Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8171
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8171, 557 aa
1>>>pF1KB8171 557 - 557 aa - 557 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2050+/-0.00117; mu= 13.2117+/- 0.069
mean_var=69.7856+/-14.145, 0's: 0 Z-trim(102.1): 57 B-trim: 429 in 3/44
Lambda= 0.153529
statistics sampled from 6774 (6823) to 6774 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 3756 841.7 0
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 3756 841.7 0
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 2625 591.1 1.1e-168
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 2363 533.1 3.3e-151
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 2363 533.1 3.6e-151
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 2186 493.9 2.4e-139
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 2035 460.5 2.4e-129
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 1956 443.0 4.5e-124
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 1859 421.5 1.3e-117
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 1859 421.5 1.3e-117
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 1776 403.1 4.6e-112
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 1675 380.7 2.5e-105
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 1565 356.3 4.9e-98
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 1472 335.8 9.1e-92
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 1015 234.5 1.4e-61
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
initn: 3756 init1: 3756 opt: 3756 Z-score: 4495.6 bits: 841.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3756; 100.0% identity (100.0% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IVSQRKLSKSLLKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IVSQRKLSKSLLKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 MGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 QMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGI
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB8 KPKCSSEMYESSRTLAP
:::::::::::::::::
CCDS30 KPKCSSEMYESSRTLAP
550
>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (575 aa)
initn: 3756 init1: 3756 opt: 3756 Z-score: 4495.3 bits: 841.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3756; 100.0% identity (100.0% similar) in 557 aa overlap (1-557:19-575)
10 20 30 40
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLLKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLLKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 ARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 DRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 VILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKAL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 VAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 PKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASH
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 LPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKS
490 500 510 520 530 540
530 540 550
pF1KB8 VLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
550 560 570
>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (558 aa)
initn: 2636 init1: 2159 opt: 2625 Z-score: 3141.7 bits: 591.1 E(32554): 1.1e-168
Smith-Waterman score: 2625; 70.5% identity (89.6% similar) in 536 aa overlap (11-543:9-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFE
:: : : . .:: .:::::..:. . ::: :.: :: : : .:..::: .
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 VDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGL--KEADFLGGMECTL
: ::::.:. ..::.::.::::.::::::::::::.: . . .:. .: ::::::::::
CCDS10 VGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYD-THGPSGFSCQEDDFLGGMECTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
::::.:.:... :: : : .::::.::::::..:::. ::::.: ::::::::.::::::
CCDS10 GQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
:::..:.::: :::.::::: :::.:.:..::::..:::: . : :::.:::.:: :
CCDS10 FLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFL
::::::::..::.::. :.: :.::.:.::::: :...:::::.:.: :.:...:::
CCDS10 KHDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKM
:::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::
CCDS10 DYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPII
: :.::::::::.: :::::::::: .. :: ::::::::::.:::..:::::::.::::
CCDS10 FSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPII
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADF
.:::. :. : .: .::::.:::::::::.:::::::::::.::.::::.::::::::::
CCDS10 SKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 SDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNG
.:::.::::::.::::.:::.:::::::::::..:.:::::::: ::::::.:::.::.
CCDS10 TDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSH
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB8 KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
.:. :.
CCDS10 RGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
540 550
>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (557 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2363 Z-score: 2828.1 bits: 533.1 E(32554): 3.3e-151
Smith-Waterman score: 2363; 63.0% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (3-542:5-541)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQW
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.:: :::.::. : ::
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTL
::.::::.:.: .::.:........::: : :.:.: : .. .. .. :::. ::::
CCDS96 VEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
:::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.: : :::.::.::::::
CCDS96 GQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
:.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: : : :: .:.:.::.:
CCDS96 FMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHS
::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.::::.: : ..:.:.
CCDS96 KHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSD
:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::.:: ::: ::::::::
CCDS96 FLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 KMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAP
: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:. :::..:::::::.::
CCDS96 KRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 IIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNA
::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.::.::::.::::::::
CCDS96 IINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 DFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYY
:::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.:::: :::::: :::.::
CCDS96 DFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYY
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB8 NGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
..::.:
CCDS96 ASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
540 550
>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (612 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2363 Z-score: 2827.4 bits: 533.1 E(32554): 3.6e-151
Smith-Waterman score: 2363; 63.0% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (3-542:60-596)
10 20 30
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVAC
.:. . : . ::: ..:::::.:
CCDS61 SGWSSKGVRARAREPERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGA------SRVELRVSC
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 KGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLR
.:. :::.:.:: :::.::. : :: ::.::::.:.: .::.:........::: : :.
