Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8569, 771 aa
1>>>pF1KB8569 771 - 771 aa - 771 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6861+/-0.000831; mu= 14.8120+/- 0.051
mean_var=113.0023+/-21.955, 0's: 0 Z-trim(110.6): 43 B-trim: 111 in 1/52
Lambda= 0.120651
statistics sampled from 11721 (11758) to 11721 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.361), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 ( 771) 5124 903.1 0
CCDS73187.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 ( 645) 1999 359.1 1.3e-98
CCDS31272.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (1024) 1999 359.2 1.9e-98
CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047) 1947 350.2 1e-95
CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 ( 513) 1936 348.0 2.2e-95
CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs108|chr2 (1056) 1266 231.6 5e-60
CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 397) 370 75.4 2e-13
CCDS42392.2 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 398) 370 75.4 2e-13
CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs108|chr7 ( 399) 366 74.7 3.3e-13
CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs108|chr19 ( 399) 354 72.6 1.4e-12
CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs108|chr22 ( 394) 327 67.9 3.6e-11
>>CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 (771 aa)
initn: 5124 init1: 5124 opt: 5124 Z-score: 4822.4 bits: 903.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5124; 99.9% identity (99.9% similar) in 771 aa overlap (1-771:1-771)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEEDKLLSAVPEEGDATRDPGPEPEEEPGVRNGMASEGLNSSLCSPGHERRGTPADTEEP
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CCDS42 MEEDKLLSAVPEEGDATRDPGPEPEEEPGVRNGMASEGLNSSLCSPGHERRGTPADTEEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TKDPDVAFHGLSLGLSLTNGLALGPDLNILEDSAESRPWRAGVLAEGDNASRSLYPDAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TKDPDVAFHGLSLGLSLTNGLALGPDLNILEDSAESRPWRAGVLAEGDNASRSLYPDAED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PQLGLDGPGEPDVRDGFSATFEKILESELLRGTQYSSLDSLDGLSLTDESDSCVSFEAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PQLGLDGPGEPDVRDGFSATFEKILESELLRGTQYSSLDSLDGLSLTDESDSCVSFEAPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TPLIQQRARDSPEPGAGLGIGDMAFEGDMGAAGGDGELGSPLRRSISSSRSENVLSRLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TPLIQQRARDSPEPGAGLGIGDMAFEGDMGAAGGDGELGSPLRRSISSSRSENVLSRLSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 MAMPNGFHEDGPQGPGGDEDDDEEDTDKLLNSASDPSLKDGLSDSDSELSSSEGLEPGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAMPNGFHEDGPQGPGGDEDDDEEDTDKLLNSASDPSLKDGLSDSDSELSSSEGLEPGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DPLANGCQGVSEAAHRLARRLYHLEGFQRCDVARQLGKNNEFSRLVAGEYLSFFDFSGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DPLANGCQGVSEAAHRLARRLYHLEGFQRCDVARQLGKNNEFSRLVAGEYLSFFDFSGLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LDGALRTFLKAFPLMGETQERERVLTHFSRRYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LDGALRTFLKAFPLMGETQERERVLTHFSRRYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 HGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEWAIDEDELRKSLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEWAIDEDELRKSLSEL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 VDDKFGTGTKKVTRILDGGNPFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHADMGGKRTPRGRRGWK
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CCDS42 VDDKFGTGTKKVTRILDGGNPFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHADMDGKRTPRGRRGWK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 KFYAVLKGTILYLQKDEYRPDKALSEGDLKNAIRVHHALATRASDYSKKSNVLKLKTADW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KFYAVLKGTILYLQKDEYRPDKALSEGDLKNAIRVHHALATRASDYSKKSNVLKLKTADW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RVFLFQAPSKEEMLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RVFLFQAPSKEEMLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 RSHENKLRQLTAELAEHRCHPVERGIKSKEAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSHENKLRQLTAELAEHRCHPVERGIKSKEAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB8 VGSDDLERIEARLATLEGDDPSLRKTHSSPALSQGHVTGSKTTKDATGPDT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VGSDDLERIEARLATLEGDDPSLRKTHSSPALSQGHVTGSKTTKDATGPDT
730 740 750 760 770
>>CCDS73187.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (645 aa)
initn: 2045 init1: 1966 opt: 1999 Z-score: 1883.8 bits: 359.1 E(32554): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 2085; 54.3% identity (74.9% similar) in 650 aa overlap (126-769:18-634)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 SRPWRAGVLAEGDNASRSLYPDAEDPQLGLDGPGEPDVRDGFSATFEKILESELLRGTQY
::: :.:: .:: ::::. .::.:
CCDS73 MPLKSPVPFLPGTSPSADGP------DSFSCVFEAILESHRAKGTSY
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SSLDSLDGLSLTDESDS-CVSFEAPLTPLIQQRARDSPEPGAGLGIGDMAFEGDMG-AAG
.:: ::..:. ..: .:: : : . .: : : : : : : ...
