FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8556, 910 aa
1>>>pF1KB8556 910 - 910 aa - 910 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1066+/-0.00116; mu= -7.1676+/- 0.070
mean_var=434.4099+/-89.696, 0's: 0 Z-trim(114.7): 39 B-trim: 128 in 1/53
Lambda= 0.061535
statistics sampled from 15205 (15242) to 15205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 5.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 910) 6062 553.1 8.7e-157
CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 864) 5759 526.1 1.1e-148
CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 754) 4953 454.5 3.3e-127
CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 ( 601) 3886 359.7 9.1e-99
CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1 ( 896) 1223 123.5 1.8e-27
>>CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 (910 aa)
initn: 6062 init1: 6062 opt: 6062 Z-score: 2928.3 bits: 553.1 E(32554): 8.7e-157
Smith-Waterman score: 6062; 100.0% identity (100.0% similar) in 910 aa overlap (1-910:1-910)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
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CCDS58 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS58 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
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CCDS58 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
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CCDS58 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
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CCDS58 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
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610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
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790 800 810 820 830 840
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 ALSKADMPAA
::::::::::
CCDS58 ALSKADMPAA
910
>>CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 (864 aa)
initn: 5759 init1: 5759 opt: 5759 Z-score: 2783.2 bits: 526.1 E(32554): 1.1e-148
Smith-Waterman score: 5759; 100.0% identity (100.0% similar) in 862 aa overlap (1-862:1-862)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS32 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
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CCDS32 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
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550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
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pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
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CCDS32 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
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pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
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790 800 810 820 830 840
pF1KB8 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
::::::::::::::::::::::
CCDS32 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSVS
850 860
>>CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 (754 aa)
initn: 4953 init1: 4953 opt: 4953 Z-score: 2397.3 bits: 454.5 E(32554): 3.3e-127
Smith-Waterman score: 4953; 100.0% identity (100.0% similar) in 749 aa overlap (1-749:1-749)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
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pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
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550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
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pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKVKVHL
730 740 750
>>CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19 (601 aa)
initn: 3886 init1: 3886 opt: 3886 Z-score: 1886.6 bits: 359.7 E(32554): 9.1e-99
Smith-Waterman score: 3886; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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