Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7861
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7861, 554 aa
1>>>pF1KB7861 554 - 554 aa - 554 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9270+/-0.00107; mu= 9.7593+/- 0.065
mean_var=267.3979+/-49.994, 0's: 0 Z-trim(114.8): 944 B-trim: 91 in 1/50
Lambda= 0.078432
statistics sampled from 14348 (15365) to 14348 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.775), E-opt: 0.2 (0.472), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10494.2 ZNF205 gene_id:7755|Hs108|chr16 ( 554) 3956 461.0 1.7e-129
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CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1069 134.4 4.1e-31
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1066 133.9 4.2e-31
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1069 134.5 4.2e-31
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1065 133.8 4.7e-31
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1050 132.3 1.8e-30
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 1046 131.7 2.1e-30
CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 422) 1025 129.2 9.7e-30
CCDS9283.1 ZNF10 gene_id:7556|Hs108|chr12 ( 573) 1027 129.6 1e-29
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1022 128.9 1.3e-29
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1021 128.8 1.4e-29
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1023 129.2 1.4e-29
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1022 129.0 1.5e-29
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1022 129.1 1.5e-29
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1022 129.1 1.6e-29
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 1017 128.4 2e-29
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1014 128.2 3.2e-29
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1013 128.2 3.9e-29
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1009 127.7 4.8e-29
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1007 127.4 5e-29
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1007 127.4 5.2e-29
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1007 127.4 5.3e-29
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1007 127.4 5.4e-29
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1003 126.8 5.8e-29
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1006 127.3 5.8e-29
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1006 127.3 6e-29
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1003 126.9 6.6e-29
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1005 127.3 6.7e-29
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1003 126.9 7.1e-29
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 1001 126.7 8e-29
CCDS34357.1 ZNF311 gene_id:282890|Hs108|chr6 ( 666) 997 126.3 1.2e-28
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 997 126.3 1.2e-28
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 ( 458) 993 125.6 1.3e-28
CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19 ( 422) 991 125.4 1.4e-28
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 994 125.9 1.4e-28
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 994 125.9 1.5e-28
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 994 126.0 1.5e-28
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 992 125.8 1.9e-28
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 988 125.1 1.9e-28
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 985 124.6 2e-28
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 988 125.2 2e-28
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 988 125.2 2.2e-28
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 990 125.6 2.2e-28
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 992 126.0 2.3e-28
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 991 125.8 2.3e-28
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 992 126.0 2.3e-28
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 985 124.8 2.6e-28
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 982 124.4 2.9e-28
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 981 124.3 3.4e-28
>>CCDS10494.2 ZNF205 gene_id:7755|Hs108|chr16 (554 aa)
initn: 3956 init1: 3956 opt: 3956 Z-score: 2438.5 bits: 461.0 E(32554): 1.7e-129
Smith-Waterman score: 3956; 100.0% identity (100.0% similar) in 554 aa overlap (1-554:1-554)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSADGGGIQDTQDKETPPEVPDRGHPHQEMPSKLGEAVPSGDTQESLHIKMEPEEPHSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSADGGGIQDTQDKETPPEVPDRGHPHQEMPSKLGEAVPSGDTQESLHIKMEPEEPHSEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ASQEDGAQGAWGWAPLSHGSKEKALFLPGGALPSPRIPVLSREGRTRDRQMAAALLTAWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASQEDGAQGAWGWAPLSHGSKEKALFLPGGALPSPRIPVLSREGRTRDRQMAAALLTAWS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QMPVTFEDVALYLSREEWGRLDHTQQNFYRDVLQKKNGLSLGFPFSRPFWAPQAHGKGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QMPVTFEDVALYLSREEWGRLDHTQQNFYRDVLQKKNGLSLGFPFSRPFWAPQAHGKGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SGSSRQAGDEKEWRGACTGAVEVGQRVQTSSVAALGNVKPFRTRAGRVQWGVPQCAQEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGSSRQAGDEKEWRGACTGAVEVGQRVQTSSVAALGNVKPFRTRAGRVQWGVPQCAQEAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGRSSGPAKDSGQPAEPDRTPDAAPPDPSPTEPQEYRVPEKPNEEEKGAPESGEEGLAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CGRSSGPAKDSGQPAEPDRTPDAAPPDPSPTEPQEYRVPEKPNEEEKGAPESGEEGLAPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SEVGRKSYRCEQCGKGFSWHSHLVTHRRTHTGEKPYACTDCGKRFGRSSHLIQHQIIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SEVGRKSYRCEQCGKGFSWHSHLVTHRRTHTGEKPYACTDCGKRFGRSSHLIQHQIIHTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EKPYTCPACRKSFSHHSTLIQHQRIHTGEKPYVCDRCAKRFTRRSDLVTHQGTHTGAKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKPYTCPACRKSFSHHSTLIQHQRIHTGEKPYVCDRCAKRFTRRSDLVTHQGTHTGAKPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KCPICAKCFTQSSALVTHQRTHTGVKPYPCPECGKCFSQRSNLIAHNRTHTGEKPYHCLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KCPICAKCFTQSSALVTHQRTHTGVKPYPCPECGKCFSQRSNLIAHNRTHTGEKPYHCLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 CGKSFSHSSHLTAHQRTHRGVRPYACPLCGKSFSRRSNLHRHEKIHTTGPKALAMLMLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CGKSFSHSSHLTAHQRTHRGVRPYACPLCGKSFSRRSNLHRHEKIHTTGPKALAMLMLGA
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB7 AAAGALATPPPAPT
::::::::::::::
CCDS10 AAAGALATPPPAPT
550
>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (665 aa)
initn: 1051 init1: 1051 opt: 1069 Z-score: 672.1 bits: 134.4 E(32554): 4.1e-31
Smith-Waterman score: 1069; 54.9% identity (75.4% similar) in 268 aa overlap (267-531:284-548)
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QEAACGRSSGPAKDSGQPAEPDRTPDAAPPDPSPTEPQEYRVPEKPNE---EEKGAPESG
.:. .. .. :.: . .. : . :
CCDS62 SFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNPKISHNEQQRIPFEESQYKCSETSHSSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EEGLAPDSEVGRKSYRCEQCGKGFSWHSHLVTHRRTHTGEKPYACTDCGKRFGRSSHLIQ
... .:: .: ..:.::::.::: ::::.:.::::::::: :..::: :.:::::..
CCDS62 TQNMRNNSE--EKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVS
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HQIIHTGEKPYTCPACRKSFSHHSTLIQHQRIHTGEKPYVCDRCAKRFTRRSDLVTHQGT
:: ::::::: : : ::::. .:. ::: ::::::: :..:.: : . :..:: :
CCDS62 HQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRT
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HTGAKPHKCPICAKCFTQSSALVTHQRTHTGVKPYPCPECGKCFSQRSNLIAHNRTHTGE
::: ::..: :.: : :: :..::: ::: ::: : .::: ::: .:.::.::::::
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pF1KB7 KPYHCLDCGKSFSHSSHLTAHQRTHRGVRPYACPLCGKSFSRRSNLHRHEKIHTTGPKAL
::..: .:::::: ::.:.:::::: : .:: : :::::.: :.: :..::: : :
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500 510 520 530 540 550
540 550
pF1KB7 AMLMLGAAAAGALATPPPAPT
CCDS62 ECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQ
560 570 580 590 600 610
>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (667 aa)
initn: 1051 init1: 1051 opt: 1069 Z-score: 672.1 bits: 134.4 E(32554): 4.1e-31
Smith-Waterman score: 1069; 54.9% identity (75.4% similar) in 268 aa overlap (267-531:286-550)
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QEAACGRSSGPAKDSGQPAEPDRTPDAAPPDPSPTEPQEYRVPEKPNE---EEKGAPESG
.:. .. .. :.: . .. : . :
CCDS62 SFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNPKISHNEQQRIPFEESQYKCSETSHSSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EEGLAPDSEVGRKSYRCEQCGKGFSWHSHLVTHRRTHTGEKPYACTDCGKRFGRSSHLIQ
... .:: .: ..:.::::.::: ::::.:.::::::::: :..::: :.:::::..
CCDS62 TQNMRNNSE--EKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVS
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HQIIHTGEKPYTCPACRKSFSHHSTLIQHQRIHTGEKPYVCDRCAKRFTRRSDLVTHQGT
:: ::::::: : : ::::. .:. ::: ::::::: :..:.: : . :..:: :
CCDS62 HQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRT
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HTGAKPHKCPICAKCFTQSSALVTHQRTHTGVKPYPCPECGKCFSQRSNLIAHNRTHTGE
::: ::..: :.: : :: :..::: ::: ::: : .::: ::: .:.::.::::::
CCDS62 HTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGE
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 KPYHCLDCGKSFSHSSHLTAHQRTHRGVRPYACPLCGKSFSRRSNLHRHEKIHTTGPKAL
::..: .:::::: ::.:.:::::: : .:: : :::::.: :.: :..::: : :
CCDS62 KPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHT-GEKPY
500 510 520 530 540 550
540 550
pF1KB7 AMLMLGAAAAGALATPPPAPT
CCDS62 ECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQ
560 570 580 590 600 610
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 1065 init1: 1065 opt: 1066 Z-score: 672.0 bits: 133.9 E(32554): 4.2e-31
Smith-Waterman score: 1174; 45.2% identity (65.0% similar) in 423 aa overlap (111-531:1-388)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 KEKALFLPGGALPSPRIPVLSREGRTRDRQMAAALLTAWSQMPVTFEDVALYLSREEWGR
:::.:: : :: ::::::.:.::.::::
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRP
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 LDHTQQNFYRDVLQKKNGLSLGFPFSRPFWAPQAHGKGEASGSSRQAGDEKEWRGACTGA
:: .:...::::.:.. : ... : . ..: . .: .: :. .