CCDS73 TSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPL-------EPDSGTSSA
50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GDGELGSPLRRSISSSRSENVLSRLSLMAMPNGFHEDGPQGPGGDEDDDEEDTDKLLNSA
.:: : . .. :.. .: .: :. .: : .: .::. . : .
CCDS73 ADG----PWTQR---GEEEEAEARAKL--APG--RE--PPSPCHSEDSLGLGAAPL---G
100 110 120 130
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SDPSLKDGLSDSDSELSSSEGLEPGSADPLANGCQGVSEAAHRLARRLYHLEGFQRCDVA
:.: :.. .:::::::.:.: : ::.: :.:: .. :::.:::.:::.:.::.. :::
CCDS73 SEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVA
140 150 160 170 180 190
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RQLGKNNEFSRLVAGEYLSFFDFSGLTLDGALRTFLKAFPLMGETQERERVLTHFSRRYC
:.:::::.::.:::::::.:: :.:.::: :::.::: . ::::::::::::.:::.::
CCDS73 RHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYF
200 210 220 230 240 250
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 QCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKDLLK
::::. .:::: :::::::::::::::::::::.:.: .::.::. :::: :: ..:::
CCDS73 QCNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLK
260 270 280 290 300 310
460 470 480 490 500
pF1KB8 TLYNSIKNEKLEWAIDEDELRKSLSELVDDKFGTGTKKVTRIL----DGGNPFLDVPQAL
.::.:::::::.:::::.:::.:::::.: . : . :: .:..::::.
CCDS73 ALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADP----NPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEP
320 330 340 350 360 370
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SATTYKHGVLTRKTHADMGGKRTPRGRRGWKKFYAVLKGTILYLQKDEYRPDKALSEGDL
.:..::::.:.::.::: ..::::.::::.:...::: ::::::.::.: ::::: .:
CCDS73 GAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETEL
380 390 400 410 420 430
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 KNAIRVHHALATRASDYSKKSNVLKLKTADWRVFLFQAPSKEEMLSWILRINLVAAIFSA
:::: .:::::::::::::. .:. :.::::::::::::: :.: ::: :::.:::.:::
CCDS73 KNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSA
440 450 460 470 480 490
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 PAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQLRSHENKLRQLTAELAEHRCHPVERGIKSK
: :::::::.::: :::::: .::: ::::.:.:: ::. ...:: ::: . . ..:
CCDS73 PPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGK
500 510 520 530 540 550
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 EAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIKVGSDDLERIEARLATLEGDDPSLRKTHSS
:::: : :: :: :::::: :: :: .:.:.::..:. .:: :: . . .: .:::
CCDS73 EAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEAALAQAGSTEDGLPPSHSS
560 570 580 590 600 610
750 760 770
pF1KB8 PALSQGHVTGSKTTKDATGPDT
:.:. . .. . .. :
CCDS73 PSLQPKPSSQPRAQRHSSEPRPGAGSGRRKP
620 630 640
>>CCDS31272.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (1024 aa)
initn: 2045 init1: 1966 opt: 1999 Z-score: 1880.9 bits: 359.2 E(32554): 1.9e-98
Smith-Waterman score: 2087; 48.5% identity (68.6% similar) in 789 aa overlap (9-769:254-1013)
10 20 30
pF1KB8 MEEDKLLSAVPEEGDATRDPGPEPEEEPGVRNGMASEG
: : : :: .. :: : :..
