Result of FASTA (omim) for
pF1KB8450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8450, 638 aa
1>>>pF1KB8450 638 - 638 aa - 638 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5707+/-0.000714; mu= -7.1069+/- 0.044
mean_var=928.4950+/-209.198, 0's: 0 Z-trim(117.1): 502 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.042091
statistics sampled from 28206 (28729) to 28206 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 8.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005560 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofo ( 638) 4372 282.4 3.3e-75
NP_057952 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofo ( 617) 4080 264.7 7.2e-70
NP_001026971 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 is ( 686) 3772 246.0 3.2e-64
NP_001191355 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 is ( 613) 1503 108.2 9.1e-23
NP_002305 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isofo ( 647) 1503 108.2 9.4e-23
NP_001305159 (OMIM: 601782) dual specificity testi ( 466) 413 41.8 0.0067
NP_006276 (OMIM: 601782) dual specificity testis-s ( 626) 413 42.0 0.0078
XP_011538802 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 301) 401 40.7 0.009
>>NP_005560 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isoform 2 (638 aa)
initn: 4372 init1: 4372 opt: 4372 Z-score: 1471.1 bits: 282.4 E(85289): 3.3e-75
Smith-Waterman score: 4372; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 CGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB8 FEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
610 620 630
>>NP_057952 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isoform 2 (617 aa)
initn: 4080 init1: 4080 opt: 4080 Z-score: 1375.4 bits: 264.7 E(85289): 7.2e-70
Smith-Waterman score: 4080; 100.0% identity (100.0% similar) in 601 aa overlap (38-638:17-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 DVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
530 540 550 560 570 580
610 620 630
pF1KB8 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
590 600 610
>>NP_001026971 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofor (686 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 1273.9 bits: 246.0 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 3772; 100.0% identity (100.0% similar) in 554 aa overlap (38-591:17-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 DVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRAPPGAAGEGPGCADDE
530 540 550 560 570 580
610 620 630
pF1KB8 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
NP_001 GPVRRQGKVTIKYDPKELRKHLNLEEWILEQLTRLYDCQEEEISELEIDVDELLDMESDD
590 600 610 620 630 640
>>NP_001191355 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isofor (613 aa)
initn: 2128 init1: 578 opt: 1503 Z-score: 529.7 bits: 108.2 E(85289): 9.1e-23
Smith-Waterman score: 2217; 56.2% identity (79.0% similar) in 594 aa overlap (39-623:17-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 VWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGKF
.: .:. ::.. ::::::.:.: ::::...
NP_001 MLLASAPRRRRFLQRAKCCDCSASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
:: ::::: .: : :::::.::::::: :..: ..: :::.:.::.:. ::::.:. .
NP_001 GESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVES-----AC-SNYATTVQ
.:..:..:.. .: .::..:::.:.::...:.::.:::.. .: .... ::.
NP_001 TVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVS
:. :. .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.. :..::. ::: .::::
NP_001 VQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLLQLTLEHDP--
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKE
. : :.:. . . : . .. .. :.. . :: ::..::: .:
NP_001 ----HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGS
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKE
: .:..:::::: ..:::: ::::::::::: :::::::::. ::.::::::
NP_001 PASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMD
::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.::..::::.::::. ...:::
NP_001 LIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMD
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 P-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
.::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.. .:.::::::::.::.:.:
NP_001 SQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMVDE-
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
: : :.:.: :::::::::::::::::::.::.:::: ::.:::::::::::
NP_001 KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEII
460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
:.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::... :: :.::.::.: :::
NP_001 GRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHW
510 520 530 540 550 560
610 620 630
pF1KB8 FEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
.:.: ..: :.: :: .::.::
NP_001 LETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
570 580 590 600 610
>>NP_002305 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isoform 1 (647 aa)
initn: 2186 init1: 578 opt: 1503 Z-score: 529.5 bits: 108.2 E(85289): 9.4e-23
Smith-Waterman score: 2308; 55.2% identity (78.5% similar) in 627 aa overlap (6-623:19-625)
10 20 30 40
pF1KB8 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSL
: .. : .::..: .: . ...: ::..:::: .:. ::
NP_002 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQ-YLQALNADWHADCFRCCDCSASL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 TNWYYEKDGKLYCPKDYWGKFGEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIE
.. ::::::.:.: ::::...:: ::::: .: : :::::.::::::: :..: ..:
NP_002 SHQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 DGDAYALVQHATLYCGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFS
:::.:.::.:. ::::.:. ..:..:..:.. .: .::..:::.:.::...:.::.:
NP_002 DGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VSVES-----AC-SNYATTVQVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEV
::.. .: .... ::.:. :. .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.
