCAPDNLNASIESQGQIKMYINEVCRETVSRCCNSFLQQAGLNLLISMTVIN---
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HMLANSISDF-FRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKE
.:::.: ::. : :.: :. .:.:::: :..:.:.:... ::. ::. :. ::: ..
CCDS14 NMLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQMLFSFMSLFIRNG
230 240 250 260 270 280
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CCDS14 NREILLETPAP
290 300
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CCDS55 KVVTIIPKI
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CCDS14 KACHCKSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGITV
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CCDS14 MIENLVN--NPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAG
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CCDS14 LKLLGHLSIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKGSVKTKFYVLKVFSCLSKNHANTRELISAK
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CCDS14 VLSSLVAPFNKNESKANILNIIEIFENINFQFKTKAKLFTKEKFTKSELISIFQEAKQFG
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CCDS14 QKLQDLAEHSDPEVRDKVIRLILKL
540 550
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CCDS35 SVQEIREHLRAKESTEPESSSCNCIQCELKIGSEEFEELLLLMEKIRDPFIHEISKIAMG
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CCDS35 MRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIRMAPPYPNLNIIQTYICKV
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CCDS35 CEETLAYSVDSPEQLSGIRMIRHLTTTTDYHTLVANYMSGFLSLLATGNAKTRFHVLKML
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]