Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8283
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8283, 292 aa
1>>>pF1KB8283 292 - 292 aa - 292 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2078+/-0.00202; mu= 7.7324+/- 0.118
mean_var=261.8706+/-55.694, 0's: 0 Z-trim(103.4): 948 B-trim: 19 in 1/49
Lambda= 0.079256
statistics sampled from 6384 (7404) to 6384 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 1.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12492.1 ZNF146 gene_id:7705|Hs108|chr19 ( 292) 2077 251.3 6.3e-67
CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19 ( 412) 1757 214.9 8e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1447 179.6 4.3e-45
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1447 179.8 5e-45
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1397 174.1 2.8e-43
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1361 169.8 4.1e-42
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1361 169.9 4.4e-42
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1355 169.1 6.6e-42
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1355 169.2 6.8e-42
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1355 169.2 6.9e-42
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1349 168.6 1.2e-41
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1345 168.1 1.7e-41
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1343 167.8 1.8e-41
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1343 167.8 1.9e-41
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1343 167.9 1.9e-41
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1343 167.9 1.9e-41
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1327 165.7 4.7e-41
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1327 165.8 5.5e-41
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1327 165.8 5.6e-41
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1324 165.5 6.8e-41
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1326 165.9 7.3e-41
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1325 165.8 7.5e-41
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1325 165.8 7.5e-41
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1325 165.8 7.6e-41
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1321 165.5 1.2e-40
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1321 165.5 1.2e-40
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1321 165.5 1.2e-40
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1316 164.6 1.3e-40
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1316 164.8 1.6e-40
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1316 164.8 1.6e-40
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1313 164.4 2e-40
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1313 164.4 2e-40
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1313 164.5 2.1e-40
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1306 163.5 3.1e-40
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1306 163.6 3.4e-40
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1306 163.6 3.4e-40
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1306 163.6 3.4e-40
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1306 163.6 3.4e-40
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 1302 162.9 3.9e-40
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1303 163.2 4e-40
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1303 163.2 4e-40
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1302 163.0 4.1e-40
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 1302 163.0 4.2e-40
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1303 163.4 4.9e-40
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1299 162.9 6.7e-40
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1299 163.0 6.9e-40
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1295 162.2 7e-40
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1297 162.7 7.8e-40
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1295 162.5 9.2e-40
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1293 162.2 1e-39
>>CCDS12492.1 ZNF146 gene_id:7705|Hs108|chr19 (292 aa)
initn: 2077 init1: 2077 opt: 2077 Z-score: 1315.0 bits: 251.3 E(32554): 6.3e-67
Smith-Waterman score: 2077; 99.7% identity (100.0% similar) in 292 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHEHFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVI
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSHLSQQRIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHEHFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 THTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 THTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 GCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHIRHQKIHTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHIRHQKIHTH
250 260 270 280 290
>>CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19 (412 aa)
initn: 1757 init1: 1757 opt: 1757 Z-score: 1115.7 bits: 214.9 E(32554): 8e-56
Smith-Waterman score: 1757; 81.7% identity (94.8% similar) in 289 aa overlap (4-292:124-412)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTE
. .:: ..: .:.::: :::.:. :. :::
CCDS33 QKENFLSHQKHHTGEKPYECEKVSIQMPTIIRHQKNHTGTKPYACKECGKAFNGKAYLTE
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HEHFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKI
::..:: :::::::.::.:::::::.::::: :::.: :.:.::::.:::::::. ::.:
CCDS33 HEKIHTGEKPFECNQCGRAFSQKQYLIKHQNIHTGKKPFKCSECGKAFSQKENLIIHQRI
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 HTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGE
::::::.::: :::::::::.::::::.::::::..::::::.:::::::::::::::::
CCDS33 HTGEKPYECKGCGKAFIQKSSLIRHQRSHTGEKPYTCKECGKAFSGKSNLTEHEKIHIGE
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYE
::.::.:::: : ::.:::::.::::::::::::.::::::. ::::::::::.::::::
CCDS33 KPYKCNECGTIFRQKQYLIKHHNIHTGEKPYECNKCGKAFSRITSLIVHVRIHTGDKPYE
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 CNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSEC
:.:::::: ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::
CCDS33 CKVCGKAFCQSSSLTVHMRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHMRIHTGEKPYQCSEC
340 350 360 370 380 390
280 290
pF1KB8 GKAFSQKSHHIRHQKIHTH
::::::::::::::.::::
CCDS33 GKAFSQKSHHIRHQRIHTH
400 410
>>CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 (527 aa)
initn: 1447 init1: 1447 opt: 1447 Z-score: 923.0 bits: 179.6 E(32554): 4.3e-45
Smith-Waterman score: 1447; 65.5% identity (87.1% similar) in 287 aa overlap (6-292:241-527)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHE
... ..::.:. :: : :.::::.:. :.
