Result of FASTA (omim) for
pF1KB8452
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8452, 357 aa
1>>>pF1KB8452 357 - 357 aa - 357 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0981+/-0.000656; mu= -12.3510+/- 0.038
mean_var=768.8241+/-178.155, 0's: 0 Z-trim(114.6): 639 B-trim: 279 in 1/55
Lambda= 0.046255
statistics sampled from 23867 (24551) to 23867 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 8.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001290181 (OMIM: 602399) mitogen-activated prot ( 357) 2369 174.1 4.1e-43
NP_002960 (OMIM: 602399) mitogen-activated protein ( 367) 1439 112.1 2e-24
XP_011529008 (OMIM: 602898) PREDICTED: mitogen-act ( 256) 955 79.6 8.8e-15
NP_001306 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 360) 958 80.0 9.1e-15
NP_002742 (OMIM: 602898) mitogen-activated protein ( 364) 955 79.8 1.1e-14
XP_006715061 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 283) 941 78.7 1.8e-14
NP_620581 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 360) 941 78.9 2e-14
XP_011512612 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 401) 941 78.9 2.1e-14
NP_002745 (OMIM: 602899) mitogen-activated protein ( 365) 931 78.2 3.2e-14
XP_016865789 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 328) 665 60.4 6.7e-09
NP_620582 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 297) 648 59.2 1.4e-08
XP_016865790 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 301) 648 59.2 1.4e-08
XP_016865788 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 328) 648 59.2 1.5e-08
XP_016865793 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 258) 598 55.7 1.3e-07
XP_016865792 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 270) 598 55.8 1.3e-07
XP_016865791 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 273) 598 55.8 1.3e-07
NP_620583 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 307) 598 55.9 1.4e-07
NP_620407 (OMIM: 176948) mitogen-activated protein ( 360) 593 55.6 2e-07
NP_002736 (OMIM: 176948) mitogen-activated protein ( 360) 593 55.6 2e-07
NP_002737 (OMIM: 601795) mitogen-activated protein ( 379) 590 55.5 2.3e-07
XP_016863930 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 360) 584 55.0 3e-07
XP_016863922 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 402) 584 55.1 3.1e-07
XP_016863911 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 440) 584 55.2 3.3e-07
NP_001035145 (OMIM: 601795) mitogen-activated prot ( 357) 558 53.3 9.8e-07
NP_620601 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 677) 547 53.0 2.3e-06
XP_011522259 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 677) 547 53.0 2.3e-06
NP_002740 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 816) 547 53.1 2.5e-06
NP_620602 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 816) 547 53.1 2.5e-06
NP_620603 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 816) 547 53.1 2.5e-06
XP_006721622 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 822) 547 53.1 2.5e-06
XP_006721621 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 822) 547 53.1 2.5e-06
XP_006721620 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 822) 547 53.1 2.5e-06
XP_016865981 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 632) 514 50.8 1e-05
NP_057597 (OMIM: 612325,612651) serine/threonine-p ( 632) 514 50.8 1e-05
XP_016865979 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 632) 514 50.8 1e-05
NP_055735 (OMIM: 612325,612651) serine/threonine-p ( 632) 514 50.8 1e-05
XP_016865978 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 632) 514 50.8 1e-05
XP_016865977 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 632) 514 50.8 1e-05
XP_016865980 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 632) 514 50.8 1e-05
XP_011512722 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 639) 514 50.8 1e-05
XP_011512723 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 639) 514 50.8 1e-05
XP_011512721 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 639) 514 50.8 1e-05
XP_016865974 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 639) 514 50.8 1e-05
XP_016865976 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 639) 514 50.8 1e-05
XP_016865975 (OMIM: 612325,612651) PREDICTED: seri ( 639) 514 50.8 1e-05
XP_016866355 (OMIM: 154235,614181) PREDICTED: seri ( 439) 490 48.9 2.5e-05
XP_011512924 (OMIM: 154235,614181) PREDICTED: seri ( 583) 490 49.1 2.9e-05
