Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7880
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7880, 640 aa
1>>>pF1KB7880 640 - 640 aa - 640 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0288+/-0.00197; mu= 24.8314+/- 0.119
mean_var=348.7040+/-62.704, 0's: 0 Z-trim(104.2): 944 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.068682
statistics sampled from 6750 (7799) to 6750 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS56106.1 ZNF549 gene_id:256051|Hs108|chr19 ( 640) 4500 461.8 1.3e-129
CCDS12952.1 ZNF549 gene_id:256051|Hs108|chr19 ( 627) 4370 448.9 1e-125
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 2112 225.2 2.3e-58
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1754 190.1 1.3e-47
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1734 187.7 4.4e-47
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1713 185.6 1.8e-46
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1708 185.5 3e-46
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1698 184.1 5e-46
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1698 184.3 5.5e-46
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1698 184.4 5.6e-46
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1698 184.4 5.6e-46
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1682 182.7 1.6e-45
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1655 180.0 1e-44
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1652 180.1 1.4e-44
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1639 178.5 3.2e-44
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1638 178.3 3.3e-44
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1635 177.9 3.9e-44
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 1629 177.4 6e-44
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1628 177.2 6.3e-44
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1628 177.4 6.7e-44
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1628 177.4 6.8e-44
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1608 175.1 2.4e-43
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1606 175.1 2.9e-43
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1606 175.2 3e-43
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1604 175.0 3.4e-43
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1600 174.4 4.2e-43
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1600 174.4 4.3e-43
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1600 174.5 4.4e-43
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1585 172.9 1.2e-42
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1582 172.7 1.5e-42
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1579 172.2 1.7e-42
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1579 172.3 1.8e-42
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1580 172.6 1.8e-42
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1580 172.8 1.9e-42
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 1578 172.3 2e-42
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1575 172.0 2.4e-42
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1575 172.0 2.4e-42
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1574 172.0 2.7e-42
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1573 171.7 2.7e-42
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1573 171.7 2.7e-42
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1562 170.8 6.1e-42
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1563 171.1 6.2e-42
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1561 170.6 6.2e-42
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1556 170.2 9.2e-42
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 1547 168.9 1.5e-41
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 1547 169.0 1.5e-41
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1550 170.0 1.6e-41
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1550 170.0 1.6e-41
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1545 168.8 1.7e-41
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1545 169.0 1.9e-41
>>CCDS56106.1 ZNF549 gene_id:256051|Hs108|chr19 (640 aa)
initn: 4500 init1: 4500 opt: 4500 Z-score: 2440.3 bits: 461.8 E(32554): 1.3e-129
Smith-Waterman score: 4500; 99.8% identity (99.8% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEAALVNTPQIPMVTEEFVKPSQGHVTFEDIAVYFSQEEWGLLDEAQRCLYHDVMLENF
