Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8525
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8525, 961 aa
1>>>pF1KB8525 961 - 961 aa - 961 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4442+/-0.000923; mu= 12.5874+/- 0.056
mean_var=130.7709+/-26.281, 0's: 0 Z-trim(111.0): 73 B-trim: 389 in 1/52
Lambda= 0.112155
statistics sampled from 11973 (12046) to 11973 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 4.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4663.1 GABBR1 gene_id:2550|Hs108|chr6 ( 961) 6486 1061.2 0
CCDS4664.1 GABBR1 gene_id:2550|Hs108|chr6 ( 899) 5400 885.5 0
CCDS4665.1 GABBR1 gene_id:2550|Hs108|chr6 ( 844) 5355 878.2 0
CCDS6736.1 GABBR2 gene_id:9568|Hs108|chr9 ( 941) 1590 269.0 3e-71
CCDS2997.1 GPR156 gene_id:165829|Hs108|chr3 ( 814) 429 81.1 9.5e-15
CCDS54629.1 GPR156 gene_id:165829|Hs108|chr3 ( 810) 419 79.5 2.9e-14
>>CCDS4663.1 GABBR1 gene_id:2550|Hs108|chr6 (961 aa)
initn: 6486 init1: 6486 opt: 6486 Z-score: 5673.8 bits: 1061.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6486; 100.0% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:1-961)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLLLLLLAPLFLRPPGAGGAQTPNATSEGCQIIHPPWEGGIRYRGLTRDQVKAINFLPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLLLLLLAPLFLRPPGAGGAQTPNATSEGCQIIHPPWEGGIRYRGLTRDQVKAINFLPVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YEIEYVCRGEREVVGPKVRKCLANGSWTDMDTPSRCVRICSKSYLTLENGKVFLTGGDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YEIEYVCRGEREVVGPKVRKCLANGSWTDMDTPSRCVRICSKSYLTLENGKVFLTGGDLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ALDGARVDFRCDPDFHLVGSSRSICSQGQWSTPKPHCQVNRTPHSERRAVYIGALFPMSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALDGARVDFRCDPDFHLVGSSRSICSQGQWSTPKPHCQVNRTPHSERRAVYIGALFPMSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GWPGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GWPGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ILMPGCSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ILMPGCSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FEKWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVPVKNLKRQDAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IIVGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSINCTVDEMTEAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIVGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSINCTVDEMTEAVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GHITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLTKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GHITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLTKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LNKTSGGGGRSGVRLEDFNYNNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNKTSGGGGRSGVRLEDFNYNNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 QLQGGSYKKIGYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLQGGSYKKIGYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LGIVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLDGYHIGRNQFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGIVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLDGYHIGRNQFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 FVCQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKEWRKTLEPWKLYATVGLLVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FVCQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKEWRKTLEPWKLYATVGLLVGM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 DVLTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDIDVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVLTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDIDVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 LLLGIFLAYETKSVSTEKINDHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLLGIFLAYETKSVSTEKINDHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 IVFSSYITLVVLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVFSSYITLVVLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 IIAEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLSCDGSRVHLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIAEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLSCDGSRVHLLY
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 K
:
CCDS46 K
>>CCDS4664.1 GABBR1 gene_id:2550|Hs108|chr6 (899 aa)
initn: 5359 init1: 5359 opt: 5400 Z-score: 4724.6 bits: 885.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5905; 93.5% identity (93.5% similar) in 961 aa overlap (1-961:1-899)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLLLLLLAPLFLRPPGAGGAQTPNATSEGCQIIHPPWEGGIRYRGLTRDQVKAINFLPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLLLLLLAPLFLRPPGAGGAQTPNATSEGCQIIHPPWEGGIRYRGLTRDQVKAINFLPVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YEIEYVCRGEREVVGPKVRKCLANGSWTDMDTPSRCVRICSKSYLTLENGKVFLTGGDLP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YEIEYVCRGEREVVGPKVRKCLANGSWTDMDTPSRCV-----------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ALDGARVDFRCDPDFHLVGSSRSICSQGQWSTPKPHCQVNRTPHSERRAVYIGALFPMSG
:::::::::::::::::::::
CCDS46 ---------------------------------------NRTPHSERRAVYIGALFPMSG
100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GWPGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GWPGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKI
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ILMPGCSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ILMPGCSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKL
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FEKWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVPVKNLKRQDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FEKWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVPVKNLKRQDAR
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IIVGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSINCTVDEMTEAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIVGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSINCTVDEMTEAVE
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GHITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLTKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GHITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLTKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALA
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LNKTSGGGGRSGVRLEDFNYNNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNKTSGGGGRSGVRLEDFNYNNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIE
