Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8336, 491 aa
1>>>pF1KB8336 491 - 491 aa - 491 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1429+/-0.00118; mu= 10.1941+/- 0.070
mean_var=190.9185+/-37.443, 0's: 0 Z-trim(109.5): 965 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.092822
statistics sampled from 9916 (10949) to 9916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 3401 468.4 7.6e-132
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 1280 184.4 2.4e-46
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 1126 163.6 3.2e-40
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1105 160.9 2.7e-39
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1104 160.9 3.5e-39
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1104 161.0 3.7e-39
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1104 161.0 3.7e-39
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1104 161.0 3.7e-39
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1092 159.2 9e-39
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1092 159.2 9.3e-39
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1092 159.4 1.1e-38
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1080 157.5 2.3e-38
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 1080 157.7 2.9e-38
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 1078 157.3 3.2e-38
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 1075 157.0 4.6e-38
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1070 156.3 6.9e-38
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 1070 156.3 7.3e-38
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 1070 156.3 7.4e-38
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 1065 155.7 1.2e-37
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1065 155.7 1.2e-37
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1065 155.7 1.2e-37
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 1062 155.2 1.4e-37
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1062 155.3 1.6e-37
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1063 155.5 1.7e-37
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1059 154.8 2e-37
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 1059 154.8 2.1e-37
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 1059 154.9 2.4e-37
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1053 154.1 3.7e-37
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1050 153.8 5.6e-37
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1045 152.9 6.9e-37
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1048 153.5 7.2e-37
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1047 153.4 8e-37
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 1046 153.2 8.1e-37
CCDS32797.1 ZNF519 gene_id:162655|Hs108|chr18 ( 540) 1044 152.8 8.4e-37
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 1043 152.7 9.2e-37
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 1040 152.3 1.2e-36
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1040 152.4 1.3e-36
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1040 152.4 1.3e-36
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1037 151.9 1.6e-36
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1037 151.9 1.7e-36
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1037 152.0 1.7e-36
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 1036 151.8 1.8e-36
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 1034 151.5 2.2e-36
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1033 151.5 2.7e-36
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1031 151.1 2.8e-36
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1032 151.3 3e-36
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1031 151.2 3.3e-36
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1031 151.5 4.7e-36
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 1026 150.5 4.7e-36
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1027 150.7 4.7e-36
>>CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 (491 aa)
initn: 3401 init1: 3401 opt: 3401 Z-score: 2480.5 bits: 468.4 E(32554): 7.6e-132
Smith-Waterman score: 3401; 100.0% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (1-491:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAIPKHSLSPVPWEEDSFLQVKVEEEEEASLSQGGESSHDHIAHSEAARLRFRHFRYEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAIPKHSLSPVPWEEDSFLQVKVEEEEEASLSQGGESSHDHIAHSEAARLRFRHFRYEEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SGPHEALAHLRALCCQWLQPEAHSKEQILELLVLEQFLGALPPEIQAWVGAQSPKSGEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGPHEALAHLRALCCQWLQPEAHSKEQILELLVLEQFLGALPPEIQAWVGAQSPKSGEEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AVLVEDLTQVLDKRGWDPGAEPTEASCKQSDLGESEPSNVTETLMGGVSLGPAFVKACEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVLVEDLTQVLDKRGWDPGAEPTEASCKQSDLGESEPSNVTETLMGGVSLGPAFVKACEP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EGSSERSGLSGEIWTKSVTQQIHFKKTSGPYKDVPTDQRGRESGASRNSSSAWPNLTSQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGSSERSGLSGEIWTKSVTQQIHFKKTSGPYKDVPTDQRGRESGASRNSSSAWPNLTSQE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KPPSEDKFDLVDAYGTEPPYTYSGKRSSKCRECRKMFQSASALEAHQKTHSRKTPYACSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPPSEDKFDLVDAYGTEPPYTYSGKRSSKCRECRKMFQSASALEAHQKTHSRKTPYACSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CGKAFSRSTHLAQHQVVHTGAKPHECKECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKAFSRSTHLAQHQVVHTGAKPHECKECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGKAFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGRAFSDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGKAFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGRAFSDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALM
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB8 VHLRIHITVLQ
:::::::::::
CCDS12 VHLRIHITVLQ
490
>>CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 (494 aa)
initn: 2057 init1: 886 opt: 1280 Z-score: 945.4 bits: 184.4 E(32554): 2.4e-46
Smith-Waterman score: 1289; 42.7% identity (69.6% similar) in 494 aa overlap (12-489:13-494)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MAIPKHSLSPVPWEEDSFLQVKVEEEEEASLSQGGESSHDHIAHSEAARLRFRHFRYEE
: :....: ::::::. . :.: . ... .:. : .::.: : .