CCDS82 IIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQ
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHT
..::::::.::::::::: : . ...:: ::::: . :.::::.:::: ::..:.:::.
CCDS82 KIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICKECGKAFSQKSNLIAHEKIHS
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKP
::::.::..::::: ::.:.: ::..::::::. :.::::.:: ..:: : . : ::::
CCDS82 GEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKP
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECN
..:..:: ::.: . : :. ::::::: :::::::::::::::::.: :.:.::::::
CCDS82 YECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYECN
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGK
::::::::::::.:.:.::::::. :..:::::::.:.:.::.: :::.:::.: ::::
CCDS82 KCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIECGK
460 470 480 490 500 510
280 290
pF1KB8 AFSQKSHHIRHQKIHTH
::::::: .:::.::::
CCDS82 AFSQKSHLVRHQRIHTH
520
>--
initn: 1055 init1: 1055 opt: 1055 Z-score: 680.8 bits: 134.8 E(32554): 1.3e-31
Smith-Waterman score: 1055; 64.7% identity (84.7% similar) in 215 aa overlap (43-257:26-240)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 ENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHEHFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLF
::.::.:::.:.: .:.: ::::: .
CCDS82 MRKEHCEYNEPVKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPY
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 ECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKE
::..: :.::.::.:. : :::. :. ..:..::::::. :::::::: ::::::..:::
CCDS82 ECSNCRKAFSHKEKLIKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKE
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 CGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKA
: :.:: :::: .::::: ::::..:.::: ::.::. :: ::..::::::: :::::::
CCDS82 CEKSFSQKSNLIDHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKA
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 FSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQF
: . .:: .:.: :.:.:::.:. ::::::: : : .::: ::::::: ::::::::::
CCDS82 FPRIASLALHMRSHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQS
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290
pF1KB8 STLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHIRHQKIHTH
:.:..
CCDS82 SALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLV
240 250 260 270 280 290
>>CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 (686 aa)
initn: 1447 init1: 1447 opt: 1447 Z-score: 921.9 bits: 179.8 E(32554): 5e-45
Smith-Waterman score: 1447; 65.5% identity (87.1% similar) in 287 aa overlap (6-292:400-686)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHE
... ..::.:. :: : :.::::.:. :.
CCDS12 IIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQ
370 380 390 400 410 420
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHT
..::::::.::::::::: : . ...:: ::::: . :.::::.:::: ::..:.:::.
CCDS12 KIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICKECGKAFSQKSNLIAHEKIHS
430 440 450 460 470 480
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKP
::::.::..::::: ::.:.: ::..::::::. :.::::.:: ..:: : . : ::::
CCDS12 GEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKP
490 500 510 520 530 540
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECN
..:..:: ::.: . : :. ::::::: :::::::::::::::::.: :.:.::::::
CCDS12 YECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYECN
550 560 570 580 590 600
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGK
::::::::::::.:.:.::::::. :..:::::::.:.:.::.: :::.:::.: ::::
CCDS12 KCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIECGK
610 620 630 640 650 660
280 290
pF1KB8 AFSQKSHHIRHQKIHTH
::::::: .:::.::::
CCDS12 AFSQKSHLVRHQRIHTH
670 680
>--
initn: 1055 init1: 1055 opt: 1055 Z-score: 679.6 bits: 134.9 E(32554): 1.6e-31
Smith-Waterman score: 1055; 64.7% identity (84.7% similar) in 215 aa overlap (43-257:185-399)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 ENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHEHFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLF
::.::.:::.:.: .:.: ::::: .
CCDS12 NVKCLMRKEHCEYNEPVKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPY
160 170 180 190 200 210
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 ECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKE
::..: :.::.::.:. : :::. :. ..:..::::::. :::::::: ::::::..:::
CCDS12 ECSNCRKAFSHKEKLIKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKE
220 230 240 250 260 270
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 CGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKA
: :.:: :::: .::::: ::::..:.::: ::.::. :: ::..::::::: :::::::
CCDS12 CEKSFSQKSNLIDHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKA
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 FSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQF
: . .:: .:.: :.:.:::.:. ::::::: : : .::: ::::::: ::::::::::
CCDS12 FPRIASLALHMRSHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQS
340 350 360 370 380 390
260 270 280 290
pF1KB8 STLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHIRHQKIHTH
:.:..
