Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8154
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8154, 569 aa
1>>>pF1KB8154 569 - 569 aa - 569 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4590+/-0.00202; mu= 9.8919+/- 0.120
mean_var=292.0817+/-57.499, 0's: 0 Z-trim(105.1): 979 B-trim: 47 in 2/47
Lambda= 0.075045
statistics sampled from 7161 (8242) to 7161 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 3.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 3978 445.6 7.6e-125
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 2471 282.4 9.6e-76
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 2471 282.5 1e-75
CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 570) 1881 218.6 1.7e-56
CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 571) 1869 217.3 4.1e-56
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1796 209.4 1e-53
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 1765 206.0 1e-52
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1756 205.2 2.2e-52
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1726 201.7 1.7e-51
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1725 201.8 2.2e-51
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1725 201.8 2.3e-51
CCDS42982.1 ZNF74 gene_id:7625|Hs108|chr22 ( 644) 1714 200.6 5e-51
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1698 198.9 1.7e-50
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1663 195.0 2.1e-49
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1659 194.6 3e-49
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1659 194.6 3.1e-49
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1659 194.6 3.2e-49
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1659 194.7 3.2e-49
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1645 193.2 9.7e-49
CCDS4443.1 ZNF354C gene_id:30832|Hs108|chr5 ( 554) 1642 192.7 1e-48
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1643 192.9 1.1e-48
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 1633 192.0 2.6e-48
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1629 191.2 2.6e-48
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1629 191.5 3.2e-48
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1624 190.7 3.9e-48
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1624 190.9 4.4e-48
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1627 191.5 4.5e-48
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1621 190.6 5.8e-48
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 1601 188.2 2.1e-47
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 1601 188.2 2.1e-47
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1603 188.7 2.4e-47
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1603 188.7 2.4e-47
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1600 188.2 2.5e-47
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1600 188.2 2.6e-47
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1598 187.9 2.7e-47
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1597 187.9 3.2e-47
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1597 187.9 3.2e-47
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1589 187.1 6.4e-47
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1587 186.9 7.7e-47
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1587 187.0 7.9e-47
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1581 186.0 9.4e-47
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1581 186.1 1e-46
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1579 185.8 1.1e-46
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1580 186.0 1.1e-46
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1581 186.2 1.1e-46
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1581 186.2 1.1e-46
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1580 186.1 1.2e-46
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1577 185.6 1.2e-46
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1577 185.6 1.3e-46
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 1577 185.7 1.4e-46
>>CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 (569 aa)
initn: 3978 init1: 3978 opt: 3978 Z-score: 2354.9 bits: 445.6 E(32554): 7.6e-125
Smith-Waterman score: 3978; 100.0% identity (100.0% similar) in 569 aa overlap (1-569:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLYRKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLYRKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GKEPWMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSSKQETYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKEPWMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSSKQETYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEILPEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQSFPTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEILPEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQSFPTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEKKLLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEKKLLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECGKAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECGKAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAFSQYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAFSQYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSSLAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSSLAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 QHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTLHQRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTLHQRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHER
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB8 IHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFIS
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFIS
550 560
>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
initn: 3556 init1: 1979 opt: 2471 Z-score: 1473.3 bits: 282.4 E(32554): 9.6e-76
Smith-Waterman score: 2529; 66.1% identity (82.2% similar) in 557 aa overlap (1-555:9-530)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLYRKVMLENYRSLVSLGVSVSKP
: ..:::: ::::.::::::. :. .::.:: .::::::: :::::. :::
CCDS12 MAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 DVISLLEQGKEPWMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSSKQETYEE--SSKVVTVGARHLS
.:: :::::: :::::.: :.: : :: . .. :.. ::. ::: :.:.. . :
CCDS12 SVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDFYEEHQSQKIIET---LTS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YSLDYPSLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEILPEVQNKEYNKSWQTFHQDTI
:.:.: ::::. . : ... : :.:.. ... ::::.: : . ...:: ::: .:::. .
