Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8480, 854 aa
1>>>pF1KB8480 854 - 854 aa - 854 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9397+/-0.00112; mu= 5.8387+/- 0.068
mean_var=243.9854+/-47.924, 0's: 0 Z-trim(110.6): 12 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.082109
statistics sampled from 11731 (11740) to 11731 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.361), width: 16
Scan time: 4.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 854) 5588 675.9 8.2e-194
CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 732) 4718 572.8 7.7e-163
CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 ( 724) 4122 502.2 1.4e-141
CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12 ( 803) 1463 187.2 9.8e-47
CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 651) 626 88.0 5.9e-17
CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 704) 626 88.0 6.2e-17
>>CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 (854 aa)
initn: 5588 init1: 5588 opt: 5588 Z-score: 3593.0 bits: 675.9 E(32554): 8.2e-194
Smith-Waterman score: 5588; 99.9% identity (100.0% similar) in 854 aa overlap (1-854:1-854)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPPCSGGDGSTPPGPSLRDRDCPAQSAEYPRDRLDPRPGSPSEASSPPFLRSRAPVNWYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPPCSGGDGSTPPGPSLRDRDCPAQSAEYPRDRLDPRPGSPSEASSPPFLRSRAPVNWYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EKAQVFLWHLLVSGSTTLLCLWKQPFHVSAFPVTASLAFRQSQGAGQHLYKDLQPFILLR
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKAQVFLWHLMVSGSTTLLCLWKQPFHVSAFPVTASLAFRQSQGAGQHLYKDLQPFILLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 MEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKKKIKEKYIDQEELNKTKPIWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKKKIKEKYIDQEELNKTKPIWT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 NNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 KCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 DYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 KTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 IVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 VKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPP
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB8 LEGDDDTSRMEEVD
::::::::::::::
CCDS32 LEGDDDTSRMEEVD
850
>>CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 (732 aa)
initn: 4718 init1: 4718 opt: 4718 Z-score: 3036.9 bits: 572.8 E(32554): 7.7e-163
Smith-Waterman score: 4718; 100.0% identity (100.0% similar) in 732 aa overlap (123-854:1-732)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VTASLAFRQSQGAGQHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLM
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLT
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 IVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 IVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTV
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 ITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 ITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKH
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 SQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKK
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 DGDKKKKKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DGDKKKKKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFS
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 VEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVD
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 SEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIH
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 EDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVER
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 LRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFEN
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 LCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAA
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 KKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYR
640 650 660 670 680 690
820 830 840 850
pF1KB8 MIKLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MIKLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD
700 710 720 730
>>CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 (724 aa)
initn: 2811 init1: 2811 opt: 4122 Z-score: 2655.4 bits: 502.2 E(32554): 1.4e-141
Smith-Waterman score: 4122; 85.8% identity (96.0% similar) in 732 aa overlap (123-854:1-724)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VTASLAFRQSQGAGQHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLM
::::.. :::::::::::::::::
CCDS49 MPEEVH-----HGEEEVETFAFQAEIAQLM
10 20
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLT
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:..::: :.::::
CCDS49 SLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLT
30 40 50 60 70 80
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 IVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTV
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS49 LVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVV
90 100 110 120 130 140
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 ITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKH
:::::::::::::::::::::::.: :::.::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS49 ITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKH
150 160 170 180 190 200
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 SQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKK
::::::::::..::::.::.:::::::.. :::.:.:..:.::.:::::::::...
CCDS49 SQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKG---EKEEEDKDDEEKPKIEDVGSDEEDDSG
210 220 230 240 250 260
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 DGDKKKKKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFS
::: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KDKKKKTKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFS
270 280 290 300 310 320
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 VEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVD
::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::::::::::::
CCDS49 VEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVD
330 340 350 360 370 380
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 SEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIH
:::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::: ::::.:::::
CCDS49 SEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIH
390 400 410 420 430 440
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 EDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVER
::: ::..:::::::.:: :::::.::..: .::::.:: :::::::.:.::::::::::
CCDS49 EDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVER
450 460 470 480 490 500
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 LRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFEN
.::.:.::.:: ::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::.::.:.::::
CCDS49 VRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFEN
510 520 530 540 550 560
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 LCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAA
:::.::.::.::::::..:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS49 LCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMA
570 580 590 600 610 620
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 KKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYR
:::::::::: :.::::::::::::::.:::::.::.:::::::::::::::::.:::::
CCDS49 KKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYR
630 640 650 660 670 680
820 830 840 850
pF1KB8 MIKLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD
:::::::::::. .:.. .::: .:.::::::.:.:::::::
CCDS49 MIKLGLGIDEDEVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD
690 700 710 720
>>CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12 (803 aa)
initn: 1759 init1: 448 opt: 1463 Z-score: 952.6 bits: 187.2 E(32554): 9.8e-47
Smith-Waterman score: 2148; 47.8% identity (74.2% similar) in 730 aa overlap (137-854:71-783)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 QHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIF
:. : ::::::. ..:.::::..:.:::::
CCDS90 GSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLI
:::::::.:::::::: :::: . :....:: ... .:. : ..:::.:::. .:.