CCDS31 SPREVSSHAQRIARAKWEFFYGSLDPPSSGAKPPEQAPPSPPGVGSRQGSGVAVGRAAKY
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80
pF1KB8 LNSSLCS-PGHERRGTPAD---TEEPTKDPDVAFHGLSLGLSLTN-------GLALGPDL
...: . : . : : : .:. : . . : : : : ::
CCDS31 SETDLDTVPLRCYRETDIDEVLAEREEADSAIESQPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHP
290 300 310 320 330 340
90 100 110 120 130
pF1KB8 NILEDSAESRPWRAGVLAEGDN----ASRSLYPDAEDPQLGLDGPGEP------DVRDGF
.. . . .:: . :. ::.. : .. : : : : : :.:
CCDS31 SLGSGNEDEDDDEAGGEEDVDDEVFEASEGARPGSRMP-LKSPVPFLPGTSPSADGPDSF
350 360 370 380 390 400
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 SATFEKILESELLRGTQYSSLDSLDGLSLTDESDS-CVSFEAPLTPLIQQRARDSPEPGA
: .:: ::::. .::.:.:: ::..:. ..: .:: : : . .: : :
CCDS31 SCVFEAILESHRAKGTSYTSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLA
410 420 430 440 450 460
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 GLGIGDMAFEGDMG-AAGGDGELGSPLRRSISSSRSENVLSRLSLMAMPNGFHEDGPQGP
: : : : ....:: : . .. :.. .: .: :. .: : .:
CCDS31 PL-------EPDSGTSSAADG----PWTQ---RGEEEEAEARAKL--APG--RE--PPSP
470 480 490 500
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 GGDEDDDEEDTDKLLNSASDPSLKDGLSDSDSELSSSEGLEPGSADPLANGCQGVSEAAH
.::. . : .:.: :.. .:::::::.:.: : ::.: :.:: .. :::.
CCDS31 CHSEDSLGLGAAPL---GSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQ
510 520 530 540 550
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 RLARRLYHLEGFQRCDVARQLGKNNEFSRLVAGEYLSFFDFSGLTLDGALRTFLKAFPLM
:::.:::.:.::.. ::::.:::::.::.:::::::.:: :.:.::: :::.::: . ::
CCDS31 RLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALM
560 570 580 590 600 610
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 GETQERERVLTHFSRRYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFI
::::::::::.:::.:: ::::. .:::: :::::::::::::::::::::.:.: .::
CCDS31 GETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFI
620 630 640 650 660 670
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 ANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEWAIDEDELRKSLSELVDDKFGTGTKKVTRI
.::. :::: :: ..:::.::.:::::::.:::::.:::.:::::.: . :: .
CCDS31 GNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADP-----NPKVIKR
680 690 700 710 720 730
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 LDGGN-----PFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHADMGGKRTPRGRRGWKKFYAVLKGTI
..::. ::::. .:..::::.:.::.::: ..::::.::::.:...::: :
CCDS31 ISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMI
740 750 760 770 780 790
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 LYLQKDEYRPDKALSEGDLKNAIRVHHALATRASDYSKKSNVLKLKTADWRVFLFQAPSK
:::::.::.: ::::: .::::: .:::::::::::::. .:. :.:::::::::::::
CCDS31 LYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSL
800 810 820 830 840 850
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 EEMLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQLRSHENKLRQL
:.: ::: :::.:::.:::: :::::::.::: :::::: .::: ::::.:.:: ::. .
