Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8207, 292 aa
1>>>pF1KB8207 292 - 292 aa - 292 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1553+/-0.00116; mu= 5.9667+/- 0.066
mean_var=202.0187+/-45.474, 0's: 0 Z-trim(108.4): 699 B-trim: 278 in 1/50
Lambda= 0.090236
statistics sampled from 9358 (10163) to 9358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 2.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 1994 272.4 2.8e-73
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 1216 171.2 8.7e-43
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 1183 166.8 1.7e-41
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 1134 160.8 2e-39
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 1134 160.8 2e-39
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 1133 160.6 2.1e-39
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 1133 160.6 2.2e-39
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 1133 160.7 2.3e-39
CCDS55184.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 260) 1108 157.0 1.3e-38
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 1097 155.6 3.9e-38
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 1099 156.1 4.5e-38
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 1099 156.2 4.6e-38
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 1037 148.0 1.1e-35
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 1037 148.0 1.2e-35
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 1037 148.1 1.2e-35
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 974 139.8 3.1e-33
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 974 139.8 3.2e-33
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 974 139.8 3.3e-33
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 946 136.1 3.6e-32
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 880 127.5 1.4e-29
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 818 119.4 3.8e-27
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 813 118.8 5.9e-27
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 809 118.6 1.4e-26
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 809 118.6 1.4e-26
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 809 118.7 1.4e-26
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 808 118.5 1.5e-26
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 808 118.5 1.6e-26
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 808 118.5 1.6e-26
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 808 118.5 1.6e-26
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 761 112.0 6.6e-25
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 731 108.3 1.2e-23
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 731 108.3 1.3e-23
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 734 109.0 1.4e-23
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 734 109.0 1.5e-23
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 264) 713 105.6 4.1e-23
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 713 105.7 4.6e-23
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 690 102.6 3.4e-22
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 667 99.6 2.6e-21
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 665 99.5 3.6e-21
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 651 97.6 1.2e-20
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 648 97.4 2.1e-20
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 642 96.3 2.4e-20
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 648 97.5 2.4e-20
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 641 96.4 3.3e-20
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 641 96.4 3.4e-20
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 635 95.8 7.4e-20
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 634 95.7 8.5e-20
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 634 95.8 8.9e-20
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 634 95.8 9.1e-20
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 614 93.2 5.5e-19
>>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 (292 aa)
initn: 1994 init1: 1994 opt: 1994 Z-score: 1429.2 bits: 272.4 E(32554): 2.8e-73
Smith-Waterman score: 1994; 100.0% identity (100.0% similar) in 292 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
250 260 270 280 290
>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa)
initn: 585 init1: 585 opt: 1216 Z-score: 881.6 bits: 171.2 E(32554): 8.7e-43
Smith-Waterman score: 1216; 61.4% identity (85.3% similar) in 293 aa overlap (1-291:1-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
:. ..:.:::::::::.:.::::::: ..::::..::: . :::::.:.::: :::::::
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
::::: ::.:...:: ::::: .::::::.:: :. : ...::.:::::.:..::::
CCDS11 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
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CCDS11 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYK-P
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CCDS11 TTAVDIWSIGCIFAEMVTR-KALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
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CCDS11 FPKW-TRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQY
240 250 260 270 280 290
CCDS11 VLQRFRH
300
>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa)
initn: 1004 init1: 524 opt: 1183 Z-score: 858.5 bits: 166.8 E(32554): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 1183; 59.9% identity (82.0% similar) in 294 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
:....:.:::::::::.:.::.:. : :.::::..::: . :::::.:.::: :::::.:
CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
:::.: ::.:...:: ::::: :::::..:. : ..::.:::::.::.::::
CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
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CCDS88 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKP-
::..:.:: ::::::... : ::::.. ::: :::: :::: : ::..:..:::::
CCDS88 STAVDIWSLGCIFAEMVTR-RALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
.: . : .. .::: :. ::.::...:. .: .::::. :: ::.:.: :
CCDS88 FPKW-ARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 1050 init1: 779 opt: 1134 Z-score: 821.2 bits: 160.8 E(32554): 2e-39
Smith-Waterman score: 1134; 56.3% identity (84.6% similar) in 293 aa overlap (1-291:189-478)
10 20 30
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
:. : ::::.:::::.::.:.... :...:
CCDS53 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
:::..::. . ::.: .:.::. :::.::: ::: :::..:.::.::::::. :.:::.:
CCDS53 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
.:.:.. .. . :: ::.:.:.::..:: :.::::::::::::::..:::::::::::::
CCDS53 MDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARA
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDD
..:.. :: :::::::::::::.:.. :::.::::..:::: :.:. :::::::. :.:
CCDS53 KSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMAS-GRPLFPGSTVED
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
.:. ::::::::..: ::.... ..: : : : :.: .:.:.. : .:. ..:.
