Result of FASTA (omim) for
pF1KB8341
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8341, 609 aa
1>>>pF1KB8341 609 - 609 aa - 609 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9653+/-0.00131; mu= 8.2782+/- 0.080
mean_var=419.1955+/-82.399, 0's: 0 Z-trim(107.9): 2095 B-trim: 93 in 1/48
Lambda= 0.062642
statistics sampled from 13632 (15934) to 13632 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.473), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 6.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 2123 208.2 6.3e-53
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 2123 208.2 6.3e-53
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 2123 208.3 6.6e-53
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 2123 208.3 6.6e-53
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 2108 207.0 1.7e-52
NP_003443 (OMIM: 603132) zinc finger protein 189 i ( 626) 2067 203.2 2.2e-51
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 2032 200.0 1.9e-50
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 2032 200.0 1.9e-50
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 2032 200.1 2e-50
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 2032 200.1 2e-50
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 2032 200.1 2e-50
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 2032 200.1 2e-50
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 2032 200.1 2e-50
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 2032 200.1 2e-50
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 2032 200.1 2e-50
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 2032 200.1 2e-50
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2031 200.0 2.2e-50
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2031 200.0 2.2e-50
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2031 200.0 2.2e-50
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2031 200.0 2.2e-50
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2031 200.0 2.2e-50
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2031 200.0 2.2e-50
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311076 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311077 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311071 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311082 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 2031 200.1 2.3e-50
XP_016885305 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 2031 200.1 2.3e-50
XP_006724618 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311080 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 2031 200.1 2.3e-50
NP_001311083 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_016885302 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_016885303 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_006724613 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_016885299 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_016885301 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_016885300 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
XP_016885304 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2031 200.1 2.4e-50
NP_001311084 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 821) 2031 200.2 2.4e-50
NP_001265160 (OMIM: 603132) zinc finger protein 18 ( 612) 2021 199.0 3.9e-50
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2020 199.1 4.6e-50
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2020 199.1 4.6e-50
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2020 199.1 4.6e-50
>>NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (585 aa)
initn: 2891 init1: 1499 opt: 2123 Z-score: 1071.2 bits: 208.2 E(85289): 6.3e-53
Smith-Waterman score: 2123; 56.8% identity (77.2% similar) in 514 aa overlap (107-609:71-581)
80 90 100 110 120
pF1KB8 INHHLQYNGLGDNMECKGNLEGQEASQEGLYMCVKITCEEKA-------TESHSTSSTFH
:.: :: :. . . : .:. . :
NP_001 KKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKH
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RIIPTKEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEK---CSEVKKHRNTFSKKPSYIQHQ
.:: ..:. .::.: . : : ::::.::.. :: ::: : .:: . . : ::
NP_001 EIINSEERPFKCEELVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGK---AFSINEKLIWHQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKPYQCNACGKAFIRGSQLTEHQRVHT
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NP_001 RLHSGEKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHT
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pF1KB8 YECKECGKAFILGSHLTYHQRVHTGEKPYICKECGKAFLCASQLNEHQRIHTGEKPYECK
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NP_001 YECNECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECT
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pF1KB8 ECGKTFFRGSQLTYHLRVHSGERPYKCKECGKAFISNSNLIQHQRIHTGEKPYKCKECGK
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NP_001 ECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGK
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pF1KB8 AFICGKQLSEHQRIHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQHEKIH-GEKHYECKECGKTFVR
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NP_001 AFSVNGKLMRHQRIHTGEKPFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSI
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pF1KB8 ATQLTYHQRIHTGEKPYKCKECDKAFIYGSQLSEHQRIHRGEKPYECKQCGKAFIRGSHL
..:: ::::::::::.:: ::.::: .:. ::::: ::::..::.::::: ..::
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pF1KB8 TEHLRTHTGEKPYECKECGRAFSRGSELTLHQRIHTGEKPYTCVQCGKDFRCPSQLTQHT
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NP_001 IRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRFSFQLSQHQ
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pF1KB8 RLHN
.:.
