Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8669, 590 aa
1>>>pF1KB8669 590 - 590 aa - 590 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1349+/-0.00102; mu= -2.1693+/- 0.061
mean_var=285.2523+/-59.107, 0's: 0 Z-trim(114.3): 90 B-trim: 147 in 1/51
Lambda= 0.075938
statistics sampled from 14744 (14831) to 14744 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.456), width: 16
Scan time: 4.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 4019 453.8 2.7e-127
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 1328 158.9 1.2e-38
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 1297 155.6 1.5e-37
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 1296 155.5 1.5e-37
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 954 117.9 2.5e-26
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 938 116.2 8.6e-26
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 938 116.2 8.6e-26
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 933 115.6 1.2e-25
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 908 112.9 7.8e-25
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 802 101.3 2.9e-21
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 785 99.4 9.2e-21
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 785 99.4 1e-20
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 724 92.7 1e-18
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 668 86.6 6.9e-17
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 413) 629 82.3 1.3e-15
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 470) 629 82.4 1.4e-15
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 629 82.4 1.5e-15
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 536 72.1 1.6e-12
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 531 71.6 2.2e-12
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 524 70.8 3.9e-12
>>CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 (590 aa)
initn: 4019 init1: 4019 opt: 4019 Z-score: 2398.7 bits: 453.8 E(32554): 2.7e-127
Smith-Waterman score: 4019; 100.0% identity (100.0% similar) in 590 aa overlap (1-590:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGDYEDDLCRRALILVSDLCARVRDADTNDRCQEFNDRIRGYPRGPDADISVSLLSVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSGDYEDDLCRRALILVSDLCARVRDADTNDRCQEFNDRIRGYPRGPDADISVSLLSVIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TFCGIVLLGVSLFVSWKLCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHLAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TFCGIVLLGVSLFVSWKLCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHLAAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LGGHPLLGGPHHHAHAAHHPPFAELLEPGSLGGSDTPEPSYLDMDSYPEAAAAAVAAGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGGHPLLGGPHHHAHAAHHPPFAELLEPGSLGGSDTPEPSYLDMDSYPEAAAAAVAAGVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PSQTSPELPSEGGAGSGLLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRYPALPRPLTQQTLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSQTSPELPSEGGAGSGLLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRYPALPRPLTQQTLTS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QPDPSSEERPPALPLPLPGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTGAPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QPDPSSEERPPALPLPLPGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTGAPC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GRISFALRYLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRISFALRYLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRKTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NPVFNETFQFSVPLAELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNLLELAEQPPDRPLWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NPVFNETFQFSVPLAELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNLLELAEQPPDRPLWR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DIVEGGSEKADLGELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLISEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DIVEGGSEKADLGELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLISEGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RLKKRKTSIKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRVGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLKKRKTSIKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRVGPD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB8 AADPHGREHWAEMLANPRKPVEHWHQLVEEKTVTSFTKGSKGLSEKENSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AADPHGREHWAEMLANPRKPVEHWHQLVEEKTVTSFTKGSKGLSEKENSE
550 560 570 580 590
>>CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 1503 init1: 1132 opt: 1328 Z-score: 807.4 bits: 158.9 E(32554): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 1384; 51.7% identity (73.2% similar) in 447 aa overlap (139-583:15-425)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LVGGGGHHLAAGLGGHPLLGGPHHHAHAAHHPPFAELLEPGSLGG-SDT-PEPSYLDMDS
.::. : :. :. .: .:: : .
CCDS87 MPWRNKEASSPSSANPPLEALQSPSFRGNMADKLKDPSTL---G
10 20 30 40
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 YPEAAAAAVAAGVKPSQTSPELPSEGGAGSGLLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRY
. ::: :: :.:::..:.: . . . . .. ..:.: : .::.
CCDS87 FLEAA-------VKISHTSPDIPAE-------VQMSVKEHIMRHTRLQRQTTEPASSTRH
50 60 70 80
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 PALPRPLTQQTLTSQPDPSSEERPPALPLPLPGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSG
.. : : .: .:. : ..: ::: : ::.::::::. ..:
CCDS87 TSFKRHLPRQMHVSSVD-YGNELPPAAEQPTS--------IGRIKPELYK------QKSV
90 100 110 120 130
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 GGPGSGEAGTGAPCGRISFALRYLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPD
: . .: . ::.:.:.::: : .. :.::::.:.:::::: : ::::::::::::
CCDS87 DGEDAKSEATKS-CGKINFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCGSSDPYVKIYLLPD
140 150 160 170 180 190
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 RKKKFQTKVHRKTLNPVFNETFQFSVPLAELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNL
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CCDS87 RKCKLQTRVHRKTLNPTFDENFHFPVPYEELADRKLHLSVFDFDRFSRHDMIGEVILDNL
200 210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 LELAEQPPDRPLWRDIVEGGSEKADLGELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGF
.: .. . .:.:: . ::..::::. :::::::::::::.:.:: ::::::.::.