CCDS12 YNLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEY-KSWGSFHQNPL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FDIQQSFPTKEKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEKKLLKCNDCEKVFNQSSSLTLH
. :. .: .::.:::. ::.:..:. . .: ..: .::::::::::::::.::::::::
CCDS12 LCTQKIIPKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLAQHQRVH
:::::::::: :.::::.::: .::.::.::::::::::::::::::::::::.:: :::
CCDS12 QRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECGKAFSNGSFLAQHQRIHTGEK
::::::.:: :.:::::.:.:.:::::::::.:.::::::::::: : .:::::.:::::
CCDS12 TGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PYVCNVCGKAFSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAFSQYAHLAQHQRVHTGEKPYEC
:: ::::::::: :.:: ::::::::::::::::: ::::: .:::::::.:::::::.:
CCDS12 PYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSSLAQHQRSHTGEKPYMCKECR
. ::::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::.::::
CCDS12 QECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSSLTQHQR--------------
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 KTFSQNAGLAQHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTLHQRIHTGERPYECKDCRKSFR
.:::::::::.:::::::: :::. ::::::::::::::.:.:.::
CCDS12 --------------VHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFR
470 480 490 500
540 550 560
pF1KB8 QRAHLAHHERIHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFIS
:.::::::.::: :: :: :.:
CCDS12 QHAHLAHHQRIHIGES---LSPPNPVNHQVL
510 520 530
>>CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 3556 init1: 1979 opt: 2471 Z-score: 1472.9 bits: 282.5 E(32554): 1e-75
Smith-Waterman score: 2529; 66.1% identity (82.2% similar) in 557 aa overlap (1-555:65-586)
10 20 30
pF1KB8 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNL
: ..:::: ::::.::::::. :. .::.:
CCDS74 PVRVESSEATAISQEKSQEEERMAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 YRKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQGKEPWMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSS
: .::::::: :::::. :::.:: :::::: :::::.: :.: : :: . .. :..
CCDS74 YSNVMLENYRILVSLGLCFSKPSVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTP
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140
pF1KB8 KQETYEE--SSKVVTVGARHLSYSLDYPSLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKE
::. ::: :.:.. . ::.:.: ::::. . : ... : :.:.. ... ::::.:
CCDS74 KQDFYEEHQSQKIIET---LTSYNLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEIITHEE
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 ILPEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQSFPTKEKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVE
: . ...:: ::: .:::. .. :. .: .::.:::. ::.:..:. . .: ..: .:
CCDS74 PLFDEREQEY-KSWGSFHQNPLLCTQKIIPKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAE
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 KKLLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPY
:::::::::::::.:::::::::::::::::: :.::::.::: .::.::.:::::::::
CCDS74 KKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPY
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 ECKECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIE
:::::::::::::::.:: :::::::::.:: :.:::::.:.:.:::::::::.:.::::
CCDS74 ECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIE
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 CGKAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKAFSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKA
::::::: : .:::::.::::::: ::::::::: :.:: ::::::::::::::::: ::
CCDS74 CGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKA
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 FSQYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNS
::: .:::::::.:::::::.:. ::::::::::: :::::::::::::::::::::::.
CCDS74 FSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSND
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 SSLAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLAQHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLT
:::.:::: .:::::::::.:::::::: :::.
CCDS74 SSLTQHQR----------------------------VHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLA
520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 LHQRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHERIHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFI
::::::::::::::.:.:.:::.::::::.::: :: :: :.:
CCDS74 QHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHHQRIHIGES---LSPPNPVNHQVL
550 560 570 580 590
pF1KB8 S
>>CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 (570 aa)
initn: 1339 init1: 1339 opt: 1881 Z-score: 1127.8 bits: 218.6 E(32554): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 1881; 47.9% identity (76.1% similar) in 564 aa overlap (6-569:4-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLYRKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQ
:::.:::..:..::: ::. :::.::. ::..::..:::.:.::.:: ::.:::.
CCDS46 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVITLLED
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70 80 90 100 110 120
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CCDS12 NVFPLNSDFFPSRHNLYEYDLFGKCLEHNFDCHNNVKCLMRKEHCEYNEPVKSYGNSSSH
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CCDS12 ECGKAFSQKSHLVRHQRIHTH
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CCDS46 ECGKVFSKNSILVQHCSIHTREKP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]