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MAEAALVITPQIPMVTEEFVKPSQGHVTFEDIAVYFSQEEWGLLDEAQRCLYHDVMLENF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SLMASVGCLHGIEAEEAPSEQTLSAQGVSQARTPKLGPSIPNAHSCEMCILVMKDILYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLMASVGCLHGIEAEEAPSEQTLSAQGVSQARTPKLGPSIPNAHSCEMCILVMKDILYLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EHQGTLPWQKPYTSVASGKWFSFGSNLQQHQNQDSGEKHIRKEESSALLLNSCKIPLSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EHQGTLPWQKPYTSVASGKWFSFGSNLQQHQNQDSGEKHIRKEESSALLLNSCKIPLSDN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LFPCKDVEKDFPTILGLLQHQTTHSRQEYAHRSRETFQQRRYKCEQVFNEKVHVTEHQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LFPCKDVEKDFPTILGLLQHQTTHSRQEYAHRSRETFQQRRYKCEQVFNEKVHVTEHQRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HTGEKAYKRREYGKSLNSKYLFVEHQRTHNAEKPYVCNICGKSFLHKQTLVGHQQRIHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HTGEKAYKRREYGKSLNSKYLFVEHQRTHNAEKPYVCNICGKSFLHKQTLVGHQQRIHTR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ERSYVCIECGKSLSSKYSLVEHQRTHNGEKPYVCNVCGKSFRHKQTFVGHQQRIHTGERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ERSYVCIECGKSLSSKYSLVEHQRTHNGEKPYVCNVCGKSFRHKQTFVGHQQRIHTGERP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YVCMECGKSFIHSYDRIRHQRVHTGEGAYQCSECGKSFIYKQSLLDHHRIHTGERPYECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YVCMECGKSFIHSYDRIRHQRVHTGEGAYQCSECGKSFIYKQSLLDHHRIHTGERPYECK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ECGKAFIHKKRLLEHQRIHTGEKPYVCIICGKSFIRSSDYMRHQRIHTGERAYECSDCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ECGKAFIHKKRLLEHQRIHTGEKPYVCIICGKSFIRSSDYMRHQRIHTGERAYECSDCGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 AFISKQTLLKHHKIHTRERPYECSECGKGFYLEVKLLQHQRIHTREQLCECNECGKVFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AFISKQTLLKHHKIHTRERPYECSECGKGFYLEVKLLQHQRIHTREQLCECNECGKVFSH
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550 560 570 580 590 600
pF1KB7 QKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGERPYNCTACEKAFIYKNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGERPYNCTACEKAFIYKNKL
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610 620 630 640
pF1KB7 VEHQRIHTGEKPYECGKCGKAFNKRYSLVRHQKVHITEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VEHQRIHTGEKPYECGKCGKAFNKRYSLVRHQKVHITEEP
610 620 630 640
>>CCDS12952.1 ZNF549 gene_id:256051|Hs108|chr19 (627 aa)
initn: 4365 init1: 4365 opt: 4370 Z-score: 2370.7 bits: 448.9 E(32554): 1e-125
Smith-Waterman score: 4379; 97.8% identity (97.8% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEAALVNTPQIPMVTEEFVKPSQGHVTFEDIAVYFSQEEWGLLDEAQRCLYHDVMLENF
::::::: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAEAALVITPQ-------------GHVTFEDIAVYFSQEEWGLLDEAQRCLYHDVMLENF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SLMASVGCLHGIEAEEAPSEQTLSAQGVSQARTPKLGPSIPNAHSCEMCILVMKDILYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLMASVGCLHGIEAEEAPSEQTLSAQGVSQARTPKLGPSIPNAHSCEMCILVMKDILYLS
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EHQGTLPWQKPYTSVASGKWFSFGSNLQQHQNQDSGEKHIRKEESSALLLNSCKIPLSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EHQGTLPWQKPYTSVASGKWFSFGSNLQQHQNQDSGEKHIRKEESSALLLNSCKIPLSDN
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pF1KB7 LFPCKDVEKDFPTILGLLQHQTTHSRQEYAHRSRETFQQRRYKCEQVFNEKVHVTEHQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFPCKDVEKDFPTILGLLQHQTTHSRQEYAHRSRETFQQRRYKCEQVFNEKVHVTEHQRV
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HTGEKAYKRREYGKSLNSKYLFVEHQRTHNAEKPYVCNICGKSFLHKQTLVGHQQRIHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGEKAYKRREYGKSLNSKYLFVEHQRTHNAEKPYVCNICGKSFLHKQTLVGHQQRIHTR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ERSYVCIECGKSLSSKYSLVEHQRTHNGEKPYVCNVCGKSFRHKQTFVGHQQRIHTGERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ERSYVCIECGKSLSSKYSLVEHQRTHNGEKPYVCNVCGKSFRHKQTFVGHQQRIHTGERP
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pF1KB7 YVCMECGKSFIHSYDRIRHQRVHTGEGAYQCSECGKSFIYKQSLLDHHRIHTGERPYECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YVCMECGKSFIHSYDRIRHQRVHTGEGAYQCSECGKSFIYKQSLLDHHRIHTGERPYECK
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pF1KB7 ECGKAFIHKKRLLEHQRIHTGEKPYVCIICGKSFIRSSDYMRHQRIHTGERAYECSDCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECGKAFIHKKRLLEHQRIHTGEKPYVCIICGKSFIRSSDYMRHQRIHTGERAYECSDCGK
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pF1KB7 AFISKQTLLKHHKIHTRERPYECSECGKGFYLEVKLLQHQRIHTREQLCECNECGKVFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AFISKQTLLKHHKIHTRERPYECSECGKGFYLEVKLLQHQRIHTREQLCECNECGKVFSH
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pF1KB7 QKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGERPYNCTACEKAFIYKNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGERPYNCTACEKAFIYKNKL
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610 620 630 640
pF1KB7 VEHQRIHTGEKPYECGKCGKAFNKRYSLVRHQKVHITEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VEHQRIHTGEKPYECGKCGKAFNKRYSLVRHQKVHITEEP
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>>CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 (706 aa)
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Smith-Waterman score: 2112; 47.8% identity (75.0% similar) in 627 aa overlap (24-640:35-654)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEAALVNTPQIPMVTEEFVKPSQGHVTFEDIAVYFSQEEWGLLDEAQRCLYH
.. :::::.::::::::: ::: ::: :::
CCDS12 SPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPCGSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDAAQRHLYH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DVMLENFSLMASVGCLHGIEAEEAPSEQTLSAQGVSQARTPKLGPSIPNAHSCEMCILVM
.:::::. :..:.: ::.:.: : .:..:.. : :.: :. :: .:.::.:: .