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 QLQGGSYKKIGYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLQGGSYKKIGYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSS
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LGIVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLDGYHIGRNQFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGIVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLDGYHIGRNQFP
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 FVCQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKEWRKTLEPWKLYATVGLLVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FVCQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKEWRKTLEPWKLYATVGLLVGM
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 DVLTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDIDVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVLTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDIDVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLL
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 LLLGIFLAYETKSVSTEKINDHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLLGIFLAYETKSVSTEKINDHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLA
720 730 740 750 760 770
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 IVFSSYITLVVLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVFSSYITLVVLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEK
780 790 800 810 820 830
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 IIAEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLSCDGSRVHLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIAEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLSCDGSRVHLLY
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 K
:
CCDS46 K
>>CCDS4665.1 GABBR1 gene_id:2550|Hs108|chr6 (844 aa)
initn: 5355 init1: 5355 opt: 5355 Z-score: 4685.7 bits: 878.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5355; 99.1% identity (99.4% similar) in 809 aa overlap (153-961:36-844)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DGARVDFRCDPDFHLVGSSRSICSQGQWSTPKPHCQVNRTPHSERRAVYIGALFPMSGGW
:.:: .: : ::::::::::::::::::
CCDS46 PFARVGWPLPLLVVMAAGVAPVWASHSPHLPRPHSRVPPHPSSERRAVYIGALFPMSGGW
10 20 30 40 50 60
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKIIL
70 80 90 100 110 120
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 MPGCSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPGCSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKLFE
130 140 150 160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVPVKNLKRQDARII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVPVKNLKRQDARII
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSINCTVDEMTEAVEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSINCTVDEMTEAVEGH
250 260 270 280 290 300
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 ITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLTKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLTKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALALN
310 320 330 340 350 360
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTSGGGGRSGVRLEDFNYNNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KTSGGGGRSGVRLEDFNYNNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIEQL
370 380 390 400 410 420
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 QGGSYKKIGYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QGGSYKKIGYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSSLG
430 440 450 460 470 480
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 IVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLDGYHIGRNQFPFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLDGYHIGRNQFPFV
490 500 510 520 530 540
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 CQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKEWRKTLEPWKLYATVGLLVGMDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKEWRKTLEPWKLYATVGLLVGMDV
550 560 570 580 590 600
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDIDVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDIDVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLLLL
610 620 630 640 650 660
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 LGIFLAYETKSVSTEKINDHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLAIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGIFLAYETKSVSTEKINDHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLAIV
670 680 690 700 710 720
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 FSSYITLVVLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSSYITLVVLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEKII
730 740 750 760 770 780
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 AEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLSCDGSRVHLLYK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLSCDGSRVHLLYK
790 800 810 820 830 840
>>CCDS6736.1 GABBR2 gene_id:9568|Hs108|chr9 (941 aa)
initn: 1412 init1: 477 opt: 1590 Z-score: 1392.6 bits: 269.0 E(32554): 3e-71
Smith-Waterman score: 1632; 35.1% identity (65.6% similar) in 793 aa overlap (150-917:42-817)
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 PALDGARVDFRCDPDFHLVGSSRSICSQGQWSTPKPHCQVNRTPHSERRAVYIGALFPMS
:. : : : : .: :.:..
CCDS67 PPPPPPPPPARLLLLLLLPLLLPLAPGAWGWARGAP-----RPPPSSPPLSIMG-LMPLT
20 30 40 50 60
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ---GGWPGGQACQPAVEMALEDVNSRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYND
. :.. ::::.:.:.. .. . : : : : .:..:: ... : .:. .
CCDS67 KEVAKGSIGRGVLPAVELAIEQIRNESLLRP-YFLDLRLYDTECDNAKGLKAFYDAIKYG
70 80 90 100 110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 PIKIILMPG-CSSVSTLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNP
: ..... : : ::....::. . :::. ::.....:.:......: :::: :: . ::
CCDS67 PNHLMVFGGVCPSVTSIIAESLQGWNLVQLSFAATTPVLADKKKYPYFFRTVPSDNAVNP
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TRVKLFEKWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVPVKNLK
. .::.... ::...:. : .. :. . .:: . :::. .:: .:: . ::.::
CCDS67 AILKLLKHYQWKRVGTLTQDVQRFSEVRNDLTGVLYGEDIEISDTESFSNDPCTSVKKLK
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 RQDARIIVGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNWFKIYDPSIN---CTV
.:.:::.: : .. : :::: .:.: ..:.:: :.. ::: .:.. : :
CCDS67 GNDVRIILGQFDQNMAAKVFCCAYEENMYGSKYQWIIPGWYEPSWWEQVHTEANSSRCLR
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 DEMTEAVEGHITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKLT-KRLKRHPEETGGFQEAPLAY
.. :.::.: ... :. . ..::. : :.. .. . :: : . :. ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]