CCDS90 LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELV
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 NNLGTIAKSGTKAFM----EALQAGADIS-MIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQ
.::::::::::. :. :: . : . : .:::::::::::.:::.:: : .:::.: :
CCDS90 KNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQ
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 YAWESSAGGSFTVRTDT-GEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPI
. :::... :.: .: :. .:::: . : :::. ..::: ::..:::.::::..::
CCDS90 HIWESDSN-EFSVIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPI
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 TLFVEKERDKEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKK
.. : :. .. ::.: .:::: ::.:. .:. :::::: : :
CCDS90 YVWSSKT---ETVEEPMEEEEAAKEEKE----ESDDEAAVEE----EEEEKKP----KTK
280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 KIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFR
:... : : .: :::: : .. ..:: ::::.... .: .: ::..::.. :.
CCDS90 KVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFK
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510
pF1KB8 ALLFVPRRAPFDLFENR--KKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPL
..:::: :: ::.. ::.. :::::::::: :. ....:.::::..:::::.::::
CCDS90 SILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPL
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 NISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNR
:.::: ::: :.::::::.::.: :... ..:.:: : :...:. :::::. :: .::
CCDS90 NVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNR
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 KKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGL
.:..:::. .: ...:: .: ::::.: .::...: .. .. .: ::::: :.:
CCDS90 TRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGY
510 520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 EVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMK
::::. ::.::::.: : ::.:: . .:.:::... :.:. :...: . .:: : . ::
CCDS90 EVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLNWMK
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 D-ILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMAAKK
: :. :.::.:::.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : . ::
CCDS90 DKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKK
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760 770 780 790 800 810
pF1KB8 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI
.:::: : .:. . .. . :..::.: ::...:.::: : ::. : : .....:: ::.
CCDS90 TFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERML
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820 830 840 850
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.:.:.:: : . .. : : . .. ::.:
CCDS90 RLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
750 760 770 780 790 800
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.::::.:.:.. ..: . : :..:.: : . :.:: :::::::. .:..::::::
CCDS61 ASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIA
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.::.:::..::: :. : .:::::::::::..::..: : .. . : : :...
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: : . .: . :::.:.::: : :. : :....: :.:.:...:.
CCDS61 GVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPL---------
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:..
CCDS61 --------------------------------------------------------YLNG
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...: . :: .: :. . .. :::. ... . . :..... :..:....::
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: ..:. .:. ... :: :.:.:. . ...:..: ::::::::::.:::.:::.::.:
CCDS61 P-SMFDVSRELGSSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQES
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... .: : .. ...: . .. : :.: ::.:... .. :: ... .. ...::
CCDS61 ALIRKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLL
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:: .:: :: ...::..: .::. . ..:::. . .. . .: . : ..:. ::..
CCDS61 RYESSALPSG-QLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFC
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.: .:: . .:.::. : :.:: . . . . .::: ... ::.: :.:
CCDS61 FEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETD-IVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKET--EELMA
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pF1KB8 IMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKH
:...: ..: .: :. :: : : ... .: ..... : : .. . .
CCDS61 WMRNVLGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMG---AARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPT
540 550 560 570 580
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::::: :..:. : : .. . .. :: .::.:....:. ..::.. ..:. ...
CCDS61 LEINPRHALIKKLNQLRASEPGLAQL--LVDQIYENAMIAAGL-VDDPRAMVGRLNELLV
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CCDS61 KALERH
650
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:::: .:.... ..::.::.:.::::::.::::.:.:.. ..: . : :..:
CCDS10 KHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEI
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CCDS10 HLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGSKAFLDALQNQAEASSKIIGQFGV
150 160 170 180 190 200
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CCDS10 GFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGSGVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDC
210 220 230 240 250 260
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CCDS10 KEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPL------------------------------------
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CCDS10 -----------------------------YLNGRRMNTLQAIWMMDPKDVREWQHEEFYR
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CCDS10 ATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAE
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CCDS10 KYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYESSALPSG-QLTSLSEYASRMRAGT
440 450 460 470 480 490
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CCDS10 VLEMG---AARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPRHALIKKLNQLRASEPGLAQL-
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CCDS10 -LVDQIYENAMIAAGL-VDDPRAMVGRLNELLVKALERH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]