CCDS31 EQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAM
860 870 880 890 900 910
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 TAELAEHRCHPVERGIKSKEAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIKVGSDDLERIE
..:: ::: . . ..::::: : :: :: :::::: :: :: .:.:.::..:. .:
CCDS31 ASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVE
920 930 940 950 960 970
740 750 760 770
pF1KB8 ARLATLEGDDPSLRKTHSSPALSQGHVTGSKTTKDATGPDT
: :: . . .: .::::.:. . .. . .. :
CCDS31 AALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSSQPRAQRHSSEPRPGAGSGRRKP
980 990 1000 1010 1020
>>CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047 aa)
initn: 2019 init1: 1058 opt: 1947 Z-score: 1831.8 bits: 350.2 E(32554): 1e-95
Smith-Waterman score: 2074; 48.6% identity (71.1% similar) in 745 aa overlap (13-753:323-1015)
10 20 30 40
pF1KB8 MEEDKLLSAVPEEGDATRDPGPEPEEEPGV-RNGMASEGL-N
: . : .:. .: : :. ..: :: :
CCDS43 PGRVKHVEFQGVEILWTGGDKRETQHPIDFETSLQRTASPDSKESSKVPRHLISSAGLCN
300 310 320 330 340 350
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SSLCSPGHERRGTPADTEEPTKDPDVAFHGLSLGLSLTNGLALGPDLNILEDSAESRPWR
:: . . .. : .:.: . . : . : : . . : . . :: . . . :
CCDS43 SSSLTENVWDESWKAPSERPGTSSGT-FSPVRLDESGEDEVFLQENKQHLEKTPKPERDR
360 370 380 390 400 410
110 120 130 140 150
pF1KB8 AGVLAEGDNASRSLYPDAEDPQLGLDGPG-EPDVRDGFSATFEKILESELLRGTQYSSLD
. . .... .:: .. ::: : : .:. :: ::.. : : : .
CCDS43 ERISEQEEHVK------GEDEDIL--GPGYTEDSTDVYSSQFETILDNTSL----YYSAE
420 430 440 450
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SLDGLSLTDESDSCVSFEAPLTPLIQQRARDSPEPGAGLGIGDMAFEGDMGAAGGDGELG
::. .: .: :: ::: ::::.:::: .. : . .: : :: ..
CCDS43 SLE--TLYSEPDSYFSFEMPLTPMIQQRIKE----------GGQFLERTSG--GGHQDI-
460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 SPLRRSISSSRSENVLSRLSLMAMPNGFHEDGPQGPGGDEDDDEEDTDKLLNSASDPSLK
.: : . ... : .. ::... .... . : .. .:. ..:
CCDS43 ------LSVSADGGIVMGYS-SGVTNGLND-------ASDSIYTKGTPEIAFWGSNAGVK
510 520 530 540 550
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DGLSDSDSELSSSEGLEPGSADPLANGCQGVSEAAHRLARRLYHLEGFQRCDVARQLGKN
.. ::..:.: :: . . :.:: .. :::.:::.:::.:. :.: :::..::::
CCDS43 TTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEAAKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKN
560 570 580 590 600 610
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 NEFSRLVAGEYLSFFDFSGLTLDGALRTFLKAFPLMGETQERERVLTHFSRRYCQCNPDD
::::.::: :::.::::.:.::: .:: :.::: :.:::::::::: ::: :: ::::
CCDS43 NEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDT
620 630 640 650 660 670
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 STSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSI
.:.::.: ::::.::::::::::::::::.::.:::::. .:.: ::.:::::.:::::
CCDS43 IASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSI
680 690 700 710 720 730
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KNEKLEWAIDEDELRKSLSELVDDKF-GTGTKKVTRILDGGNPFLDVPQALSATTYKHGV
::::::::.:..: .:: :: ...: :: : ..:: . :::::.:. .:..:: :
CCDS43 KNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGF
740 750 760 770 780 790
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 LTRKTHADMGGKRTPRGRRGWKKFYAVLKGTILYLQKDEYRPDKALSEGDLKNAIRVHHA
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CCDS43 LARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHA
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pF1KB8 LATRASDYSKKSNVLKLKTADWRVFLFQAPSKEEMLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSS
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CCDS43 LASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGS
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CCDS43 QKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKD
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pF1KB8 HYLTFEKSRYETYIHLLAMKIKVGSDDLERIEARLATLEGDDPSLRKTHSSPALSQGHVT
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CCDS43 HYLEFEKTRYEMYVSIL----KEGGKEL------LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSP
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CCDS43 ITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
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CCDS34 AKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFS
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CCDS34 LVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQE
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CCDS34 FIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTI
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CCDS34 SRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLY
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CCDS34 LQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEE
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CCDS34 MQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITT
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CCDS34 ELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSIL----KEGGKEL------
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CCDS34 LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
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CCDS33 KWTLDASQSSLLETDGEQPSSLKKKEAGEAPKPGEEVKSEGTARPAETGDVQPDIHLTSA