CCDS12 SALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLV
400 410 420 430 440 450
>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa)
initn: 1388 init1: 1388 opt: 1397 Z-score: 890.5 bits: 174.1 E(32554): 2.8e-43
Smith-Waterman score: 1397; 62.2% identity (85.2% similar) in 291 aa overlap (2-291:452-742)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQ-QKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSN
::: : :....::.:. :. :.:.:...:
CCDS27 QTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSR
430 440 450 460 470 480
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LTEHEHFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTH
::.:.. :: :::.::::::.:: ... . .:: :::.: ..:::::..: ...::. :
CCDS27 LTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDH
490 500 510 520 530 540
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 QKIHTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIH
:.:::::::.::..::::: ... ::::: ::::::. :.::::.:. .:.: :::.::
CCDS27 QRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIH
550 560 570 580 590 600
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 IGEKPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDK
:::::.::::: ::: .: ::.:: .:::::::.::::::.:.: . ::.: :::.:.:
CCDS27 TGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEK
610 620 630 640 650 660
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PYECNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQC
::::: :::.:: :::: :: :.::::::: ::.::::::. : : .: :.:::.:::.:
CCDS27 PYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYEC
670 680 690 700 710 720
280 290
pF1KB8 SECGKAFSQKSHHIRHQKIHTH
:::::::::.: .::. ::
CCDS27 SECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
730 740 750
>>CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (580 aa)
initn: 1361 init1: 1361 opt: 1361 Z-score: 869.5 bits: 169.8 E(32554): 4.1e-42
Smith-Waterman score: 1361; 65.3% identity (84.1% similar) in 277 aa overlap (15-291:157-433)
10 20 30 40
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHEHFHTREKPF
:: :. ::. :::: .: .::..:. :::.
CCDS56 LLRYEKGCVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPY
130 140 150 160 170 180
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 ECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKD
::.:::::::.:. .: ::. ::::: ..::::::.: : ::. :..:::::::. :::
CCDS56 ECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKD
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 CGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCSECGTA
: ::: ::::::.:.: ::::::. ::::::.:: :.:: :::::: ::::. :.::: :
CCDS56 CWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRA
250 260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 FGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQS
:.. . . :. :::::::.::.::::::: . .:.:.: :.:.::: :. ::::::::
CCDS56 FSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQS
310 320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHI
::::::.:.::.:::: :.:::::::. .: : .::::.:::.:::::::: : :. :
CCDS56 SSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLI
370 380 390 400 410 420
290
pF1KB8 RHQKIHTH
:::.:::
CCDS56 RHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEK
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 740 init1: 740 opt: 740 Z-score: 485.7 bits: 98.8 E(32554): 9.8e-21
Smith-Waterman score: 740; 67.1% identity (88.1% similar) in 143 aa overlap (124-266:434-576)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 HTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGE
::::..: :::.:: ::::::::::: ::
CCDS56 HTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGE
410 420 430 440 450 460
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYE
::..:..:: ::.:.. :..:..:::::::..:::::::::. .:: .::: :.:.::::
CCDS56 KPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYE
470 480 490 500 510 520
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 CNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSEC
:: ::::::: : : .:.::::::::. :::::::::: ..:..: : :::..
CCDS56 CNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
530 540 550 560 570 580
280 290
pF1KB8 GKAFSQKSHHIRHQKIHTH
>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa)
initn: 1361 init1: 1361 opt: 1361 Z-score: 869.0 bits: 169.9 E(32554): 4.4e-42
Smith-Waterman score: 1361; 65.3% identity (84.1% similar) in 277 aa overlap (15-291:221-497)
10 20 30 40
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHEHFHTREKPF
:: :. ::. :::: .: .::..:. :::.