CCDS42 MSGEATVLAYHAPEEQEGLLVVKVEEENYV-LDQD-FGLQENPWSQEVFRQKFRQFSYSD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ASGPHEALAHLRALCCQWLQPEAHSKEQILELLVLEQFLGALPPEIQAWVGAQSPKSGEE
..::.:::..:: ::::::.::.::::::::::.:::::. :: :.:::. . :..:::
CCDS42 STGPREALSRLRELCCQWLRPEVHSKEQILELLMLEQFLAILPEELQAWLREHRPENGEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AAVLVEDLTQVLDKRGWDPGAEPTEASCKQSDLGESEPSNVTETLMGGVSLGPAFVKACE
:....:.: . :. .: . : . .. : ... ..: . . : . . :.
CCDS42 AVTMLEELEKELE----EPRQQDTTHG-QEMFWQEMTSTGALKSLSLNSPVQP-LENQCK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 PEGS-----SERSG--LSGEIWT--KSVTQQIHFKKTSGPYKDVPTD---QRGRES--GA
: . .::.: ..:.. . ... . .: : .: . :: : :.
CCDS42 TETQESQAFQERDGRMVAGKVLMAKQEIVECVASAAMISPGK-LPGETHSQRIAEEALGG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SRNSSSAWPNLTSQE--KPPSEDKFDLVDAYGTEPPYTYSGKRSSKCRECRKMFQSASAL
::.. : .... . ::.:. . ... . : .: .: .: . :. :
CCDS42 LDNSKKQKGNAAGNKISQLPSQDRHFSLATFNRRIPTEHSVLES---HESEGSFSMNSND
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 EAHQKTHSRKTPYACSECGKAFSRSTHLAQHQVVHTGAKPHECKECGKAFSRVTHLTQHQ
..:.. .:. : : .::::: .:..: .:: .::: .:. ::::::::: . :..::
CCDS42 ITQQSVDTREKLYECFDCGKAFCQSSKLIRHQRIHTGERPYACKECGKAFSLSSDLVRHQ
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 RIHTGEKPYKCGECGKTFSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGKAFSQSTHLTQHQRIHT
:::.:::::.: ::::.: :..: .:.:.::::.:::: ::::::.:. : ::..:::
CCDS42 RIHSGEKPYECCECGKAFRGSSELIRHRRIHTGEKPYECGECGKAFSRSSALIQHKKIHT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 GEKPYKCDACGRAFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKP
:.: :.: :::.::. : ::.: :::.:::::.:. : :.: :::.: .::::::::::
CCDS42 GDKSYECIACGKAFGRSSILIEHQRIHTGEKPYECNECGKSFNQSSALTQHQRIHTGEKP
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB8 YKCSDCGKAFSRSSALMVHLRIHITVLQ
:.::.: :.: . :.:: : : : :
CCDS42 YECSECRKTFRHRSGLMQHQRTHTRV
470 480 490
>>CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 (358 aa)
initn: 2060 init1: 1057 opt: 1126 Z-score: 835.6 bits: 163.6 E(32554): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 1126; 50.0% identity (72.6% similar) in 336 aa overlap (162-486:2-327)
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 DKRGWDPGAEPTEASCKQSDLGESEPSNVTETLMGGVSLGPAFVKACEPEGSSERSGLSG
:.: :... ::. . . ::. :. .