NP_001 SVHSEGKS
580
>>NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (585 aa)
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Smith-Waterman score: 2123; 56.8% identity (77.2% similar) in 514 aa overlap (107-609:71-581)
80 90 100 110 120
pF1KB8 INHHLQYNGLGDNMECKGNLEGQEASQEGLYMCVKITCEEKA-------TESHSTSSTFH
:.: :: :. . . : .:. . :
NP_001 KKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKH
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pF1KB8 RIIPTKEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEK---CSEVKKHRNTFSKKPSYIQHQ
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NP_001 EIINSEERPFKCEELVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGK---AFSINEKLIWHQ
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pF1KB8 RIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKPYQCNACGKAFIRGSQLTEHQRVHT
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NP_001 RLHSGEKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHT
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pF1KB8 YECKECGKAFILGSHLTYHQRVHTGEKPYICKECGKAFLCASQLNEHQRIHTGEKPYECK
:::.::::.: .:.: :: .::::::: ::::::.: ..: .:::::::::::::
NP_001 YECNECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECT
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pF1KB8 ECGKTFFRGSQLTYHLRVHSGERPYKCKECGKAFISNSNLIQHQRIHTGEKPYKCKECGK
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NP_001 ECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGK
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pF1KB8 AFICGKQLSEHQRIHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQHEKIH-GEKHYECKECGKTFVR
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NP_001 AFSVNGKLMRHQRIHTGEKPFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSI
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pF1KB8 ATQLTYHQRIHTGEKPYKCKECDKAFIYGSQLSEHQRIHRGEKPYECKQCGKAFIRGSHL
..:: ::::::::::.:: ::.::: .:. ::::: ::::..::.::::: ..::
NP_001 NAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHL
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pF1KB8 TEHLRTHTGEKPYECKECGRAFSRGSELTLHQRIHTGEKPYTCVQCGKDFRCPSQLTQHT
.: :.::::::..: :::..:: .:. .:: .:: .::: : ::: :: ::.::
NP_001 IRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRFSFQLSQHQ
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 RLHN
.:.
NP_001 SVHSEGKS
580
>>NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 isofor (643 aa)
initn: 2891 init1: 1499 opt: 2123 Z-score: 1070.8 bits: 208.3 E(85289): 6.6e-53
Smith-Waterman score: 2123; 56.8% identity (77.2% similar) in 514 aa overlap (107-609:129-639)
80 90 100 110 120
pF1KB8 INHHLQYNGLGDNMECKGNLEGQEASQEGLYMCVKITCEEKA-------TESHSTSSTFH
:.: :: :. . . : .:. . :
NP_666 KKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKH
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RIIPTKEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEK---CSEVKKHRNTFSKKPSYIQHQ
.:: ..:. .::.: . : : ::::.::.. :: ::: : .:: . . : ::
NP_666 EIINSEERPFKCEELVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGK---AFSINEKLIWHQ
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKPYQCNACGKAFIRGSQLTEHQRVHT
:.:.::::..:.::::.:. .: : :: ::..::::::. ::::: ...:..:::.::
NP_666 RLHSGEKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHT
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GEKPYECKKCGKAFSYCSQYTLHQRIHSGEKPYECKDCGKAFILGSQLTYHQRIHSGEKP
:::::.::.::..:: : : :::.:.:::::::.:::::: ....: :::::.::::
NP_666 GEKPYQCKECGNGFSCSSAYITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKP
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 YECKECGKAFILGSHLTYHQRVHTGEKPYICKECGKAFLCASQLNEHQRIHTGEKPYECK
:::.::::.: .:.: :: .::::::: ::::::.: ..: .:::::::::::::
NP_666 YECNECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECT
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ECGKTFFRGSQLTYHLRVHSGERPYKCKECGKAFISNSNLIQHQRIHTGEKPYKCKECGK
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NP_666 ECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGK
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AFICGKQLSEHQRIHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQHEKIH-GEKHYECKECGKTFVR
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NP_666 AFSVNGKLMRHQRIHTGEKPFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSI
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490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ATQLTYHQRIHTGEKPYKCKECDKAFIYGSQLSEHQRIHRGEKPYECKQCGKAFIRGSHL
..:: ::::::::::.:: ::.::: .:. ::::: ::::..::.::::: ..::
NP_666 NAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHL
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550 560 570 580 590 600
pF1KB8 TEHLRTHTGEKPYECKECGRAFSRGSELTLHQRIHTGEKPYTCVQCGKDFRCPSQLTQHT
.: :.::::::..: :::..:: .:. .:: .:: .::: : ::: :: ::.::
NP_666 IRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRFSFQLSQHQ
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pF1KB8 RLHN
.:.