CCDS61 HGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQ
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELS
:.: : .. .. .. :::. :::::::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.:
CCDS61 FHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 GNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFK
:..:::.:.: : :::.::.:::::::.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :.
CCDS61 GTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFR
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KB8 VSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPK
.:..:::: : : :: .:.:.::.:::::::::::::.::. : : :...::.:::::
CCDS61 LSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPK
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 YKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHY
:. ::::::.::::.: : ..:.:.:::::::::::.:::::::::::::::.: :::
CCDS61 YRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHC
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 IHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECA
. : :::.::.:: ::: ::::::::: ::::::::::::.. :::::::::. .::::
CCDS61 LSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECE
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 GIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITD
:.::. .:. :::..:::::::.::::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:
CCDS61 EISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSD
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 MADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFR
::.:: :::.::.::::.:::::::::::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::
CCDS61 MAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFR
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550
pF1KB8 NFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
.:: :.:.:::: :::::: :::.:: ..::.:
CCDS61 DFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
570 580 590 600 610
>>CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (633 aa)
initn: 2596 init1: 2161 opt: 2186 Z-score: 2615.2 bits: 493.9 E(32554): 2.4e-139
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20 30 40 50 60 70
pF1KB8 GIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVY
: : : .:..::: .: ::::.:. ..::.
CCDS10 GGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVF
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB8 SKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGL--KEADFLGGMECTLGQ-------------
::.::::.::::::::::::.: . . .:. .: ::::::::::::
CCDS10 SKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYD-THGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQPAQKWLLQVVMRV
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 ------------------------------------------------------------
CCDS10 SVDVLGPAGHCAKHFLCCTESSHLARTGPSFLLRYDDLCLPWATAGAVRWWTCRGGHTQG
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170
pF1KB8 --IVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
::.:.:... :: : : .::::.::::::..:::. ::::.: ::::::::.::::::
CCDS10 WQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDP
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
:::..:.::: :::.::::: :::.:.:..::::..:::: . : :::.:::.:: :
CCDS10 FLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRG
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFL
::::::::..::.::. :.: :.::.:.::::: :...:::::.:.: :.:...:::
CCDS10 KHDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFL
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKM
:::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::
CCDS10 DYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKR
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360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPII
: :.::::::::.: :::::::::: .. :: ::::::::::.:::..:::::::.::::
CCDS10 FSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPII
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADF
.:::. :. : .: .::::.:::::::::.:::::::::::.::.::::.::::::::::
CCDS10 SKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADF
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480 490 500 510 520 530
pF1KB8 SDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNG
.:::.::::::.::::.:::.:::::::::::..:.:::::::: ::::::.:::.::.
CCDS10 TDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSH
560 570 580 590 600 610
540 550
pF1KB8 KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
.:. :.
CCDS10 RGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
620 630
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
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Smith-Waterman score: 2035; 57.1% identity (81.3% similar) in 525 aa overlap (22-543:5-528)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVILKMQSHGQWF
:.::: : :.: .. :.: :: :: ::.. : ::.
CCDS62 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWY
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLG
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CCDS62 EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPF
::::..::.. : .: : :::.:::. :::.. : : . ..:::::.::.:.::::.
CCDS62 QIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGK
::. ....:.. .::::::: :::.:.:. ::.:.:::: :: :. .: .:.:..:.
CCDS62 LEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGS
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 HDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLD
::.:: : .:. ... : ... :..:::: : . :::.:::::.. .. :.: .:::
CCDS62 HDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLD
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 YIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMF
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CCDS62 YIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMF
290 300 310 320 330 340
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pF1KB8 PAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQ
:::::::.:::.. :::.: .::: .:: : ::::.::::.::::...::::::..:::.
CCDS62 PAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIIN
350 360 370 380 390 400
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pF1KB8 KVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFS
.::. :. :. . :::::.:::.:::::::. .::.:::.::.::::.::::::.::::
CCDS62 HVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFS
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pF1KB8 DMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNG-
:..:::: : :::: :: ..::::::::::.:..: :::. ::::.:.::: :.:
CCDS62 AMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY
470 480 490 500 510 520
540 550
pF1KB8 KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
: . ::
CCDS62 KLLPPKNPATKQQKQ
530
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Smith-Waterman score: 1956; 53.7% identity (81.9% similar) in 525 aa overlap (22-545:22-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFE
:. :::: :. ... :::. :: :: .: ...:.:.:
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGRWIE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 VDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLGQ
::::. . .::..:: :..:..:::::.:.: . : ... : : :::: . :.::
CCDS10 YDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLGT
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 IVSQRKLSKSLLK-HGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFL
:::..:... :: . . :::. ::. :.::: : . :.. .:.:: ::.:.::::::
CCDS10 IVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNR-VITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
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pF1KB8 EIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKH
:... .::. .:::::::. .:.:.:: : : . :::.:: .. .. . .:.:..: :
CCDS10 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 DFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDY
:::::: .. ..: : .. ...:::::: . ::::::::: .:: :::.. .:::::
CCDS10 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFP
:.::::..:::.::::::::.: . :::::.:. ::::.:. :::.: ::::::::::
CCDS10 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 AFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQK
:.::::..::.. :::.:::::: :: :.:..:...::..:::....:::::..::...