NP_002 VSIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLR
. :..::. ::: .:::: . : :.:. . . : . .. .. :
NP_002 DLLIQETSRLLQLTLEHDP------HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSAR
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 RRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKG
.. . :: ::..::: .: : .:..:::::: ..:::: :::::::::::
NP_002 QKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 FFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKK
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NP_002 CFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKR
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB8 LNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDP-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLI
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NP_002 LNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLV
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLN
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NP_002 RENKNVVVADFGLARLMVDE-KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMIN
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 GKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPL
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NP_002 GRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPI
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 AAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
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NP_002 TVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLP
590 600 610 620 630 640
NP_002 AHPEVPD
>>NP_001305159 (OMIM: 601782) dual specificity testis-sp (466 aa)
initn: 414 init1: 296 opt: 413 Z-score: 173.0 bits: 41.8 E(85289): 0.0067
Smith-Waterman score: 413; 47.2% identity (68.3% similar) in 142 aa overlap (496-637:47-181)
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDE
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NP_001 GRSGSTWPWTLPEACGTCTPKVYFTATSHPREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDE
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530 540 550 560 570 580
pF1KB8 TVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCR
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NP_001 KADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-RTLVGDDCPLPFLLLAIHCCN
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pF1KB8 LEPESRPAFSKLEDSFEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
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NP_001 LEPSTRAPFTEITQHLEWI---LEQLPEPAPLTRTALTHN---QGSVARGGPSATLPRPD
140 150 160 170 180
NP_001 PRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPS
190 200 210 220 230 240
>>NP_006276 (OMIM: 601782) dual specificity testis-speci (626 aa)
initn: 789 init1: 296 opt: 413 Z-score: 171.9 bits: 42.0 E(85289): 0.0078
Smith-Waterman score: 778; 41.2% identity (65.8% similar) in 330 aa overlap (311-637:37-341)
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 RRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKG
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NP_006 PLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGRPSSYRALRSAVSSLARVDDFHCAEKIGAG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 FFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKK
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NP_006 FFSEVYKVRHRQSGQVMVLK-MNKLPSNRGNT-LREVQLMNRLRHPNILRFMGVCVHQGQ
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pF1KB8 LNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIK
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NP_006 LHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTSKNCLVR
130 140 150 160 170 180
470 480 490 500 510
pF1KB8 LDK---TVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEM
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NP_006 REDRGFTAVVGDFGLA-------EKIPV---------YREGARKEPLAVVGSPYWMAPEV
190 200 210 220
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pF1KB8 LNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFF
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NP_006 LRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-RTLVGDDCPLPFL
230 240 250 260 270 280
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 PLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSP
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NP_006 LLAIHCCNLEPSTRAPFTEITQHLEWI---LEQLPEPAPLTRTALTHN---QGSVARGGP
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 P
NP_006 SATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKP
350 360 370 380 390 400
>>XP_011538802 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specificit (301 aa)
initn: 698 init1: 288 opt: 401 Z-score: 170.7 bits: 40.7 E(85289): 0.009
Smith-Waterman score: 669; 42.7% identity (70.0% similar) in 253 aa overlap (335-584:62-292)
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIR
: .:.:::....:: :.:.:.::..: .
XP_011 VSQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFTCEKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALK--MN
40 50 60 70 80
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pF1KB8 CDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFP
.. ..: ::..: :.:::.:.:.:: .. .:. :::::..:.:...: : .:
XP_011 TLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLP
90 100 110 120 130 140
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: .:..: :: :..::: :.::::.:.::::: :. ..:::::::. .
XP_011 WTVRVKLAYDIAVGLSYLHFKGIFHRDLTSKNCLIKRDENGYSAVVADFGLA-------E
150 160 170 180 190 200
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIG
. : . ..: .:::.:.:::::.: . :.: .:.::.::.:::::.
XP_011 KIPDVSMGSEK-----------LAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKADVFSYGIILCEIIA
210 220 230 240 250
550 560 570 580 590 600
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XP_011 RIQADPDYLPRTENFGLDYDAF--QHMVGDCPPDFLQLTFNCCNDSWRKHLG
260 270 280 290 300
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638 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]