NP_666 SVHSEGKS
640
>>NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (643 aa)
initn: 2891 init1: 1499 opt: 2123 Z-score: 1070.8 bits: 208.3 E(85289): 6.6e-53
Smith-Waterman score: 2123; 56.8% identity (77.2% similar) in 514 aa overlap (107-609:129-639)
80 90 100 110 120
pF1KB8 INHHLQYNGLGDNMECKGNLEGQEASQEGLYMCVKITCEEKA-------TESHSTSSTFH
:.: :: :. . . : .:. . :
NP_001 KKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKH
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RIIPTKEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEK---CSEVKKHRNTFSKKPSYIQHQ
.:: ..:. .::.: . : : ::::.::.. :: ::: : .:: . . : ::
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pF1KB8 RIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKPYQCNACGKAFIRGSQLTEHQRVHT
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pF1KB8 RLHN
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NP_001 SVHSEGKS
640
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pF1KB8 EKEVYEMESLQWENMGKRINHHL-QYNGLGDNMECKGNL--EGQEASQ--EGLYMCVK--
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pF1KB8 --ITCEE-KATESHSTSSTFHRIIPTKEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEKCSE
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XP_016 CDVCGKVFSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDEN
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pF1KB8 MPHLLVTFRDVAIDFSQEEWECLDPAQRDLYRDVMLENYSNLISLDLESSCV
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pF1KB8 TKKLSPEKEVYEMESLQWENMG---KRINHHLQYNGLG-DNMECKGNLEGQEASQEGLYM
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pF1KB8 CVKITCEEKATESH--STSSTFHRIIP-TKEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEK
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NP_003 -WEIPRESLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEK
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pF1KB8 ---CSEVKKHRNTFSKKPSYIQHQRIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKP
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NP_003 SSGLIQHQRIHTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHL
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pF1KB8 ---GEKPYTCVQCGKDFRCPSQLTQHTRLHN
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NP_003 EVKTQETHECDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
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>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
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pF1KB8 ITCEEKATESHSTSSTFHRIIPT--KEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEKCSEV
. . .:... . .. . : ::: :::.:: ..::. : ::.:...:. :. :
NP_001 QSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYEC
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pF1KB8 KKHRNTFSKKPSYIQHQRIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKPYQCNACG
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NP_001 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECG
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230 240 250 260 270 280
pF1KB8 KAFIRGSQLTEHQRVHTGEKPYECKKCGKAFSYCSQYTLHQRIHSGEKPYECKDCGKAFI
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NP_001 KSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFS
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290 300 310 320 330 340
pF1KB8 LGSQLTYHQRIHSGEKPYECKECGKAFILGSHLTYHQRVHTGEKPYICKECGKAFLCASQ
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NP_001 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTL
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pF1KB8 LNEHQRIHTGEKPYECKECGKTFFRGSQLTYHLRVHSGERPYKCKECGKAFISNSNLIQH
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NP_001 LTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQH
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pF1KB8 QRIHTGEKPYKCKECGKAFICGKQLSEHQRIHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQHEKIH
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NP_001 QRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIH
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470 480 490 500 510 520
pF1KB8 -GEKHYECKECGKTFVRATQLTYHQRIHTGEKPYKCKECDKAFIYGSQLSEHQRIHRGEK
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NP_001 TGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEK
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pF1KB8 PYECKQCGKAFIRGSHLTEHLRTHTGEKPYECKECGRAFSRGSELTLHQRIHTGEKPYTC
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NP_001 PYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB8 VQCGKDFRCPSQLTQHTRLHN
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
initn: 2931 init1: 1498 opt: 2032 Z-score: 1026.5 bits: 200.0 E(85289): 1.9e-50
Smith-Waterman score: 2032; 54.6% identity (79.6% similar) in 504 aa overlap (82-582:124-621)
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pF1KB8 VTKKLSPEKEVYEMESLQWENMGKRINHHLQYNGLGDNMECKGNLEGQEASQEGLYMCVK
: ::.:.:. . .: : . : .
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pF1KB8 ITCEEKATESHSTSSTFHRIIPT--KEKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEKCSEV
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XP_016 QSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYEC
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pF1KB8 KKHRNTFSKKPSYIQHQRIHTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQHQKIHTNEKPYQCNACG
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XP_016 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECG
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pF1KB8 KAFIRGSQLTEHQRVHTGEKPYECKKCGKAFSYCSQYTLHQRIHSGEKPYECKDCGKAFI
:.: :....:.:.:::::::::..::::: . : : :::.:::::.: .:::::
XP_016 KSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFS
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pF1KB8 LGSQLTYHQRIHSGEKPYECKECGKAFILGSHLTYHQRVHTGEKPYICKECGKAFLCASQ
.:.:: :::::.:::::::.:::::: . : :::.::::::: : :::::: ..
XP_016 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTL
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pF1KB8 QRIHTGEKPYKCKECGKAFICGKQLSEHQRIHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQHEKIH
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XP_016 QRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIH
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pF1KB8 -GEKHYECKECGKTFVRATQLTYHQRIHTGEKPYKCKECDKAFIYGSQLSEHQRIHRGEK
::: :::..::..: ... : :::::: :::: :.:: :.: ..:.::.:.: : :::
XP_016 TGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEK
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pF1KB8 PYECKQCGKAFIRGSHLTEHLRTHTGEKPYECKECGRAFSRGSELTLHQRIHTGEKPYTC
::::..:::.: ...:::.: : ::::::: :..::.::...: :: ::: :::
XP_016 PYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB8 VQCGKDFRCPSQLTQHTRLHN
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 2931 init1: 1498 opt: 2032 Z-score: 1026.4 bits: 200.1 E(85289): 2e-50
Smith-Waterman score: 2032; 54.6% identity (79.6% similar) in 504 aa overlap (82-582:131-628)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VTKKLSPEKEVYEMESLQWENMGKRINHHLQYNGLGDNMECKGNLEGQEASQEGLYMCVK
: ::.:.:. . .: : . : .
XP_016 GHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPE------R
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120 130 140 150 160
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]