CCDS87 FEASDLSRETSIWKDIQYATSESVDLGEIMFSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNLKAMDITGY
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 SDPYVKASLISEGRRLKKRKTSIKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCI
::::::.::. .::::::.::.::::::::.::::..::. ::....:.: :.:.::: .
CCDS87 SDPYVKVSLLCDGRRLKKKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENMDQVSLLISVMDYDRV
320 330 340 350 360 370
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 GHNEVIGVCRVGPDAADPHGREHWAEMLANPRKPVEHWHQLVEEKTVTSFTKGSKGLSEK
::::.::::::: .:. ::.:: :::: ::::. :::.::: : :: .:. :
CCDS87 GHNEIIGVCRVGI-TAEGLGRDHWNEMLAYPRKPIAHWHSLVEVKK--SFKEGNPRL
380 390 400 410 420
590
pF1KB8 ENSE
>>CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 1543 init1: 1145 opt: 1297 Z-score: 787.8 bits: 155.6 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 1517; 46.3% identity (67.9% similar) in 579 aa overlap (4-580:7-513)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSGDYEDDLCRRALILVSDLCARVRDADTNDRCQEFNDRIRGYPRGPDADISVSLLS
: ..::..:: .:..:: ..:. . : :: : ..:::::::.
CCDS87 MSFHKEDGVNSLCQKALHIVTELC--FAGQVEWEKCSGIFPRDRGSQGGSSTDISVSLLA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VIVTFCGIVLLGVSLFVSWKLCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHL
:.:.:::..:: ::::: ::::: :..: :. ... :
CCDS87 VVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSK--------PVTSNITT--------------L
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AAGLGGHPLLGGPHHHAHAAHHPPFAELLEPGSLGGSDTPEPSYLDMDSYPEAAAAAVAA
.... : .:..: : : . . . : :. :.
CCDS87 PQSISSAP-----------------TEVFE--------TEEKKEIKENEKP--AVKAIEP
100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 GVKPSQTSPELPSEGGAGSGLLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRYPALPRPLTQQT
..: :.:::..:.: .. :. :. ..:.: . .::. .. : : .:
CCDS87 AIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIK-------HARVQRQITEPTSSTRHSSFRRHLPRQM
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LTSQPDPSSEERPPALPLPLPGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTG
.:. : : .: : :: .. ::.::::::. ..: . :. . .
CCDS87 QVSSVDFSMGTEP-----VLQRGETTTS-IGRIKPELYK------QKSVDSEGNQNEDVK
190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 APCGRISFALRYLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHR
::...:.:.: : .. :::.:..:::::::: .: ::::::.::::::::::::.:::
CCDS87 I-CGKLNFTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHR
240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 KTLNPVFNETFQFSVPLAELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNLLELAEQPPDRP
:::::.:.::::: : .:..:::::::::::::::::.::.:.::::.:... .
CCDS87 KTLNPLFDETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREAT
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 LWRDIVEGGSEKADLGELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLIS
.:.:: . .:. ::::. :::::::::::.:.:.:: ::::::.:: ::::::.::.
CCDS87 VWKDIHCATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMC
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 EGRRLKKRKTSIKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRV
::::::::::. :::::::.::::..::. ::.:..:.:::::.::: .::::::::::.
CCDS87 EGRRLKKRKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRT
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 GPDAADPHGREHWAEMLANPRKPVEHWHQLVE-EKTVTSF-TKGSKGLSEKENSE
: :: . ::.:: :::: :::. ::: :.: .::: ..::
CCDS87 GLDA-EGLGRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
470 480 490 500 510 520
>>CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 (491 aa)
initn: 1714 init1: 1124 opt: 1296 Z-score: 787.6 bits: 155.5 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 1543; 48.0% identity (68.4% similar) in 567 aa overlap (7-571:6-491)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSGDYEDDLCRRALILVSDLCARVRDADTNDRCQEF--NDRIRGYPRGPDADISVSLLSV
: ::..:: :...:::: : .: ::.: . : :. :: : :::::::..
CCDS77 MPGARDALCHQALQLLAELCAR--GALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLTL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 IVTFCGIVLLGVSLFVSWKLCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHLA
.:: ::..:.::::::::::::::::..: : .:. .
CCDS77 VVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERG---------------------LPSGSKDN--
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AGLGGHPLLGGPHHHAHAAHHPPFAELLEPGSLGGSDTPEPSYLDMDSYPEAAAAAVAAG
. .:: . ... .. ..:.: :: : :: .
CCDS77 ---NQEPL---NYMDTETNEQENSEDFLDP------PTPCP-----DS-----------S
100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VKPSQTSPELPSEGGAGSGLLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRYPALPRPLTQQTL
.: :.:::..: .: . . :. . ..::: . ..:. .. : :.
