FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8419, 529 aa
1>>>pF1KB8419 529 - 529 aa - 529 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7948+/-0.00151; mu= 12.9506+/- 0.089
mean_var=226.4865+/-45.015, 0's: 0 Z-trim(106.2): 956 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.085222
statistics sampled from 7850 (8872) to 7850 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 3833 485.2 7.7e-137
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1676 220.1 5.8e-57
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1676 220.2 6e-57
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1676 220.2 6.1e-57
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1676 220.2 6.1e-57
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1662 218.6 2.3e-56
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1633 214.9 2.4e-55
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1633 215.0 2.5e-55
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1629 214.3 3.2e-55
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1621 213.3 5.8e-55
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CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1616 212.8 1e-54
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1616 212.8 1e-54
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1614 212.7 1.4e-54
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1609 212.2 2.4e-54
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1609 212.2 2.4e-54
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1604 211.2 2.6e-54
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1604 211.3 2.7e-54
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1604 211.3 2.7e-54
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1602 211.1 3.5e-54
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1595 210.1 5.6e-54
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1596 210.4 5.6e-54
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1595 210.2 5.9e-54
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1583 208.5 1.3e-53
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 1585 208.9 1.4e-53
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1585 209.1 1.5e-53
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CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1581 208.5 2e-53
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1581 208.5 2.1e-53
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1577 207.8 2.4e-53
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1577 208.0 2.8e-53
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1573 207.3 3.2e-53
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1575 207.7 3.2e-53
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1575 207.8 3.3e-53
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1574 207.6 3.6e-53
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1572 207.5 4.6e-53
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1568 206.9 6.1e-53
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1568 206.9 6.2e-53
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1567 206.7 6.3e-53
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1567 206.7 6.4e-53
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1567 206.8 6.9e-53
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1565 206.6 8.6e-53
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1559 205.6 1.1e-52
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1559 205.6 1.1e-52
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1558 205.5 1.2e-52
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1559 205.7 1.2e-52
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1559 205.8 1.3e-52
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1554 205.3 2.2e-52
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1550 204.6 2.5e-52
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1550 204.6 2.5e-52
>>CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 (529 aa)
initn: 3833 init1: 3833 opt: 3833 Z-score: 2570.2 bits: 485.2 E(32554): 7.7e-137
Smith-Waterman score: 3833; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEQEKKLLVSDSNSFMERESLKSPFTGDTSMNNLETVHHNNSKADKLKEKPSEWSKRHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MEQEKKLLVSDSNSFMERESLKSPFTGDTSMNNLETVHHNNSKADKLKEKPSEWSKRHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 QHYKHEDAKEMPLTWVQDEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QHYKHEDAKEMPLTWVQDEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VQQNSSFVDRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VQQNSSFVDRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 MHTGEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MHTGEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EKPYECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EKPYECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KCLECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KCLECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YEESLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YEESLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 FSQSSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 FSQSSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRS
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490 500 510 520
pF1KB8 AYLSQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AYLSQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS
490 500 510 520
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
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Smith-Waterman score: 1684; 57.7% identity (78.1% similar) in 397 aa overlap (108-490:218-614)
80 90 100 110 120
pF1KB8 DEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNACVQQNSSFV---------
::. .::. :.: . .:
CCDS74 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 -----DRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHT
..::.:::: :::: : . :.:::.:::::.::::.: : .: :: ::::.::
CCDS74 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKP
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CCDS74 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
310 320 330 340 350 360
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCL
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CCDS74 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
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310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSEYEE
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CCDS74 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
430 440 450 460 470 480
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKTFSQ
...: .:.. ::. :::::.: .::..:. :: ::.::: :: :::: :.:: :.::.
CCDS74 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRSAYL
::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. :
CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
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490 500 510 520
pF1KB8 SQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS
..:.. :
CCDS74 TKHQRTHTG
610
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 3281 init1: 1669 opt: 1676 Z-score: 1135.9 bits: 220.2 E(32554): 6e-57
Smith-Waterman score: 1684; 57.7% identity (78.1% similar) in 397 aa overlap (108-490:260-656)
80 90 100 110 120
pF1KB8 DEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNACVQQNSSFV---------
::. .::. :.: . .:
CCDS74 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 -----DRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHT
..::.:::: :::: : . :.:::.:::::.::::.: : .: :: ::::.::
CCDS74 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKP
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CCDS74 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
350 360 370 380 390 400
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCL
:::. :::.::.: .: ::.: ::::::: : .:::.::.:::: .:.:::::::::.:
CCDS74 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
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310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSEYEE
.: :.: .. : .:::::::::::.: .::: ::.::.: ::..::::: :: .. .
CCDS74 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
470 480 490 500 510 520
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKTFSQ
...: .:.. ::. :::::.: .::..:. :: ::.::: :: :::: :.:: :.::.
CCDS74 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRSAYL
::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. :
CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
590 600 610 620 630 640
490 500 510 520
pF1KB8 SQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS
..:.. :
CCDS74 TKHQRTHTG
650
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 3281 init1: 1669 opt: 1676 Z-score: 1135.8 bits: 220.2 E(32554): 6.1e-57
Smith-Waterman score: 1684; 57.7% identity (78.1% similar) in 397 aa overlap (108-490:272-668)
80 90 100 110 120
pF1KB8 DEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNACVQQNSSFV---------
::. .::. :.: . .:
CCDS12 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
250 260 270 280 290 300
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 -----DRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHT
..::.:::: :::: : . :.:::.:::::.::::.: : .: :: ::::.::
CCDS12 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
310 320 330 340 350 360
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKP
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CCDS12 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
370 380 390 400 410 420
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCL
:::. :::.::.: .: ::.: ::::::: : .:::.::.:::: .:.:::::::::.:
CCDS12 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
430 440 450 460 470 480
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSEYEE
.: :.: .. : .:::::::::::.: .::: ::.::.: ::..::::: :: .. .
CCDS12 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
490 500 510 520 530 540
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKTFSQ
...: .:.. ::. :::::.: .::..:. :: ::.::: :: :::: :.:: :.::.
CCDS12 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
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::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. :
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..:.. :
CCDS12 TKHQRTHTG
670
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...: .:.. ::. :::::.: .::..:. :: ::.::: :: :::: :.:: :.::.
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::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. :
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..:.. :
CCDS54 TKHQRTHTG
680
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130 140 150 160 170 180
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430 440 450 460 470 480
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::
CCDS45 VIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQHQRIHIG
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CCDS64 GKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAF
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CCDS64 SQRSKLIKHQLIHTRE
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CCDS27 QLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
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CCDS10 -EGESAQHSDGESDFERDAGIQRLQGHSPGEDHGEVVSQDREVGQLIGLQGTYLGEKPYE
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CCDS10 GNRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSYNSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSS
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CCDS10 ALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIA
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CCDS10 HQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSECGKCFSQRSQLVVHQRT
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CCDS10 HTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKGFSWNSVLIIHQRIHTGE
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CCDS10 KPYKCPECGKGFSNSSNFITHQRTHMKEKLY
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CCDS27 TSSLVTRLRVSTEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKS------WKCNECGKTF
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pF1KB8 SNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHTGEKPYQCGECGKSFSNTS
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CCDS27 TQSSSLTQHQRTHTGERPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRS
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pF1KB8 HLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKPYECSVCGKGFSHSYVLIE
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CCDS27 FLTQHQRIHTGEKPYKCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIH
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