CCDS12 SVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVE-VLQVRIPNADPSTKKANSCDMCGPFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KDILYLSEHQGTLPWQKPYTSVASGKWFSFGSNLQQHQNQDSGEKHIRKEESSALLLNSC
::::.:.::::: .:::: : :. : ...::.:::.. :: : .: .. :..:
CCDS12 KDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDRDALMKSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 KIPLSDNLFPCKDVEKDFPTILG---LLQHQTTHSRQE-YAHRSRET---FQQRRYKCE-
:. ::.: : :.. : .::: ::: :.. : :. :.. .. :. ..:
CCDS12 KVHLSENPFTCREGGK---VILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTTQKLFECSN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 --QVFNEKVHVTEHQRVHTGEKAYKRREYGKSLNSKYLFVEHQRTHNAEKPYVCNICGKS
..: .. . .: :.:. : . :. :. : .. ... :..: :.::. :::.
CCDS12 CGKAFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSIL-GNKKFHTGEIPHVCKECGKA
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 FLHKQTLVGHQQRIHTRERSYVCIECGKSLSSKYSLVEHQRTHNGEKPYVCNVCGKSFRH
: :.. : :: ..::. . : :: :::... : ..:.::: :.::.:: :. :::.: .
CCDS12 FSHSSKLRKHQ-KFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDECGKAFSN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 KQTFVGHQQRIHTGERPYVCMECGKSFIHSYDRIRHQRVHTGEGAYQCSECGKSFIYKQS
.. .. :. ..::::::. :..::..: .: . .:::.::: :.::.::::: ...
CCDS12 RSHLIRHE-KVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKSFSRSSA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 LLDHHRIHTGERPYECKECGKAFIHKKRLLEHQRIHTGEKPYVCIICGKSFIRSSDYMRH
:..: :.:::::::::.:::.:: ... : .::..::::.:. : ::..: .:: .::
CCDS12 LIQHWRVHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRH
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 QRIHTGERAYECSDCGKAFISKQTLLKHHKIHTRERPYECSECGKGFYLEVKLLQHQRIH
:..::::: .:: :::::: ...::..:.:.:: .:::::::: :.: .:.:: :::
CCDS12 QKVHTGERPFECCDCGKAFSNSSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLIQHWRIH
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 TREQLCECNECGKVFSHQKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGER
: :. ::.::::.:.:.. :.:: .::: :.: ::.:::: : . . ::.:::::.::.
CCDS12 TGEKPYECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQKVHTGEK
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590 600 610 620 630 640
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CCDS12 M
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CCDS12 KSFSRKSNLIRHRRVHTEERP
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CCDS27 CKECGKGFIQRSSLLMHLRNHSGEKPYKCNECGKAFSQSAYLLNHQRIHTGEKPYKCKEC
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CCDS27 SLLLHQ-RVHTEKKTFGCKKCGKIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLF
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CCDS27 RLHNGEKPYECRECGKTFIMSKSFMVHQKLHTQEKAYKCEDCGKAFSYNSSLLVHRRIHT
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pF1KB7 CECNECGKVFSHQKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGERPYNCT
.::.::::::... :. ::..:::::: :::::: : . .::.::..::::. :.:
CCDS27 YKCNDCGKVFSYRSNLIAHQRIHTGEKPYACSECGKGFTYNRNLIEHQRIHSGEKTYECH
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CCDS27 VCRKVLTSSRNLMVHQRIHTGEKPYKCNECGKDFSQNKNLVVHQRMHTGEKPYECDKCRK
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CCDS27 SFTSKRNLVGHQRIHTGEKPYGCNDCSKVFRQRKNLTVHQKIHTDEKPCECDVSEKEFSQ
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CCDS31 SNLVFLEVWLDNPKMWLRDNQDNLKSMERGHKYDVFGKIFNSSINIVHVGLRSHKCGTGE
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CCDS31 KPYECSECGKAFTQKSSLISHQRTHTGEKPYECSECRKTFSEKSSLIHHQRTHTGEKPFE
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pF1KB7 CNECGKVFSHQKRLLEHQKVHTGEKPCECSECGKCFRHRTSLIQHQKVHSGERPYNCTAC
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CCDS31 AKAFFEKAQLIIHQRIHTGERPYKCGECGKSFTRKSHLMRHQRIHTGDKYYGCNECGTTF
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CCDS31 NRKSQLMIHQRNHII
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CCDS35 SECEKNLPQNSNLNIHKKIHTGGKH-------FECT--ECGKAFTRKSTLSMHQKIHTGE
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640 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]