CCDS10 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
360 370 380 390 400 410
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pF1KB8 VAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSD
::. :.. :. . :.:::::::.:::::.:: .::.:.:.::.::::.::::::::::.
CCDS10 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
420 430 440 450 460 470
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pF1KB8 MQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKG
:..::::. .::: :: . ::::::::::.:..:. .:::.::::.:.:::.:.. :.
CCDS10 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKN
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB8 IKPKCSSEMYESSRTLAP
. : :
CCDS10 LPPTNSEPA
540
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVILKMQSHGQWF
:.: :.: ..: . :.: :: :: ::.:. . :.:
CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLG
:. ::: .:.: .: .:: . ... :: ::.::: ..::... :.. ::::: ::.::
CCDS13 ELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPF
::::.. :. : :: :. ::...::: :.::. : : . .::.:: :::..:::::
CCDS13 QIVSSQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKDNR-VVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPF
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 LEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGK
::.::..: . .::.:.::. :::.:.:: :.: :. .:.:.:. .. :.::.:.
CCDS13 LEFFRQGD-GKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLD
::.:: : ... ..... ...:::.:. . :::.::::::. ...:... .::::
CCDS13 HDLIGTFHTSLAQLQAV----PAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLD
230 240 250 260 270
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pF1KB8 YIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMF
:.::::::.:::..:::.::::: . ::::. : :::: :: .:: . :::::::.:
CCDS13 YVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQ
:::::::..::.. :::.::.::: .:: ::::::.:.::.. ::...::::::.::::.
CCDS13 PAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIIN
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 KVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFS
.::. :.. .. :::::.::.::::..::. ::::.:.::.:::::::::::.:::
CCDS13 HVARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFE
400 410 420 430 440 450
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pF1KB8 DMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGK
:..::.: : :.. .:. . ::::::::.: :..: :::..::::::.:.:.:. ..
CCDS13 AMEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQ
460 470 480 490 500 510
540 550
pF1KB8 GIKPKCSSEMYESSRTLAP
: :
CCDS13 GWAPLKPLPPSAKDPAQAPQA
520 530
>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (542 aa)
initn: 1557 init1: 1186 opt: 1859 Z-score: 2224.9 bits: 421.5 E(32554): 1.3e-117
Smith-Waterman score: 1859; 52.0% identity (80.1% similar) in 523 aa overlap (22-542:9-525)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVILKMQSHGQWF
:.: :.: ..: . :.: :: :: ::.:. . :.:
CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLG
:. ::: .:.: .: .:: . ... :: ::.::: ..::... :.. ::::: ::.::
CCDS46 ELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPF
::::.. :. : :: :. ::...::: :.::. : : . .::.:: :::..:::::
CCDS46 QIVSSQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKDNR-VVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGK
::.::..: . .::.:.::. :::.:.:: :.: :. .:.:.:. .. :.::.:.
CCDS46 LEFFRQGD-GKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGS
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 HDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLD
::.:: : ... ..... ...:::.:. . :::.::::::. ...:... .::::
CCDS46 HDLIGTFHTSLAQLQAV----PAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLD
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 YIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMF
:.::::::.:::..:::.::::: . ::::. : :::: :: .:: . :::::::.:
CCDS46 YVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLF
290 300 310 320 330 340
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pF1KB8 PAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQ
:::::::..::.. :::.::.::: .:: ::::::.:.::.. ::...::::::.::::.
CCDS46 PAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIIN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFS
.::. :.. .. :::::.::.::::..::. ::::.:.::.:::::::::::.:::
CCDS46 HVARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFE
410 420 430 440 450 460
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pF1KB8 DMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGK
:..::.: : :.. .:. . ::::::::.: :..: :::..::::::.:.:.:. ..
CCDS46 AMEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQ
470 480 490 500 510 520
540 550
pF1KB8 GIKPKCSSEMYESSRTLAP
: :
CCDS46 GWAPLKPLPPSAKDPAQAPQA
530 540
557 residues in 1 query sequences
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