NP_001229314 (OMIM: 154235,614181) serine/threonin ( 583) 490 49.1 2.9e-05
NP_005897 (OMIM: 154235,614181) serine/threonine-p ( 623) 490 49.1 3e-05
XP_016866353 (OMIM: 154235,614181) PREDICTED: seri ( 623) 490 49.1 3e-05
>>NP_001290181 (OMIM: 602399) mitogen-activated protein (357 aa)
initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369 Z-score: 895.0 bits: 174.1 E(85289): 4.1e-43
Smith-Waterman score: 2369; 99.7% identity (99.7% similar) in 357 aa overlap (1-357:1-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
NP_001 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADSEMTGYVVTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADSEMTGYVVTRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 FESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
310 320 330 340 350
>>NP_002960 (OMIM: 602399) mitogen-activated protein kin (367 aa)
initn: 1433 init1: 1433 opt: 1439 Z-score: 559.5 bits: 112.1 E(85289): 2e-24
Smith-Waterman score: 2339; 97.0% identity (97.0% similar) in 367 aa overlap (1-357:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
NP_002 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLR----------DLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VSKETPL
:::::::
NP_002 VSKETPL
>>XP_011529008 (OMIM: 602898) PREDICTED: mitogen-activat (256 aa)
initn: 1056 init1: 955 opt: 955 Z-score: 386.4 bits: 79.6 E(85289): 8.8e-15
Smith-Waterman score: 1037; 60.5% identity (87.2% similar) in 243 aa overlap (112-344:1-243)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 RHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLMKHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL
::.::....: . :.....::::::.:.::
XP_011 MGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGL
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB8 ----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADSEMTGYVVTRWYRAPEVILNWM
:::::.:.::::::::.::::::::::: ::::::.::::::::..::::
XP_011 KYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMTGYVATRWYRAPEIMLNWM
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 RYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFVQRLQSDEAKNY
.:.::::::::::::::.. ::.:: :::..::::.::.:.::: : . ...:..:..:
XP_011 HYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTY
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 MKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEP
...:: . .::..::. .:.:::..:: .:::::..:::.:.::::: :: . :: ::::
XP_011 IQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEP
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350
pF1KB8 QVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
... ::.: . .:::.:::..::.::::::::
XP_011 EAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
220 230 240 250
>>NP_001306 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein kin (360 aa)
initn: 1531 init1: 958 opt: 958 Z-score: 386.1 bits: 80.0 E(85289): 9.1e-15
Smith-Waterman score: 1514; 62.2% identity (85.9% similar) in 347 aa overlap (8-344:5-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
: :::::..:: ::: :..:.::::::::.::.: : .:: .::.::: :
NP_001 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..: : ::: .::.::....
NP_001 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: .:: .:..:::.::.:.:: :::::.:::::::::::::::::::..:.
NP_001 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.::..::..::.
NP_001 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
.:::::: ...:. : ::.::...: .. : .::... .:.::::.:::::::::...:.
NP_001 LTGTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
::..:::: :: . :: .::: .. ::.::.. : .:::: .:: ::.:: ::
NP_001 TAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VSKETPL
NP_001 MES
360
>>NP_002742 (OMIM: 602898) mitogen-activated protein kin (364 aa)
initn: 1503 init1: 955 opt: 955 Z-score: 385.0 bits: 79.8 E(85289): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 1498; 61.3% identity (85.3% similar) in 354 aa overlap (1-344:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
::.: :.::::::..::.::: . :.::::::::.:::: :.: :::.::: :
NP_002 MSGP---RAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::: . :.:.:::::::::..::::::::::::: ...:: . ::: .::.::....
NP_002 PFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: . :.....::::::.:.:: :::::.:.::::::::.:::::::::::
NP_002 KCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::.. ::.:: :::..::::.::.