CCDS77 MKISHTSPDIPLSTQTG----IQENCAHGV---RVQRQVTEPTSSARHNSIRRQLN----
130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 TSQPDPSSEERPPALPLPLPGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTGA
:.:: . .. .:. ::.::::::. .:: . .:. ...
CCDS77 LSNPDFNIQQLQK---------QEQLTGIGRIKPELYK------QRSLDND-DGRRSNSK
180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PCGRISFALRYLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRK
::...: :.: .::.:.: .:..::::: .: :::::::::::::: : :::::::
CCDS77 ACGKLNFILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRK
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 TLNPVFNETFQFSVPLAELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNLLELAEQPPDRPL
::::::.:.: : :: .: :::::::::::::::::::::::.:..:.::. : . :
CCDS77 TLNPVFDEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECIL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 WRDIVEGGSEKADLGELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLISE
:.:: ....::::: :::::::::::::.::::: ::::::.:: ::::::.::. .
CCDS77 WKDIEYVTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCD
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 GRRLKKRKTSIKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRVG
:::::::::: :.:::::.::::.:::: ::..... :::::.::: .::::.::::.::
CCDS77 GRRLKKRKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVG
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 PDAADPHGREHWAEMLANPRKPVEHWHQLVEEKTVTSFTKGSKGLSEKENSE
. :. ::.::.:::. ::::. :::.:::..
CCDS77 -NEAERLGRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEKR
460 470 480 490
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
initn: 918 init1: 435 opt: 954 Z-score: 586.0 bits: 117.9 E(32554): 2.5e-26
Smith-Waterman score: 954; 49.7% identity (77.2% similar) in 298 aa overlap (288-581:127-419)
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 PGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTGAP--CGRISFALRYLYGSDQ
: : :: : :...:.: : . ..:
CCDS14 EKGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEE-EKEPENLGKLQFSLDYDFQANQ
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 LVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRKTLNPVFNETFQFSVPLA
:.: .::: .::: : .: ::::::..::::.:::..::::::::::.::::: :.::
CCDS14 LTVGVLQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQ
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 ELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLD-NLLELAEQPPDRPLWRDIVEGGSEKAD-LG
::. . : ...:::::::.::.::.: . : ..:. :: .. :::. : .:. . ::
CCDS14 ELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLG-QPIEE--WRDLQGGEKEEPEKLG
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 ELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLISEGRRLKKRKTSIKKNT
.. :: :.::::.::: :..:.::: ::. :.:::::: :...:.::::.::..::.:
CCDS14 DICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKT
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 LNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRVGPDAADPHGREHWAEM
::: .::.. :.. :....: . ..:.::: .:.::.:: :: .:. . : ::..:
CCDS14 LNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELR-HWSDM
340 350 360 370 380 390
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400 410
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:::.
CCDS76 VEEEVDAMLAVKK
410
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:.....: : . ..::.: :.:: .::: :
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CCDS90 MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFD
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CCDS90 EQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELR-HWSDMLANPRRPIAQWHTLQ
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CCDS90 VEEEVDAMLAVKK
410 420
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CCDS74 VGLKGRLGWEWGTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQPRGLHRPTRLPTPV------ASATA
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CCDS74 QVQPEVEE-LEP----APSGPGQ-QVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAA
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CCDS74 LDLGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVYD
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CCDS74 FDRFSRNDAIGEVRV----PMSSVDLGRPVQAWRELQAAPREEEKLGDICFSLRYVPTAG
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CCDS74 KLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEV
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CCDS74 PCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHS
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:
CCDS74 LRPPDRVRLLPAP
370 380
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CCDS12 RQTLNPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVR----VPMSSVDLGR
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CCDS12 PVQAWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKV
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pF1KB8 SLISEGRRLKKRKTSIKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIG
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CCDS12 HLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIG
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CCDS58 MYRDPEAASPGAPSRD--VLLVSAIIT--------VSLS
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CCDS58 VTVVLCGLCHWCQR-----KLGKRYKNSLETVGTPD--SGRGRSEKKAING-TLLSG---
30 40 50 60 70
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CCDS58 GKAGRG---------RWRTVQSHLAAGKLN-LSKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRT
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CCDS58 E----PRSS---VSDLVNSLTSEMLM-LSPGSEEDEAHEGCSRENL----GRIQFSVGYN
180 190 200 210 220
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pF1KB8 YGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRKTLNPVFNETFQF
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CCDS58 FQESTLTVKIMKAQELPAKDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLF
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CCDS58 EGFPYEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQM---QTFWKDLKPCSDG
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CCDS58 SGSRGELLLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTV
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CCDS58 TMKRNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKSG-PGEVK
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CCDS58 HWKDMIARPRQPVAQWHQLKA
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590 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:24:14 2016 done: Fri Nov 4 14:24:15 2016
Total Scan time: 4.100 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]