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CCDS33 EHENLRTPMNSSWLPGSPMPQAQSPEEGQRPPAGDKLANGVRN-NKVAWNLASRLYRLEG
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CCDS33 FRKSEVAAYLQKNNDFSRAVAEEYLSFFQFGGQSLDRALRSFLQALVLSGETQERERILY
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pF1KB8 HFSRRYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQD
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CCDS33 QFSRRFHHCNPGIFPSVDSVHTLTCAIMLLNTDLHGQNIGKSMSCQEFITNLNGLRDGGN
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CCDS33 FPKELLKALYWSIRSEKLEWAVDEEDTARP--EKAQPSLPAG--KMSK------PFLQLA
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CCDS33 QDPTVPTYKQGILARKMHQDADGKKTPWGKRGWKMFHTLLRGMVLYFLKQGEDHCLEGES
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CCDS33 LVGQMVDEPVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIARINLA
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pF1KB8 AAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQLRSHENKLRQLTAELAE-HRCHPV
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CCDS33 AATHSAPPFPAAVGSQRRFVRPILPVGPAQSSLEEQHRSHENCLDAAADDLLDLQRNLPE
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CCDS33 RRG-RGRELEEHRLRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPSDALDLWEEQLGREAGGTRE
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CCDS33 PKLSLKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKRNISERRTYRKIIPKRNRNQL
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CCDS32 KNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCEDI-------AQFLYKGEGLNKT
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CCDS32 AIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQ
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CCDS32 RYCQCNNGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEE
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CCDS32 LLRNLYESIKNEPFK--IPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNC
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CCDS42 KNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCEDI-------AQFLYKGEGLNKT
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CCDS42 AIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQ
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pF1KB8 RYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKD
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CCDS42 RYCQCNNGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEE
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::..::.::::: .. : ::. ..:. : :: :
CCDS42 LLRNLYESIKNEPFK--IPEDDG----NDLTHTFF--------------NP--D------
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CCDS42 ----REGWLLK-----LGGGRV----KTWKRRWFILTDNCLYYF--EYTTDK-----EPR
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. : ... :. : . ::: : ..: :: :: :: . ..::.
CCDS42 GIIPLEN-LSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQVIKACKTEADGRVVEGNHTVYRISAPT
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pF1KB8 KEEMLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQLRSHENKLRQ
:: :: :. ::: : . .. ::
CCDS42 PEEKEEWIKCIK--AAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKRH
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pF1KB8 LTAELAEHRCHPVERGIKSKEAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIKVGSDDLERI
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pF1KB8 SELSSSEGLEPGSADPLANGCQGVSEAAHRLARRLYHLEGFQRCDVARQLGKNNEFSRLV
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CCDS53 AMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLQSSPEDVAQFLYKGEGLNKTVIGDYLGERDEFNIKV
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.. . .:. :.: ::: :: .: : ::.:. .:.. :. ::: ::: : :
CCDS53 LQAFVELHEFADLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFASRYCLCNPGVFQSTDTC
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pF1KB8 HTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEW
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CCDS53 YVLSFAIIMLNTSLHNHNVRDKPTAERFIAMNRGINEGGDLPEELLRNLYESIKNEPFK-
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pF1KB8 AIDEDELRKSLSELVDDKFGTGTKKVTRILDGGNPFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHAD
: ::.
CCDS53 -IPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGII
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CCDS12 AMGRKKFNMDPKKGIQFLVENELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAV
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.... .:. :.: ::: :: .: : ::.:. .:.. :..::: ::: : :
CCDS12 LHAFVDLHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPGVFQSTDTC
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pF1KB8 HTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEW
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CCDS12 YVLSFAVIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFK-
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pF1KB8 AIDEDELRKSLSELVDDKFGTGTKKVTRILDGGNPFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHAD
: ::.
CCDS12 -IPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGII
250 260 270 280 290 300
771 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 13:14:38 2016 done: Fri Nov 4 13:14:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]