NP_002 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIME
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
:.::: : . ...:..:..:...:: . .::..::. .:.:::..:: .:::::..:::
NP_002 VVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
.:.::::: :: . :: ::::... ::.: . .:::.:::..::.::::::::
NP_002 SAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPP
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VSKETPL
NP_002 GSLEIEQ
360
>>XP_006715061 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-activat (283 aa)
initn: 1178 init1: 941 opt: 941 Z-score: 380.9 bits: 78.7 E(85289): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 1167; 60.2% identity (86.5% similar) in 274 aa overlap (81-344:1-274)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 AKVAIKKLYRPFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMP
:.::::::::::::: ..:..: : :::
XP_006 MKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTH
10 20 30
120 130 140 150 160
pF1KB8 FMGTDLGKLMKHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKIL
.::.::....: .:: .:..:::.::.:.:: :::::.:::::::::::::
XP_006 LMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKIL
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 DFGLARQADSEMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSD
::::::..:.::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.:
XP_006 DFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTD
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 HLDQLKEIMKVTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEK
:.:::: :....::: ::......:. :.::...: .. : .::... .:.::::.::::
XP_006 HIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEK
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 MLVLDAEQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLS
:::::...:.::..:::: :: . :: .::: .. ::.::.. : .:::: .:: ::.:
XP_006 MLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVIS
220 230 240 250 260 270
350
pF1KB8 FKPPRQLGARVSKETPL
: ::
XP_006 FVPPPLDQEEMES
280
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10 20 30 40 50 60
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: :::::..:: ::: :..:.::::::::.::.: : .:: .::.::: :
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10 20 30 40 50
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:::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..: : ::: .::.::....
NP_620 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
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pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: .:: .:..:::.::.:.:: :::::.:::::::::::::::::::..:.
NP_620 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
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pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.::.:::: :..
NP_620 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILR
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pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
..::: ::......:. :.::...: .. : .::... .:.::::.:::::::::...:.
NP_620 LVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
::..:::: :: . :: .::: .. ::.::.. : .:::: .:: ::.:: ::
NP_620 TAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VSKETPL
NP_620 MES
360
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Smith-Waterman score: 1338; 59.5% identity (83.8% similar) in 328 aa overlap (35-344:65-392)
10 20 30 40 50
pF1KB8 PPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCS--------AVDGRTGAKVAIK
.: ..::: : : .:: .::.:
XP_011 SGRNFPRGRALLPLRALPVLHLQHPSPCTHAGMRSTVCSTQVRCESAAFDTKTGLRVAVK
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60 70 80 90 100 110
pF1KB8 KLYRPFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDL
:: ::::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..: : ::: .::.::
XP_011 KLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADL
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pF1KB8 GKLMKHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLAR
....: .:: .:..:::.::.:.:: :::::.:::::::::::::::::::
XP_011 NNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAR
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 QADSEMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLK
..:.::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.::.::::
XP_011 HTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLK
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230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EIMKVTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDA
:....::: ::......:. :.::...: .. : .::... .:.::::.:::::::::.
XP_011 LILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDS
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 EQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQ
..:.::..:::: :: . :: .::: .. ::.::.. : .:::: .:: ::.:: ::
XP_011 DKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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350
pF1KB8 LGARVSKETPL
XP_011 DQEEMES
400
>>NP_002745 (OMIM: 602899) mitogen-activated protein kin (365 aa)
initn: 1511 init1: 840 opt: 931 Z-score: 376.3 bits: 78.2 E(85289): 3.2e-14
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10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
..:::.:.:.:::::. .: . :::::::.::::.: :.: ::::::: :
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pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::::.::::::::: :::::.::::::::::::: .: .:.::::::::: ::: :.:
NP_002 PFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIM
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pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: ..:..::.::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::.
NP_002 GME-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADA
120 130 140 150 160 170
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pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::.::::::::.:.:::: .:.:
NP_002 EMTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILK
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pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
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NP_002 VTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRL
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQK-YDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGA
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NP_002 TAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDS
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350
pF1KB8 RVSKETPL
NP_002 RRRSGMKL
360
>>XP_016865789 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-activat (328 aa)
initn: 1238 init1: 665 opt: 665 Z-score: 280.8 bits: 60.4 E(85289): 6.7e-09
Smith-Waterman score: 1221; 63.0% identity (86.6% similar) in 276 aa overlap (8-273:5-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
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XP_016 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSR
10 20 30 40 50
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pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..: : ::: .::.::....
XP_016 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
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pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
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XP_016 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
120 130 140 150 160 170
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pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
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XP_016 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMR
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
.:::::: ...:. : ::.::...: .. : .::... .:.::
XP_016 LTGTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLGSQSVAQPGELFYLLSC
240 250 260 270 280 290
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300 310 320
357 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sat Nov 5 21:46:17 2016 done: Sat Nov 5 21:46:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]