FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8580, 482 aa
1>>>pF1KB8580 482 - 482 aa - 482 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0885+/-0.000844; mu= 7.3947+/- 0.052
mean_var=167.9761+/-34.036, 0's: 0 Z-trim(113.6): 82 B-trim: 11 in 1/49
Lambda= 0.098958
statistics sampled from 14133 (14216) to 14133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.437), width: 16
Scan time: 3.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 482) 3215 470.7 1.6e-132
CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 ( 525) 2496 368.0 1.3e-101
CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 385) 2345 346.4 3.2e-95
CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 ( 485) 1305 198.0 1.9e-50
CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 461) 1244 189.3 7.7e-48
CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 522) 1244 189.3 8.5e-48
>>CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (482 aa)
initn: 3215 init1: 3215 opt: 3215 Z-score: 2492.8 bits: 470.7 E(32554): 1.6e-132
Smith-Waterman score: 3215; 100.0% identity (100.0% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIF
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 YT
::
CCDS10 YT
>>CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 (525 aa)
initn: 2397 init1: 2156 opt: 2496 Z-score: 1937.5 bits: 368.0 E(32554): 1.3e-101
Smith-Waterman score: 2496; 77.6% identity (89.0% similar) in 491 aa overlap (7-482:42-525)
10 20 30
pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSS---
:::. :..: : :::. :: ::.:..
CCDS12 CPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPT-PPAPPGPGTDAQ
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB8 ----------LGP-LLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAA
:: :::: :::::.: ...::::::::.:.: ::.:..::: ..
CCDS12 AAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFLVGKGLSS-
80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 AAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQ
:::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::
CCDS12 -----QRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDEVQ
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDT
::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::..
CCDS12 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLEN
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 IDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFG
:::.: :::.::::::::.::: ::::::::.::: :::.:::::.::::::::: ::
CCDS12 IDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVTPE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 NKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPR
:..:::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::.:::::
CCDS12 NRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDRPR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 CCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
:::::::: ::::::::::::::::::::::.::.:: .:::::::::::::::::::::
CCDS12 CCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 IEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPDSHYGTKGLK
:. ... .::::::::::::.:.:::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::.
CCDS12 IHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHYGTKGLR
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480
pF1KB8 KVVHETPAA-SKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
::.::.:.. .:: : : . :::::::.:::::::.::::
CCDS12 KVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
490 500 510 520
>>CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (385 aa)
initn: 2340 init1: 2340 opt: 2345 Z-score: 1822.9 bits: 346.4 E(32554): 3.2e-95
Smith-Waterman score: 2345; 98.6% identity (99.2% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..: : :
CCDS32 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIR-SLNMRKS
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN
CCDS32 KPWDRMIPALVVMGQLTHSGSCSRNP
360 370 380
>>CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 (485 aa)
initn: 1274 init1: 790 opt: 1305 Z-score: 1019.1 bits: 198.0 E(32554): 1.9e-50
Smith-Waterman score: 1312; 44.7% identity (72.6% similar) in 481 aa overlap (7-481:23-484)
10 20 30 40
pF1KB8 MASLGPAAAGEQAS--GAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQR
::.:..:. . . :.:: ::: :.: .:: :.
CCDS10 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGN--NHQE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 EPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSA
: .:. . .:.:: :..::.::..::.::.: :. . .:::..:::.::.
CCDS10 SP--GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGP------PGATRTVPAHKYVLAVGSS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 VFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPA
:: ::: : .: ...::..::::::::: ::...::::... .::..:::.:::: :::
CCDS10 VFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDID
: ::.:: :.: :: .::.:.:::.::.:.. : ..:: .. :. .::: .:: .
CCDS10 LAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTI
:: .. :..:. .:. .: ::. ::::::.:: ::.: ::..:::.:: :.:.: ::.
CCDS10 TLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 EEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR-
:::: : ::: ::. .:. ..:: .:.. :::... : : ..: .:::. :
CCDS10 EEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRS
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB8 --WGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFS
: : : : :.:.:.::. :.:.::::: : ..:.:.:.. . .:.:: : :
CCDS10 NQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFM
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 CDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFF
::..::: : :..:... .. ::: :.: : . :..: .:. .: .:..: :
CCDS10 SDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEV-----QCGKVAFQF
410 420 430 440 450 460
460 470 480
pF1KB8 FSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
: ..:::... :::::.:::
CCDS10 QCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
470 480
>>CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (461 aa)
initn: 1228 init1: 814 opt: 1244 Z-score: 972.3 bits: 189.3 E(32554): 7.7e-48
Smith-Waterman score: 1244; 44.6% identity (73.6% similar) in 444 aa overlap (44-481:34-460)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 SGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRF
: :::. ...:: :..::..:..::.:
CCDS13 DIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHF
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALL
:.: :: ::.:.:..:::.::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.:
CCDS13 VVGP------PGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAML
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 RFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEP
...: ::.... .::..:::.:::: :: : ::.:: : : :: .::.:. ::.::
CCDS13 KYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEP
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 QLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQ
.:.. : ..:: .. :...::: :::..:: ..:.:.::. .: .: :.. :::.:::
CCDS13 DLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQ
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 RQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKP
::.: ... ::.::::::: :::.: :....:: : ::::.:. :. ..:: .:. ::
CCDS13 RQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKP
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 RVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSI
....... : : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:. :.:::::::
CCDS13 ELQFVSKARKGLVPQRC--HRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSS
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420
pF1KB8 HGPTDYQVNIQIIEYEKKQ--TLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACAT
: ..:...:.. :.: .:::: . . ::..::: : :. :..: :.. ::: .
CCDS13 CGSAEYSAKIEL----KRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
: : . :..: .:. .: .:.. : : ..:::... :::::.:::
CCDS13 LDGNELSYFGQEGMTEV-----QCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
420 430 440 450 460
>>CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (522 aa)
initn: 1228 init1: 814 opt: 1244 Z-score: 971.5 bits: 189.3 E(32554): 8.5e-48
Smith-Waterman score: 1244; 44.6% identity (73.6% similar) in 444 aa overlap (44-481:95-521)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 SGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRF
: :::. ...:: :..::..:..::.:
CCDS13 DIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHF
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALL
:.: :: ::.:.:..:::.::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.:
CCDS13 VVGP------PGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAML
130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 RFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEP
...: ::.... .::..:::.:::: :: : ::.:: : : :: .::.:. ::.::
CCDS13 KYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEP
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 QLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQ
.:.. : ..:: .. :...::: :::..:: ..:.:.::. .: .: :.. :::.:::
CCDS13 DLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQ
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 RQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKP
::.: ... ::.::::::: :::.: :....:: : ::::.:. :. ..:: .:. ::
CCDS13 RQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKP
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 RVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSI
....... : : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:. :.:::::::
CCDS13 ELQFVSKARKGLVPQRC--HRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSS
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KB8 HGPTDYQVNIQIIEYEKKQ--TLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACAT
: ..:...:.. :.: .:::: . . ::..::: : :. :..: :.. ::: .
CCDS13 CGSAEYSAKIEL----KRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVI
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
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