CCDS43 MESLRGNTAQGPTNEEDYKNEGQLSRQ-TKC
10 20 30
200 210 220 230 240
pF1KB8 EIWTKSVTQQIHFKKTSGPYKDVPTDQRGRESGASRNSSSAWPNLTSQEKPP--------
:: .. .:.: :.. : ..: :: :. : : ::: .:.: :
CCDS43 PAQKKSSFENTVVRKVSVTLKEIFTGEEGPES--SEFSLS--PNLDAQQKIPKGHGSPIS
40 50 60 70 80
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ---SEDKFDLVDAYGTEPPYTYSGKRSSKCRECRKMFQSASALEAHQKTHSRKTPYACSE
:.:. ::. . .: .. :: ::.: :. : : .:.. :. . :. :..
CCDS43 RKNSKDNSDLI-----KHQRLFSQRKPCKCNECEKAFSYQSDLLVHSRIHGGEKPFECNK
90 100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CGKAFSRSTHLAQHQVVHTGAKPHECKECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKT
:::.::::::: .:: .::: ::.::.:::::::: :::. :::::::::::.:.::::.
CCDS43 CGKSFSRSTHLIEHQRTHTGEKPYECNECGKAFSRSTHLSLHQRIHTGEKPYECSECGKA
150 160 170 180 190 200
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGKAFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGRAFSDC
:::::.:.::::.:: ::::.:. :::::.. . . :::::::::.::.:. ::.:::
CCDS43 FSRSTNLSQHQRTHTQERPYKCNECGKAFGDRSTIIQHQRIHTGENPYECSKCGKAFSWI
210 220 230 240 250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALM
:.: .: : :.::.::.:. : :.:..:::: ::::::.::::..: :::.:::::.:.
CCDS43 SSLTEHQRTHTGENPYECSECGKVFSRSSSLTEHQRIHSGEKPHECRVCGKGFSRSSSLI
270 280 290 300 310 320
490
pF1KB8 VHLRIHITVLQ
.: : :
CCDS43 IHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFCQSSTLIRHQHLHTKE
330 340 350
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 1105 init1: 1105 opt: 1105 Z-score: 819.0 bits: 160.9 E(32554): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 1120; 46.0% identity (69.6% similar) in 378 aa overlap (116-486:8-356)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 EQILELLVLEQFLGALPPEIQAWVGAQSPKSGEEAAVLVEDLTQVLDKRGWDPGAEPTEA
.: .: : ::... : .. : .: .:
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEW----RPLDA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 SCKQSDLGESEPSNVTETLMGGVSLGPAFVKACEPEGSSERSGLSGEIWTKS-VTQQIHF
. : :: . .: . .:.: . . : :: .:. :. ......:
CCDS23 A--QRDLYR----DVMQENYGNVV-------SLDFEIRSE-----NEVNPKQEISEDVQF
40 50 60 70
210 220 230 240 250
pF1KB8 KKTSG-PYKDV---PTDQRGRESGASRNSSSAWPNLTSQE--KPPSEDKFDLVDAYGTEP
:: : ... : ...: ::: .: : : .::..: . : . ::. :
CCDS23 GTTSERPAENAEENPESEEGFESG-DR-SERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLL--VHKE-
80 90 100 110 120 130
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 PYTYSGKRSSKCRECRKMFQSASALEAHQKTHSRKTPYACSECGKAFSRSTHLAQHQVVH
...: : : .: : :.. : :. :::::. :: : ::::.::::.:: ::: .:
CCDS23 --VHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTH
140 150 160 170 180
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 TGAKPHECKECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKTFSRSTHLTQHQRVHTGER
:: .:..:.::::.:.: .:: ::: :::::::.::.::::.: : .:: ::::.:.::.
CCDS23 TGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEK
190 200 210 220 230 240
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 PYECDACGKAFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGRAFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQC
::::. :::.::.:.::.:::: :::::::.:. :::.::. : ::.: :.:.::.::.:
CCDS23 PYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKC
250 260 270 280 290 300
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 KVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALMVHLRIHITVLQ
: : :.:.:.:..:.: :::::::.:..::. ::: : :. : : :
CCDS23 DECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACG
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