Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8452
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8452, 357 aa
1>>>pF1KB8452 357 - 357 aa - 357 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4709+/-0.00125; mu= -0.2022+/- 0.071
mean_var=368.6993+/-88.487, 0's: 0 Z-trim(107.4): 337 B-trim: 135 in 1/52
Lambda= 0.066794
statistics sampled from 9161 (9525) to 9161 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS77688.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 357) 2369 243.1 2.8e-64
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 1439 153.5 2.7e-37
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 958 107.1 2.4e-23
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 955 106.8 2.9e-23
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 941 105.5 7.4e-23
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 931 104.5 1.5e-22
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 598 72.3 6.1e-13
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 593 71.9 9.3e-13
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 590 71.7 1.2e-12
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 558 68.6 9.6e-12
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 547 67.9 2.9e-11
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 547 68.0 3.2e-11
>>CCDS77688.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 (357 aa)
initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369 Z-score: 1267.5 bits: 243.1 E(32554): 2.8e-64
Smith-Waterman score: 2369; 99.7% identity (99.7% similar) in 357 aa overlap (1-357:1-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
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CCDS77 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
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CCDS77 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADSEMTGYVVTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADSEMTGYVVTRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 FESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
310 320 330 340 350
>>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 (367 aa)
initn: 1433 init1: 1433 opt: 1439 Z-score: 783.1 bits: 153.5 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 2339; 97.0% identity (97.0% similar) in 367 aa overlap (1-357:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS14 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLR----------DLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
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CCDS14 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VSKETPL
:::::::
CCDS14 VSKETPL
>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 1531 init1: 958 opt: 958 Z-score: 532.6 bits: 107.1 E(32554): 2.4e-23
Smith-Waterman score: 1514; 62.2% identity (85.9% similar) in 347 aa overlap (8-344:5-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
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CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
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CCDS48 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
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CCDS48 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
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CCDS48 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
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CCDS48 LTGTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
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CCDS48 TAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VSKETPL
CCDS48 MES
360
>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa)
initn: 1503 init1: 955 opt: 955 Z-score: 531.0 bits: 106.8 E(32554): 2.9e-23
Smith-Waterman score: 1498; 61.3% identity (85.3% similar) in 354 aa overlap (1-344:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
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CCDS14 MSGP---RAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::: . :.:.:::::::::..::::::::::::: ...:: . ::: .::.::....
CCDS14 PFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: . :.....::::::.:.:: :::::.:.::::::::.:::::::::::
CCDS14 KCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::.. ::.:: :::..::::.::.
CCDS14 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIME
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
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CCDS14 VVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
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CCDS14 SAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPP
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VSKETPL
CCDS14 GSLEIEQ
360
>>CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 1514 init1: 941 opt: 941 Z-score: 523.8 bits: 105.5 E(32554): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 1497; 61.7% identity (85.9% similar) in 347 aa overlap (8-344:5-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
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CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..: : ::: .::.::....
CCDS48 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: .:: .:..:::.::.:.:: :::::.:::::::::::::::::::..:.
CCDS48 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.::.:::: :..
CCDS48 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
..::: ::......:. :.::...: .. : .::... .:.::::.:::::::::...:.
CCDS48 LVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
::..:::: :: . :: .::: .. ::.::.. : .:::: .:: ::.:: ::
CCDS48 TAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VSKETPL
CCDS48 MES
360
>>CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1511 init1: 840 opt: 931 Z-score: 518.5 bits: 104.5 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 1515; 65.4% identity (86.2% similar) in 347 aa overlap (8-343:6-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
..:::.:.:.:::::. .: . :::::::.::::.: :.: ::::::: :
CCDS48 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::::.::::::::: :::::.::::::::::::: .: .:.::::::::: ::: :.:
CCDS48 PFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: ..:..::.::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::.
CCDS48 GME-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::.::::::::.:.:::: .:.:
CCDS48 EMTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
:::.: .::::.:.. ::.:...::. .:::.... ::: :..:::::: ::...:.
CCDS48 VTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB8 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQK-YDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGA
::..::.::.:: ..: :.: ..:. .:::.. :.::::. :::...:.:
CCDS48 TAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDS
300 310 320 330 340 350
350
pF1KB8 RVSKETPL
CCDS48 RRRSGMKL
360
>>CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (307 aa)
initn: 1142 init1: 587 opt: 598 Z-score: 345.9 bits: 72.3 E(32554): 6.1e-13
Smith-Waterman score: 1125; 65.1% identity (87.1% similar) in 249 aa overlap (8-246:5-253)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
: :::::..:: ::: :..:.::::::::.::.: : .:: .::.::: :
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFMDFYLVMPFMGTDLGKLM
:::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..: : ::: .::.::....
CCDS48 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGL----------RDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
: .:: .:..:::.::.:.:: :::::.:::::::::::::::::::..:.
CCDS48 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.::.:::: :..
CCDS48 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
..::: ::......:.
CCDS48 LVGTPGAELLKKISSESLSTCWRRCLYWTQIRELQRPKPLHMPTLLSTTILMMNQWPILM
240 250 260 270 280 290
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 847 init1: 445 opt: 593 Z-score: 342.5 bits: 71.9 E(32554): 9.3e-13
Smith-Waterman score: 889; 40.2% identity (71.3% similar) in 356 aa overlap (7-343:5-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
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: ..:..:.: ...::.:.:: :::::.:: .: :.::: :::::: ::
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350
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CCDS10 ELIFQETARFQPGVLEAP
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CCDS42 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]