CCDS53 ELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQP-LINHAPRLDSEGIELITKFLQ
400 410 420 430 440 450
270 280 290
pF1KB8 CNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
. .:.:::::..: :: .. :
CCDS53 YESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFV
460 470 480 490 500 510
>>CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 1050 init1: 779 opt: 1134 Z-score: 821.2 bits: 160.8 E(32554): 2e-39
Smith-Waterman score: 1134; 56.3% identity (84.6% similar) in 293 aa overlap (1-291:189-478)
10 20 30
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
:. : ::::.:::::.::.:.... :...:
CCDS90 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
:::..::. . ::.: .:.::. :::.::: ::: :::..:.::.::::::. :.:::.:
CCDS90 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
.:.:.. .. . :: ::.:.:.::..:: :.::::::::::::::..:::::::::::::
CCDS90 MDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARA
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDD
..:.. :: :::::::::::::.:.. :::.::::..:::: :.:. :::::::. :.:
CCDS90 KSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMAS-GRPLFPGSTVED
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
.:. ::::::::..: ::.... ..: : : : :.: .:.:.. : .:. ..:.
CCDS90 ELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQP-LINHAPRLDSEGIELITKFLQ
400 410 420 430 440 450
270 280 290
pF1KB8 CNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
. .:.:::::..: :: .. :
CCDS90 YESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGK
460 470 480 490 500 510
>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (496 aa)
initn: 1044 init1: 774 opt: 1133 Z-score: 820.8 bits: 160.6 E(32554): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 1133; 58.0% identity (84.7% similar) in 288 aa overlap (1-286:162-446)
10 20 30
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
.. : ::.:.:::::.::.:.:.. : ..:
CCDS14 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
:::..::. . ::.: .:.::. :::.::: ::: :::..:..:.::::::. :.:::.:
CCDS14 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
.:.:.. .. . :: ::::::.::..:: ..::::::::::::::. :::::::::::::
CCDS14 LDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARA
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDD
.::.. :: :::::::::::.:.:. :::.::::..:::: :.:. :::::::. :..
CCDS14 KSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMAT-GRPLFPGSTVEE
320 330 340 350 360
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
::. :::.::::::: ::.. . ..: : : : : .:.. .:.:.. : ::: .::.
CCDS14 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAE-ALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQ
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270 280 290
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. .:::::.:..::.:
CCDS14 FEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPA
430 440 450 460 470 480
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10 20 30
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.. : ::.:.:::::.::.:.:.. : ..:
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:::..::. . ::.: .:.::. :::.::: ::: :::..:..:.::::::. :.:::.:
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.::.. :: :::::::::::.:.:. :::.::::..:::: :.:. :::::::. :..
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220 230 240 250 260
pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
::. :::.::::::: ::.. . ..: : : : : .:.. .:.:.. : ::: .::.
CCDS48 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAE-ALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQ
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. .:::::.:..::.:
CCDS48 FEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPA
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10 20 30
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
.. : ::.:.:::::.::.:.:.. : ..:
CCDS55 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
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40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
:::..::. . ::.: .:.::. :::.::: ::: :::..:..:.::::::. :.:::.:
CCDS55 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
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.:.:.. .. . :: ::::::.::..:: ..::::::::::::::. :::::::::::::
CCDS55 LDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARA
330 340 350 360 370 380
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDD
.::.. :: :::::::::::.:.:. :::.::::..:::: :.:. :::::::. :..
CCDS55 KSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMAT-GRPLFPGSTVEE
390 400 410 420 430 440
220 230 240 250 260
pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
::. :::.::::::: ::.. . ..: : : : : .:.. .:.:.. : ::: .::.
CCDS55 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAE-ALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQ
450 460 470 480 490 500
270 280 290
pF1KB8 CNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
. .:::::.:..::.:
CCDS55 FEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPA
510 520 530 540 550 560
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
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pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVK----------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ----------------NGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
210 220 230 240 250 260
>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 1093 init1: 483 opt: 1097 Z-score: 798.0 bits: 155.6 E(32554): 3.9e-38
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10 20 30 40 50 60
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:. : :.:::::::::.:.:.... : ..::.:..::....:::::.:.::: :::::.:
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCN-GD-LDPEIVKSFLFQLLKGLGFCH
::: :.::: .:..: :.::: ..:::::.:: :. .: .:::.:.:.:.:. :::
CCDS44 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFCH
70 80 90 100 110 120
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:: :::::::::::::. .: .::::::::::::::.: :. :::::::: :.::.:.
CCDS44 SRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSAR
130 140 150 160 170 180
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pF1KB8 YSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYK-
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CCDS44 YSTPVDIWSIGTIFAELATK-KPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKN
190 200 210 220 230
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pF1KB8 PYPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
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CCDS44 TFPKWKPG-SLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
240 250 260 270 280 290
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]