Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8279
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8279, 406 aa
1>>>pF1KB8279 406 - 406 aa - 406 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7830+/-0.00124; mu= 6.4764+/- 0.073
mean_var=219.1727+/-44.964, 0's: 0 Z-trim(109.5): 951 B-trim: 141 in 1/50
Lambda= 0.086633
statistics sampled from 9867 (10899) to 9867 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 2798 362.8 3.3e-100
CCDS59001.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 247) 1718 227.6 1e-59
CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 ( 389) 1362 183.3 3.4e-46
CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 394) 1227 166.4 4.1e-41
CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 ( 348) 1197 162.6 5.1e-40
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 1164 158.5 9.2e-39
CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 335) 959 132.9 4.5e-31
CCDS55503.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX ( 415) 952 132.1 9.5e-31
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 934 130.0 5.9e-30
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 872 122.2 1.1e-27
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 868 121.5 1.1e-27
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 868 121.6 1.4e-27
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 868 121.6 1.4e-27
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 864 121.3 2.5e-27
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 864 121.3 2.7e-27
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 864 121.3 2.7e-27
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 864 121.3 2.7e-27
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 855 120.0 4.4e-27
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 855 120.2 6e-27
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 854 120.1 6.9e-27
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 850 119.5 7.8e-27
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 850 119.5 7.8e-27
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 850 119.5 8e-27
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 850 119.5 8.2e-27
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 851 119.7 8.3e-27
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 853 120.2 9.5e-27
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 853 120.2 9.7e-27
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 844 118.6 1.2e-26
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 842 118.5 1.6e-26
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 838 117.8 1.7e-26
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 841 118.4 2e-26
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 838 117.9 2e-26
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 838 117.9 2.1e-26
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 839 118.2 2.3e-26
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 837 117.8 2.4e-26
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 837 117.8 2.4e-26
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 839 118.2 2.5e-26
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 837 117.9 2.5e-26
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 837 117.9 2.5e-26
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 837 117.9 2.6e-26
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 837 117.9 2.6e-26
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 837 117.9 2.7e-26
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 837 117.9 2.7e-26
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 834 117.4 2.8e-26
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 833 117.3 3.1e-26
CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs108|chr3 ( 271) 826 116.1 3.9e-26
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 832 117.3 4.3e-26
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 833 117.5 4.4e-26
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 830 117.0 4.5e-26
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 831 117.2 5.1e-26
>>CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 (406 aa)
initn: 2798 init1: 2798 opt: 2798 Z-score: 1912.5 bits: 362.8 E(32554): 3.3e-100
Smith-Waterman score: 2798; 99.8% identity (100.0% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETPGPREALSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETPGPREALSRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAVAVVEDLEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAVAVVEDLEQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQFQEQDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQFQEQDGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SIPENQELASKQEILKEMEHLGDSRLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTGERRHR
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SIPENQELASKQEILKEMEHLGDSKLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTGERRHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 CNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPYQCKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPYQCKEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEKRYQCRECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEKRYQCRECGKAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB8 IQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
370 380 390 400
>>CCDS59001.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 (247 aa)
initn: 1718 init1: 1718 opt: 1718 Z-score: 1185.7 bits: 227.6 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 1718; 99.6% identity (100.0% similar) in 247 aa overlap (160-406:1-247)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQFQEQDGESIPENQELA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MVTQLRYESFCLHQFQEQDGESIPENQELA
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SKQEILKEMEHLGDSRLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTGERRHRCNECGKSFT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SKQEILKEMEHLGDSKLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTGERRHRCNECGKSFT
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPYQCKECGKAFSASNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPYQCKECGKAFSASNG
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEKRYQCRECGKAFIQNAGLFQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEKRYQCRECGKAFIQNAGLFQH
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400
pF1KB8 LRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
220 230 240
>>CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 (389 aa)
initn: 1276 init1: 728 opt: 1362 Z-score: 942.8 bits: 183.3 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 1362; 55.3% identity (76.2% similar) in 378 aa overlap (1-373:7-383)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MASTEEQYDLKIVKV---EEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETP
. ..: : : ::: ::. :. : :: .: :. ::::::::.:
CCDS47 MAITLTLQTAEMQEGLLAVKVKEEEEEHSCGPESGLSRNNPHTREIFRRRFRQFCYQESP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GPREALSRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAV
::::::.::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.: ::::::
CCDS47 GPREALQRLQELCHQWLRPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVRQHRPVSGEEAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AVVEDLEQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCL
.:.::::.::..::.:. .: : . : . : . . :: .. :.: . :: :. .