CCDS23 LDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDF---------EIRSENEVNPKQEISEDVQFGTTS--
40 50 60 70
210 220 230 240 250
pF1KB7 VEVGQRVQTSSVAALGNVKPFRT--RAGRVQWGVPQCAQEAACGRSSGPAKDSGQPAEPD
.: .. . . :.. :. : ::: :.: . . : .:
CCDS23 ----ERPAENAEENPESEEGFESGDRSER-QWG-DLTAEEWV-----------SYPLQP-
80 90 100 110 120
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 RTPDAAPPDPSPTEPQEYRVPEKPNEEEKGAPESGEEGLAPDSEVGRKSYRCEQCGKGFS
. : : .:.. . . :. . .. . ...: . :.: .::::::
CCDS23 -VTDLLVHKEVHT-GIRYHICSHCG---KAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFS
130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 WHSHLVTHRRTHTGEKPYACTDCGKRFGRSSHLIQHQIIHTGEKPYTCPACRKSFSHHST
:::. :.::::::.:: :..::: ::::::::::: :::::::. : : ::: . :
CCDS23 RSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSH
180 190 200 210 220 230
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 LIQHQRIHTGEKPYVCDRCAKRFTRRSDLVTHQGTHTGAKPHKCPICAKCFTQSSALVTH
:::::: :.::::: :..:.: :.: : :. :: :::: ::..: :.. :.. : :. :
CCDS23 LIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKH
240 250 260 270 280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 QRTHTGVKPYPCPECGKCFSQRSNLIAHNRTHTGEKPYHCLDCGKSFSHSSHLTAHQRTH
:.::: .:: : :::: ::: :.:. : :.::::::::: .::..::. :::. :::::
CCDS23 YRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTH
300 310 320 330 340 350
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 RGVRPYACPLCGKSFSRRSNLHRHEKIHTTGPKALAMLMLGAAAAGALATPPPAPT
: .:: : ::::::: :.: :.:::: : :
CCDS23 TGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHT-GEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGE
360 370 380 390 400 410
CCDS23 KPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
420 430 440 450 460 470
>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (692 aa)
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... .:: .: ..:.::::.::: ::::.:.::::::::: :..::: :.:::::..
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360 370 380 390 400 410
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:: ::::::: : : ::::. .:. ::: ::::::: :..:.: : . :..:: :
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420 430 440 450 460 470
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::..: .:::::: ::.:.:::::: : .:: : :::::.: :.: :..::: : :
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540 550
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CCDS12 ECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQ
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: .. :. .. ::: : : : : .: ... :.: :.: .::..:: ...:.
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::::::: :..:.: :. . .. :: ::: ::..: :.: :.::. :..:::::::
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CCDS64 KLIKHQLIHTRE
680
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>--
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CCDS33 RMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHT
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pF1KB7 LDHTQQNFYRDVLQK--KNGLSLGFPFSRP-----------FWA------PQAHGKGE--
:: .:: ::.:. . :: .:::. ...: : ..: .:
CCDS92 LDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETA
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.: :::. .:. .: .: :. . .: .: : . . : .
CCDS92 FEIKSSVSSRSIFKDKQ---SCDIKME-GMARNDLWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERH
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pF1KB7 VPQCA--------QE--AACGRSSG----PA----------KDSGQPAEPDRTPDAAPPD
. : : :: . :. .: :: .:: . . :
CCDS92 LRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQD
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.. .: :. :.. : .:. . .:. .
CCDS92 SCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHRE----
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CCDS92 -KPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPY
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: : :::: : :. ::: :::.: :.:..:.: :.. : :. :: :::: ::..::
CCDS92 ECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPE
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CCDS92 CGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKC
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CCDS92 FSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHT-GEKPYECCQCGKAFIR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]