CCDS42 LLRYEKGCVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPY
200 210 220 230 240 250
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 ECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKD
::.:::::::.:. .: ::. ::::: ..::::::.: : ::. :..:::::::. :::
CCDS42 ECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKD
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 CGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCSECGTA
: ::: ::::::.:.: ::::::. ::::::.:: :.:: :::::: ::::. :.::: :
CCDS42 CWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRA
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 FGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQS
:.. . . :. :::::::.::.::::::: . .:.:.: :.:.::: :. ::::::::
CCDS42 FSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQS
380 390 400 410 420 430
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHI
::::::.:.::.:::: :.:::::::. .: : .::::.:::.:::::::: : :. :
CCDS42 SSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLI
440 450 460 470 480 490
290
pF1KB8 RHQKIHTH
:::.:::
CCDS42 RHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEK
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 740 init1: 740 opt: 740 Z-score: 485.2 bits: 98.9 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 740; 67.1% identity (88.1% similar) in 143 aa overlap (124-266:498-640)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 HTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGE
::::..: :::.:: ::::::::::: ::
CCDS42 HTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGE
470 480 490 500 510 520
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KPFKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYE
::..:..:: ::.:.. :..:..:::::::..:::::::::. .:: .::: :.:.::::
CCDS42 KPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYE
530 540 550 560 570 580
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 CNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSEC
:: ::::::: : : .:.::::::::. :::::::::: ..:..: : :::..
CCDS42 CNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
590 600 610 620 630 640
280 290
pF1KB8 GKAFSQKSHHIRHQKIHTH
>>CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (568 aa)
initn: 1355 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 865.8 bits: 169.1 E(32554): 6.6e-42
Smith-Waterman score: 1355; 62.9% identity (83.6% similar) in 286 aa overlap (6-291:251-536)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHE
.:.:..:..:. : .:::.::.: .:. :.
CCDS54 IQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQ
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHT
. :: :::..:.:::::::::. .: :: .::::: .::.::::.:::: :. ::.:::
CCDS54 RTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHT
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKP
::::.::..::::: :::.:: :.:.::::::. : ::::.: ::.: :..:: ::::
CCDS54 GEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKP
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECN
.::..: ::..: :: :: .:::::::::.::::.::....::.: : :.:.:::.:.
CCDS54 YKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCS
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGK
::::: :.: : : : ::::::: :.:::::::: : : : :::::.::: :.::::
CCDS54 ECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGK
470 480 490 500 510 520
280 290
pF1KB8 AFSQKSHHIRHQKIHTH
:::::: . ::.:::
CCDS54 AFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
530 540 550 560
>>CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (604 aa)
initn: 1355 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 865.6 bits: 169.2 E(32554): 6.8e-42
Smith-Waterman score: 1355; 62.9% identity (83.6% similar) in 286 aa overlap (6-291:287-572)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHE
.:.:..:..:. : .:::.::.: .:. :.
CCDS43 IQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQ
260 270 280 290 300 310
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHT
. :: :::..:.:::::::::. .: :: .::::: .::.::::.:::: :. ::.:::
CCDS43 RTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHT
320 330 340 350 360 370
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKP
::::.::..::::: :::.:: :.:.::::::. : ::::.: ::.: :..:: ::::
CCDS43 GEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKP
380 390 400 410 420 430
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECN
.::..: ::..: :: :: .:::::::::.::::.::....::.: : :.:.:::.:.
CCDS43 YKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCS
440 450 460 470 480 490
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGK
::::: :.: : : : ::::::: :.:::::::: : : : :::::.::: :.::::
CCDS43 ECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGK
500 510 520 530 540 550
280 290
pF1KB8 AFSQKSHHIRHQKIHTH
:::::: . ::.:::
CCDS43 AFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
560 570 580 590 600
>>CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (620 aa)
initn: 1355 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 865.5 bits: 169.2 E(32554): 6.9e-42
Smith-Waterman score: 1355; 62.9% identity (83.6% similar) in 286 aa overlap (6-291:303-588)
10 20 30
pF1KB8 MSHLSQQKIYSGENPFACKVCGKVFSHKSNLTEHE
.:.:..:..:. : .:::.::.: .:. :.
CCDS54 IQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQ
280 290 300 310 320 330
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HFHTREKPFECNECGKAFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHT
. :: :::..:.:::::::::. .: :: .::::: .::.::::.:::: :. ::.:::
CCDS54 RTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHT
340 350 360 370 380 390
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKP
::::.::..::::: :::.:: :.:.::::::. : ::::.: ::.: :..:: ::::
CCDS54 GEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKP
400 410 420 430 440 450
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FKCSECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECN
.::..: ::..: :: :: .:::::::::.::::.::....::.: : :.:.:::.:.
CCDS54 YKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCS
460 470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGK
::::: :.: : : : ::::::: :.:::::::: : : : :::::.::: :.::::
CCDS54 ECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGK
520 530 540 550 560 570
280 290
pF1KB8 AFSQKSHHIRHQKIHTH
:::::: . ::.:::
CCDS54 AFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
580 590 600 610 620
292 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 11:21:55 2016 done: Fri Nov 4 11:21:55 2016
Total Scan time: 1.830 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]