CCDS47 TVLEDLERELDDPGEQVLSHAHEQEEFVKEKATP-GAAQESSNDQFQTLEEQLGYNLREV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 HQFQEQDGESIPENQELASKQEILKEMEHLGD--SRLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQ
:: ::.. : ::: :.:: .:.. : . .. . ... .: .:: :... :::
CCDS47 CPVQEIDGKAGTWNVELAPKREISQEVKSLIQVLGKQNGNITQIPEYGDTCDREGRLEKQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 QAHSTGERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSH
.. :. :: . :.:::::::..:.:::::: :::::::::.:::.:::.::.: .:.: :
CCDS47 RVSSSVERPYICSECGKSFTQNSILIEHQRTHTGEKPYECDECGRAFSQRSGLFQHQRLH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 TGEKPYQCKECGKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEK
:::: :::. :::::: . :: .: :::::::::.:. :.:.: : :..::::::::.
CCDS47 TGEKRYQCSVCGKAFSQNAGLFHHLRIHTGEKPYQCNQCNKSFSRRSVLIKHQRIHTGER
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 RYQCRECGKAFIQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
:.:.:::: :: . .:.:: .::
CCDS47 PYECEECGKNFIYHCNLIQHRKVHPVAESS
360 370 380
>>CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 (394 aa)
initn: 1147 init1: 662 opt: 1227 Z-score: 851.5 bits: 166.4 E(32554): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 1227; 51.2% identity (75.7% similar) in 375 aa overlap (5-374:20-389)
10 20 30 40
pF1KB8 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQF
:: .: :... : ::..:. .: ..: :. :::.
CCDS46 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMK-VEAKSHLQW-QESRLKRSNPLAREIFRRHFRQL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 CYQETPGPREALSRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPE
::::::::::::.::.:::.:::::.. ::::::.::::::::.:::.:::.::::: ::
CCDS46 CYQETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 SGEEAVAVVEDLEQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLR
:::::: ..::::.::.:: .. :.: ..::: ... : ..: : .: :: ::
CCDS46 SGEEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRH-RQEVLCKEMVPL-AEQTPLTLQSQPKEPQLT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 YESF--CLHQFQEQDGESIPENQELASKQEILKEMEHLGD--SRLQRDVSL-DSKYRETC
.: : :.. : : . :..::. ... : .: : .. .:: : .. :.
CCDS46 CDSAQKC-HSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 KRDSKAEKQQAHSTGERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRS
.. .. :.: .. :: .:.:.:::::::.:: ::.::::::::.::::.:::::::: :
CCDS46 EHKDRIERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SLNEHRRSHTGEKPYQCKECGKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQ
.: .:: :. .: :.::::::.:: : :: .:.::: :::::.:. :.:.. : :..
CCDS46 GLFNHRGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HQRIHTGEKRYQCRECGKAFIQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKI
::: ::::. .:: ::::.: .. .:..: ..::
CCDS46 HQRSHTGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
360 370 380 390
pF1KB8 HTGERP
>>CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 1607 init1: 561 opt: 1197 Z-score: 831.9 bits: 162.6 E(32554): 5.1e-40
Smith-Waterman score: 1197; 51.6% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (5-351:8-348)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETPGPREAL
:.: : :.:.: : : :.. . . .: :: ::..:::..:::::::
CCDS46 MTTALEPEDQKGLLIIKAE-DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAVAVVEDL
..: :::.:::::: :::::::.::::::::.:::..:::::: ::::.:::::.:.:::
CCDS46 TQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQFQEQ
:.::.:::.:.: . . . ..:.. . : : .::.: :::. :. . :..
CCDS46 ERELDEPGKQVPGNSE-RRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA---GKPQRN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 DGESIPENQELASKQEILKEMEHLGD--SRLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTG
.. .:.:: .:... :. : ::. .::..:. : .. . ....: :: .
CCDS46 GDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRE---
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPY
.::..:.::::::..:: : .:.: :::::::.:.:::::: .:: : :.: ::: :::
CCDS46 RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPY
240 250 260 270 280 290
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CCDS11 WASWELHSLRHCDDDGRTENGALAPKQELPSALESHEVPGTLNMGVPQIFKYGETCFPKG
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CCDS11 RFERKRNPSR-KKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQ
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CCDS11 HQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRR
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CCDS11 HNAEKLLNVVKV
360
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CCDS82 SWELQSLRPHDEDIKTTNVKSASRQKTSLGIELHCNVSNILHMNGSQSSTYRGTYEQDGR
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CCDS82 FEKRQGNPSWKKQQKCDECGKIFSQSSALILHQRIHSGKKPYACDECAKAFSRSAILIQH
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10 20 30 40
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CCDS55 ALVLVEFLQRE--------PDGTKNESLLTFEDVAVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQD
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CCDS55 IYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVSTSEIQTSGCEVSK--KTRMK--IAQKTMGRENPGD
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CCDS55 THSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPK--LMDLHGKGPTGEKPFKCQECGKSFRVSSDL
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CCDS55 IKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMTHQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQ
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CCDS55 RREACLVSPN
410
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pF1KB8 -EKQQAHSTGERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEH
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CCDS12 AGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEK
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pF1KB8 P
:
CCDS12 PYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]